Variant av särskild betydelse

Termen variant av särskild betydelse,^[1] variant of concern (VOC) är en kategori som används när mutationer i receptor-bindande domänet (rbd) signifikant ökar bindandeförmågan (t.ex. N501Y) i RBD-hACE2-komplexet (genetisk data), när den samtidigt kan sammankopplas till en snabb betydande ökning bland människor (epidemiologisk data).^[2]

Kriterium under covid-19-pandemin

Under covid-19-pandemin har följande kriterier använts, för att bedöma vilka varianter som är av särskild betydelse.

Mer smittsam
Ökad mortalitet
Ökad morbiditet
Ökad risk för långtidscovid
Förmågan att vara gömd i diagnostiska tester^{[förtydliga]}
Minskad känslighet mot antivirala medel
Minskad känslighet mot neutralisering av antikroppar
Förmågan att kringgå naturlig immunitet
Förmågan att smitta vaccinerade personer
Ökad risk för vissa sjukdomar, såsom systemiskt inflammationsresponssyndrom
Ökad affinitet för särskilda demografiska eller kliniska grupper, såsom barn eller personer som lider av immunsuppression

Exempel

Kanada

Sedan den 12 maj 2021 följde Kanada utvecklingen av tre stycken varianter av särskild betydelse, B.1.1.7, B.1.351 och P.1.^[3]

Sverige

Sedan den 17 maj 2021 följde Sverige utvecklingen av fyra stycken varianter av särskild betydelse, B.1.1.7, B.1.351, P.1 och B.1.1.7 med E484K.^[1]

Storbritannien

Sedan den 5 mars 2021 följde Storbritannien åtta varianter av särskild betydelse, fyra med benämningen VOC, Variant of Concern (Variant av särskild betydelse) och fyra med benämningen VUI, Variant under Investigation (Variant under utredning) från Public Health England.^[4]

I mars 2021 bytte PHE sitt datumformat i benämningarna till [ÅR][MÅNAD]-[NUMMER], där månad är en tresiffrig kod.^[5]

USA

Sedan februari 2021 i en artikel publicerad i JAMA (The Journal of the American Medical Association) beskrivs tre 'varianter av särskild betydelse': B.1.1.7, B.1.351 och P.1.^[6] Centers for Disease Control and Prevention (CDC) spårar också B.1.427 och B.1.429 som varianter av särskild betydelse.^[7]

Referenser

^ [a b] ”Statistik om SARS-CoV-2 virusvarianter av särskild betydelse — Folkhälsomyndigheten”. www.folkhalsomyndigheten.se. http://www.folkhalsomyndigheten.se/smittskydd-beredskap/utbrott/aktuella-utbrott/covid-19/statistik-och-analyser/sars-cov-2-virusvarianter-av-sarskild-betydelse/. Läst 17 maj 2021.
^ Shahhosseini, Nariman; Babuadze, George (Giorgi); Wong, Gary; Kobinger, Gary P. (2021/5). ”Mutation Signatures and In Silico Docking of Novel SARS-CoV-2 Variants of Concern” (på engelska). Microorganisms 9 (5): sid. 926. doi:10.3390/microorganisms9050926. https://www.mdpi.com/2076-2607/9/5/926. Läst 17 maj 2021.
^ Canada, Public Health Agency of (19 april 2020). ”COVID-19 daily epidemiology update”. aem. https://health-infobase.canada.ca/covid-19/epidemiological-summary-covid-19-cases.html. Läst 17 maj 2021.
^ ”Covid-19: Another new variant added to UK watch list” (på brittisk engelska). BBC News. 4 mars 2021. https://www.bbc.com/news/health-56284155. Läst 17 maj 2021.
^ ”Variants: distribution of cases data” (på engelska). GOV.UK. https://www.gov.uk/government/publications/covid-19-variants-genomically-confirmed-case-numbers/variants-distribution-of-cases-data. Läst 17 maj 2021.
^ Walensky, Rochelle P.; Walke, Henry T.; Fauci, Anthony S. (2021-03-16). ”SARS-CoV-2 Variants of Concern in the United States—Challenges and Opportunities” (på engelska). JAMA 325 (11): sid. 1037. doi:10.1001/jama.2021.2294. ISSN 0098-7484. https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2776739?s=03. Läst 17 maj 2021.
^ CDC (11 februari 2020). ”Cases, Data, and Surveillance” (på amerikansk engelska). Centers for Disease Control and Prevention. https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/cases-updates/variant-surveillance/variant-info.html. Läst 17 maj 2021.

[:0-1] [a b] ”Statistik om SARS-CoV-2 virusvarianter av särskild betydelse — Folkhälsomyndigheten”. www.folkhalsomyndigheten.se. http://www.folkhalsomyndigheten.se/smittskydd-beredskap/utbrott/aktuella-utbrott/covid-19/statistik-och-analyser/sars-cov-2-virusvarianter-av-sarskild-betydelse/. Läst 17 maj 2021.

[2] Shahhosseini, Nariman; Babuadze, George (Giorgi); Wong, Gary; Kobinger, Gary P. (2021/5). ”Mutation Signatures and In Silico Docking of Novel SARS-CoV-2 Variants of Concern” (på engelska). Microorganisms 9 (5): sid. 926. doi:10.3390/microorganisms9050926. https://www.mdpi.com/2076-2607/9/5/926. Läst 17 maj 2021.

[3] Canada, Public Health Agency of (19 april 2020). ”COVID-19 daily epidemiology update”. aem. https://health-infobase.canada.ca/covid-19/epidemiological-summary-covid-19-cases.html. Läst 17 maj 2021.

[4] ”Covid-19: Another new variant added to UK watch list” (på brittisk engelska). BBC News. 4 mars 2021. https://www.bbc.com/news/health-56284155. Läst 17 maj 2021.

[5] ”Variants: distribution of cases data” (på engelska). GOV.UK. https://www.gov.uk/government/publications/covid-19-variants-genomically-confirmed-case-numbers/variants-distribution-of-cases-data. Läst 17 maj 2021.

[6] Walensky, Rochelle P.; Walke, Henry T.; Fauci, Anthony S. (2021-03-16). ”SARS-CoV-2 Variants of Concern in the United States—Challenges and Opportunities” (på engelska). JAMA 325 (11): sid. 1037. doi:10.1001/jama.2021.2294. ISSN 0098-7484. https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2776739?s=03. Läst 17 maj 2021.

[7] CDC (11 februari 2020). ”Cases, Data, and Surveillance” (på amerikansk engelska). Centers for Disease Control and Prevention. https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/cases-updates/variant-surveillance/variant-info.html. Läst 17 maj 2021.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]