Família de proteínas
Uma família de proteínas é um grupo de proteínas relacionadas à evolução. Em muitos casos, uma família de proteínas possui uma família de genes correspondente, na qual cada gene codifica uma proteína correspondente com uma relação de 1: 1.[1] O termo família de proteínas não deve ser confundido com família, pois é usado em taxonomia.
As proteínas de uma família descendem de um ancestral comum e geralmente possuem estruturas tridimensionais semelhantes, funções e similaridade significativa de sequência. O mais importante deles é a similaridade de sequência (geralmente sequência de aminoácidos), pois é o indicador mais estrito da homologia e, portanto, o mais claro indicador de ancestralidade comum.[2]
É muito improvável que proteínas que não compartilhem um ancestral comum mostrem similaridade estatisticamente significativa da sequência, tornando o alinhamento de sequências uma ferramenta poderosa para identificar os membros das famílias de proteínas.[3]
Terminologia e uso
[editar | editar código-fonte]Como em muitos termos biológicos, o uso da família de proteínas é um tanto dependente do contexto; pode indicar grandes grupos de proteínas com o menor nível possível de similaridade de sequência detectável ou grupos muito estreitos de proteínas com sequência, função e estrutura tridimensional quase idênticas, ou qualquer tipo de grupo intermediário. Para distinguir entre essas situações, o termo superfamília protéica é freqüentemente usado para proteínas relacionadas à distância, cuja relação não é detectável por similaridade de sequência, mas apenas a partir de características estruturais compartilhadas.[4][5][6]
Domínios proteicos e motivos
[editar | editar código-fonte]O conceito de família de proteínas foi concebido em um momento em que poucas estruturas ou sequências de proteínas eram conhecidas; Naquela época, principalmente proteínas pequenas, de domínio único, como mioglobina, hemoglobina e citocromo c eram estruturalmente entendidas. Desde então, verificou-se que muitas proteínas compreendem múltiplas unidades ou domínios estruturais e funcionais independentes.
Referências
- ↑ «What are protein families?». EMBL-EBI Train online (em inglês). 18 de novembro de 2011. Consultado em 10 de outubro de 2019
- ↑ Vogel, Christine; Chothia, Cyrus (26 de maio de 2006). «Protein Family Expansions and Biological Complexity». PLOS Computational Biology (em inglês). 2 (5): e48. ISSN 1553-7358. PMC 1464810
. PMID 16733546. doi:10.1371/journal.pcbi.0020048
- ↑ Kunin, V.; Cases, I.; Enright, A. J.; De Lorenzo, V.; Ouzounis, C. A. (2003). «Myriads of protein families, and still counting». Genome Biology. 4 (2). 401 páginas. PMC 151299. PMID 12620116. doi:10.1186/gb-2003-4-2-401
- ↑ Dayhoff, M. O. (1974). «Computer analysis of protein sequences». Federation Proceedings. 33 (12): 2314–2316. PMID 4435228
- ↑ Dayhoff, M. O.; McLaughlin, P. J.; Barker, W. C.; Hunt, L. T. (1975). «Evolution of sequences within protein superfamilies». Die Naturwissenschaften. 62 (4): 154–161. Bibcode:1975NW.....62..154D. doi:10.1007/BF00608697
- ↑ Dayhoff, M. O. (1976). «The origin and evolution of protein superfamilies». Federation Proceedings. 35 (10): 2132–2138. PMID 181273
