TAF15

TAF15
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 2MMY
Ідентифікатори
Символи	TAF15, Npl3, RBP56, TAF2N, TAFII68, TATA-box binding protein associated factor 15
Зовнішні ІД	OMIM: 601574 MGI: 1917689 HomoloGene: 131088 GeneCards: TAF15
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • ядерце • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • regulation of signal transduction by p53 class mediator Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8148	70439
Ensembl	ENSG00000270647 ENSG00000276833	ENSMUSG00000020680
UniProt	Q92804	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_003487 NM_139215	NM_027427
RefSeq (білок)	NP_003478 NP_631961	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 17: 35.81 – 35.86 Mb	Хр. 11: 83.47 – 83.51 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TAF15 (англ. TATA-box binding protein associated factor 15) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 592 амінокислот, а молекулярна маса — 61 830.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSDSGSYGQS		GGEQQSYSTY		GNPGSQGYGQ		ASQSYSGYGQ		TTDSSYGQNY
SGYSSYGQSQ		SGYSQSYGGY		ENQKQSSYSQ		QPYNNQGQQQ		NMESSGSQGG
RAPSYDQPDY		GQQDSYDQQS		GYDQHQGSYD		EQSNYDQQHD		SYSQNQQSYH
SQRENYSHHT		QDDRRDVSRY		GEDNRGYGGS		QGGGRGRGGY		DKDGRGPMTG
SSGGDRGGFK		NFGGHRDYGP		RTDADSESDN		SDNNTIFVQG		LGEGVSTDQV
GEFFKQIGII		KTNKKTGKPM		INLYTDKDTG		KPKGEATVSF		DDPPSAKAAI
DWFDGKEFHG		NIIKVSFATR		RPEFMRGGGS		GGGRRGRGGY		RGRGGFQGRG
GDPKSGDWVC		PNPSCGNMNF		ARRNSCNQCN		EPRPEDSRPS		GGDFRGRGYG
GERGYRGRGG		RGGDRGGYGG		DRSGGGYGGD		RSSGGGYSGD		RSGGGYGGDR
SGGGYGGDRG		GGYGGDRGGG		YGGDRGGGYG		GDRGGYGGDR		GGGYGGDRGG
YGGDRGGYGG		DRGGYGGDRG		GYGGDRSRGG		YGGDRGGGSG		YGGDRSGGYG
GDRSGGGYGG		DRGGGYGGDR		GGYGGKMGGR		NDYRNDQRNR		PY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Morohoshi F., Arai K., Takahashi E., Tanigami A., Ohki M. (1996). Cloning and mapping of a human RBP56 gene encoding a putative RNA binding protein similar to FUS/TLS and EWS proteins. Genomics. 38: 51—57. PMID 8954779 DOI:10.1006/geno.1996.0591
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhang D., Paley A.J., Childs G. (1998). The transcriptional repressor ZFM1 interacts with and modulates the ability of EWS to activate transcription. J. Biol. Chem. 273: 18086—18091. PMID 9660765 DOI:10.1074/jbc.273.29.18086
• Jobert L., Argentini M., Tora L. (2009). PRMT1 mediated methylation of TAF15 is required for its positive gene regulatory function. Exp. Cell Res. 315: 1273—1286. PMID 19124016 DOI:10.1016/j.yexcr.2008.12.008
• Bertolotti A., Lutz Y., Heard D.J., Chambon P., Tora L. (1996). hTAF(II)68, a novel RNA/ssDNA-binding protein with homology to the pro-oncoproteins TLS/FUS and EWS is associated with both TFIID and RNA polymerase II. EMBO J. 15: 5022—5031. PMID 8890175

Див. також

• Хромосома 17