NCAM1

NCAM1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2E3V, 2HAZ, 2VKW, 2VKX, 3MTR, 5AEA
Ідентифікатори
Символи	NCAM1, CD56, MSK39, NCAM, neural cell adhesion molecule 1
Зовнішні ІД	OMIM: 116930 MGI: 97281 HomoloGene: 40754 GeneCards: NCAM1
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4684	17967
Ensembl	ENSG00000149294	ENSMUSG00000039542
UniProt	P13591	P13595
RefSeq (мРНК)	NM_181351 NM_000615 NM_001076682 NM_001242607 NM_001242608 NM_001386289 NM_001386290 NM_001386291 NM_001386292	NM_001081445 NM_001113204 NM_010875 NM_001311065
RefSeq (білок)	NP_000606 NP_001070150 NP_001229536 NP_001229537 NP_851996	NP_001074914 NP_001106675 NP_001297994 NP_035005 NP_001391651
Локус (UCSC)	Хр. 11: 112.96 – 113.28 Mb	Хр. 9: 49.41 – 49.71 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NCAM1 (англ. Neural cell adhesion molecule 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 858 амінокислот, а молекулярна маса — 94 574.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLQTKDLIWT		LFFLGTAVSL		QVDIVPSQGE		ISVGESKFFL		CQVAGDAKDK
DISWFSPNGE		KLTPNQQRIS		VVWNDDSSST		LTIYNANIDD		AGIYKCVVTG
EDGSESEATV		NVKIFQKLMF		KNAPTPQEFR		EGEDAVIVCD		VVSSLPPTII
WKHKGRDVIL		KKDVRFIVLS		NNYLQIRGIK		KTDEGTYRCE		GRILARGEIN
FKDIQVIVNV		PPTIQARQNI		VNATANLGQS		VTLVCDAEGF		PEPTMSWTKD
GEQIEQEEDD		EKYIFSDDSS		QLTIKKVDKN		DEAEYICIAE		NKAGEQDATI
HLKVFAKPKI		TYVENQTAME		LEEQVTLTCE		ASGDPIPSIT		WRTSTRNISS
EEKASWTRPE		KQETLDGHMV		VRSHARVSSL		TLKSIQYTDA		GEYICTASNT
IGQDSQSMYL		EVQYAPKLQG		PVAVYTWEGN		QVNITCEVFA		YPSATISWFR
DGQLLPSSNY		SNIKIYNTPS		ASYLEVTPDS		ENDFGNYNCT		AVNRIGQESL
EFILVQADTP		SSPSIDQVEP		YSSTAQVQFD		EPEATGGVPI		LKYKAEWRAV
GEEVWHSKWY		DAKEASMEGI		VTIVGLKPET		TYAVRLAALN		GKGLGEISAA
SEFKTQPVQG		EPSAPKLEGQ		MGEDGNSIKV		NLIKQDDGGS		PIRHYLVRYR
ALSSEWKPEI		RLPSGSDHVM		LKSLDWNAEY		EVYVVAENQQ		GKSKAAHFVF
RTSAQPTAIP		ANGSPTSGLS		TGAIVGILIV		IFVLLLVVVD		ITCYFLNKCG
LFMCIAVNLC		GKAGPGAKGK		DMEEGKAAFS		KDESKEPIVE		VRTEEERTPN
HDGGKHTEPN		ETTPLTEPEK		GPVEAKPECQ		ETETKPAPAE		VKTVPNDATQ
TKENESKA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, взаємодія хазяїн-вірус, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 11