THBS2

THBS2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1YO8, 2RHP
Ідентифікатори
Символи	THBS2, TSP2, thrombospondin 2
Зовнішні ІД	OMIM: 188061 MGI: 98738 HomoloGene: 2438 GeneCards: THBS2
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • heparin binding • extracellular matrix structural constituent Клітинна компонента • GO:0005578 Позаклітинна матриця • platelet alpha granule • базальна мембрана • extracellular region • міжклітинний простір • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • positive regulation of synapse assembly • negative regulation of angiogenesis • адгезія клітин • extracellular matrix organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7058	21826
Ensembl	ENSG00000186340	ENSMUSG00000023885
UniProt	P35442	Q03350
RefSeq (мРНК)	NM_003247	NM_011581
RefSeq (білок)	NP_003238 NP_001368868 NP_001368869 NP_001368870 NP_001368871	NP_035711
Локус (UCSC)	Хр. 6: 169.22 – 169.25 Mb	Хр. 17: 14.89 – 14.91 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

THBS2 (англ. Thrombospondin 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 172 амінокислот, а молекулярна маса — 129 991.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVWRLVLLAL		WVWPSTQAGH		QDKDTTFDLF		SISNINRKTI		GAKQFRGPDP
GVPAYRFVRF		DYIPPVNADD		LSKITKIMRQ		KEGFFLTAQL		KQDGKSRGTL
LALEGPGLSQ		RQFEIVSNGP		ADTLDLTYWI		DGTRHVVSLE		DVGLADSQWK
NVTVQVAGET		YSLHVGCDLI		DSFALDEPFY		EHLQAEKSRM		YVAKGSARES
HFRGLLQNVH		LVFENSVEDI		LSKKGCQQGQ		GAEINAISEN		TETLRLGPHV
TTEYVGPSSE		RRPEVCERSC		EELGNMVQEL		SGLHVLVNQL		SENLKRVSND
NQFLWELIGG		PPKTRNMSAC		WQDGRFFAEN		ETWVVDSCTT		CTCKKFKTIC
HQITCPPATC		ASPSFVEGEC		CPSCLHSVDG		EEGWSPWAEW		TQCSVTCGSG
TQQRGRSCDV		TSNTCLGPSI		QTRACSLSKC		DTRIRQDGGW		SHWSPWSSCS
VTCGVGNITR		IRLCNSPVPQ		MGGKNCKGSG		RETKACQGAP		CPIDGRWSPW
SPWSACTVTC		AGGIRERTRV		CNSPEPQYGG		KACVGDVQER		QMCNKRSCPV
DGCLSNPCFP		GAQCSSFPDG		SWSCGSCPVG		FLGNGTHCED		LDECALVPDI
CFSTSKVPRC		VNTQPGFHCL		PCPPRYRGNQ		PVGVGLEAAK		TEKQVCEPEN
PCKDKTHNCH		KHAECIYLGH		FSDPMYKCEC		QTGYAGDGLI		CGEDSDLDGW
PNLNLVCATN		ATYHCIKDNC		PHLPNSGQED		FDKDGIGDAC		DDDDDNDGVT
DEKDNCQLLF		NPRQADYDKD		EVGDRCDNCP		YVHNPAQIDT		DNNGEGDACS
VDIDGDDVFN		ERDNCPYVYN		TDQRDTDGDG		VGDHCDNCPL		VHNPDQTDVD
NDLVGDQCDN		NEDIDDDGHQ		NNQDNCPYIS		NANQADHDRD		GQGDACDPDD
DNDGVPDDRD		NCRLVFNPDQ		EDLDGDGRGD		ICKDDFDNDN		IPDIDDVCPE
NNAISETDFR		NFQMVPLDPK		GTTQIDPNWV		IRHQGKELVQ		TANSDPGIAV
GFDEFGSVDF		SGTFYVNTDR		DDDYAGFVFG		YQSSSRFYVV		MWKQVTQTYW
EDQPTRAYGY		SGVSLKVVNS		TTGTGEHLRN		ALWHTGNTPG		QVRTLWHDPR
NIGWKDYTAY		RWHLTHRPKT		GYIRVLVHEG		KQVMADSGPI		YDQTYAGGRL
GLFVFSQEMV		YFSDLKYECR		DI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як клітинна адгезія. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію, з молекулою гепарину.

Література

• Labell T.L., Byers P.H. (1993). Sequence and characterization of the complete human thrombospondin 2 cDNA: potential regulatory role for the 3' untranslated region. Genomics. 17: 225—229. PMID 8406456 DOI:10.1006/geno.1993.1308
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Labell T.L., McGookey Milewicz D.J., Disteche C.M., Byers P.H. (1992). Thrombospondin II: partial cDNA sequence, chromosome location, and expression of a second member of the thrombospondin gene family in humans. Genomics. 12: 421—429. PMID 1559694 DOI:10.1016/0888-7543(92)90430-Z
• Asch A.S., Silbiger S., Heimer E., Nachman R.L. (1992). Thrombospondin sequence motif (CSVTCG) is responsible for CD36 binding. Biochem. Biophys. Res. Commun. 182: 1208—1217. PMID 1371676 DOI:10.1016/0006-291X(92)91860-S
• Misenheimer T.M., Hahr A.J., Harms A.C., Annis D.S., Mosher D.F. (2001). Disulfide connectivity of recombinant C-terminal region of human thrombospondin 2. J. Biol. Chem. 276: 45882—45887. PMID 11590138 DOI:10.1074/jbc.M104218200
• Carlson C.B., Liu Y., Keck J.L., Mosher D.F. (2008). Influences of the N700S thrombospondin-1 polymorphism on protein structure and stability. J. Biol. Chem. 283: 20069—20076. PMID 18499674 DOI:10.1074/jbc.M800223200

Див. також

• Хромосома 6