NAIP

NAIP
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2VM5
Ідентифікатори
Символи	NAIP, BIRC1, NLRB1, psiNLR family, apoptosis inhibitory protein, NLR family apoptosis inhibitory protein
Зовнішні ІД	OMIM: 600355 MGI: 1298226 HomoloGene: 136092 GeneCards: NAIP
Онтологія гена Молекулярна функція • peptidase inhibitor activity • nucleotide binding • cysteine-type endopeptidase inhibitor activity • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • cysteine-type endopeptidase inhibitor activity involved in apoptotic process Клітинна компонента • перикаріон • soma • basolateral plasma membrane • neuron projection • цитоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process • negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • response to amino acid • negative regulation of peptidase activity • процес імунної системи • нейробіологія розвитку • response to axon injury • вроджений імунітет • inflammatory response • GO:0097285 апоптоз • Убіквітин-залежний протеоліз • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • mitotic spindle assembly • inhibition of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • negative regulation of apoptotic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4671	17948
Ensembl	ENSG00000278613 ENSG00000276068 ENSG00000249437	ENSMUSG00000078945
UniProt	Q13075	Q9QUK4
RefSeq (мРНК)	NM_004536 NM_022892 NM_001346870	NM_001126182 NM_010872
RefSeq (білок)	NP_001333799 NP_004527 NP_075043	NP_001119654 NP_035002
Локус (UCSC)	Хр. 5: 70.97 – 71.03 Mb	Хр. 13: 100.28 – 100.34 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NAIP (англ. NLR family apoptosis inhibitory protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 403 амінокислот, а молекулярна маса — 159 582.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATQQKASDE		RISQFDHNLL		PELSALLGLD		AVQLAKELEE		EEQKERAKMQ
KGYNSQMRSE		AKRLKTFVTY		EPYSSWIPQE		MAAAGFYFTG		VKSGIQCFCC
SLILFGAGLT		RLPIEDHKRF		HPDCGFLLNK		DVGNIAKYDI		RVKNLKSRLR
GGKMRYQEEE		ARLASFRNWP		FYVQGISPCV		LSEAGFVFTG		KQDTVQCFSC
GGCLGNWEEG		DDPWKEHAKW		FPKCEFLRSK		KSSEEITQYI		QSYKGFVDIT
GEHFVNSWVQ		RELPMASAYC		NDSIFAYEEL		RLDSFKDWPR		ESAVGVAALA
KAGLFYTGIK		DIVQCFSCGG		CLEKWQEGDD		PLDDHTRCFP		NCPFLQNMKS
SAEVTPDLQS		RGELCELLET		TSESNLEDSI		AVGPIVPEMA		QGEAQWFQEA
KNLNEQLRAA		YTSASFRHMS		LLDISSDLAT		DHLLGCDLSI		ASKHISKPVQ
EPLVLPEVFG		NLNSVMCVEG		EAGSGKTVLL		KKIAFLWASG		CCPLLNRFQL
VFYLSLSSTR		PDEGLASIIC		DQLLEKEGSV		TEMCVRNIIQ		QLKNQVLFLL
DDYKEICSIP		QVIGKLIQKN		HLSRTCLLIA		VRTNRARDIR		RYLETILEIK
AFPFYNTVCI		LRKLFSHNMT		RLRKFMVYFG		KNQSLQKIQK		TPLFVAAICA
HWFQYPFDPS		FDDVAVFKSY		MERLSLRNKA		TAEILKATVS		SCGELALKGF
FSCCFEFNDD		DLAEAGVDED		EDLTMCLMSK		FTAQRLRPFY		RFLSPAFQEF
LAGMRLIELL		DSDRQEHQDL		GLYHLKQINS		PMMTVSAYNN		FLNYVSSLPS
TKAGPKIVSH		LLHLVDNKES		LENISENDDY		LKHQPEISLQ		MQLLRGLWQI
CPQAYFSMVS		EHLLVLALKT		AYQSNTVAAC		SPFVLQFLQG		RTLTLGALNL
QYFFDHPESL		SLLRSIHFPI		RGNKTSPRAH		FSVLETCFDK		SQVPTIDQDY
ASAFEPMNEW		ERNLAEKEDN		VKSYMDMQRR		ASPDLSTGYW		KLSPKQYKIP
CLEVDVNDID		VVGQDMLEIL		MTVFSASQRI		ELHLNHSRGF		IESIRPALEL
SKASVTKCSI		SKLELSAAEQ		ELLLTLPSLE		SLEVSGTIQS		QDQIFPNLDK
FLCLKELSVD		LEGNINVFSV		IPEEFPNFHH		MEKLLIQISA		EYDPSKLVKL
IQNSPNLHVF		HLKCNFFSDF		GSLMTMLVSC		KKLTEIKFSD		SFFQAVPFVA
SLPNFISLKI		LNLEGQQFPD		EETSEKFAYI		LGSLSNLEEL		ILPTGDGIYR
VAKLIIQQCQ		QLHCLRVLSF		FKTLNDDSVV		EIAKVAISGG		FQKLENLKLS
INHKITEEGY		RNFFQALDNM		PNLQELDISR		HFTECIKAQA		TTVKSLSQCV
LRLPRLIRLN		MLSWLLDADD		IALLNVMKER		HPQSKYLTIL		QKWILPFSPI
IQK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до інгібіторів протеаз, інгібітор тіолових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Dubrez-Daloz L., Dupoux A., Cartier J. (2008). IAPs: more than just inhibitors of apoptosis proteins. Cell Cycle. 7: 1036—1046. PMID 18414036 DOI:10.4161/cc.7.8.5783
• Karimpour S., Davoodi J., Ghahremani M.H. (2011). Integrity of ATP binding site is essential for effective inhibition of the intrinsic apoptosis pathway by NAIP. Biochem. Biophys. Res. Commun. 407: 158—162. PMID 21371431 DOI:10.1016/j.bbrc.2011.02.130
• Katagiri N., Shobuike T., Chang B., Kukita A., Miyamoto H. (2012). The human apoptosis inhibitor NAIP induces pyroptosis in macrophages infected with Legionella pneumophila. Microbes Infect. 14: 1123—1132. PMID 22504023 DOI:10.1016/j.micinf.2012.03.006

Див. також

• Хромосома 5