KR20110126748A - 이중특이적 항-erbb-1/항-c-met 항체 - Google Patents

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Abstract

본 발명은 인간 ErbB-1 및 인간 c-Met 에 대한 이중특이적 항체, 그의 제조 방법, 상기 항체를 포함하는 약학 조성물, 및 그의 용도에 관한 것이다.

Description

이중특이적 항-ERBB-1/항-C-MET 항체{BISPECIFIC ANTI-ERBB-1/ANTI-C-MET ANTIBODIES}
본 발명은 인간 ErbB-1 및 인간 c-Met 에 대한 이중특이적 항체, 그의 제조 방법, 상기 항체를 함유하는 약학 조성물, 및 그의 용도에 관한 것이다.
ErbB 패밀리 단백질
ErbB 단백질 패밀리는 4 개의 일원 ErbB-1 (표피 성장 인자 수용체 (EGFR) 로도 호칭됨), ErbB-2 (인간에서 HER2 로, 설치류에서 neu 로도 호칭됨), ErbB-3 (HER3 으로도 호칭됨) 및 ErbB-4 (HER4 로도 호칭됨) 로 이루어진다. ErbB 패밀리 단백질은 수용체 티로신 키나아제이고 세포 성장, 분화 및 생존의 중요한 매개체에 해당한다.
ErbB-1 및 항-ErbB-1 항체
Erb-B1 (ERBB1, 인간 표피 성장 인자 수용체, EGFR, HER-1 또는 조류 적혈모구 백혈병 바이러스 (v-erb-b) 종양유전자 상동체로도 알려짐; SEQ ID NO:16) 은 c-erbB 원종양유전자에 의해 인코딩되는 170 kDa 막횡단 수용체이며, 고유의 티로신 키나아제 활성을 나타낸다 (Modjtahedi, H., et al., Br. J. Cancer 73 (1996) 228-235; Herbst, R.S., and Shin, D.M., Cancer 94 (2002) 1593-1611). EGFR 의 아이소형 및 변이체 (예를 들어, 대안적 RNA 전사물, 끝이 잘린 형태, 다형, 등) 가 또한 존재하며, 예를 들어 Swissprot 데이타베이스 엔트리 번호 P00533-1, P00533-2, P00533-3, 및 P00533-4 에 의해 확인되는 것들이 있으나 이에 제한되지 않는다. EGFR 은 리간드 예컨대 표피 성장 인자 (EGF), 전환 성장 α), 암피레굴린, 헤파린-결합 EGF (hb-EGF), 베타셀룰린, 인자-α (TGf- 및 에피레굴린에 결합하는 것으로 알려져 있다 (Herbst, R.S., and Shin, D.M., Cancer 94 (2002) 1593-1611; Mendelsohn, J., and Baselga, J., Oncogene 19 (2000) 6550-6565). EGFR 은, 이에 제한되는 것은 아니나, 세포 증식, 분화, 세포 생존, 세포자멸사, 혈관생성, 유사분열유도, 및 전이를 제어하는 신호 전달 경로의 활성화를 포함하여, 티로신-키나아제 매개 신호 전달 경로를 통해 수많은 세포 과정을 조절한다 (Atalay, G., et al., Ann. Oncology 14 (2003) 1346-1363; Tsao, A.S., and Herbst, R.S., Signal 4 (2003) 4-9; Herbst, R.S., and Shin, D.M., Cancer 94 (2002) 1593-1611; Modjtahedi, H., et al., Br. J. Cancer 73 (1996) 228-235).
항-ErbB-1 항체는 EGFR 의 세포외 부분을 표적으로 하여, 리간드 결합의 차단을 초래함으로써 후속 사건 예컨대 세포 증식을 저해한다 (Tsao, A.S., and Herbst, R.S., Signal 4 (2003) 4-9). 2 이상의 상이한 종 (예를 들어, 마우스 및 인간) 으로부터의 항체의 부분을 포함하는 키메라 항-ErbB-1 항체가 개발되었다. 참조, 예를 들어, US 5,891,996 (마우스/인간 키메라 항체, R3), 또는 US 5,558,864 (쥐과 항-EGFR MAb 425 의 키메라 및 인간화 형태). 또한, IMC-C225 (세투시맙, Erbitux®; ImClone) 는 다양한 인간 이종이식 모델에서 항종양 효능을 나타낸 것으로 보고된 키메라 마우스/인간 항-EGFR 모노클로날 항체 (마우스 M225 모노클로날 항체에 기초함, 인간 임상 시험에서 HAMA 반응을 초래했음) 이다 (Herbst, R.S., and Shin, D.M., Cancer 94 (2002) 1593-1611). IMC-C225 의 효능은 아마도 증가된 항체-의존적 세포 독성 (ADCC) 활성에 의해, EGFR 신호전달 경로에 의해 조절되는 세포 사건의 저해를 비롯한 여러 메카니즘의 원인이 된다 (Herbst, R.S., and Shin, D.M., Cancer 94 (2002) 1593-1611). IMC-C225 도, 방사선요법 및 화학요법과 조합된 경우를 포함하여, 임상 시험에서 사용되었다 (Herbst, R.S., and Shin, D.M., Cancer 94 (2002) 1593-1611). 최근에, Abgenix, Inc. (Fremont, CA) 는 암 치료용 ABX-EGF 를 개발했다. ABX-EGF 는 완전 인간 항-EGFR 모노클로날 항체이다 (Yang, X.D., et al., Crit. Rev. Oncol./Hematol. 38 (2001) 17-23).
WO 2006/082515 는 랫트 모노클로날 항체 ICR62 에서 유래된 인간화 항-EGFR 모노클로날 항체 및 이의 암 치료를 위한 당조작된 (glycoengineered) 형태를 언급한다.
c-Met 및 항-c-Met 항체
MET (중간엽-상피 전이 인자) 는 단백질 MET (c-Met; 간세포 성장 인자 수용체 HGFR; HGF 수용체; 산란 인자 수용체; SF 수용체로도 알려짐; SEQ ID NO:15) 를 인코딩하는 원종양유전자이다 (Dean, M., et al., Nature 318 (1985) 385-8; Chan, A.M., et al., Oncogene 1 (1987) 229-33; Bottaro, D.P., et al., Science 251 (1991) 802-4; Naldini, L., et al., EMBO J. 10 (1991) 2867-78; Maulik, G., et al., Cytokine Growth Factor Rev. 13 (2002) 41-59). MET 는 배아 발달 및 상처 치유에 필수적인 막 수용체이다. 간세포 성장 인자 (HGF) 는 MET 수용체의 유일하게 알려진 리간드이다. MET 는 상피 기원의 세포에 의해 정상적으로 발현되는 한편, HGF 의 발현은 중간엽 기원의 세포에 국한된다. HGF 자극시, MET 는 침습적 성장으로 알려진 과정을 집합적으로 야기하는 여러 생물학적 반응들을 유도한다. 암에서 비정상적인 MET 활성화는 나쁜 예후와 연관되며, 비정상적으로 활성인 MET 는 종양 성장, 종양에 영양분을 공급하는 새로운 혈관의 형성 (혈관생성), 및 다른 기관으로의 암 전파 (전이) 를 유발한다. MET 는 간, 신장, 위, 유방, 및 뇌의 암을 비롯한 많은 유형의 인간 악성종양에서 탈조절된다. 정상적으로는, 줄기 세포 및 조상 세포만이 MET 를 발현하며, MET 는 이들 세포가 침습적으로 성장할 수 있게 하여 배아에서 새로운 조직을 생성하거나 성체에서 손상된 조직을 재생시킨다. 그러나, 암 줄기 세포는 정상적 줄기 세포가 MET 를 발현하는 능력을 강탈하여, 암 존속 및 신체 내 다른 자리로의 전파의 원인이 되는 것으로 여겨진다.
원종양유전자 MET 산물은 간세포 성장 인자 수용체이며, 티로신-키나아제 활성을 인코딩한다. 1차 단일쇄 전구체 단백질은 번역 후에 절단되어 알파 및 베타 서브유닛을 생성하며, 이들은 이황 연결되어 성숙한 수용체를 형성한다. MET 유전자 내의 다양한 돌연변이는 유두모양 신장 암종과 연관된다.
항-c-Met 항체는 예를 들어 US 5,686,292, US 7,476,724, WO 2004/072117, WO 2004/108766, WO 2005/016382, WO 2005/063816, WO 2006/015371, WO 2006/104911, WO 2007/126799, 또는 WO 2009/007427 에서 알려졌다.
C-Met 결합 펩티드는 예를 들어 [Matzke, A., et al., Cancer Res 65 (14) (2005) 6105-10] 및 [Tam, Eric, M., et al., J. Mol. Biol. 385 (2009)79-90] 에서 알려졌다.
다중특이적 항체
매우 다양한 재조합 항체 포맷이 최근 개발되었고, 예를 들어 IgG 항체 포맷 및 단일쇄 도메인의 융합에 의한 4가 이중특이적 항체가 있다 (참조, 예를 들어 Coloma, M.J., et al., Nature Biotech 15 (1997) 159-163; WO 2001/077342; 및 Morrison, S.L., Nature Biotech 25 (2007) 1233-1234).
또한 2 이상의 항원에 결합할 수 있는, 항체 핵심 구조 (IgA, IgD, IgE, IgG 또는 IgM) 가 더이상 유지되지 않는 여러 다른 새로운 포맷 예컨대 다이아- (dia-), 트리아- (tria-) 또는 테트라바디 (tetrabody), 미니바디 (minibody), 여러 단일쇄 포맷 (scFv, Bis-scFv) 이 개발되었다 (Holliger, P., et al., Nature Biotech 23 (2005) 1126-1136; Fischer, N., Leger, O., Pathobiology 74 (2007) 3-14; Shen, J., et al., Journal of Immunological Methods 318 (2007) 65-74; Wu, C., et al., Nature Biotech. 25 (2007) 1290-1297).
모든 상기 포맷은 링커를 사용하여 항체 핵심 (IgA, IgD, IgE, IgG 또는 IgM) 을 추가의 결합 단백질 (예를 들어, scFv) 에 융합시키거나 예를 들어 2 개의 Fab 단편 또는 scFv 를 융합시킨다 (Fischer, N., Leger, O., Pathobiology 74 (2007) 3-14). 자연 항체와 높은 정도의 유사성을 유지함으로써, 예를 들어 Fc 수용체 결합을 통해 매개되는, 보체-의존적 세포독성 (CDC) 또는 항체 의존적 세포 세포독성 (ADCC) 과 같은 효과기 기능의 유지가 요구될 수 있다는 점에 유의해야 한다.
WO 2007/024715 에서 조작된 다가 및 다중특이적 결합 단백질로서 이중 가변 도메인 면역글로불린이 보고되어 있다. 생물학적으로 활성인 항체 이합체의 제조 과정이 US 6,897,044 에 보고되어 있다. 펩티드 링커를 통해 서로 연결되어 있는 4 개 이상의 가변 도메인을 갖는 다가 FV 항체 구축물이 US 7,129,330 에 보고되어 있다. 이합체성 및 다합체성 항원 결합 구조가 US 2005/0079170 에 보고되어 있다. 자연적 면역글로불린이 아닌, 연결 구조에 의해 서로 공유 결합된 3 또는 4 개의 Fab 단편을 포함하는 3- 또는 4-가 단일특이적 항원-결합 단백질이 US 6,511,663 에 보고되어 있다. WO 2006/020258 에서 원핵 및 진핵 세포에서 효율적으로 발현될 수 있고, 치료 및 진단 방법에서 유용한 4가 이중특이적 항체가 보고되어 있다. 2 가지 유형의 폴리펩티드 이합체를 포함하는 혼합물에서 하나 이상의 사슬간 이황 연결을 통해 연결되어 있는 이합체를 하나 이상의 사슬간 이황 연결을 통해 연결되어 있지 않은 이합체로부터 분리하거나 우선적으로 합성하는 방법이 US 2005/0163782 에 보고되어 있다. 이중특이적 4가 수용체가 US 5,959,083 에 보고되어 있다. 3 개 이상의 기능적 항원 결합 자리가 있는 조작된 항체가 WO 2001/077342 에 보고되어 있다.
다중특이적 및 다가 항원-결합 폴리펩티드가 WO 1997/001580 에 보고되어 있다. WO 1992/004053 은 동일한 항원 결정인자에 결합하는 IgG 클래스의 모노클로날 항체로부터 전형적으로 제조되는 동종접합체가 합성 교차-연결을 통해 공유적으로 연결됨을 보고한다. 항원에 대한 결합활성이 높은 올리고머성 모노클로날 항체가 WO 1991/06305 에 보고되어 있고, 여기서 2 이상의 면역글로불린 단량체가 함께 연합되어 4가 또는 6가 IgG 분자를 형성함으로써, 전형적으로 IgG 클래스인 올리고머가 분비된다. 인터페론 감마 활성이 병원성인 질환을 치료하는데 사용될 수 있는 양-유래 항체 및 조작된 항체 구축물이 US 6,350,860 에 보고되어 있다. US 2005/0100543 에서 이중특이적 항체의 다가 담체인 표적화가능 구축물, 즉 표적화가능 구축물의 각각의 분자가 2 이상의 이중특이적 항체의 담체로서의 역할을 할 수 있는 표적화가능 구축물이 보고되어 있다. 유전자 조작된 이중특이적 4가 항체가 WO 1995/009917 에 보고되어 있다. WO 2007/109254 에서 안정화된 scFv 로 이루어지거나 포함하는 안정화된 결합 분자가 보고되어 있다. US 2007/0274985 는 단일쇄 Fab (scFab) 단편을 포함하는 항체 포맷에 관한 것이다.
WO 2008/140493 은 항-ErbB 패밀리 일원 항체 및 하나 이상의 항-ErbB 패밀리 일원 항체를 포함하는 이중특이적 항체에 관한 것이다. US 2004/0071696 은 ErbB 단백질 패밀리의 일원에 결합하는 이중특이적 항체 분자에 관한 것이다.
WO2009111707(A1) 은 Met 및 HER 대항제에 의한 조합 요법에 관한 것이다. WO2009111691(A2A3) 은 Met 및 EGFR 대항제에 의한 조합 요법에 관한 것이다.
WO2004072117 은 c-Met 하향조절/내재화를 유도하는 c-Met 항체 및, 이중특이적 항체 특히 ErbB-1 이 제 2 항원인 이중특이적 항체에 있어서의 c-Met 항체의 잠재적 용도에 관한 것이다.
발명의 요약
본 발명의 첫번째 양상은 OVCAR-8 세포 상에서 흐름 세포측정 검정으로 2 시간 후 측정되는 경우, 항체의 부재 하에서의 c-Met 의 내재화에 비해 15 % 이하의 c-Met 의 내재화를 보이는 것을 특징으로 하는, 인간 ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 제 1 항원-결합 자리 및 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 제 2 항원-결합 자리를 포함하는 인간 ErbB-1 및 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 이중특이적 항체이다.
본 발명의 하나의 구현예에서 상기 항체는 인간 ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 1 또는 2 개의 항원-결합 자리 및 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 1 개의 항원-결합 자리를 포함하는, 인간 ErbB-1 및 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 2가 또는 3가, 이중특이적 항체이다.
본 발명의 하나의 구현예에서 상기 항체는 인간 ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 2 개의 항원-결합 자리 및 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 제 3 항원-결합 자리를 포함하는, 인간 ErbB-1 및 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 3가, 이중특이적 항체이다.
본 발명의 하나의 구현예에서 상기 항체는 인간 ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 1 개의 항원-결합 자리 및 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 1 개의 항원-결합 자리를 포함하는 인간 ErbB-1 및 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 2가, 이중특이적 항체이다.
본 발명의 하나의 양상은 하기를 특징으로 하는, 인간 ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 제 1 항원-결합 자리 및 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 제 2 항원-결합 자리를 포함하는 인간 ErbB-1 및 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 이중특이적 항체이다:
i) 상기 제 1 항원-결합 자리는 중쇄 가변 도메인 내에 SEQ ID NO: 17 의 CDR3H 영역, SEQ ID NO: 18 의 CDR2H 영역, 및 SEQ ID NO:19 의 CDR1H 영역, 및 경쇄 가변 도메인 내에 SEQ ID NO: 20 의 CDR3L 영역, SEQ ID NO:21 의 CDR2L 영역, 및 SEQ ID NO:22 의 CDR1L 영역을 포함하고;
상기 제 2 항원-결합 자리는 중쇄 가변 도메인 내에 SEQ ID NO: 29 의 CDR3H 영역, SEQ ID NO: 30 의 CDR2H 영역, 및 SEQ ID NO: 31 의 CDR1H 영역, 및 경쇄 가변 도메인 내에 SEQ ID NO: 32 의 CDR3L 영역, SEQ ID NO: 33 의 CDR2L 영역, 및 SEQ ID NO: 34 의 CDR1L 영역을 포함함; 또는
ii) 상기 제 1 항원-결합 자리는 중쇄 가변 도메인 내에 SEQ ID NO: 23 의 CDR3H 영역, SEQ ID NO: 24 의 CDR2H 영역, 및 SEQ ID NO:25 의 CDR1H 영역, 및 경쇄 가변 도메인 내에 SEQ ID NO: 26 의 CDR3L 영역, SEQ ID NO:27 의 CDR2L 영역, 및 SEQ ID NO:28 의 CDR1L 영역을 포함하고;
상기 제 2 항원-결합 자리는 중쇄 가변 도메인 내에 SEQ ID NO: 29 의 CDR3H 영역, SEQ ID NO: 30 의 CDR2H 영역, 및 SEQ ID NO: 31 의 CDR1H 영역, 및 경쇄 가변 도메인 내에 SEQ ID NO: 32 의 CDR3L 영역, SEQ ID NO: 33 의 CDR2L 영역, 및 SEQ ID NO: 34 의 CDR1L 영역을 포함함.
상기 이중특이적 항체는 바람직하게는 하기를 특징으로 한다:
i) ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 상기 제 1 항원-결합 자리는 중쇄 가변 도메인으로서 SEQ ID NO: 1 의 서열, 및 경쇄 가변 도메인으로서 SEQ ID NO: 2 의 서열을 포함하고;
c-Met 에 특이적으로 결합하는 상기 제 2 항원-결합 자리는 중쇄 가변 도메인으로서 SEQ ID NO: 5 의 서열, 및 경쇄 가변 도메인으로서 SEQ ID NO: 6 의 서열을 포함함; 또는
ii) ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 상기 제 1 항원-결합 자리는 중쇄 가변 도메인으로서 SEQ ID NO: 3 의 서열, 및 경쇄 가변 도메인으로서 SEQ ID NO: 4 의 서열을 포함하고;
c-Met 에 특이적으로 결합하는 상기 제 2 항원-결합 자리는 중쇄 가변 도메인으로서 SEQ ID NO: 5 의 서열, 및 경쇄 가변 도메인으로서 SEQ ID NO: 6 의 서열을 포함함.
본 발명의 추가의 양상은 IgG1 또는 IgG3 서브클래스의 불변 영역을 포함하는 것을 특징으로 하는 본 발명에 따른 이중특이적 항체이다.
하나의 구현예에서 본 발명에 따른 상기 이중특이적 항체는 Asn297 에서 당쇄로 글리코실화되어 상기 당쇄 내의 푸코오스의 양이 65 % 이하인 것을 특징으로 한다.
본 발명의 추가의 양상은 상기 이중특이적 항체의 사슬을 인코딩하는 핵산 분자이다.
본 발명의 추가의 양상은 상기 이중특이적 항체를 포함하는 약학 조성물, 암 치료용 상기 약학 조성물, 암 치료용 약제의 제조를 위한 상기 이중특이적 항체의 용도, 치료를 필요로 하는 환자에게 상기 이중특이적 항체를 투여하는 것에 의하는 암 환자의 치료 방법이다.
EGFR, 및 c-Met 는 수용체 크로스-토크 (cross-talk) 의 일부로서 인산화 및 하류 신호전달 캐스캐이드의 활성화를 초래하므로, 그리고 종양 조직 세포 표면 상의 이들 수용체의 상향조절로 인해 (Bachleitner-Hofmann et al., Mol. Canc. Ther. (2009) 3499-3508), 본 발명에 따른 이중특이적 <ErbB-1-c-Met> 항체는 항종양 효능 및 암 세포 저해와 같은 값진 특성을 갖는다.
본 발명에 따른 항체는 매우 값진 특성, 예를 들어 그 중에서도, 수용체 ErbB1 및 c-Met 를 둘다 발현하는 암 세포의 성장 저해, 암 환자에게 유익을 야기하는 항종양 효능을 보인다. 본 발명에 따른 이중특이적 <ErbB1-c-Met> 항체는 수용체 ErbB1 및 c-Met 를 둘다 발현하는 암 세포 상에서 그들의 부모 단일특이적, 2가 <c-Met> 항체에 비해 감소된 c-Met 수용체의 내재화를 보인다.
발명의 상세한 설명
본 발명의 첫번째 양상은 인간 ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 제 1 항원-결합 자리 및 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 제 2 항원-결합 자리를 포함하는 인간 ErbB-1 및 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 이중특이적 항체로서, OVCAR-8 세포 상에서 흐름 세포측정 검정으로 2 시간 후 측정되는 경우, 상기 이중특이적 항체의 부재 하에서의 c-Met 의 내재화에 비해 15 % 이하의 c-Met 의 내재화를 보이는 것을 특징으로 하는 이중특이적 항체이다.
따라서 본 발명은 인간 ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 제 1 항원-결합 자리 및 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 제 2 항원-결합 자리를 포함하는 인간 ErbB-1 및 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 이중특이적 항체로서, 흐름 세포측정 검정에 의해 1 시간의 OVCAR-8 세포-항체 인큐베이션 후 측정되는 경우, 항체의 부재 하에서의 OVCAR-8 세포 상에서의 c-Met 의 내재화에 비해 15 % 이하의 OVCAR-8 세포 상에서의 c-Met 의 내재화의 증가를 야기하는 이중특이적 항체를 지향한다.
하나의 구현예에서 인간 ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 제 1 항원-결합 자리 및 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 제 2 항원-결합 자리를 포함하는 인간 ErbB-1 및 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 상기 이중특이적 항체는 OVCAR-8 세포 상에서 흐름 세포측정 검정으로 2 시간 후 측정되는 경우, 상기 이중특이적 항체의 부재 하에서의 c-Met 의 내재화에 비해 10 % 이하의 c-Met 의 내재화를 보이는 것을 특징으로 한다.
하나의 구현예에서 인간 ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 제 1 항원-결합 자리 및 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 제 2 항원-결합 자리를 포함하는 인간 ErbB-1 및 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 상기 이중특이적 항체는 OVCAR-8 세포 상에서 흐름 세포측정 검정으로 2 시간 후 측정되는 경우, 상기 이중특이적 항체의 부재 하에서의 c-Met 의 내재화에 비해 7 % 이하의 c-Met 의 내재화를 보이는 것을 특징으로 한다.
하나의 구현예에서 인간 ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 제 1 항원-결합 자리 및 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 제 2 항원-결합 자리를 포함하는 인간 ErbB-1 및 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 상기 이중특이적 항체는 OVCAR-8 세포 상에서 흐름 세포측정 검정으로 2 시간 후 측정되는 경우, 상기 이중특이적 항체의 부재 하에서의 c-Met 의 내재화에 비해 5 % 이하의 c-Met 의 내재화를 보이는 것을 특징으로 한다.
용어 "c-Met 의 내재화" 는 항체의 부재 하에서의 c-Met 의 내재화와 비교되는 OVCAR-8 세포 (NCI Cell Line 명칭; NCI (National Cancer Institute) 로부터 구매 OVCAR-8-NCI; Schilder, R.J. et al., Int. J. Cancer 45 (1990) 416-422; Ikediobi, O.N. et al., Mol. Cancer. Ther. 5 (2006) 2606-2012; Lorenzi, P.L., et al., Mol. Cancer Ther. 8 (2009) 713-24) 상에서의 항체-유도성 c-Met 수용체 내재화를 언급한다. c-Met 수용체의 내재화는 본 발명에 따른 이중특이적 항체에 의해 유도되고, 실시예 9 에서 기술된 바와 같이 흐름 세포측정 검정으로 (FACS) 2 시간 후 측정된다. 본 발명에 따른 이중특이적 항체는 2 시간의 항체 노출 후 항체의 부재 하에서의 c-Met 의 내재화에 비해 OVCAR-8 세포 상에서 15 % 이하의 c-Met 의 내재화를 보인다. 하나의 구현예에서 상기 항체는 10 % 이하의 c-Met 의 내재화를 보인다. 하나의 구현예에서 상기 항체는 7 % 이하의 c-Met 의 내재화를 보인다. 하나의 구현예에서 상기 항체는 5 % 이하의 c-Met 의 내재화를 보인다.
본 발명의 또다른 양상은 인간 ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 제 1 항원-결합 자리 및 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 제 2 항원-결합 자리를 포함하는 인간 ErbB-1 및 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 이중특이적 항체로서, OVCAR-8 세포 상에서 흐름 세포측정 검정으로 2 시간 후 측정되는 경우, (상응하는) 단일특이적, 2가 부모 c-Met 항체에 의해 유도되는 c-Met 의 내재화에 비해 c-Met 의 내재화를 50 % 이상 (하나의 구현예에서 60 % 이상; 또다른 구현예에서 70 % 이상, 하나의 구현예에서 80 % 이상) 감소시키는 것을 특징으로 하는 이중특이적 항체이다. OVCAR-8 세포 상에서 흐름 세포측정 검정으로 2 시간 후 측정되는 % 내재화 값을 사용하고, 한편 0 미만의 % 내재화 값은 0% 내재화로 설정하고, 예를 들어 BsAB01 의 경우에 -14% 내재화는 0% 내재화로 설정하여, c-Met 의 내재화의 감소는 하기와 같이 계산된다: 100 × (% 단일특이적, 2가 부모 c-Met 항체에 의해 유도된 c-Met 의 내재화 - % 이중특이적 ErbB-1/cMet 항체에 의해 유도된 c-Met 의 내재화) / % 단일특이적, 2가 부모 c-Met 항체에 의해 유도된 c-Met 의 내재화. 예를 들어, 이중특이적 ErbB-1/cMet 항체 BsAB01 은 -14 % 의 c-Met 의 내재화를 보이며 이는 0 % 로 설정되고, 단일특이적, 2가 부모 c-Met 항체 Mab 5D5 는 44 % 의 c-Met 의 내재화를 보인다. 따라서 이중특이적 ErbB-1/cMet 항체 BsAB01 은 100 × (40-0)/40 % = 100 % 의 c-Met 의 내재화의 감소를 보인다 (실시예 9 에서 OVCAR-8 세포 상에서 흐름 세포측정 검정으로 2 시간 후 측정된 내재화 값 참조).
본원에서 사용되는, "항체" 는 항원-결합 자리를 포함하는 결합 단백질을 언급한다. 본원에서 사용되는 용어 "결합 자리" 또는 "항원-결합 자리" 는 리간드가 실제로 결합하는 항체 분자의 영역(들)을 의미하며 항체에서 유래된다. 용어 "항원-결합 자리" 는 항체 중쇄 가변 도메인 (VH) 및/또는 항체 경쇄 가변 도메인 (VL), 또는 VH/VL 의 쌍을 포함하며, 전체 항체 또는 항체 단편 예컨대 단일쇄 Fv, VH 도메인 및/또는 VL 도메인, Fab, 또는 (Fab)2 에서 유래될 수 있다. 본 발명의 하나의 구현예에서 각각의 항원-결합 자리는 항체 중쇄 가변 도메인 (VH) 및/또는 항체 경쇄 가변 도메인 (VL) 을 포함하고, 바람직하게는 항체 경쇄 가변 도메인 (VL) 및 항체 중쇄 가변 도메인 (VH) 으로 이루어지는 한 쌍에 의해 형성된다.
항체 유래 항원-결합 자리에 더하여 예를 들어 [Matzke, A., et al., Cancer Res. 65 (14) (2005) 6105-10] 에 기술된 바와 같은 결합 펩티드도 항원 (예를 들어, c-Met) 에 특이적으로 결합할 수 있다. 따라서 본 발명의 추가의 양상은 인간 ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 항원-결합 자리 및 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 결합 펩티드를 포함하는 인간 ErbB-1 및 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 이중특이적 결합 분자이다. 따라서 본 발명의 추가의 양상은 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 항원-결합 자리 및 인간 ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 결합 펩티드를 포함하는 인간 ErbB-1 및 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 이중특이적 결합 분자이다.
Erb-B1 (ERBB1, 인간 표피 성장 인자 수용체, EGFR, HER-1 또는 조류 적혈모구 백혈병 바이러스 (v-erb-b) 종양유전자 상동체로도 알려짐; SEQ ID NO:16) 은 c-erbB 원종양유전자에 의해 인코딩되는 170 kDa 막횡단 수용체이며, 고유의 티로신 키나아제 활성을 나타낸다 (Modjtahedi, H., et al., Br. J. Cancer 73 (1996) 228-235; Herbst, R.S., and Shin, D.M., Cancer 94 (2002) 1593-1611). EGFR 의 아이소형 및 변이체 (예를 들어, 대안적 RNA 전사물, 끝이 잘린 형태, 다형, 등) 가 또한 존재하며, 예를 들어 Swissprot 데이타베이스 엔트리 번호 P00533-1, P00533-2, P00533-3, 및 P00533-4 에 의해 확인되는 것들이 있으나 이에 제한되지 않는다. EGFR 은 리간드 예컨대 표피 성장 인자 (EGF), 전환 성장 α), 암피레굴린, 헤파린-결합 EGF (hb-EGF), 베타셀룰린, 인자-α (TGf- 및 에피레굴린에 결합하는 것으로 알려져 있다 (Herbst, R.S., and Shin, D.M., Cancer 94 (2002) 1593-1611; Mendelsohn, J., and Baselga, J., Oncogene 19 (2000) 6550-6565). EGFR 은, 이에 제한되는 것은 아니나, 세포 증식, 분화, 세포 생존, 세포자멸사, 혈관생성, 유사분열유도, 및 전이를 제어하는 신호 전달 경로의 활성화를 포함하여, 티로신-키나아제 매개 신호 전달 경로를 통해 수많은 세포 과정을 조절한다 (Atalay, G., et al., Ann. Oncology 14 (2003) 1346-1363; Tsao, A.S., and Herbst, R.S., Signal 4 (2003) 4-9; Herbst, R.S., and Shin, D.M., Cancer 94 (2002) 1593-1611; Modjtahedi, H., et al., Br. J. Cancer 73 (1996) 228-235).
인간 ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 항원-결합 자리, 특히 중쇄 가변 도메인 (VH) 및/또는 항체 경쇄 가변 도메인 (VL) 은 a) 알려진 항-ErbB-1 항체 예컨대 예를 들어 IMC-C225 (세투시맙, Erbitux®; ImClone) (Herbst, R.S., and Shin, D.M., Cancer 94 (2002) 1593-1611), ABX-EGF (Abgenix) (Yang, X.D., et al., Crit. Rev. Oncol./Hematol. 38 (2001) 17-23), 인간화 ICR62 (WO 2006/082515) 또는 예를 들어 US 5,891,996, US 5,558,864 에 기술된 기타 항체로부터; 또는 b) 그 중에서도 인간 ErbB-1 단백질 또는 그의 핵산 또는 단편을 사용하는 새로운 면역화 방법에 의해 또는 파지 디스플레이에 의해 수득되는 신규한 항-ErbB-1 항체에서 유래될 수 있다.
MET (중간엽-상피 전이 인자) 는 단백질 MET (c-Met; 간세포 성장 인자 수용체 HGFR; HGF 수용체; 산란 인자 수용체; SF 수용체로도 알려짐; SEQ ID NO:15) 를 인코딩하는 원종양유전자이다 (Dean, M., et al., Nature 318 (1985) 385-8; Chan, A.M., et al., Oncogene 1 (1987) 229-33; Bottaro, D.P., et al., Science 251 (1991) 802-4; Naldini, L., et al., EMBO J. 10 (1991) 2867-78; Maulik, G., et al., Cytokine Growth Factor Rev. 13 (2002) 41-59). MET 는 배아 발달 및 상처 치유에 필수적인 막 수용체이다. 간세포 성장 인자 (HGF) 는 MET 수용체의 유일하게 알려진 리간드이다. MET 는 상피 기원의 세포에 의해 정상적으로 발현되는 한편, HGF 는 중간엽 기원의 세포에 국한된다. HGF 자극시, MET 는 침습적 성장으로 알려진 과정을 집합적으로 야기하는 여러 생물학적 반응들을 유도한다. 암에서 비정상적인 MET 활성화는 나쁜 예후와 연관되며, 비정상적으로 활성인 MET 는 종양 성장, 종양에 영양분을 공급하는 새로운 혈관의 형성 (혈관생성), 및 다른 기관으로의 암 전파 (전이) 를 유발한다. MET 는 간, 신장, 위, 유방, 및 뇌의 암을 비롯한 많은 유형의 인간 악성종양에서 탈조절된다. 정상적으로는, 줄기 세포 및 조상 세포만이 MET 를 발현하며, MET 는 이들 세포가 침습적으로 성장할 수 있게 하여 배아에서 새로운 조직을 생성하거나 성체에서 손상된 조직을 재생시킨다. 그러나, 암 줄기 세포는 정상적 줄기 세포가 MET 를 발현하는 능력을 강탈하여, 암 존속 및 신체 내 다른 자리로의 전파의 원인이 되는 것으로 여겨진다.
인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 항원-결합 자리, 특히 중쇄 가변 도메인 (VH) 및/또는 항체 경쇄 가변 도메인 (VL) 은 a) 예를 들어 US 5,686,292, US 7,476,724, WO 2004/072117, WO 2004/108766, WO 2005/016382, WO 2005/063816, WO 2006/015371, WO 2006/104911, WO 2007/126799, 또는 WO 2009/007427 에서 기술된 알려진 항-c-Met 항체에서 b) 예를 들어 그 중에서도 인간 항-c-Met 단백질 또는 그의 핵산 또는 단편을 사용하는 새로운 면역화 방법에 의해 또는 파지 디스플레이에 의해 수득되는 신규한 항-c-Met 항체에서 유래될 수 있다.
본 발명의 추가의 양상은 하기를 특징으로 하는, 인간 ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 제 1 항원-결합 자리 및 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 제 2 항원-결합 자리를 포함하는 인간 ErbB-1 및 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 이중특이적 항체이다:
i) ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 상기 제 1 항원-결합 자리는 중쇄 가변 도메인으로서 SEQ ID NO: 1 의 서열, 및 경쇄 가변 도메인으로서 SEQ ID NO: 2 의 서열을 포함하고;
c-Met 에 특이적으로 결합하는 상기 제 2 항원-결합 자리는 중쇄 가변 도메인으로서 SEQ ID NO: 5 의 서열, 및 경쇄 가변 도메인으로서 SEQ ID NO: 6 의 서열을 포함함; 또는
ii) ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 상기 제 1 항원-결합 자리는 중쇄 가변 도메인으로서 SEQ ID NO: 3 의 서열, 및 경쇄 가변 도메인으로서 SEQ ID NO: 4 의 서열을 포함하고;
c-Met 에 특이적으로 결합하는 상기 제 2 항원-결합 자리는 중쇄 가변 도메인으로서 SEQ ID NO: 5 의 서열, 및 경쇄 가변 도메인으로서 SEQ ID NO: 6 의 서열을 포함함.
항체 특이성은 항원의 특정 에피토프에 대한 항체의 선별적 인지를 언급한다. 예를 들어, 자연적 항체는 단일특이적이다. 본 발명에 따른 "이중특이적 항체" 는 2 개의 상이한 항원-결합 특이성을 갖는 항체이다. 항체가 하나 이상의 특이성을 갖는 경우, 인지되는 에피토프는 단일 항원 또는 하나 이상의 항원과 연관될 수 있다. 본 발명의 항체는 2 개의 상이한 항원, 즉 제 1 항원으로서의 ErbB-1 및 제 2 항원으로서의 c-Met 에 특이적이다.
본원에서 사용되는 용어 "단일특이적" 항체는 각각 동일한 항원의 동일한 에피토프에 결합하는 하나 이상의 결합 자리를 갖는 항체를 의미한다.
본 출원에서 사용되는 용어 "가" 는 항체 분자 중 명시된 수의 결합 자리의 존재를 의미한다. 따라서, 용어 "2가", "4가", 및 "6가" 는 각각 항체 분자 중 2 개의 결합 자리, 4 개의 결합 자리, 및 6 개의 결합 자리의 존재를 의미한다. 본 발명에 따른 이중특이적 항체는 "2가" 이상이고, "3가" 또는 "다가" (예를 들어, "4가" 또는 "6가") 일 수 있다.
본 발명의 항체의 항원-결합 자리는 항원에 대한 결합 자리의 친화도에 다른 정도로 기여하는 6 개의 상보성 결정 영역 (CDR) 을 함유할 수 있다. 3 개의 중쇄 가변 도메인 CDR (CDRH1, CDRH2 및 CDRH3) 및 3 개의 경쇄 가변 도메인 CDR (CDRL1, CDRL2 및 CDRL3) 이 존재한다. CDR 및 골격 영역 (FR) 의 범위는 이들 영역이 서열 중 변이성에 따라 규정된 아미노산 서열의 종합 데이타베이스와 비교함으로써 확인된다. 또한 본 발명의 범주에 포함되는 것은 더 적은 CDR 로 구성되는 (즉, 결합 특이성이 3, 4 또는 5 개의 CDR 로 결정되는) 기능적 항원 결합 자리이다. 예를 들어, 6 개의 CDR 의 하나의 완전한 세트 미만이 결합에 충분할 수 있다. 일부의 경우에, VH 또는 VL 도메인이 충분할 수 있다.
바람직한 구현예에서, 본 발명의 항체는 인간 기원의 하나 이상의 면역글로불린 클래스의 면역글로불린 불변 영역을 추가로 포함한다. 면역글로불린 클래스는 IgG, IgM, IgA, IgD, 및 IgE 아이소형 및, IgG 및 IgA 의 경우에, 그들의 서브유형을 포함한다. 바람직한 구현예에서, 본 발명의 항체는 IgG 유형 항체의 불변 도메인 구조를 갖지만, 4 개의 항원 결합 자리를 갖는다. 이는 예를 들어 c-Met 에 특이적으로 결합하는 1 개 (또는 2 개) 의 완전한 항원 결합 자리 (예를 들어, 단일쇄 Fab 단편 또는 단일쇄 Fv) 를 ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 전체 항체의 N- 또는 C-말단 중 또는 경쇄에 연결시켜서 3가 이중특이적 항체 (또는 4가 이중특이적 항체) 를 산출함으로써 달성된다. 대안적으로 예를 들어 EP 07024867.9, EP 07024864.6, EP 07024865.3 또는 [Ridgway, J.B., Protein Eng. 9 (1996) 617-621]; WO 96/027011; [Merchant, A.M., et al., Nature Biotech 16 (1998) 677-681]; [Atwell, S., et al., J. Mol. Biol. 270 (1997) 26-35] 및 EP 1870459A1 에 기술된 바와 같이, IgG 예컨대 면역글로불린 불변 영역을 포함하는 인간 ErbB-1 및 인간 c-Met 에 대한 이중특이적, 2가 항체가 사용될 수 있다.
본원에서 사용되는 용어 "모노클로날 항체" 또는 "모노클로날 항체 조성물" 은 단일 아미노산 조성의 항체 분자의 제제를 언급한다.
용어 "키메라 항체" 는 통상적으로 재조합 DNA 기술에 의해 제조되는, 하나의 공급원 또는 종으로부터의 가변 영역, 즉 결합 영역 및, 상이한 공급원 또는 종에서 유래된 불변 영역의 일부 이상을 포함하는 항체를 언급한다. 쥐과 가변 영역 및 인간 불변 영역을 포함하는 키메라 항체가 바람직하다. 본 발명에 포함되는 "키메라 항체" 의 다른 바람직한 형태는, 특히 C1q 결합 및/또는 Fc 수용체 (FcR) 결합에 관하여, 본 발명에 따른 특성을 생성하도록, 불변 영역이 원래의 항체로부터 개질 또는 변화된 것이다. 그러한 키메라 항체는 또한 "클래스-전환된 항체" 로도 언급된다. 키메라 항체는 면역글로불린 가변 영역을 인코딩하는 DNA 분절 및 면역글로불린 불변 영역을 인코딩하는 DNA 분절을 포함하는 발현된 면역글로불린 유전자의 산물이다. 키메라 항체의 제조 방법은 당업계에 잘 알려진 종래의 재조합 DNA 및 유전자 트랜스펙션 기술을 수반한다. 참조, 예를 들어, [Morrison, S.L., et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81 (1984) 6851-6855]; US 5,202,238 및 US 5,204,244.
용어 "인간화 항체" 는 그 안의 골격 또는 "상보성 결정 영역" (CDR) 이 부모 면역글로불린과 비교할 때 상이한 특이성의 면역글로불린의 CDR 을 포함하도록 개질된 항체를 언급한다. 바람직한 구현예에서, 쥐과 CDR 이 인간 항체의 골격 영역에 이식되어 "인간화 항체" 를 제조한다. 참조, 예를 들어, [Riechmann, L., et al., Nature 332 (1988) 323-327]; 및 [Neuberger, M.S., et al., Nature 314 (1985) 268-270]. 특히 바람직한 CDR 은 키메라 항체에 대해 상이 언급된 항원을 인지하는 서열을 나타내는 것에 상응한다. 본 발명에 포함되는 "인간화 항체" 의 다른 형태는 특히 C1q 결합 및/또는 Fc 수용체 (FcR) 결합에 관하여, 본 발명에 따른 특성을 생성하도록, 불변 영역이 원래의 항체로부터 추가로 개질 또는 변화된 것이다.
본원에서 사용되는 용어 "인간 항체" 는 인간 생식 계열 면역글로불린 서열에서 유래된 가변 및 불변 영역을 갖는 항체를 포함하는 것으로 의도된다. 인간 항체는 당업계에 잘 알려져 있다 (van Dijk, M.A., and van de Winkel, J.G., Curr. Opin. Chem. Biol. 5 (2001) 368-374). 인간 항체는 또한 면역화시 내인성 면역글로불린 생산의 부재 하에 인간 항체의 전체 목록 또는 선별물을 생성할 수 있는 트랜스제닉 동물 (예를 들어, 마우스) 에서 생산될 수 있다. 그러한 생식-계열 돌연변이체 마우스 중 인간 생식-계열 면역글로불린 유전자 배열의 전달은 항원 공격시 인간 항체의 생산을 초래할 수 있다 (참조, 예를 들어, Jakobovits, A., et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90 (1993) 2551-2555; Jakobovits, A., et al., Nature 362 (1993) 255-258; Bruggemann, M., et al., Year Immunol. 7 (1993) 33-40). 인간 항체는 또한 파지 디스플레이 라이브러리에서 생산될 수 있다 (Hoogenboom, H.R., and Winter, G.J. Mol. Biol. 227 (1992) 381-388; Marks, J.D., et al., J. Mol. Biol. 222 (1991) 581-597). 또한 Cole, S.P.C. 등 및 Boerner, P. 등의 기술이 인간 모노클로날 항체의 제조에 이용가능하다 (Cole, S.P.C., et al., Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy, Liss, A.L., (1985) 77-96; 및 Boerner, P., et al., J. Immunol. 147 (1991) 86-95). 본 발명에 따른 키메라 및 인간화 항체에 대해 이미 언급된 바와 같이 본원에서 사용되는 용어 "인간 항체" 는 또한, 예를 들어 "클래스 전환" 즉 Fc 부분의 변화 또는 돌연변이 (예를 들어, IgG1 로부터 IgG4 로 및/또는 IgG1/IgG4 돌연변이) 에 의해, 특히 C1q 결합 및/또는 FcR 결합에 관하여 본 발명에 따른 특성을 생성하도록 불변 영역이 개질된 항체를 포함한다.
본원에서 사용되는 용어 "재조합 인간 항체" 는 재조합 수단에 의해 제조, 발현, 창출 또는 단리되는 모든 인간 항체, 예컨대 인간 면역글로불린 유전자에 대해 트랜스제닉인 동물 (예를 들어, 마우스) 로부터 또는 숙주 세포 예컨대 NS0 또는 CHO 세포로부터 단리된 항체, 또는 숙주 세포에 트랜스펙션된 재조합 발현 벡터를 사용하여 발현되는 항체를 포함하는 것으로 의도된다. 그러한 재조합 인간 항체는 재배열된 형태의 가변 및 불변 영역을 갖는다. 본 발명에 따른 재조합 인간 항체는 생체내 체세포 초돌연변이에 적용되었다. 따라서, 재조합 항체의 VH 및 VL 영역의 아미노산 서열은 인간 생식 계열 VH 및 VL 서열에서 유래하고 이와 관련되지만, 생체내의 인간 항체 생식 계열 목록 안에는 자연적으로 존재하지 않을 수 있는 서열이다.
본원에서 사용되는 "가변 도메인" (경쇄 (VL) 의 가변 도메인, 중쇄 (VH) 의 가변 영역) 은 항체를 항원에 결합시키는데 직접 관여하는 경 및 중쇄의 각각의 쌍을 의미한다. 가변 인간 경 및 중쇄의 도메인은 동일한 일반적 구조를 갖고, 각각의 도메인은 3 개의 "과가변 영역" (또는 상보성 결정 영역, CDR) 에 의해 연결된, 서열이 광범위하게 보존된 4 개의 골격 (FR) 영역을 포함한다. 골격 영역은 β-병풍 구조를 취하고, CDR 은 루프를 형성하여 β-병풍 구조를 연결할 수 있다. 각 사슬 내의 CDR 은 골격 영역에 의해 3 차원 구조가 유지되고, 다른 사슬로부터의 CDR 과 함께 항원 결합 자리를 형성한다. 항체 중 및 경쇄 CDR3 영역은 본 발명에 따른 항체의 결합 특이성/친화도에서 특히 중요한 역할을 하므로, 본 발명의 추가의 목적을 제공한다.
본원에서 사용되는 용어 "과가변 영역" 또는 "항체의 항원 결합 부분 또는 항원 결합 자리" 는 항원-결합을 책임지는 항체의 아미노산 잔기를 언급한다. 과가변 영역은 "상보성 결정 영역" 또는 "CDR" 로부터의 아미노산 잔기를 포함한다. "골격" 또는 "FR" 영역은 본원에서 정의된 과가변 영역 잔기를 제외한 가변 도메인 영역이다. 그러므로, 항체의 경 및 중쇄는 N- 에서 C-말단까지 도메인 FR1, CDR1, FR2, CDR2, FR3, CDR3, 및 FR4 를 포함한다. 각각의 사슬 상의 CDR 은 그러한 골격 아미노산에 의해 분리된다. 특히, 중쇄의 CDR3 은 항원 결합에 가장 많이 기여하는 영역이다. CDR 및 FR 영역은 [Kabat, et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th ed., Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD (1991)] 의 표준 정의에 따라 결정된다.
본원에서 사용되는 용어 "결합" 또는 "특이적으로 결합" 은 시험관내 검정에서, 바람직하게는 정제된 야생형 항원에 의한 플라스몬 공명 검정 (BIAcore, GE-Healthcare Uppsala, Sweden) 에서 항원의 에피토프 (인간 ErbB-1 또는 인간 c-Met) 에 대한 항체의 결합을 언급한다. 결합의 친화도는 용어 ka (항체/항원 복합체로부터 항체의 연합에 대한 속도 상수), kD (해리 상수), 및 KD (kD/ka) 에 의해 정의된다. 결합 또는 특이적 결합은 10-8 mol/ℓ 이하, 바람직하게는 10-9 M 내지 10-13 mol/ℓ 의 결합 친화도 (KD) 를 의미한다. 따라서, 본 발명에 따른 이중특이적 <ErbB1-c-Met> 항체는 각각의 항원에 특이적으로 결합하고 항원에 대해 결합 친화도 (KD) 10-8 mol/ℓ 이하, 바람직하게는 10-9 M 내지 10-13 mol/ℓ 로 특이적이다.
FcγRIII 에 대한 항체의 결합은 BIAcore 검정 (GE-Healthcare Uppsala, Sweden) 에 의해 조사될 수 있다. 결합의 친화도는 용어 ka (항체/항원 복합체로부터 항체의 연합에 대한 속도 상수), kD (해리 상수), 및 KD (kD/ka) 에 의해 정의된다.
용어 "에피토프" 는 항체에 특이적으로 결합할 수 있는 임의의 폴리펩티드 결정인자를 포함한다. 특정 구현예예서, 에피토프 결정인자는 분자의 화학적 활성 표면기 예컨대 아미노산, 당 측쇄, 포스포릴, 또는 술포닐을 포함하고, 특정 구현예예서, 특이적 3차원 구조 특성, 및 또는 특이적 전하 특성을 가질 수 있다. 에피토프는 항체에 의해 결합되는 항원의 영역이다.
특정 구현예예서, 항체가 단백질 및/또는 거대분자의 복합 혼합물 중 그것의 표적 항원을 우선적으로 인지하는 경우에 항체가 항원에 특이적으로 결합하는 것으로 여겨진다.
본 출원에서 사용되는 용어 "불변 영역" 은 가변 영역을 제외한 항체의 도메인의 합을 의미한다. 불변 영역은 항원의 결합에 직접 관여하지는 않지만, 다양한 효과기 기능을 나타낸다. 중쇄의 불변 영역의 아미노산 서열에 따라, 항체는 클래스 IgA, IgD, IgE, IgG 및 IgM 으로 분류되고, 이중 다수는 서브클래스, 예컨대 IgG1, IgG2, IgG3, 및 IgG4, IgA1 및 IgA2 로 추가로 분류될 수 있다. 항체의 상이한 클래스에 해당하는 중쇄 불변 영역은 각각 α, δ, ε, γ, 및 μ 로 호칭된다. 모든 5 개의 항체 클래스에서 발견될 수 있는 경쇄 불변 영역은 κ (캅파) 및 λ (람다) 로 호칭된다. 불변 영역은 바람직하게는 인간 기원에서 유래된다.
본 출원에서 사용되는 용어 "인간 기원에서 유래된 불변 영역" 은 서브클래스 IgG1, IgG2, IgG3, 또는 IgG4 의 인간 항체의 불변 중쇄 영역 및/또는 불변 경쇄 캅파 또는 람다 영역을 의미한다. 그러한 불변 영역은 당업계에 잘 알려져 있고, 예를 들어 Kabat, E.A. 에 의해 기술되어 있다 (참조, 예를 들어 Johnson, G. and Wu, T.T., Nucleic Acids Res. 28 (2000) 214-218; Kabat, E.A., et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 72 (1975) 2785-2788).
하나의 구현예에서 본 발명에 따른 이중특이적 항체는 바람직하게는 인간 기원에서 유래된 IgG1 또는 IgG3 서브클래스의 (바람직하게는 IgG1 서브클래스의) 불변 영역을 포함한다. 하나의 구현예에서 본 발명에 따른 이중특이적 항체는 바람직하게는 인간 기원에서 유래된 IgG1 또는 IgG3 서브클래스의 (바람직하게는 IgG1 서브클래스의) Fc 부분을 포함한다.
IgG4 서브클래스의 항체는 감소된 Fc 수용체 (FcgRIIIa) 결합을 보이는 한편, 다른 IgG 서브클래스의 항체는 강한 결합을 보인다. 그러나 Pro238, Asp265, Asp270, Asn297 (Fc 탄수화물의 상실), Pro329, Leu234, Leu235, Gly236, Gly237, Ile253, Ser254, Lys288, Thr307, Gln311, Asn434, 및 His435 는, 변경되는 경우, 또한 감소된 Fc 수용체 결합을 제공하는 잔기이다 (Shields, R.L., et al., J. Biol. Chem. 276 (2001) 6591-6604; Lund, J., et al., FASEB J. 9 (1995) 115-119; Morgan, A., et al., Immunology 86 (1995) 319-324; EP 0 307 434).
하나의 구현예에서 본 발명에 따른 항체는 IgG1 항체에 비해 감소된 FcR 결합을 갖고, 전장 부모 항체는 PVA236 돌연변이를 함유하고/거나, S228, L234, L235 및/또는 D265 에서 돌연변이가 있는 IgG1 또는 IgG2 서브클래스의 또는 IgG4 서브클래스의 FcR 결합에 관한 것이다. 하나의 구현예에서 전장 부모 항체 내의 돌연변이는 S228P, L234A, L235A, L235E 및/또는 PVA236 이다. 또다른 구현예에서 전장 부모 항체 내의 돌연변이는 IgG4 S228P 내에 및 IgG1 L234A 및 L235A 내에 있다.
항체의 불변 영역은 ADCC (항체-의존적 세포-매개 세포독성) 및 CDC (보체-의존적 세포독성) 에 직접 관여한다. 보체 활성화 (CDC) 는 대부분의 IgG 항체 서브클래스의 불변 영역에 대한 보체 인자 C1q 의 결합에 의해 개시된다. 항체에 대한 C1q 의 결합은 소위 결합 자리에서의 규정된 단백질-단백질 상호작용에 의해 야기된다. 그러한 불변 영역 결합 자리는 당업계에 알려져 있고, 예를 들어 [Lukas, T., J., et al., J. Immunol. 127 (1981) 2555-2560]; [Brunhouse, R., and Cebra, J., J., Mol. Immunol. 16 (1979) 907-917]; [Burton, D., R., et al., Nature 288 (1980) 338-344]; [Thommesen, J., E., et al., Mol. Immunol. 37 (2000) 995-1004]; [Idusogie, E., E., et al., J. Immunol. 164 (2000) 4178-4184]; [Hezareh, M., et al., J. Virol. 75 (2001) 12161-12168]; [Morgan, A., et al., Immunology 86 (1995) 319-324]; 및 EP 0 307 434 에 기술되어 있다. 그러한 불변 영역 결합 자리는, 예를 들어, 아미노산 L234, L235, D270, N297, E318, K320, K322, P331, 및 P329 (Kabat 의 EU 인덱스에 따라 넘버링함) 에 의해 특징화된다.
용어 "항체-의존적 세포 세포독성 (ADCC)" 은 효과기 세포의 존재 하에 본 발명에 따른 항체에 의한 인간 표적 세포의 용해를 언급한다. ADCC 는 바람직하게는 효과기 세포 예컨대 새롭게 단리된 PBMC 또는 연막으로부터 정제된 효과기 세포, 예컨대 단핵구 또는 자연 살해 (NK) 세포 또는 영구적으로 성장하는 NK 세포주의 존재 하에 ErB-1 및 c-Met 발현 세포의 제제를 본 발명에 따른 항체로 처리함으로써 측정된다.
용어 "보체-의존적 세포독성 (CDC)" 은 대부분의 IgG 항체 서브클래스의 Fc 부분에 대한 보체 인자 C1q 의 결합에 의해 개시되는 과정이다. 항체에 대한 C1q 의 결합은 소위 결합 자리에서 규정된 단백질-단백질 상호작용에 의해 야기된다. 그러한 Fc 부분 결합 자리는 당업계에 알려져 있다 (상기 참조). 그러한 Fc 부분 결합 자리는, 예를 들어, 아미노산 L234, L235, D270, N297, E318, K320, K322, P331, 및 P329 (Kabat 의 EU 인덱스에 따라 넘버링함) 에 의해 특징화된다. 서브클래스 IgG1, IgG2, 및 IgG3 의 항체는 통상적으로 C1q 및 C3 결합을 포함하는 보체 활성화를 보이는 반면, IgG4 는 보체계를 활성화시키지 않고 C1q 및/또는 C3 에 결합하지 않는다.
모노클로날 항체의 세포-매개 효과기 기능은 [Umana, P., et al., Nature Biotechnol. 17 (1999) 176-180], 및 US 6,602,684 에 기술된 바와 같이 그의 올리고당 성분을 조작함으로써 증강될 수 있다. 가장 흔히 사용되는 치료적 항체인 IgG1 유형 항체는 각각의 CH2 도메인 내에 Asn297 에서 보존된 N-연결된 글리코실화 자리를 갖는 당단백질이다. Asn297 에 부착된 2 개의 복합 이중안테나 (biantennary) 올리고당은 CH2 도메인 사이에 파묻혀 있고, 폴리펩티드 백본과 광범위한 접촉을 이루고, 이의 존재는 항체가 효과기 기능 예컨대 항체 의존적 세포 세포독성 (ADCC) 을 매개하는데 필수적이다 (Lifely, M.R., et al., Glycobiology 5 (1995) 813-822; Jefferis, R., et al., Immunol. Rev. 163 (1998) 59-76; Wright, A., and Morrison, S.L., Trends Biotechnol. 15 (1997) 26-32). [Umana, P., et al. Nature Biotechnol. 17 (1999) 176-180] 및 WO 99/54342 는 중국 햄스터 난소 (CHO) 세포에서 이등분된 올리고당의 형성을 촉매하는 글리코실트랜스퍼라아제인 β(1,4)-N-아세틸글루코사미닐트랜스퍼라아제 III ("GnTIII") 의 과발현이 시험관내에서 항체의 ADCC 활성을 상당히 증가시킴을 밝혔다. Asn297 탄수화물의 조성의 변경 또는 이의 제거가 또한 FcγR 및 C1q 에 대한 결합에 영향을 미친다 (Umana, P., et al., Nature Biotechnol. 17 (1999) 176-180; Davies, J., et al., Biotechnol. Bioeng. 74 (2001) 288-294; Mimura, Y., et al., J. Biol. Chem. 276 (2001) 45539-45547; Radaev, S., et al., J. Biol. Chem. 276 (2001) 16478-16483; Shields, R.L., et al., J. Biol. Chem. 276 (2001) 6591-6604; Shields, R.L., et al., J. Biol. Chem. 277 (2002) 26733-26740; Simmons, L.C., et al., J. Immunol. Methods 263 (2002) 133-147).
푸코오스의 양을 감소시킴으로써 모노클로날 항체의 세포-매개 효과기 기능을 증강시키는 방법은 예를 들어 WO 2005/018572, WO 2006/116260, WO 2006/114700, WO 2004/065540, WO 2005/011735, WO 2005/027966, WO 1997/028267, US 2006/0134709, US 2005/0054048, US 2005/0152894, WO 2003/035835, WO 2000/061739, [Niwa, R., et al., J. Immunol. Methods 306 (2005) 151-160; Shinkawa, T., et al, J Biol Chem, 278 (2003) 3466-3473]; WO 03/055993 또는 US 2005/0249722 에 기술되어 있다.
본 발명의 하나의 구현예에서, 본 발명에 따른 이중특이적 항체는 Asn297 에서 당쇄로 글리코실화되어 (IgG1 또는 IgG3 서브클래스) 상기 당쇄 내의 푸코오스의 양이 65 % 이하가 된다 (Kabat 에 따라 넘버링함). 또다른 구현예에서 상기 당쇄 내의 푸코오스의 양은 5 % 내지 65 %, 바람직하게는 20 % 내지 40 % 이다. 본 발명에 따른 "Asn297" 은 Fc 영역 내의 위치 297 근처에 위치하는 아미노산 아스파라긴을 의미한다. 항체의 작은 서열 변이에 기초하여, Asn297 은 또한 위치 297 의 몇몇 아미노산 (통상적으로 ±3 이하) 상류 또는 하류에, 즉 위치 294 와 300 사이 위치할 수 있다.
인간 IgG1 또는 IgG3 의 글리코실화는 Asn297 에서 2 개 이하의 Gal 잔기로 끝나는 핵심 푸코실화된 이중안테나 복합 올리고당 글리코실화로서 일어날 수 있다. IgG1 또는 IgG3 서브클래스의 인간 불변 중쇄 영역이 [Kabat, E.A., et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD. (1991)], 및 [Bruggemann, M., et al., J. Exp. MEd. 166 (1987) 1351-1361; Love, T.W., et al., Methods Enzymol. 178 (1989) 515-527] 에 의해 상세히 보고되어 있다. 이들 구조는 말단 Gal 잔기의 양에 따라 G0, G1 (α-1,6- 또는 α-1,3-), 또는 G2 글리칸 잔기로 표시된다 (Raju, T.S., Bioprocess Int. 1 (2003) 44-53). 항체 Fc 부분의 CHO 유형 글리코실화가 예를 들어 [Routier, F.H., Glycoconjugate J. 14 (1997) 201-207] 에 의해 기술되어 있다. 비-당개질된 CHO 숙주 세포에서 재조합적으로 발현되는 항체는 통상적으로 Asn297 에서 85 % 이상의 양으로 푸코실화된다. 전장 부모 항체의 개질된 올리고당은 하이브리드 또는 복합일 수 있다. 바람직하게는 이등분된, 환원된/비-푸코실화된 올리고당은 하이브리드이다. 또다른 구현예에서, 이등분된, 환원된/비-푸코실화된 올리고당은 복합이다.
본 발명에 따르면 "푸코오스의 양" 은 MALDI-TOF 질량 분석법에 의해 측정되고 평균 값으로서 계산되는, Asn297 에 부착된 모든 당구조의 합 (예를 들어, 복합, 하이브리드 및 고 만노오스 구조) 과 관련되는, Asn297 에서 당쇄 내의 상기 당의 양을 의미한다. 푸코오스의 상대적 양은 MALDI-TOF 에 의해 N-글리코시다아제 F 처리된 샘플에서 동정되는 모든 당구조 (예를 들어, 각각, 복합, 하이브리드 및 올리고- 및 고-만노오스 구조) 와 관련되는 푸코오스-함유 구조의 백분율이다 (참조, 예를 들어, WO 2008/077546(A1)).
하나의 구현예는 WO 2005/044859, WO 2004/065540, WO2007/031875, [Umana, P., et al., Nature Biotechnol. 17 (1999) 176-180], WO 99/154342, WO 2005/018572, WO 2006/116260, WO 2006/114700, WO 2005/011735, WO 2005/027966, WO 97/028267, US 2006/0134709, US 2005/0054048, US 2005/0152894, WO 2003/035835 또는 WO 2000/061739 에 기술된 절차를 사용하는, Asn297 에서 당쇄로 글리코실화되어 상기 당쇄 내의 푸코오스의 양이 65 % 이하인 IgG1 또는 IgG3 서브클래스의 이중특이적 항체의 제조 방법이다.
하나의 구현예는 [Niwa, R., et al., J. Immunol. Methods 306 (2005) 151-160; Shinkawa, T. et al, J Biol Chem, 278 (2003) 3466-3473]; WO 03/055993 또는 US 2005/0249722 에 기술된 절차를 사용하는, Asn297 에서 당쇄로 글리코실화되어 상기 당쇄 내의 푸코오스의 양이 65 % 이하인 IgG1 또는 IgG3 서브클래스의 이중특이적 항체의 제조 방법이다.
이중특이적 항체 포맷
본 발명의 항체는 2 이상의 결합 자리를 갖고, 다중특이적, 바람직하게는 이중특이적이다. 즉, 2 초과의 결합 자리가 존재하는 (즉, 항체가 3가 또는 다가인) 경우에도 항체는 이중특이적일 수 있다. 본 발명의 이중특이적 항체는, 예를 들어, 다가 단일쇄 항체, 다이아바디 및 트리아바디 뿐만 아니라, 추가의 항원-결합 자리 (예를 들어, 단일쇄 Fv, VH 도메인 및/또는 VL 도메인, Fab, 또는 (Fab)2,) 가 하나 이상의 펩티드-링커를 통해 연결되어 있는 전장 항체의 불변 도메인 구조를 갖는 항체를 포함한다. 항체는 단일 종으로부터의 전장이거나, 키메라화 또는 인간화될 수 있다. 2 초과의 항원 결합 자리를 갖는 항체의 경우, 단백질이 2 가지 상이한 항원에 대한 결합 자리를 갖는 한, 일부 결합 자리는 동일할 수 있다. 즉, 제 1 결합 자리는 ErbB-1 에 특이적인 한면, 제 2 결합 자리는 c-Met 에 특이적이고, 그 반대도 마찬가지이다.
바람직한 구현예에서 본 발명에 따른 인간 ErbB-1 및 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 이중특이적 항체는 (바람직하게는 IgG1 또는 IgG3 서브클래스의) 항체의 Fc 영역을 포함한다.
2가 이중특이적 포맷
예를 들어 WO2009/080251, WO2009/080252, WO2009/080253 또는 [Ridgway, J.B., Protein Eng. 9 (1996) 617-621; WO 96/027011]; [Merchant, A.M., et al., Nature Biotech 16 (1998) 677-681]; [Atwell, S., et al., J. Mol. Biol. 270 (1997) 26-35] 및 EP 1870459A1 에 기술된 바와 같이 면역글로불린 불변 영역을 포함하는 인간 ErbB-1 및 인간 c-Met 에 대한 이중특이적, 2가 항체가 사용될 수 있다.
따라서 본 발명의 하나의 구현예에서 본 발명에 따른 이중특이적 <ErbB-1-c-Met> 항체는 하기를 포함하는 2가, 이중특이적 항체이다:
a) ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 전장 항체의 경쇄 및 중쇄; 및
b) 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 전장 항체의 경쇄 및 중쇄,
상기 불변 도메인 CL 및 CH1, 및/또는 가변 도메인 VL 및 VH 는 서로 대체됨.
본 발명의 또다른 구현예에서 본 발명에 따른 이중특이적 <ErbB-1-c-Met> 항체는 하기를 포함하는 2가, 이중특이적 항체이다:
a) 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 전장 항체의 경쇄 및 중쇄; 및
b) ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 전장 항체의 경쇄 및 중쇄,
상기 불변 도메인 CL 및 CH1, 및/또는 가변 도메인 VL 및 VH 는 서로 대체됨.
하기 "놉-인투-홀 (Knob-into-holes)" 기술에 의한 예시적 도해적 구조에 대해 도 2a-c 참조.
그러한 이종이합체 2가, 이중특이적 항-ErbB-1/항-c-Met 항체의 수율을 향상시키기 위해, 예를 들어 WO 96/027011, [Ridgway, J., B., et al., Protein Eng 9 (1996) 617-621]; 및 [Merchant, A., M., et al., Nat Biotechnol 16 (1998) 677-681] 에서 여러 실시예로 상세히 기술되어 있는 놉-인투-홀 기술에 의해 상기 전장 항체의 CH3 도메인이 변경될 수 있다. 이러한 방법에서 2 개의 CH3 도메인의 상호작용 표면이 변경되어 이들 2 개의 CH3 도메인을 함유하는 2 개의 중쇄의 이종이합체화를 증가시킨다. (2 개의 중쇄의) 2 개의 CH3 도메인 중 하나는 "놉" 일 수 있고, 한편 다른 하나는 "홀" 이다. 이황 다리의 도입은 이종이합체를 안정화시키고 (Merchant, A., M., et al., Nature Biotech 16 (1998) 677-681; Atwell, S., et al., J. Mol. Biol. 270 (1997) 26-35), 수율을 증가시킨다.
따라서 본 발명의 하나의 양상에서 상기 2가, 이중특이적 항체는 추가로 하기에 의해 특징화된다:
하나의 중쇄의 CH3 도메인 및 다른 중쇄의 CH3 도메인은 각각 항체 CH3 도메인들 사이의 원래의 경계면을 포함하는 경계면에서 만나고;
상기 상기 경계면은 2가, 이중특이적 항체의 형성을 촉진하도록 변경되고, 상기 변경은 하기로 특징화되고:
a) 하나의 중쇄의 CH3 도메인이 변경되어,
2가, 이중특이적 항체 내의 다른 중쇄의 CH3 도메인의 원래의 경계면과 만나는 하나의 중쇄의 CH3 도메인의 원래의 경계면 내에서,
아미노산 잔기가 더 큰 측쇄 부피를 갖는 아미노산 잔기로 대체되어, 하나의 중쇄의 CH3 도메인의 경계면 내에 다른 중쇄의 CH3 도메인의 경계면 내의 공동에 위치가능한 돌기를 생성하고,
b) 다른 중쇄의 CH3 도메인이 변경되어,
2가, 이중특이적 항체 내에서 제 1 CH3 도메인의 원래의 경계면과 만나는 제 2 CH3 도메인의 원래의 경계면 내에서
아미노산 잔기가 더 작은 측쇄 부피를 갖는 아미노산 잔기로 대체되어, 제 2 CH3 도메인의 경계면 내에 제 1 CH3 도메인의 경계면 내의 돌기가 위치가능한 공동을 생성함.
바람직하게는 더 큰 측쇄 부피를 갖는 상기 아미노산 잔기는 아르기닌 (R), 페닐알라닌 (F), 티로신 (Y), 트립토판 (W) 으로 이루어지는 군으로부터 선택된다.
바람직하게는 더 작은 측쇄 부피를 갖는 상기 아미노산 잔기는 알라닌 (A), 세린 (S), 트레오닌 (T), 발린 (V) 으로 이루어지는 군으롭터 선택된다.
본 발명의 하나의 양상에서 2 개의 CH3 도메인 사이에 이황 다리가 형성될 수 있도록 2 개의 CH3 도메인은 각각의 CH3 도메인의 상응하는 위치에서 아미노산으로서 시스테인 (C) 의 도입에 의해 추가로 변경된다.
바람직한 구현예에서, 상기 2가, 이중특이적 항체는 "놉 사슬" 의 CH3 도메인 내에 T366W 돌연변이 및 "홀 사슬" 의 CH3 도메인 내에 T366S, L368A, Y407V 돌연변이를 포함한다. 예를 들어 "놉 사슬" 의 CH3 도메인 내로 Y349C 돌연변이를 그리고 "홀 사슬" 의 CH3 도메인 내로 E356C 돌연변이 또는 S354C 돌연변이를 도입함으로써 CH3 도메인 사이에 부가적인 사슬간 이황 다리가 또한 사용될 수 있다 (Merchant, A.M, et al., Nature Biotech 16 (1998) 677-681). 따라서 또다른 바람직한 구현예에서, 상기 2가, 이중특이적 항체는 2 개의 CH3 도메인 중 하나 내에 Y349C, T366W 돌연변이 및 2 개의 CH3 도메인 중 다른 하나 내에 E356C, T366S, L368A, Y407V 돌연변이를 포함하거나, 상기 2가, 이중특이적 항체는 2 개의 CH3 도메인 중 하나 내에 Y349C, T366W 돌연변이 및 2 개의 CH3 도메인 중 다른 하나 내에 S354C, T366S, L368A, Y407V 돌연변이를 포함한다 (하나의 CH3 도메인 내의 부가적 Y349C 돌연변이 및 다른 CH3 도메인 내의 부가적 E356C 또는 S354C 돌연변이가 사슬간 이황 다리를 형성함) (항상 Kabat 의 EU 인덱스에 따라 넘버링함). 그러나 또한 EP 1870459A1 에 의해 기술된 바와 같은 다른 놉-인-홀 기술이 대안적으로 또는 부가적으로 사용될 수 있다. 상기 2가, 이중특이적 항체에 대한 바람직한 예는 R409D; "놉 사슬" 의 CH3 도메인 내의 K370E 돌연변이 및 D399K; "홀 사슬" 의 CH3 도메인 내의 E357K 돌연변이이다 (항상 Kabat 의 EU 인덱스에 따라 넘버링함).
또다른 바람직한 구현예에서 상기 2가, 이중특이적 항체는 "놉 사슬" 의 CH3 도메인 내에 T366W 돌연변이 및 "홀 사슬" 의 CH3 도메인 내에 T366S, L368A, Y407V 돌연변이 및 부가적으로 R409D; "놉 사슬" 의 CH3 도메인 내에 K370E 돌연변이 및 D399K; "홀 사슬" 의 CH3 도메인 내에 E357K 돌연변이를 포함한다.
또다른 바람직한 구현예에서 상기 2가, 이중특이적 항체는 2 개의 CH3 도메인 중 하나 내에 Y349C, T366W 돌연변이 및 2 개의 CH3 도메인 중 다른 하나 내에 S354C, T366S, L368A, Y407V 돌연변이를 포함하거나, 상기 2가, 이중특이적 항체는 2 개의 CH3 도메인 중 하나 내에 Y349C, T366W 돌연변이 및 2 개의 CH3 도메인 중 다른 하나 내에 S354C, T366S, L368A, Y407V 돌연변이 및 부가적으로 R409D; "놉 사슬" 의 CH3 도메인 내에 K370E 돌연변이 및 D399K; "홀 사슬" 의 CH3 도메인 내에 E357K 돌연변이를 포함한다.
3가 이중특이적 포맷
본 발명의 또다른 바람직한 양상은 하기를 포함하는 3가, 이중특이적 항체이다:
a) 2 개의 항체 중쇄 및 2 개의 항체 경쇄로 이루어지는 인간 ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 전장 항체; 및
b) 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 1 개의 단일쇄 Fab 단편,
상기 b) 에서의 상기 단일쇄 Fab 단편은 상기 전장 항체의 중 또는 경쇄의 C- 또는 N- 말단에서 펩티드 연결기를 통해 a) 에서의 상기 전장 항체에 융합됨.
하기 "놉-인투-홀" 기술에 의한 예시적 도해적 구조에 대해 도 5a 참조.
본 발명의 또다른 바람직한 양상은 하기를 포함하는 3가, 이중특이적 항체이다:
a) 2 개의 항체 중쇄 및 2 개의 항체 경쇄로 이루어지는 인간 ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 전장 항체; 및
b) 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 1 개의 단일쇄 Fv 단편,
여기서 b) 에서의 상기 단일쇄 Fv 단편은 상기 전장 항체의 중 또는 경쇄의 C- 또는 N- 말단에서 펩티드 연결기를 통해 a) 에서의 상기 전장 항체에 융합됨.
하기 "놉-인투-홀" 기술에 의한 예시적 도해적 구조에 대해 도 5b 참조.
하나의 바람직한 구현예에서 인간 c-Met 에 결합하는 상기 단일쇄 Fab 또는 Fv 단편은 상기 전장 항체의 중쇄의 C-말단에서 펩티드 연결기를 통해 상기 전장 항체에 융합된다.
본 발명의 또다른 바람직한 양상은 하기를 포함하는 3가, 이중특이적 항체이다:
a) 2 개의 항체 중쇄 및 2 개의 항체 경쇄로 이루어지는 인간 ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 전장 항체;
b) 하기로 이루어지는 폴리펩티드
ba) 항체 중쇄 가변 도메인 (VH), 또는
bb) 항체 중쇄 가변 도메인 (VH) 및 항체 불변 도메인 1 (CH1),
상기 상기 폴리펩티드는 VH 도메인의 N-말단이 상기 전장 항체의 2 개의 중쇄 중 하나의 C-말단에 펩티드 연결기를 통해 융합됨;
c) 하기로 이루어지는 폴리펩티드
ca) 항체 경쇄 가변 도메인 (VL), 또는
cb) 항체 경쇄 가변 도메인 (VL) 및 항체 경쇄 불변 도메인 (CL);
여기서 상기 폴리펩티드는 VL 도메인의 N-말단이 펩티드 연결기를 통해 상기 전장 항체의 2 개의 중쇄 중 다른 하나의 C-말단에 융함됨;
여기서 b) 에서의 폴리펩티드의 항체 중쇄 가변 도메인 (VH) 및 c) 에서의 폴리펩티드의 항체 경쇄 가변 도메인 (VL) 은 함께 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 항원-결합 자리를 형성함.
바람직하게는 b) 및 c) 에서의 상기 펩티드 연결기는 동일하고, 25 개 이상의 아미노산, 바람직하게는 30 내지 50 개의 아미노산의 펩티드이다.
예시적 도해적 구조에 대해 도 3a-c 참조.
임의로 b) 에서의 폴리펩티드의 항체 중쇄 가변 도메인 (VH) 및 c) 에서의 폴리펩티드의 항체 경쇄 가변 도메인 (VL) 은 하기 위치 사이에 이황 결합의 도입에 의해 사슬간 이황 다리를 통해 연결되고 안정화된다:
i) 중쇄 가변 도메인 위치 44 와 경쇄 가변 도메인 위치 100 사이,
ii) 중쇄 가변 도메인 위치 105 와 경쇄 가변 도메인 위치 43 사이, 또는
iii) 중쇄 가변 도메인 위치 101 과 경쇄 가변 도메인 위치 100 사이 (항상 Kabat 의 EU 인덱스에 따라 넘버링함).
안정화를 위한 비자연적 이황 다리를 도입하는 기술은 예를 들어 WO 94/029350, [Rajagopal, et al., Prot. Engin. 10 (1997) 1453-59; Kobayashi, H., et al., Nuclear Medicine & Biology 25 (1998) 387-393]; 또는 [Schmidt, M., et al., Oncogene 18 (1999) 1711-1721] 에 기술되어 있다. 하나의 구현예에서 b) 및 c) 에서의 폴리펩티드의 가변 도메인 사이의 임의적 이황 결합은 중쇄 가변 도메인 위치 44 와 경쇄 가변 도메인 위치 100 사이이다. 하나의 구현예에서 b) 및 c) 에서의 폴리펩티드의 가변 도메인 사이의 임의적 이황 결합은 중쇄 가변 도메인 위치 105 와 경쇄 가변 도메인 위치 43 사이이다 (항상 Kabat 의 EU 인덱스에 따라 넘버링함). 하나의 구현예에서 단일쇄 Fab 단편의 가변 도메인 VH 와 VL 사이에 상기 임의적 이황 안정화가 없는 3가, 이중특이적 항체가 바람직하다.
단일쇄 Fab, Fv 단편의 중쇄 중 하나로의 융합에 의해 (도 5a 또는 5b) 또는 상이한 폴리펩티드의 전장 항체의 2 개의 중쇄로의 융합에 의해 (도 3a-c) 이종이합체, 3가 이중특이적 항체가 생성된다. 그러한 이종이합체 3가, 이중특이적 항-ErbB-1/항-c-Met 항체의 수율을 향상시키기 위해, 예를 들어 WO 96/027011, [Ridgway, J.B., et al., Protein Eng 9 (1996) 617-621]; 및 [Merchant, A.M., et al., Nat Biotechnol 16 (1998) 677-681] 에서 여러 실시예로 상세히 기술되어 있는 "놉-인투-홀" 기술에 의해 상기 전장 항체의 CH3 도메인이 변경될 수 있다. 이러한 방법에서 2 개의 CH3 도메인의 상호작용 표면이 변경되어 이들 2 개의 CH3 도메인을 함유하는 2 개의 중쇄의 이종이합체화를 증가시킨다. (2 개의 중쇄의) 2 개의 CH3 도메인 각각은 "놉" 일 수 있고, 한편 다른 하나는 "홀" 이다. 이황 다리의 도입은 이종이합체를 안정화시키고 (Merchant, A.M., et al., Nature Biotech 16 (1998) 677-681; Atwell, S., et al. J. Mol. Biol. 270 (1997) 26-35), 수율을 증가시킨다.
따라서 본 발명의 하나의 양상에서 상기 3가, 이중특이적 항체는 추가로 하기를 특징으로 한다:
전장 항체의 하나의 중쇄의 CH3 도메인 및 전장 항체의 다른 중쇄의 CH3 도메인은 각각 항체 CH3 도메인 사이의 원래의 경계면을 포함하는 경계면에서 만나고;
상기 경계면은 2가, 이중특이적 항체의 형성을 촉진하도록 변경되고, 상기 변경은 하기를 특징으로 하고:
a) 하나의 중쇄의 CH3 도메인이 변경되어,
2가, 이중특이적 항체 내의 다른 중쇄의 CH3 도메인의 원래의 경계면과 만나는 하나의 중쇄의 CH3 도메인의 원래의 경계면 내에서,
아미노산 잔기가 더 큰 측쇄 부피를 갖는 아미노산 잔기로 대체되어, 하나의 중쇄의 CH3 도메인 내에 다른 중쇄의 CH3 도메인의 경계면 내의 공동에 위치가능한 돌기를 생성하고
b) 다른 중쇄의 CH3 도메인이 변경되어,
3가, 이중특이적 항체 내의 제 1 CH3 도메인의 원래의 경계면과 만나는 제 2 CH3 도메인의 원래의 경계면 내에서
아미노산 잔기가 더 작은 측쇄 부피를 갖는 아미노산 잔기로 대체되어, 제 2 CH3 도메인의 경계면 내에 제 1 CH3 도메인의 경계면 내의 돌기가 위치가능한 공동을 생성함.
바람직하게는, 더 큰 측쇄 부피를 갖는 상기 아미노산 잔기는 아르기닌 (R), 페닐알라닌 (F), 티로신 (Y), 트립토판 (W) 으로 이루어지는 군에서 선택된다.
바람직하게는, 더 작은 측쇄 부피를 갖는 상기 아미노산 잔기는 알라닌 (A), 세린 (S), 트레오닌 (T), 발린 (V) 으로 이루어지는 군에서 선택된다.
본 발명의 하나의 양상에서 2 개의 CH3 도메인은 두 CH3 도메인 사이에 이황 다리가 형성될 수 있도록 각각의 CH3 도메인의 상응하는 위치에서 시스테인 (C) 을 아미노산으로서 도입함으로써 추가로 변경된다.
바람직한 구현예에서, 상기 3가, 이중특이적 항체는 "놉 사슬" 의 CH3 도메인 내에 T366W 돌연변이, 및 "홀 사슬" 의 CH3 도메인 내에 T366S, L368A, Y407V 돌연변이를 포함한다. 예를 들어 "놉 사슬" 의 CH3 도메인 내로 Y349C 돌연변이를, "홀 사슬" 의 CH3 도메인 내로 E356C 돌연변이 또는 S354C 돌연변이를 도입함으로써 CH3 도메인 사이의 추가적인 사슬간 이황 다리를 또한 사용할 수 있다 (Merchant, A.M, et al., Nature Biotech 16 (1998) 677-681). 따라서 또다른 바람직한 구현예에서, 상기 3가, 이중특이적 항체는 2 개의 CH3 도메인 중 하나 내에 Y349C, T366W 돌연변이, 2 개의 CH3 도메인 중 다른 하나 내에 E356C, T366S, L368A, Y407V 돌연변이를 포함하거나, 상기 3가, 이중특이적 항체는 2 개의 CH3 도메인 중 하나 내에 Y349C, T366W 돌연변이, 2 개의 CH3 도메인 중 다른 하나 내에 S354C, T366S, L368A, Y407V 돌연변이를 포함한다 (하나의 CH3 도메인 내의 추가적인 Y349C 돌연변이 및 다른 CH3 도메인 내의 추가적인 E356C 또는 S354C 돌연변이는 사슬간 이황 다리를 형성함) (항상 Kabat 의 EU 인덱스에 따라 넘버링함). 그러나, EP 1870459A1 에 의해 기재된 바와 같은 다른 놉-인-홀 기술이 대안적으로 또는 추가적으로 사용될 수 있다. 상기 3가, 이중특이적 항체에 대한 바람직한 예는 R409D; "놉 사슬" 의 CH3 도메인 내의 K370E 돌연변이 및 D399K; "홀 사슬" 의 CH3 도메인 내의 E357K 돌연변이이다 (항상 Kabat 의 EU 인덱스에 따라 넘버링함).
또다른 바람직한 구현예에서 상기 3가, 이중특이적 항체는 "놉 사슬" 의 CH3 도메인 내에 T366W 돌연변이, "홀 사슬" 의 CH3 도메인 내에 T366S, L368A, Y407V 돌연변이, 및 추가적으로 R409D; "놉 사슬" 의 CH3 도메인 내에 K370E 돌연변이 및 D399K; "홀 사슬" 의 CH3 도메인 내에 E357K 돌연변이를 포함한다.
또다른 바람직한 구현예에서 상기 3가, 이중특이적 항체는 2 개의 CH3 도메인 중 하나 내에 Y349C, T366W 돌연변이, 및 2 개의 CH3 도메인 중 다른 하나 내에 S354C, T366S, L368A, Y407V 돌연변이를 포함하거나, 상기 3가, 이중특이적 항체는 2 개의 CH3 도메인 중 하나 내에 Y349C, T366W 돌연변이, 및 2 개의 CH3 도메인 중 다른 하나 내에 S354C, T366S, L368A, Y407V 돌연변이, 및 추가적으로 R409D; "놉 사슬" 의 CH3 도메인 내에 K370E 돌연변이 및 D399K; "홀 사슬" 의 CH3 도메인 내에 E357K 돌연변이를 포함한다.
본 발명의 또다른 구현예는 하기를 포함하는 3가, 이중특이적 항체이다:
a) 하기로 이루어지는, 인간 ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 전장 항체:
aa) N-말단에서 C-말단 방향으로 항체 중쇄 가변 도메인 (VH), 항체 불변 중쇄 도메인 1 (CH1), 항체 힌지 영역 (HR), 항체 중쇄 불변 도메인 2 (CH2) 및 항체 중쇄 불변 도메인 3 (CH3) 으로 이루어지는 2 개의 항체 중쇄; 및
ab) N-말단에서 C-말단 방향으로 항체 경쇄 가변 도메인 (VL) 및 항체 경쇄 불변 도메인 (CL) (VL-CL) 으로 이루어지는 2 개의 항체 경쇄; 및
b) 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 하나의 단일쇄 Fab 단편,
상기 단일쇄 Fab 단편은 항체 중쇄 가변 도메인 (VH) 및 항체 불변 도메인 1 (CH1), 항체 경쇄 가변 도메인 (VL), 항체 경쇄 불변 도메인 (CL) 및 링커로 이루어지며, 상기 항체 도메인 및 링커는 N-말단에서 C-말단 방향으로 하기 순서 중 하나를 가짐:
ba) VH-CH1-링커-VL-CL, 또는 bb) VL-CL-링커-VH-CH1;
(상기 링커는 30 개 이상의 아미노산, 바람직하게는 32 개 내지 50 개 아미노산의 펩티드임);
상기 b) 의 상기 단일쇄 Fab 단편은 전장 항체의 중쇄 또는 경쇄의 C- 또는 N-말단 (바람직하게는 중쇄의 C-말단) 에서 펩티드 연결기를 통해 a) 의 상기 전장 항체에 융합됨 (상기 펩티드 연결기는 5 개 이상의 아미노산, 바람직하게는 10 개 내지 50 개 아미노산의 펩티드임).
상기 구현예에서, 바람직하게는 3가, 이중특이적 항체는 2 개의 CH3 도메인 중 하나 내에 T366W 돌연변이, 및 2 개의 CH3 도메인 중 다른 하나 내에 T366S, L368A, Y407V 돌연변이를 포함하며, 더욱 바람직하게는 3가, 이중특이적 항체는 2 개의 CH3 도메인 중 하나 내에 Y349C, T366W 돌연변이, 및 2 개의 CH3 도메인 중 다른 하나 내에 S354C (또는 E356C), T366S, L368A, Y407V 돌연변이를 포함한다. 임의로는 상기 구현예에서 3가, 이중특이적 항체는 R409D; "놉 사슬" 의 CH3 도메인 내에 K370E 돌연변이 및 D399K; "홀 사슬" 의 CH3 도메인 내에 E357K 돌연변이를 포함한다.
본 발명의 또다른 구현예는 하기를 포함하는 3가, 이중특이적 항체이다:
a) 하기로 이루어지는, 인간 ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 전장 항체:
aa) N-말단에서 C-말단 방향으로 항체 중쇄 가변 도메인 (VH), 항체 불변 중쇄 도메인 1 (CH1), 항체 힌지 영역 (HR), 항체 중쇄 불변 도메인 2 (CH2) 및 항체 중쇄 불변 도메인 3 (CH3) 으로 이루어지는 2 개의 항체 중쇄; 및
ab) N-말단에서 C-말단 방향으로 항체 경쇄 가변 도메인 (VL) 및 항체 경쇄 불변 도메인 (CL) (VL-CL) 으로 이루어지는 2 개의 항체 경쇄; 및
b) 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 하나의 단일쇄 Fv 단편,
상기 b) 의 상기 단일쇄 Fv 단편은 전장 항체의 중쇄 또는 경쇄의 C- 또는 N-말단 (바람직하게는 중쇄의 C-말단) 에서 펩티드 연결기를 통해 a) 의 상기 전장 항체에 융합되고,
상기 펩티드 연결기는 5 개 이상의 아미노산, 바람직하게는 10 개 내지 50 개 아미노산의 펩티드임.
상기 구현예에서, 바람직하게는 3가, 이중특이적 항체는 2 개의 CH3 도메인 중 하나 내에 T366W 돌연변이, 및 2 개의 CH3 도메인 중 다른 하나 내에 T366S, L368A, Y407V 돌연변이를 포함하며, 더욱 바람직하게는 3가, 이중특이적 항체는 2 개의 CH3 도메인 중 하나 내에 Y349C, T366W 돌연변이, 및 2 개의 CH3 도메인 중 다른 하나 내에 S354C (또는 E356C), T366S, L368A, Y407V 돌연변이를 포함한다. 임의로는 상기 구현예에서 3가, 이중특이적 항체는 R409D; "놉 사슬" 의 CH3 도메인 내에 K370E 돌연변이 및 D399K; "홀 사슬" 의 CH3 도메인 내에 E357K 돌연변이를 포함한다.
따라서 바람직한 구현예는 하기를 포함하는 3가, 이중특이적 항체이다:
a) 하기로 이루어지는, 인간 ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 전장 항체:
aa) N-말단에서 C-말단 방향으로 항체 중쇄 가변 도메인 (VH), 항체 불변 중쇄 도메인 1 (CH1), 항체 힌지 영역 (HR), 항체 중쇄 불변 도메인 2 (CH2) 및 항체 중쇄 불변 도메인 3 (CH3) 으로 이루어지는 2 개의 항체 중쇄; 및
ab) N-말단에서 C-말단 방향으로 항체 경쇄 가변 도메인 (VL) 및 항체 경쇄 불변 도메인 (CL) (VL-CL) 으로 이루어지는 2 개의 항체 경쇄; 및
b) 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 하나의 단일쇄 Fv 단편,
상기 b) 의 상기 단일쇄 Fv 단편은 전장 항체의 중쇄의 C-말단에서 펩티드 연결기를 통해 a) 의 상기 전장 항체에 융합되고 (2 개의 항체 중쇄-단일쇄 Fv 융합 펩티드를 야기함),
상기 펩티드 연결기는 5 개 이상 아미노산의 펩티드임.
본 발명의 또다른 구현예는 하기를 포함하는 3가, 이중특이적 항체이다:
a) 하기로 이루어지는, 인간 ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 전장 항체:
aa) N-말단에서 C-말단 방향의 항체 중쇄 가변 도메인 (VH), 항체 불변 중쇄 도메인 1 (CH1), 항체 힌지 영역 (HR), 항체 중쇄 불변 도메인 2 (CH2) 및 항체 중쇄 불변 도메인 3 (CH3) 으로 이루어지는 2 개의 항체 중쇄; 및
ab) N-말단에서 C-말단 방향의 항체 경쇄 가변 도메인 (VL) 및 항체 경쇄 불변 도메인 (CL) 으로 이루어지는 2 개의 항체 경쇄; 및
b) 하기로 이루어지는 폴리펩티드:
ba) 항체 중쇄 가변 도메인 (VH); 또는
bb) 항체 중쇄 가변 도메인 (VH) 및 항체 불변 도메인 1 (CH1),
상기 폴리펩티드는 VH 도메인의 N-말단이 펩티드 연결기를 통해 상기 전장 항체의 2 개의 중쇄 중 하나의 C-말단에 융합되고 (항체 중쇄-VH 융합 펩티드를 야기함), 상기 펩티드 연결기는 5 개 이상의 아미노산, 바람직하게는 25 내지 50 개 아미노산의 펩티드임,
c) 하기로 이루어지는 폴리펩티드:
ca) 항체 경쇄 가변 도메인 (VL), 또는
cb) 항체 경쇄 가변 도메인 (VL) 및 항체 경쇄 불변 도메인 (CL);
상기 폴리펩티드는 VL 도메인의 N-말단이 펩티드 연결기를 통해 상기 전장 항체의 2 개 중쇄 중 다른 하나의 C-말단에 융합되고 (항체 중쇄-VL 융합 펩티드를 야기함);
상기 펩티드 연결기는 b) 의 펩티드 연결기와 동일함;
상기 b) 의 폴리펩티드의 항체 중쇄 가변 도메인 (VH) 및 c) 의 폴리펩티드의 항체 경쇄 가변 도메인 (VL) 은 함께 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 항원-결합 자리를 형성함.
상기 구현예에서, 바람직하게는 3가, 이중특이적 항체는 2 개의 CH3 도메인 중 하나 내에 T366W 돌연변이, 및 2 개의 CH3 도메인 중 다른 하나 내에 T366S, L368A, Y407V 돌연변이를 포함하며, 더욱 바람직하게는 3가, 이중특이적 항체는 2 개의 CH3 도메인 중 하나 내에 Y349C, T366W 돌연변이, 및 2 개의 CH3 도메인 중 다른 하나 내에 S354C (또는 E356C), T366S, L368A, Y407V 돌연변이를 포함한다. 임의로는 상기 구현예에서 3가, 이중특이적 항체는 R409D; "놉 사슬" 의 CH3 도메인 내에 K370E 돌연변이 및 D399K; "홀 사슬" 의 CH3 도메인 내에 E357K 돌연변이를 포함한다.
본 발명의 또다른 양상에서 본 발명에 따른 3가, 이중특이적 항체는 하기를 포함한다:
a) 2 개의 항체 중쇄 VH-CH1-HR-CH2-CH3 및 2 개의 항체 경쇄 VL-CL 로 이루어지는 인간 ErbB-1 에 결합하는 전장 항체;
(바람직하게는 2 개의 CH3 도메인 중 하나는 Y349C, T366W 돌연변이, 및 2 개의 CH3 도메인 중 다른 하나는 S354C (또는 E356C), T366S, L368A, Y407V 돌연변이를 포함함);
b) 하기로 이루어지는 폴리펩티드:
ba) 항체 중쇄 가변 도메인 (VH); 또는
bb) 항체 중쇄 가변 도메인 (VH) 및 항체 불변 도메인 1 (CH1),
상기 폴리펩티드는 VH 도메인의 N-말단이 펩티드 연결기를 통해 상기 전장 항체의 2 개 중쇄 중 하나의 C-말단에 융합됨,
c) 하기로 이루어지는 폴리펩티드
ca) 항체 경쇄 가변 도메인 (VL), 또는
cb) 항체 경쇄 가변 도메인 (VL) 및 항체 경쇄 불변 도메인 (CL);
상기 폴리펩티드는 VL 도메인의 N-말단이 펩티드 연결기를 통해 상기 전장 항체의 2 개 중쇄 중 다른 하나의 C-말단에 융합됨;
상기 b) 의 폴리펩티드의 항체 중쇄 가변 도메인 (VH) 및 c) 의 폴리펩티드의 항체 경쇄 가변 도메인 (VL) 은 함께 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 항원-결합 자리를 형성함.
4가 이중특이적 포맷
하나의 구현예에서 본 발명에 따른 다중특이적 항체는 4가이며, 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 항원-결합 자리(들)이 c-Met 이합체화를 저해한다 (예를 들어 WO 2009/007427 에 기재된 바와 같음).
본 발명의 하나의 구현예에서 상기 항체는 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 2 개의 항원-결합 자리, 및 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 2 개의 항원-결합 자리를 포함하는, 인간 ErbB-1 및 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 4가, 이중특이적 항체이고, 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 상기 항원-결합 자리는 c-Met 이합체화를 저해한다 (예를 들어 WO 2009/007427 에서 기재된 바와 같음).
따라서, 본 발명의 또다른 양상은 하기를 포함하는 4가, 이중특이적 항체이다:
a) 2 개의 항체 중쇄 및 2 개의 항체 경쇄로 이루어지는 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 전장 항체; 및
b) ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 2 개의 동일한 단일쇄 Fab 단편,
상기 b) 의 상기 단일쇄 Fab 단편은 상기 전장 항체의 중쇄 또는 경쇄의 C- 또는 N-말단에서 펩티드 연결기를 통해 a) 의 상기 전장 항체에 융합됨.
따라서, 본 발명의 또다른 양상은 하기를 포함하는 4가, 이중특이적 항체이다:
a) 2 개의 항체 중쇄 및 2 개의 항체 경쇄로 이루어지는 인간 ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 전장 항체; 및
b) 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 2 개의 동일한 단일쇄 Fab 단편,
상기 b) 의 상기 단일쇄 Fab 단편은 상기 전장 항체의 중쇄 또는 경쇄의 C- 또는 N-말단에서 펩티드 연결기를 통해 a) 의 상기 전장 항체에 융합됨.
예시적 도해적 구조에 대해 도 6a 참조.
따라서, 본 발명의 또다른 양상은 하기를 포함하는 4가, 이중특이적 항체이다:
a) 2 개의 항체 중쇄 및 2 개의 항체 경쇄로 이루어지는 ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 전장 항체; 및
b) 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 2 개의 동일한 단일쇄 Fv 단편,
상기 b) 의 상기 단일쇄 Fv 단편은 상기 전장 항체의 중쇄 또는 경쇄의 C- 또는 N-말단에서 펩티드 연결기를 통해 a) 의 상기 전장 항체에 융합됨).
따라서, 본 발명의 또다른 양상은 하기를 포함하는 4가, 이중특이적 항체이다:
a) 2 개의 항체 중쇄 및 2 개의 항체 경쇄로 이루어지는 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 전장 항체; 및
b) 인간 ErbBc-2 에 특이적으로 결합하는 2 개의 동일한 단일쇄 Fv 단편,
상기 b) 의 상기 단일쇄 Fv 단편은 상기 전장 항체의 중쇄 또는 경쇄의 C- 또는 N-말단에서 펩티드 연결기를 통해 a) 의 상기 전장 항체에 융합됨.
예시적 도해적 구조에 대해 도 6b 참조.
하나의 바람직한 구현예에서, 인간 c-Met 또는 인간 ErbB-1 에 결합하는 상기 단일쇄 Fab 또는 Fv 단편은 상기 전장 항체의 중쇄의 C-말단에서 펩티드 연결기를 통해 상기 전장 항체에 융합된다.
본 발명의 다른 구현예는 하기를 포함하는 4가, 이중특이적 항체이며:
a) 하기로 이루어지는, 인간 ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 전장 항체:
aa) N-말단에서 C-말단 방향으로 항체 중쇄 가변 도메인 (VH), 항체 중쇄 불변 도메인 1 (CH1), 항체 힌지 영역 (HR), 항체 중쇄 불변 도메인 2 (CH2) 및 항체 중쇄 불변 도메인 3 (CH3) 으로 이루어지는 2 개의 동일한 항체 중쇄; 및
ab) N-말단에서 C-말단 방향으로 항체 경쇄 가변 도메인 (VL) 및 항체 경쇄 불변 도메인 (CL) (VL-CL) 으로 이루어지는 2 개의 동일한 항체 경쇄; 및
b) 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 2 개의 단일쇄 Fab 단편,
상기 단일쇄 Fab 단편은 항체 중쇄 가변 도메인 (VH) 및 항체 불변 도메인 1 (CH1), 항체 경쇄 가변 도메인 (VL), 항체 경쇄 불변 도메인 (CL) 및 링커로 이루어지고, 상기 항체 도메인 및 상기 링커는 N-말단에서 C-말단 방향으로 하기 순서 중 하나를 가짐:
ba) VH-CH1-링커-VL-CL, 또는 bb) VL-CL-링커-VH-CH1;
상기 링커는 30 개 이상의 아미노산 펩티드, 바람직하게는 32 내지 50 개의 아미노산 펩티드임;
상기 b) 의 상기 단일쇄 Fab 단편은 상기 전장 항체의 중쇄 또는 경쇄의 C- 또는 N-말단에서 펩티드 연결기를 통해 a) 의 전장 항체에 융합되고;
상기 펩티드 연결기는 5 개 이상의 아미노산 펩티드, 바람직하게는 10 내지 50 개의 아미노산 펩티드임.
3가 또는 4가 포맷에서 사용되는 용어 "전장 항체" 는 2 개의 "전장 항체 중쇄" 및 2 개의 "전장 항체 경쇄" 로 이루어지는 항체를 의미한다 (도 1 참조). "전장 항체 중쇄" 는 N-말단에서 C-말단 방향으로 항체 중쇄 가변 도메인 (VH), 항체 중쇄 불변 도메인 1 (CH1), 항체 힌지 영역 (HR), 항체 중쇄 불변 도메인 2 (CH2), 및 항체 중쇄 불변 도메인 3 (CH3) (약어: VH-CH1-HR-CH2-CH3); 및 임의로는 항체 중쇄 불변 도메인 4 (CH4) (IgE 서브클래스 항체의 경우) 로 이루어지는 폴리펩티드이다. 바람직하게는, "전장 항체 중쇄" 는 N-말단에서 C-말단 방향으로 VH, CH1, HR, CH2 및 CH3 로 이루어지는 폴리펩티드이다. "전장 항체 경쇄" 는 N-말단에서 C-말단 방향으로 항체 경쇄 가변 도메인 (VL) 및 항체 경쇄 불변 도메인 (CL) (약어: VL-CL) 으로 이루어지는 폴리펩티드이다. 항체 경쇄 불변 도메인 (CL) 은 κ(카파) 또는 λ(람다) 일 수 있다. 2 개의 전장 항체 사슬은 CL 도메인 및 CH1 도메인 사이 및 전장 항체 중쇄의 힌지 영역 사이의 폴리펩티드-간 이황 결합을 통해 함께 연결된다. 전형적인 전장 항체의 예로는 IgG (예를 들어 IgG1 및 IgG2), IgM, IgA, IgD 및 IgE 와 같은 자연적 항체가 있다. 본 발명에 따른 전장 항체는 단일 종 (예를 들어 인간) 으로부터의 것일 수 있거나, 또는 이들은 키메라화 또는 인간화 항체일 수 있다. 본 발명에 따른 전장 항체는 한쌍의 VH 및 VL 에 의해 각각 형성되는 2 개의 항원 결합 자리를 포함하고, 이는 둘 다 동일한 항원에 특이적으로 결합한다. 상기 전장 항체의 중쇄 또는 경쇄의 C-말단은 상기 중쇄 또는 경쇄의 C-말단에서의 마지막 아미노산을 의미한다. 상기 전장 항체 중쇄 또는 경쇄의 N-말단은 상기 중쇄 또는 경쇄의 N-말단에서의 마지막 아미노산을 의미한다.
본원에 사용되는 용어 "펩티드 연결기" 는 바람직하게는 합성 기점의, 아미노산 서열을 갖는 펩티드를 의미한다. 발명에 따른 이들 펩티드 연결기는 단일쇄 Fab 단편을 전장 항체의 C- 또는 N-말단에 융합시켜 본 발명에 따른 다중특이적 항체를 형성하기 위해 사용된다. 바람직하게는, b) 의 상기 펩티드 연결기는 5 개 이상의 아미노산 길이, 바람직하게는 5 내지 100 개의 아미노산 길이, 더욱 바람직하게는 10 내지 50 개의 아미노산 길이의 아미노산 서열을 갖는 펩티드이다. 하나의 구현예에서, 상기 펩티드 연결기는 (GxS)n 또는 (GxS)nGm 이며, 이때 G = 글리신, S = 세린, 및 (x = 3, n = 3, 4, 5 또는 6, 및 m = 0, 1, 2 또는 3) 또는 (x = 4, n = 2, 3, 4 또는 5 및 m = 0, 1, 2 또는 3), 바람직하게는 x = 4 및 n = 2 또는 3, 더욱 바람직하게는 x = 4, n = 2 이다. 바람직하게는, VH 또는 VH-CH1 폴리펩티드 및 VL 또는 VL-C L 폴리펩티드 (도 7a 내지 7c) 가 2 개의 동일한 펩티드 연결기를 통해 전장 항체의 C-말단에 융합되는 3가, 이중특이적 항체에서, 상기 펩티드 연결기는 25 개 이상의 아미노산 펩티드, 바람직하게는 30 내지 50 개의 아미노산 펩티드이며, 더욱 바람직하게는 상기 펩티드 연결기는 (GxS)n 또는 (GxS)nGm 이고, 이때 G = 글리신, S = 세린, 및 (x = 3, n = 6, 7 또는 8, 및 m = 0, 1, 2 또는 3) 또는 (x = 4, n = 5, 6, 또는 7 및 m = 0, 1, 2 또는 3), 바람직하게는 x = 4 및 n = 5, 6, 7 이다.
"단일쇄 Fab 단편" (도 2a 참조) 은 항체 중쇄 가변 도메인 (VH), 항체 불변 도메인 1 (CH1), 항체 경쇄 가변 도메인 (VL), 항체 경쇄 불변 도메인 (CL) 및 링커로 이루어지는 폴리펩티드이고, 이때 상기 항체 도메인 및 상기 링커는 N-말단에서 C-말단 방향으로 하기 순서 중 하나를 갖는다: a) VH-CH1-링커-VL-CL, b) VL-CL-링커-VH-CH1, c) VH-CL-링커-VL-CH1 또는 d) VL-CH1-링커-VH-CL; 이때 상기 링커는 30 개 이상의 아미노산, 바람직하게는 32 내지 50 개의 아미노산 폴리펩티드임. 상기 단일쇄 Fab 단편 [a) VH-CH1-링커-VL-CL, b) VL-CL-링커-VH-CH1, c) VH-CL-링커-VL-CH1 및 d) VL-CH1-링커-VH-CL] 은 CL 도메인과 CH1 도메인 사이의 자연적 이황 결합을 통해 안정화된다. 용어 "N-말단" 은 N-말단의 마지막 아미노산을 의미한다. 용어 "C-말단" 은 C-말단의 마지막 아미노산을 의미한다.
용어 "링커" 는 본 발명 내에서 단일쇄 Fab 단편과 연계되어 사용되고, 바람직하게는 합성 기점의 아미노산 서열을 갖는 펩티드를 의미한다. 본 발명에 따른 이들 펩티드는 a) VH-CH1 에서 VL-CL 로, b) VL-CL 에서 VH-CH1 로, c) VH-CL 에서 VL-CH1 로, 또는 d) VL-CH1 에서 VH-CL 로 연결시켜 본 발명에 따른 하기의 단일쇄 Fab 단편을 형성하는데 사용된다: a) VH-CH1-링커-VL-CL, b) VL-CL-링커-VH-CH1, c) VH-CL-링커-VL-CH1 또는 d) VL-CH1-링커-VH-CL. 단일쇄 Fab 단편 내의 상기 링커는 30 개 이상의 아미노산 길이, 바람직하게는 32 내지 50 개 아미노산 길이의 아미노산 서열을 갖는 펩티드이다. 하나의 구현예에서, 상기 링커는 (GxS)n (이때, G = 글리신, S = 세린, (x = 3, n= 8, 9 또는 10 및, m = 0, 1, 2 또는 3) 또는 (x = 4 및 n = 6, 7 또는 8 및 m = 0, 1, 2 또는 3), 바람직하게는 x = 4, n = 6 또는 7 및 m = 0, 1, 2 또는 3, 더욱 바람직하게는 x = 4, n = 7 및 m = 2 임) 이다. 하나의 구현예에서, 상기 링커는 (G4S)6G2 이다.
바람직한 구현예에서, 상기 단일쇄 Fab 단편에서 상기 항체 도메인 및 상기 링커는 N-말단에서 C-말단 방향으로 하기 순서 중 하나를 갖는다:
a) VH-CH1-링커-VL-CL, 또는 b) VL-CL-링커-VH-CH1, 더욱 바람직하게는 VL-CL-링커-VH-CH1.
또다른 바람직한 구현예에서, 상기 단일쇄 Fab 단편에서 상기 항체 도메인 및 상기 링커는 N-말단에서 C-말단 방향으로 하기 순서 중 하나를 갖는다:
a) VH-CL-링커-VL-CH1 또는 b) VL-CH1-링커-VH-CL.
임의로는, 상기 단일쇄 Fab 단편에서, CL-도메인과 CH1 도메인 사이의 자연적 이황 결합 외에도, 항체 중쇄 가변 도메인 (VH) 및 항체 경쇄 가변 도메인 (VL) 또한 하기 위치 사이의 이황 결합의 도입에 의해 이황 안정화된다:
i) 중쇄 가변 도메인 위치 44 와 경쇄 가변 도메인 위치 100 사이,
ii) 중쇄 가변 도메인 위치 105 와 경쇄 가변 도메인 위치 43 사이, 또는
iii) 중쇄 가변 도메인 위치 101 과 경쇄 가변 도메인 위치 100 사이 (항상 Kabat 의 EU 인덱스에 따라 넘버링함).
이러한 추가적인 단일쇄 Fab 단편의 이황 안정화는 단일쇄 Fab 단편의 가변 도메인 VH 와 VL 사이의 이황 결합의 도입에 의해 달성된다. 단일쇄 Fv 에 대한 안정화를 위한 비-자연적 이황 다리를 도입하는 기술은 예를 들어 WO 94/029350, [Rajagopal, V., et al., Prot. Engin. (1997) 1453-59]; [Kobayashi, H., et al., Nuclear Medicine & Biology, Vol. 25, (1998) 387-393]; 또는 [Schmidt, M., et al., Oncogene (1999) 18, 1711-1721] 에 기재되어 있다. 하나의 구현예에서, 본 발명에 따른 항체에 포함되는 단일쇄 Fab 단편의 가변 도메인 사이의 임의의 이황 결합은 중쇄 가변 도메인 위치 44 와 경쇄 가변 도메인 위치 100 사이이다. 하나의 구현예에서, 본 발명에 따른 항체에 포함되는 단일쇄 Fab 단편의 가변 도메인 사이의 임의의 이황 결합은 중쇄 가변 도메인 위치 105 와 경쇄 가변 도메인 위치 43 사이이다 (항상 Kabat 의 EU 인덱스에 따라 넘버링함).
하나의 구현예에서, 단일쇄 Fab 단편의 가변 도메인 VH 및 VL 사이의 상기 임의적 이황 안정화가 부재하는 단일쇄 Fab 단편이 바람직하다.
"단일쇄 Fv 단편" (도 2b 참조) 은 항체 중쇄 가변 도메인 (VH), 항체 경쇄 가변 도메인 (VL), 및 단일-사슬-Fv-링커로 이루어지는 폴리펩티드이며, 이때 상기 항체 도메인 및 상기 단일-사슬-Fv-링커 중 하나는 N-말단에서 C-말단 방향으로 하기 순서 중 하나를 갖는다: a) VH-단일-사슬-Fv-링커-VL, b) VL-단일-사슬-Fv-링커-VH; 바람직하게는 a) VH-단일-사슬-Fv-링커-VL 이고, 이때 상기 단일-사슬-Fv-링커는 15 개 이상의 아미노산 길이, 하나의 구현예에서는 20 개 이상의 아미노산 길이의 아미노산 서열을 갖는 폴리펩티드이다. 용어 "N-말단" 은 N-말단의 마지막 아미노산을 나타내고, 용어 "C-말단" 은 C-말단의 마지막 아미노산을 나타낸다.
단일쇄 Fv 단편 내에 사용되는 용어 "단일-사슬-Fv-링커" 는 바람직하게는 합성 기점의 아미노산 서열을 갖는 펩티드를 의미한다. 상기 단일-사슬-Fv-링커는 15 개 이상의 아미노산 길이, 하나의 구현예에서는 20 개 이상의 아미노산 길이, 바람직하게는 15 내지 30 개의 아미노산 길이의 아미노산 서열을 갖는 펩티드이다. 하나의 구현예에서, 상기 단일-사슬-링커는 (GxS)n (이때, G = 글리신, S = 세린, (x = 3 및 n = 4, 5 또는 6) 또는 (x = 4 및 n = 3, 4, 5 또는 6), 바람직하게는 x = 4, n = 3, 4 또는 5, 더욱 바람직하게는 x = 4, n = 3 또는 4 임) 이다. 하나의 구현예에서, 상기 단일-사슬-Fv-링커는 (G4S)3 또는 (G4S)4 이다.
더욱이, 상기 단일쇄 Fv 단편은 바람직하게는 이황 안정화된다. 단일쇄 항체의 이러한 추가적인 이황 안정화는 단일쇄 항체의 가변 도메인 사이의 이황 결합의 도입에 의해 달성되고, 예를 들어 WO 94/029350, [Rajagopal, V., et al., Prot. Engin. 10 (1997) 1453-59]; [Kobayashi, H., et al., Nuclear Medicine & Biology, Vol. 25 (1998) 387-393]; 또는 [Schmidt, M., et al., Oncogene 18 (1999) 1711 -1721] 에 기재되어 있다.
이황 안정화된 단일쇄 Fv 단편의 하나의 구현예에서, 본 발명에 따른 항체에 포함되는 단일쇄 Fv 단편의 가변 도메인 사이의 이황 결합은 하기로부터 선택되는 각 단일쇄 Fv 에 대해 독립적이다:
i) 중쇄 가변 도메인 위치 44 와 경쇄 가변 도메인 위치 100 사이,
ii) 중쇄 가변 도메인 위치 105 와 경쇄 가변 도메인 위치 43 사이, 또는
iii) 중쇄 가변 도메인 위치 101 과 경쇄 가변 도메인 위치 100 사이.
하나의 구현예에서, 본 발명에 따른 항체에 포함되는 단일쇄 Fv 단편의 가변 도메인 사이의 이황 결합은 중쇄 가변 도메인 위치 44 와 경쇄 가변 도메인 위치 100 사이이다.
하나의 구현예에서 본 발명에 따른 이중특이적 Her1/c-Met 항체는 HGF 의 부재 하에 A431 (ATCC No. CRL-1555) 암 세포 증식을 30% 이상 저해한다 (48 시간 후 측정됨, 실시예 7a 참조).
하나의 구현예에서 본 발명에 따른 이중특이적 Her1/c-Met 항체는 HGF 의 부재 하에 A431 (ATCC No. CRL-1555) 암 세포 증식을 30% 이상 저해한다 (48 시간 후 측정됨, 실시예 7b 참조).
본 발명에 따른 항체는 재조합 수단에 의해 생성된다. 따라서, 본 발명의 한 양상은 본 발명에 따른 항체를 인코딩하는 핵산이고, 추가적인 양상은 본 발명에 따른 항체를 인코딩하는 상기 핵산을 포함하는 세포이다. 재조합 생산 방법은 당업계에 널리 알려져 있고, 항체가 후속적으로 단리되고 통상적으로는 약학적으로 허용가능한 순도로 정제되는 원핵 및 진핵 세포에서의 단백질 발현을 포함한다. 숙주 세포에서 상기 언급된 바와 같이 항체의 발현을 위해서는, 개질된 경쇄 및 중쇄 각각을 인코딩하는 핵산이 표준 방법으로 발현 벡터에 삽입된다. 발현은 CHO 세포, NS0 세포, SP2/0 세포, HEK293 세포, COS 세포, PER.C6 세포, 효모 또는 대장균 (E. coli) 세포와 같은 적절한 원핵 또는 진핵 숙주 세포에서 수행되며, 항체는 세포로부터 회수된다 (용해 후 상청액 또는 세포). 항체의 재조합 생산의 일반적 방법은 당업계에 잘 알려져 있고 예를 들어 [Makrides, S.C., Protein Expr. Purif. 17 (1999) 183-202]; [Geisse, S., et al., Protein Expr. Purif. 8 (1996) 271-282]; 및 [Kaufman, R.J., Mol. Biotechnol. 16 (2000) 151-161]; [Werner, R.G., Drug Res. 48 (1998) 870-880] 에 기재되어 있다.
이중특이적 항체는 단백질 A-세파로오스, 히드록실아파타이트 크로마토그래피, 겔 전기영동, 투석 또는 친화성 크로마토그래피와 같은 통상적 면역글로불린 정제 절차에 의해 배양 배지로부터 적합하게 분리된다. 단일클론 항체를 인코딩하는 DNA 및 RNA는 통상적 절차를 사용하여 용이하게 단리되고 서열결정화된다. 하이브리도마 세포는 이러한 DNA 및 RNA의 원천으로서 역할할 수 있다. 단리되고 나면, DNA는 발현 벡터에 삽입될 수 있고, 이는 이후 면역글로불린 단백질을 생성하지 않는 HEK 293 세포, CHO 세포 또는 골수종 세포와 같은 숙주 세포에 트랜스펙션되어, 숙주 세포에서 재조합 단일클론 항체가 합성된다.
적절한 뉴클레오티드 변화를 항체 DNA에 도입하거나, 또는 뉴클레오티드를 합성하여 이중특이적 항체의 아미노산 서열 변이체 (또는 돌연변이체) 를 제조한다. 이러한 개질이 수행될 수 있으나, 예를 들어 상기 기재된 바와 같이 오직 매우 한정된 범위에서만 수행될 수 있다. 예를 들어, 개질은 IgG 아이소형 및 항원 결합과 같은 상기 언급한 항체 특징을 변경시키지 않으나, 재조합 생성 수율, 단백질 안정성 또는 정제 촉진을 개선시킬 수 있다.
본 발명에 사용되는 용어 "숙주 세포" 는 본 발명에 따른 항체를 생성하도록 조작될 수 있는 세포계의 임의의 종류를 나타낸다. 하나의 구현예에서, HEK 세포 또는 CHO 세포는 숙주 세포로서 사용된다. 본원에서 사용되는 바와 같이, 표현 "세포", "세포주" 및 "세포 배양물"은 호환되게 사용되며 상기 모든 지정물은 자손을 포함한다. 따라서, 단어 "형질전환체" 및 "형질전환된 세포"는 1 차 대상 세포, 및 이동의 수를 고려하지 않고 그로부터 유래된 배양물을 포함한다. 또한, 계획적 또는 부주의 돌연변이로 인해 모든 자손이 DNA 함량에 있어서 정확히 동일하지 않을 수 있다는 것이 이해된다. 본래 형질전환된 세포에서 스크리닝되는 바와 동일한 기능 또는 생물학적 활성을 갖는 변이체 자손이 포함된다.
NS0 세포에서의 발현은, 예를 들어 [Barnes, L.M., et al., Cytotechnology 32 (2000) 109-123]; 및 [Barnes, L.M., et al., Biotech. Bioeng. 73 (2001) 261-270] 에 의해 기재된다. 일시적 발현은, 예를 들어 [Durocher, Y., et al., Nucl. Acids. Res. 30 (2002) E9] 에 의해 기재된다. 가변 도메인의 클로닝은 [Orlandi, R., et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86 (1989) 3833-3837]; [Carter, P., et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89 (1992) 4285-4289]; 및 [Norderhaug, L., et al., J. Immunol. Methods 204 (1997) 77-87] 에 의해 기재된다. 바람직한 일시적 발현 시스템 (HEK 293) 은 [Schlaeger, E.-J., and Christensen, K., in Cytotechnology 30 (1999) 71-83] 및 [Schlaeger, E.-J., in J. Immunol. Methods 194 (1996) 191-199] 에 의해 기재된다.
원핵 생물에 적합한 조절 서열은 예를 들어 프로모터, 임의로는 오퍼레이터 서열, 및 리보솜 결합 자리를 포함한다. 진핵 생물 세포는 프로모터, 인핸서 및 폴리아데닐화 신호를 이용하는 것으로 알려져 있다.
핵산은 또 다른 핵산 서열과의 기능적 관계에 놓이는 경우 "작동적으로 연결된다". 예를 들어, 폴리펩티드의 분비에 참여하는 예비단백질로서 발현된다면 예비서열 또는 분비 리더에 대한 DNA 는 폴리펩티드에 대한 DNA 에 작동적으로 연결되고; 서열의 전사에 영향을 준다면 프로모터 또는 인핸서는 코딩 서열에 작동적으로 연결되거나; 또는 번역이 촉진되도록 배치된다면 리보솜 결합 자리는 코딩 서열에 작동적으로 연결된다. 일반적으로, "작동적으로 연결되는" 은 연결되는 DNA 서열이 연속적이고, 분비 리더의 경우 연속적이고 판독 프레임 내에 있는 것을 의미한다. 그러나 인핸서는 연속적일 필요가 없다. 연결은 통상적 제한 자리에서의 라이게이션에 의해 성취된다. 이러한 위치가 존재하지 않는다면, 합성 올리고뉴클레오티드 어댑터 또는 링커가 통상적 실행에 따라 사용된다.
세포 성분 또는 기타 오염물 (예를 들어, 기타 세포 핵산 또는 단백질) 을 제거하기 위해, 알칼리/SDS 처리, CsCl 밴딩, 컬럼 크로마토그래피, 아가로오스 겔 전기영동 및 기타 당업계에 잘 알려진 방법을 포함하는 표준 기술로써 항체 정제를 수행한다. 문헌 [Ausubel, F., et al., ed., Current Protocols in Molecular Biology, Greene Publishing and Wiley Interscience, New York (1987)] 을 참조한다. 상이한 방법이 수립되어 있고 예를 들어 하기에 널리 사용된다: 단백질 정제, 예컨대 미생물 단백질과의 친화성 크로마토그래피 (예를 들어, 단백질 A 또는 단백질 G 친화성 크로마토그래피), 이온 교환 크로마토그래피 (예를 들어, 양이온 교환 (카르복시메틸 수지), 이온 교환 (아미노 에틸 수지) 및 혼합-모드 교환), 친황성 흡착 (예를 들어, 베타-머캅토에탄올 및 기타 SH 리간드와), 소수성 상호작용 또는 방향족 흡착 크로마토그래피 (예를 들어, 페닐-세파로오스, 아자-아레노필릭 수지, 또는 m-아미노페닐보론산과), 금속 킬레이트 친화성 크로마토그래피 (예를 들어, Ni(II)- 및 Cu(II)-친화도 물질과), 크기 배제 크로마토그래피, 및 전기영동 방법 (예컨대 겔 전기영동, 모세관 전기영동) (Vijayalakshmi, M.A., Appl. Biochem. Biotech. 75 (1998) 93-102).
본원에서 사용되는 바와 같이, 표현 "세포", "세포주" 및 "세포 배양물" 은 호환되게 사용되며 상기 모든 지정물은 자손을 포함한다. 따라서, 단어 "형질전환체" 및 "형질전환된 세포" 는 1 차 대상 세포, 및 이동의 수를 고려하지 않고 그로부터 유래된 배양물을 포함한다. 또한, 계획적 또는 부주의 돌연변이로 인해 모든 자손이 DNA 함량에 있어서 정확히 동일하지 않을 수 있다는 것이 이해된다. 본래 형질전환된 세포에서 스크리닝되는 바와 동일한 기능 또는 생물학적 활성을 갖는 변이체 자손이 포함된다. 별개의 지정물이 의도되는 경우, 이는 문맥으로부터 명백할 것이다.
본원에서 사용되는 바와 같은 용어 "형질전환" 은 벡터/핵산을 숙주 세포 내로 이동시키는 방법을 나타낸다. 강력한 세포 벽 방해물이 없는 세포가 숙주 세포로서 사용된다면, 예를 들어 [Graham, F.L., and van der Eb, A.J., Virology 52 (1973) 456-467] 에 기재된 바와 같이 인산 칼슘 침전법에 의해 트랜스펙션을 실행한다. 그러나 핵 주입, 또는 원형질체 융합에 의한 것과 같은, 세포 내로 DNA 를 도입하기 위한 다른 방법이 또한 사용될 수 있다. 원핵 세포 또는 실질적인 세포벽 구조를 포함하는 세포가 사용된다면, 예를 들어 트랜스펙션의 한 방법은 [Cohen, S. N, et al., PNAS. 69 (1972) 2110-2114] 에서 기재된 바와 같은 염화 칼슘을 사용하는 칼슘 처리법이다.
본원에서 사용되는 바와 같은 "발현" 은, 핵산이 mRNA 로 전사되는 방법 및/또는 전사된 mRNA (또한 전사체로서 나타냄) 가 이후 펩티드, 폴리펩티드 또는 단백질로 번역되는 방법을 나타낸다. 전사체 및 인코딩된 폴리펩티드를 총체적으로 유전자 생성물로서 나타낸다. 폴리뉴클레오티드가 게놈 DNA 에서 유래한다면, 진핵 세포에서의 발현은 mRNA 의 스플라이싱 (splicing) 을 포함할 수 있다.
"벡터" 는 핵산 분자, 특히 삽입된 핵산 분자를 숙주 세포에 및/또는 숙주 세포 사이에 이동시키는 자체-스플라이싱하는 핵산 분자이다. 상기 용어는, 주로 DNA 또는 RNA 를 세포에 삽입 (예를 들어 염색체 통합) 하는 기능을 하는 벡터, 주로 DNA 또는 RNA 를 복제하는 기능을 하는 복제 벡터, 및 DNA 또는 RNA 의 전사 및/또는 번역을 위한 기능을 하는 발현 벡터를 포함한다. 기재한 바와 같은 기능 중 하나 이상을 제공하는 벡터가 또한 포함된다.
"발현 벡터" 는 적절한 숙주 세포에 도입되는 경우 폴리펩티드로 전사 및 번역될 수 있는 폴리뉴클레오티드이다. "발현 시스템" 은 통상 원하는 발현 생성물이 수득되도록 기능할 수 있는 발현 벡터를 포함하는 적합한 숙주 세포를 나타낸다.
약학 조성물
본 발명의 한 양상은 본 발명에 따른 항체를 포함하는 약학 조성물이다. 본 발명의 또다른 양상은 약학 조성물을 제조하기 위한 본 발명에 따른 항체의 용도이다. 본 발명의 추가적인 양상은 본 발명에 따른 항체를 포함하는 약학 조성물의 제조 방법이다. 또다른 양상에서, 본 발명은 약학 담체와 함께 제형화된, 본 발명에 따른 항체를 함유하는 조성물 (예를 들어, 약학 조성물) 을 제공한다.
본 발명의 하나의 구현예는 암 치료를 위한 본 발명에 따른 이중특이적 항체이다.
본 발명의 또다른 양상은 암 치료를 위한 상기 약학 조성물이다.
본 발명의 또다른 양상은 암 치료를 위한 약제의 제조를 위한 본 발명에 따른 항체의 용도이다.
본 발명의 또다른 양상은 치료를 필요로 하는 환자에게 본 발명에 따른 항체를 투여함으로써 암 환자를 치료하는 방법이다.
본원에 사용된 바와 같이, "약학 담체" 는 생리적으로 융화가능한 용매, 분산 매질, 코팅제, 항균 및 항진균제, 등장성 및 흡수 지연제 등을 포함한다. 바람직하게는, 담체는 정맥내, 근내, 피하, 비경구, 척추 또는 표피 투여 (예를 들어, 주사 또는 주입에 의함) 에 적합하다.
본 발명의 조성물은 당업계에 알려진 다양한 방법으로 투여될 수 있다. 당업자에게 숙지된 바와 같이, 투여 경로 및/또는 방식은 원하는 결과에 따라 다양할 것이다. 본 발명의 화합물을 특정 투여 경로로 투여하기 위해, 상기 화합물을 이의 불활성화를 방지하기 위한 물질과 공동 투여하거나, 상기 화합물을 이로 코팅하는 것이 필요할 수 있다. 예를 들어, 화합물은 적절한 담체, 예를 들어 리포좀 또는 희석제 중에서 대상에게 투여될 수 있다. 약학적으로 허용가능한 희석제는 염수 및 완충 수용액을 포함한다. 약학 담체는 무균 주사 용액 또는 분산액의 즉석 제조를 위한 무균 수용액 또는 분산액 및 무균 분말을 포함한다. 약학적으로 활성 물질에 대한 그러한 매질 및 작용제가 당업계에 알려져 있다.
본원에서 사용되는 "비경구 투여" 및 "비경구적으로 투여되는" 이란 어구는 소화관내 투여 및 국소 투여 외의 투여 방식 (통상적으로는 주사에 의한 투여) 을 의미하는 것이고, 정맥내, 근내, 동맥내, 경막내, 관절낭내, 안와내, 심장내, 피내, 복강내, 경기관내, 피하, 표피하, 관절내, 피막하, 지주막하, 척추내, 경막외 및 흉골내 주사 및 주입을 포함하나, 이로써 한정되지 않는다.
본원에 사용되는 용어 암은 증식성 질환을 지칭하고, 예컨대 림프종, 림프구 백혈병, 폐암, 비-소세포 폐 (NSCL) 암, 세기관지 폐포암, 뼈암, 췌장암, 피부암, 두경부암, 피부 또는 안구내 흑색종, 자궁암, 난소암, 직장암, 항문 부위암, 위암 (stomach cancer, gastric cancer), 결장암, 유방암, 자궁암, 난관의 암종, 자궁내막 암종, 자궁경부 암종, 질암종, 음문암종, 호치킨병 (Hodgkin's Disease), 식도암, 소장암, 내분비계암, 갑상샘암, 부갑상샘암, 부신암, 연조직 육종, 요도암, 음경암, 전립선암, 방광암, 신장암 또는 요관암, 콩팥 세포암종, 신우 암종, 중피종, 간세포암, 담낭암, 중추신경계 (CNS) 신생물, 척추축 종양, 뇌간 교종, 다형교모세포종, 별아교세포종, 신경집종, 뇌실막세포종, 수모세포종, 수막종, 편평세포암종, 뇌하수체샘종 및 유잉 (Ewings) 육종 (상기 암의 임의의 난치성 형태 또는 상기 암 하나 이상의 조합을 포함) 이 있다.
본 발명의 다른 양상은 항-혈관형성제로서 본 발명에 따른 이중특이적 항체 또는 약학 조성물이다. 그러한 항-혈관형성제는 암, 특히 고형 종양 및 기타 혈관 질환의 치료를 위해 사용될 수 있다.
본 발명의 하나의 구현예는 혈관 질환의 치료를 위한 본 발명에 따른 이중특이적 항체이다.
본 발명의 또다른 양상은 혈관 질환 치료용 약제의 제조를 위한 본 발명에 따른 항체의 용도이다.
본 발명의 또다른 양상은 치료를 필요로 하는 환자에게 본 발명에 따른 항체를 투여하는, 혈관 질환을 앓는 상기 환자의 치료 방법이다.
용어 "혈관 질환" 은 암, 염증성 질환, 죽상경화증, 허혈, 외상, 패혈증, COPD, 천식, 당뇨병, AMD, 망막병증, 뇌졸중, 비만증, 급성 폐 손상, 출혈, 혈관 누출 (예를 들어, 사이토카인 유도), 알레르기, 그레이브스병, 하시모토 자가면역 갑상선염, 특발저혈소판자색반병, 거세포(성) 동맥염, 류마티스관절염, 전신홍반루푸스 (SLE), 루푸스신장염, 크론병, 다발경화증, 궤양대장염, 특히 고형 종양, 안구내 혈관신생 증후군 예컨대 증식성 망막증 또는 노년기황반변성 (AMD), 류마티스관절염, 및 건선을 포함한다 (Folkman, J., et al., J. Biol. Chem. 267 (1992) 10931-10934; Klagsbrun, et al., Annu. Rev. Physiol. 53 (1991) 217-239; 및 Garner, A., Vascular diseases, In: Pathobiology of ocular disease, A dynamic approach, Garner, A., and Klintworth, G.K., (eds.), 2nd edition, Marcel Dekker, New York (1994), pp 1625-1710).
또한, 이들 조성물은 보강제, 예컨대 보존제, 습윤제, 에멀젼화제 및 분산제를 함유할 수 있다. 미생물 존재의 방지는 상기 멸균 과정, 및 다양한 항균제 및 항진균제, 예를 들어 파라벤, 클로로부탄올, 페놀, 소르빈산 등을 포함시키는 것 둘 다에 의해 보장될 수 있다. 또한, 등장화제, 예컨대 당, 염화 나트륨 등을 상기 조성물에 포함시키는 것이 바람직할 수 있다. 또한, 주사 가능한 약학 형태의 흡수 지연은, 흡수를 지연시키는 작용제, 예컨대 알루미늄 모노스테아레이트 및 젤라틴의 포함에 의해 대략적으로 발생할 수 있다.
선택되는 투여 경로에 관계없이, 적합한 수화 형태로 사용될 수 있는 본 발명의 화합물 및/또는 본 발명의 약학 조성물은, 당업계에 통상적으로 알려진 방법에 의해 약학적으로 허용가능한 투약 형태로 제형화된다.
본 발명의 약학 조성물에서 활성 성분의 실제 투약 수준은, 환자에 대한 독성이 없으면서 특정 환자, 조성물 및 투여 방식에 대해 원하는 치료학적 반응을 달성하기에 효과적인 활성 성분의 양이 수득되도록 가변적일 수 있다. 선택되는 투약 수준은 다양한 약물동태학 요소 (사용되는 본 발명의 특정 조성물의 활성, 투여 경로, 투여 시간, 사용될 특정 화합물의 분비 속도, 치료 지속기간 및/또는 사용되는 특정 조성물과 조합으로 사용되는 기타 약물, 화합물 및/또는 물질, 치료받을 환자의 나이, 성별, 체중, 상태, 일반적 건강상태 및 이전 병력 등 의료계에 알려져 있는 요소들 포함) 에 의존적일 것이다.
조성물은 무균이어야만 하고 조성물이 주사기에 의해 전달될 정도의 유동성이 있어야만 한다. 물 외에도, 담체는 바람직하게는 등장성의 완충된 염수 용액이다.
적절한 유동성은 예를 들어 레시틴과 같은 코팅을 사용함으로써, 분산액의 경우 요구되는 입자 크기를 유지함으로써, 및 계면활성제를 사용함으로써 유지될 수 있다. 많은 경우에서, 등장화제, 예를 들어 당, 폴리알콜, 예컨대 만니톨 또는 소르비톨 및 염화 나트륨을 조성물 중에서 포함하는 것이 바람직하다.
본 발명에 따른 인간 ErbB-1 및 인간 c-Met 에 대한 이중특이적 항체는 생물학적 또는 약리학 활성과 같은 가치있는 특징을 갖는 것으로 이제 밝혀졌다.
하기 실시예, 서열 목록 및 도면은 본 발명의 이해 목적을 위해 제공하였으며, 본원의 범위는 첨부된 청구의 범위에서 제시된다. 본 발명의 취지에서 벗어나지 않는 변형이 과정 중에 이루어질 수 있는 것으로 이해된다.
아미노산 서열의 설명
SEQ ID NO: 1 중쇄 가변 도메인 <ErbB-1> 세투시맙
SEQ ID NO: 2 경쇄 가변 도메인 <ErbB-1> 세투시맙
SEQ ID NO: 3 중쇄 가변 도메인 <ErbB-1> 인간화 ICR62
SEQ ID NO: 4 경쇄 가변 도메인 <ErbB-1> 인간화 ICR62
SEQ ID NO: 5 중쇄 가변 도메인 <c-Met> Mab 5D5
SEQ ID NO: 6 경쇄 가변 도메인 <c-Met> Mab 5D5
SEQ ID NO: 7 중쇄 <c-Met> Mab 5D5
SEQ ID NO: 8 경쇄 <c-Met> Mab 5D5
SEQ ID NO: 9 중쇄 <c-Met> Fab 5D5
SEQ ID NO: 10 경쇄 <c-Met> Fab 5D5
SEQ ID NO: 11 인간 IgG1 의 중쇄 불변 영역
SEQ ID NO: 12 인간 IgG3 의 중쇄 불변 영역
SEQ ID NO: 13 인간 경쇄 캅파 불변 영역
SEQ ID NO: 14 인간 경쇄 람다 불변 영역
SEQ ID NO: 15 인간 c-Met
SEQ ID NO: 16 인간 ErbB-1
SEQ ID NO: 17 중쇄 CDR3H, <ErbB-1> 세투시맙
SEQ ID NO: 18 중쇄 CDR2H, <ErbB-1> 세투시맙
SEQ ID NO: 19 중쇄 CDR1H, <ErbB-1> 세투시맙
SEQ ID NO: 20 경쇄 CDR3L, <ErbB-1> 세투시맙
SEQ ID NO: 21 경쇄 CDR2L, <ErbB-1> 세투시맙
SEQ ID NO: 22 경쇄 CDR1L, <ErbB-1> 세투시맙
SEQ ID NO: 23 중쇄 CDR3H, <ErbB-1> 인간화 ICR62
SEQ ID NO: 24 중쇄 CDR2H, <ErbB-1> 인간화 ICR62
SEQ ID NO: 25 중쇄 CDR1H, <ErbB-1> 인간화 ICR62
SEQ ID NO: 26 경쇄 CDR3L, <ErbB-1> 인간화 ICR62
SEQ ID NO: 27 경쇄 CDR2L, <ErbB-1> 인간화 ICR62
SEQ ID NO: 28 경쇄 CDR1L, <ErbB-1> 인간화 ICR62
SEQ ID NO: 29 중쇄 CDR3H, <c-Met> Mab 5D5
SEQ ID NO: 30 중쇄 CDR2H, <c-Met> Mab 5D5
SEQ ID NO: 31 중쇄 CDR1H, <c-Met> Mab 5D5
SEQ ID NO: 32 경쇄 CDR3L, <c-Met> Mab 5D5
SEQ ID NO: 33 경쇄 CDR2L, <c-Met> Mab 5D5
SEQ ID NO: 34 경쇄 CDR1L, <c-Met> Mab 5D5
도 1: 통상적 순서로 가변 및 불변 도메인을 포함하는 2 쌍의 중쇄 및 경쇄를 갖는 제 1 항원 1 에 특이적으로 결합하는 CH4 도메인이 없는 전장 항체의 도해적 구조.
2a-c: 하기를 포함하는 2 가, 이중특이적 <ErbB-1/c-Met> 항체의 도해적 구조: a) 인간 ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 전장 항체의 경쇄 및 중쇄; 및 b) 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 전장 항체의 경쇄 및 중쇄 (불변 도메인 CL 및 CH1, 및/또는 가변 도메인 VL 및 VH 는 서로 대체되며, 이는 놉-인투 홀 (knobs-into hole) 기술로 개질됨).
3:
a) 3a: 2 개의 폴리펩티드 VH 및 VL 이 융합되어 있고 (VH 및 VL 도메인 모두 함께 c-Met 에 특이적으로 결합하는 항원 결합 자리를 형성함);
b) 도 3b: 2 개의 폴리펩티드 VH-CH1 및 VL-CL 이 융합되어 있는 (VH 및 VL 도메인 모두 함께 c-Met 에 특이적으로 결합하는 항원 결합 자리를 형성함),
ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 전장 항체를 포함하는 본 발명에 따른 3가, 이중특이적 <ErbB-1/c-Met> 항체의 도해적 표시.
3c: 2 개의 폴리펩티드 VH 및 VL 이 "놉과 홀" 과 융합되어 있는 (VH 및 VL 도메인 모두 함께 c-Met 에 특이적으로 결합하는 항원 결합 자리를 형성함) ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 전장 항체를 포함하는 본 발명에 따른 3가, 이중특이적 항체의 도해적 표시.
3d: 2 개의 폴리펩티드 VH 및 VL 이 "놉과 홀" 과 융합되어 있는 (VH 및 VL 도메인 모두 함께 c-Met 에 특이적으로 결합하는 항원 결합 자리를 형성하며, 이들 VH 및 VL 도메인은 위치 VH44 와 VL100 사이에 사슬간 이황화물 다리를 포함함) ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 전장 항체를 포함하는 본 발명에 따른 3가, 이중특이적 항체의 도해적 표시.
4:
4a: 4 개의 가능한 단일쇄 Fab 단편의 도해적 구조
4b: 2 개의 단일쇄 Fv 단편의 도해적 구조
5: 전장 항체 및 하나의 단일쇄 Fab 단편 ( 5a) 또는 하나의 단일쇄 Fv 단편 ( 5b) 을 포함하는 3가, 이중특이적 <ErbB-1/c-Met> 항체의 도해적 구조 - 놉과 홀을 갖는 이중특이적 3가 예시물.
6: 전장 항체 및 2 개의 단일쇄 Fab 단편 ( 6a) 또는 2 개의 단일쇄 Fv 단편 ( 6b) 을 포함하는 4가, 이중특이적 <ErbB-1/c-Met> 항체의 도해적 구조 - c-Met 결합 자리는 c-Met 이량체화 저해 항체에서 유래함.
7a: 유표피 암 세포주 A431 에서의 ErbB1/2/3 및 c-Met 의 세포 표면 발현의 유세포측정 분석.
7b: 난소암 세포주 OVCAR-8 에서의 ErbB1/2/3 및 c-Met 의 세포 표면 발현의 유세포측정 분석.
8a: 암 세포주 A431 에서의 증식 검정 - 단일특이적 부모 <HER1> 및 <c-Met> 항체와 비교한 본 발명에 따른 이중특이적 <HER1/c-Met> 항체 BsAB01 (BsAb) 의 암 세포 증식의 저해.
8b: HGF 의 존재 하의 암 세포주 A431 에서의 증식 검정 - 단일특이적 부모 <HER1> 및 <c-Met> 항체와 비교한 본 발명에 따른 이중특이적 <HER1/c-Met> 항체 BsAB01 (BsAb) 의 암 세포 증식의 저해.
9: 0, 30, 60 및 120 분 (= 0, 0.5, 1 및 2 시간) 에 측정한 OVCAR-8 암 세포에서의 내재화 검정.
10a: OVCAR-8 암 세포에서의 증식 검정. 단일특이적 부모 <HER1> 및 <c-Met> 항체와 비교한 본 발명에 따른 이중특이적 <HER1/c-Met> 항체 BsAB01 (BsAb) 의 암 세포 증식의 저해.
도 10b: HGF 의 존재 하의 암 세포주 A431 에서의 증식 검정 - 단일특이적 부모 <HER1> 및 <c-Met> 항체와 비교한 본 발명에 따른 이중특이적 <HER1/c-Met> 항체 BsAB01 (BsAb) 의 암 세포 증식의 저해.
실험적 절차
실시예
재료 & 방법
재조합 DNA 기술
[Sambrook, J. et al., Molecular cloning: A laboratory manual; Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, New York, 1989] 에 기재된 바와 같이 표준 방법을 사용하여 DNA 를 조작하였다. 제조사의 지시사항에 따라 분자 생물학적 시약을 사용하였다.
DNA 및 단백질 서열 분석 및 서열 데이터 관리
인간 면역글로불린 경쇄 및 중쇄의 뉴클레오티드 서열에 대한 일반적인 정보는 [Kabat, E.A., et al., (1991) Sequences of Proteins of Immunological Interest, Fifth Ed., NIH 공개 번호 91-3242] 에 주어진다. 항체 사슬의 아미노산은 EU 넘버링에 따라 넘버링된다 (Edelman, G.M., et al., PNAS 63 (1969) 78-85; Kabat, E.A., et al., (1991) Sequences of Proteins of Immunological Interest, Fifth Ed., NIH 공개 번호 91-3242). GCG (Genetics Computer Group, Madison, Wisconsin) 소프트웨어 패키지 version 10.2 및 Infomax's Vector NT1 Advance suite version 8.0 을 서열 생성, 지도화, 분석, 주석달기 및 설명에 사용하였다.
DNA 서열결정화
SequiServe (Vaterstetten, Germany) 및 Geneart AG (Regensburg, Germany) 에서 수행한 이중 가닥 서열결정화에 의해 DNA 서열을 결정하였다.
유전자 합성
자동화 유전자 합성에 의해 PCR 산물 및 합성 올리고뉴클레오티드로부터 Geneart AG (Regensburg, Germany) 에 의해 원하는 유전자 분절을 제조하였다. 단일 제한 엔도뉴클레아제 절단 위치가 측면에 위치한 유전자 분절을 pGA18 (ampR) 플라스미드 내로 클로닝하였다. 플라스미드 DNA 를 형질전환된 세균으로부터 정제하고, UV 분광학에 의해 농도를 측정하였다. 서브클로닝된 유전자 단편의 DNA 서열을 DNA 서열결정화로 확인하였다. 유사한 방법으로, 펩티드 연결기에 의해 연결된 C-말단 <c-Met>5D5 scFab VH 부위를 갖거나/갖지 않는 CH3 도메인 내의 S354C 및 T366W 돌연변이를 수반하는 개질된 "놉-인투-홀" <ErbB-1> 항체 중쇄 뿐 아니라, 펩티드 연결기에 의해 연결된 C-말단 <c-Met>5D5 scFab VL 부위를 갖거나/갖지 않는 Y349C, T366S, L368A 및 Y407V 돌연변이를 수반하는 "놉-인투-홀" <ErbB-1> 항체 중쇄를 코딩하는 DNA 서열을 측면에 위치하는 BamHI 및 XbaI 제한 위치로 유전자 합성에 의해 제조하였다. 마지막으로, <ErbB-1> 항체 및 <c-Met>5D5 항체의 비개질 중쇄 및 경쇄를 인코딩하는 DNA 서열을 측면에 위치하는 BamHI 및 XbaI 제한 위치로 합성하였다. 모든 구축물을, 진핵 세포 내 분비를 위해 단백질을 표적화하는 리더 펩티드 (MGWSCIILFLVATATGVHS) 를 코딩하는 5'-말단 DNA 서열로 설계하였다.
발현 플라스미드의 구축
Roche 발현 벡터를 모든 중쇄 및 경쇄 scFv 융합 단백질 인코딩 발현 플라스미드의 구축에 사용하였다. 상기 벡터는 하기 요소로 구성된다:
- 선택 마커로서의 히그로마이신 내성 유전자,
- 엡스타인-바 (Epstein-Barr) 바이러스 (EBV) 의 복제 기점, oriP,
- 대장균 (E. coli) 에서 상기 플라스미드의 복제를 가능하게 하는 벡터 pUC18 로부터의 복제 기점,
- 대장균에 암피실린 내성을 부여하는 베타-락타마아제 유전자,
- 인간 시토메갈로바이러스 (HCMV) 로부터의 급속 초기 인핸서 및 프로모터,
- 인간 1-면역글로불린 폴리아데닐화 ("폴리 A") 신호 서열, 및
- 고유한 BamHI 및 XbaI 제한 위치.
중쇄 또는 경쇄 구축물 뿐 아니라 C-말단 VH 및 VL 도메인을 갖는 "놉-인투-홀" 구축물을 포함하는 면역글로불린 융합 유전자를 유전자 합성에 의해 제조하고, 기재된 바와 같은 pGA18 (ampR) 플라스미드 내로 클로닝하였다. 합성 DNA 분절을 수반하는 pG18 (ampR) 플라스미드 및 Roche 발현 벡터를 BamHI 및 XbaI 제한 효소 (Roche Molecular Biochemicals) 로 소화시키고, 아가로오스 겔 전기영동하였다. 정제된 중쇄 및 경쇄 코딩 DNA 분절을 이후 단리된 Roche 발현 벡터 BamHI/XbaI 단편에 라이게이션하여 최종 발현 벡터를 야기시켰다. 최종 발현 벡터를 대장균 세포 내로 형질전환시키고, 발현 플라스미드 DNA 를 단리하고 (Miniprep), 제한 효소 분석 및 DNA 서열결정화를 수행하였다. 올바른 클론을 150 ㎖ LB-Amp 배지에서 성장시키고, 플라스미드 DNA 를 다시 단리하고 (Maxiprep), DNA 서열결정화에 의해 서열 완전성을 확인하였다.
HEK293 세포에서의 면역글로불린 변이체의 일시적 발현
제조사의 지시사항에 따라 FreeStyleTM 293 Expression System (Invitrogen, USA) 을 사용하여 인간 태아 신장 293-F 세포의 일시적 트랜스펙션에 의해 재조합 면역글로불린 변이체를 발현시켰다. 간략하게는, 현탁액 FreeStyleTM 293-F 세포를 37℃/8% CO2 에서 FreeStyleTM 293 Expression 배지에서 배양하고, 트렌스펙션 일에 1-2x106 생육성 세포/㎖ 의 밀도에서 신선한 배지에 세포를 시딩하였다. 250 ㎖ 최종 트렌스펙션 부피에 대해 1:1 몰비로 250 ㎍ 의 중쇄 및 경쇄 플라스미드 DNA, 및 325 ㎕ 의 293fectinTM (Invitrogen, Germany) 을 사용하여 Opti-MEM
Figure pct00001
I 배지 (Invitrogen, USA) 에서 DNA-293fectinTM 복합체를 제조하였다. 250 ㎖ 최종 트랜스펙션 부피에 대해 1:1:2 몰비로 250 ㎍ 의 "놉-인투-홀" 중쇄 1 및 2 및 경쇄 플라스미드 DNA, 및 325 ㎕ 의 293fectinTM (Invitrogen, Germany) 을 사용하여 Opti-MEM
Figure pct00002
I 배지 (Invitrogen, USA) 에서 "놉-인투-홀" DNA-293fectin 복합체를 제조하였다. 항체 함유 세포 배양 상청액을 트랜스펙션 7 일 후 30 분 동안 14000 g 에서의 원심분리에 의해 수확하고, 멸균 필터 (0.22 ㎛) 를 통해 여과하였다. 정제될 때까지 상청액을 -20℃ 에서 저장하였다.
이중특이적 및 대조군 항체의 정제
Protein A-SepharoseTM (GE Healthcare, Sweden) 을 사용하는 친화성 크로마토그래피 및 Superdex200 크기 배제 크로마토그래피에 의해 세포 배양 상청액으로부터 3가 이중특이적 및 대조군 항체를 정제하였다. 간략하게는, 멸균 여과된 세포 배양 상청액을 PBS 완충액 (10 mM Na2HPO4, 1 mM KH2PO4, 137 mM NaCl 및 2.7 mM KCl, pH 7.4) 으로 평형화된 HiTrap ProteinA HP (5 ㎖) 컬럼 상에 적용하였다. 미결합 단백질을 평형 완충액으로 세척하였다. 항체 및 항체 변이체를 0.1 M 시트레이트 완충액, pH 2.8 으로 용리하고, 단백질 함유 분획물을 0.1 ㎖ 1 M Tris, pH 8.5 로 중화시켰다. 이후, 용리된 단백질 분획물을 풀링하고 (pooling), Amicon Ultra 원심분리 필터 장치 (MWCO: 30 K, Millipore) 로 3 ㎖ 의 부피로 농축하고, 20 mM 히스티딘, 140 mM NaCl, pH 6.0 으로 평형화된 Superdex200 HiLoad 120 ㎖ 16/60 겔 여과 컬럼 (GE Healthcare, Sweden) 상에 로딩하였다. 5% 미만의 높은 분자량 응집물을 갖는 정제된 이중특이적 및 대조군 항체를 함유하는 분획물을 풀링하고, -80℃ 에서 1.0 mg/㎖ 분취액으로서 저장하였다. 정제된 5D5 단일클론 항체의 파파인 소화 및 단백질 A 크로마토그래피에 의한 오염 Fc 도메인의 후속적 제거에 의해 Fab 단편을 생성시켰다. 20 mM 히스티딘, 140 mM NaCl, pH 6.0 으로 평형화된 Superdex200 HiLoad 120 ㎖ 16/60 겔 여과 컬럼 (GE Healthcare, Sweden) 상에서 미결합 Fab 단편을 추가로 정제하고, 풀링하고, -80℃ 에서 1.0 mg/㎖ 분취액으로서 저장하였다.
정제된 단백질의 분석
아미노산 서열을 기초로 계산한 몰 흡광 계수를 사용하여, 280 nm 에서 광학 밀도 (OD) 를 측정함으로써, 정제된 단백질 샘플의 단백질 농도를 측정하였다. 환원제 (5 mM 1,4-디티오트레이톨) 의 존재 및 부재 하에, 및 쿠마시 브릴리언트 블루 (Coomassie brilliant blue) 로 염색하여 SDS-PAGE 에 의해 이중특이적 및 대조군 항체의 순도 및 분자량을 분석하였다. NuPAGE
Figure pct00003
Pre-Cast 겔 시스템 (Invitrogen, USA) 을 제조사의 지시사항에 따라 사용하였다 (4-20% Tris-글리신 겔). 25℃ 에서 200 mM KH2PO4, 250 mM KCl, pH 7.0 실행 완충액 중 Superdex 200 분석 크기-배제 컬럼 (GE Healthcare, Sweden) 을 사용하여 고성능 SEC 에 의해 이중특이적 및 대조군 항체 샘플의 응집물 함량을 분석하였다. 25 ㎍ 단백질을 0.5 ㎖/분의 유속으로 컬럼에 주입하고, 50 분에 걸쳐 등용매 (isocratic) 용리하였다. 안정성 분석을 위해서, 1 mg/㎖ 농도의 정제된 단백질을 4℃ 및 40℃ 에서 7 일 동안 인큐베이션한 후 고성능 SEC 에 의해 평가하였다. 펩티드-N-글리코시다아제 F (Roche Molecular Biochemicals) 로의 효소적 처리에 의한 N-글리칸의 제거 후 나노전기분무 (NanoElectrospray) Q-TOF 질량분석에 의해, 환원된 이중특이적 항체 경쇄 및 중쇄의 아미노산 골격의 완전성을 확인하였다.
c-Met 인산화 검정
0.5% FCS (송아지 태아 혈청) 를 갖는 RPMI 에서의 HGF 자극 전, 6-웰 플레이트의 웰 당 5x10e5 A549 세포를 시딩하였다. 다음날, 성장 배지를 1 시간 동안 0.2% BSA (소 혈청 알부민) 함유 RPMI 로 대체하였다. 5 ㎍/㎖ 의 이중특이적 항체를 이후 배지에 첨가하고, 세포를 10 분 동안 인큐베이션하고, 이에 50 ng/㎖ 의 최종 농도에서 HGF 를 추가 10 분 동안 첨가하였다. 세포를 1 mM 나트륨 바나데이트를 함유하는 얼음 냉각된 PBS 로 1 회 세척하고, 이를 얼음에 두고 100 ㎕ 용해 완충액 (50 mM Tris-Cl pH 7.5, 150 mM NaCl, 1% NP40, 0.5% DOC, 아프로티닌, 0.5 mM PMSF, 1 mM 나트륨-바나데이트) 으로 세포 배양 플레이트 내에서 용해시켰다. 세포 용해물을 에펜도르프 (eppendorf) 튜브에 옮기고 얼음에서 30 분 동안 용해가 진행되게 하였다. BCA 방법 (Pierce) 을 사용하여 단백질 농도를 측정하였다. 4-12% Bis-Tris NuPage 겔 (Invitrogen) 상에서 30-50 ㎍ 의 용해물을 분리하고 겔 상의 단백질을 니트로셀룰로오스 멤브레인에 옮겼다. 멤브레인을 5% BSA 를 함유하는 TBS-T 로 1 시간 동안 블로킹하고, 제조사의 지시사항에 따라 Y1230,1234,1235 에 대해 유도된 포스포-특이적 (phospho-specific) c-Met 항체 (44-888, Biosource) 로 현상하였다. 면역블롯을 비인산화된 c-Met 에 결합하는 항체 (AF276, R&D) 로 리프로브 (reprobe) 하였다.
ErbB1/HER1 인산화 검정
10% FCS (송아지 태아 혈청) 를 갖는 RPMI 에서의 항체 첨가 전날, 6-웰 플레이트의 웰 당 5x10e5 Sk-Br3 세포를 시딩하였다. 다음날, 5 ㎍/㎖ 의 대조군 또는 이중특이적 항체를 배지에 첨가하고 세포를 추가 1 시간 인큐베이션하였다. 1 mM 나트륨 바나데이트를 함유하는 얼음 냉각된 PBS 로 세포를 1 회 세척하고, 이를 얼음에 두고 100 ㎕ 용해 완충액 (50 mM Tris-Cl pH 7.5, 150 mM NaCl, 1% NP40, 0.5% DOC, 아프로티닌, 0.5 mM PMSF, 1 mM 나트륨-바나데이트) 으로 세포 배양 플레이트 내에서 용해시켰다. 세포 용해물을 에펜도르프 튜브에 옮기고, 얼음에서 30 분 동안 용해가 진행되게 하였다. BCA 방법 (Pierce) 을 사용하여 단백질 농도를 측정하였다. 30-50 ㎍ 의 용해물을 4-12% Bis-Tris NuPage 겔 (Invitrogen) 상에서 분리하고, 겔 상의 단백질을 니트로셀룰로오스 멤브레인에 옮겼다. 5% BSA 를 함유하는 TBS-T 로 1 시간 동안 멤브레인을 블로킹하고, 제조사의 지시사항에 따라 Y1173 에 대해 유도된 포스포-특이적 EGFR 항체 (sc-12351, Santa Cruz) 로 현상하였다. 면역블롯을 비인산화된 EGFR 에 결합하는 항체 (06-847, Upstate) 로 리프로브하였다.
AKT 인산화 검정
10% FCS (송아지 태아 혈청) 를 갖는 RPMI 에서의 항체 첨가 전날, 6-웰 플레이트의 웰 당 5x10e5 A431 세포를 시딩하였다. 다음날, 5 ㎍/㎖ 의 대조군 또는 이중특이적 항체를 배지에 첨가하고, 세포를 추가 1 시간 인큐베이션하였다. 이후, 세포 아집합을 25 ng/㎖ HGF (R&D, 294-HGN) 로 추가 15 분 동안 자극하였다. 1 mM 나트륨 바나데이트를 함유하는 얼음 냉각된 PBS 로 세포를 1 회 세척하고, 이를 얼음에 두고 100 ㎕ 용해 완충액 (50 mM Tris-Cl pH 7.5, 150 mM NaCl, 1% NP40, 0.5% DOC, 아프로티닌, 0.5 mM PMSF, 1 mM 나트륨-바나데이트) 으로 세포 배양 플레이트 내에서 용해시켰다. 세포 용해물을 에펜도르프 튜브에 옮기고, 얼음에서 30 분 동안 용해가 진행되게 하였다. BCA 방법 (Pierce) 을 사용하여 단백질 농도를 측정하였다. 30-50 ㎍ 의 용해물을 4-12% Bis-Tris NuPage 겔 (Invitrogen) 상에서 분리하고, 겔 상의 단백질을 니트로셀룰로오스 멤브레인에 옮겼다. 5% BSA 를 함유하는 TBS-T 로 1 시간 동안 멤브레인을 블로킹하고, 제조사의 지시사항에 따라 Thr308 에 유도된 포스포-특이적 AKT 항체 (Cell Signaling, 9275) 로 현상하였다. 면역블롯을 액틴에 결합하는 항체 (Abcam, ab20272) 로 리프로브하였다.
ERK1/2 인산화 검정
10% FCS (송아지 태아 혈청) 를 갖는 RPMI 에서의 항체 첨가 전날, 6-웰 플레이트의 웰 당 5x10e5 A431 세포를 시딩하였다. 다음날, 5 ㎍/㎖ 의 대조군 또는 이중특이적 항체를 배지에 첨가하고, 세포를 추가 1 시간 인큐베이션하였다. 이후 세포 아집합을 25 ng/㎖ HGF (R&D, 294-HGN) 로 추가 15 분 동안 자극하였다. 1 mM 나트륨 바나데이트를 함유하는 얼음 냉각된 PBS 로 세포를 1 회 세척하고, 이를 얼음에 두고 100 ㎕ 용해 완충액 (50 mM Tris-Cl pH 7.5, 150 mM NaCl, 1% NP40, 0.5% DOC, 아프로티닌, 0.5 mM PMSF, 1 mM 나트륨-바나데이트) 으로 세포 배양 플레이트 내에서 용해시켰다. 세포 용해물을 에펜도르프 튜브에 옮기고, 얼음에서 30 분 동안 용해가 진행되게 하였다. BCA 방법 (Pierce) 을 사용하여 단백질 농도를 측정하였다. 30-50 ㎍ 의 용해물을 4-12% Bis-Tris NuPage 겔 (Invitrogen) 상에서 분리하고, 겔 상의 단백질을 니트로셀룰로오스 멤브레인에 옮겼다. 5% BSA 를 함유하는 TBS-T 로 1 시간 동안 멤브레인을 블로킹하고, 제조사의 지시사항에 따라 Thr202/Tyr204 에 대해 유도된 포스포-특이적 Erk1/2 항체 (CellSignaling, Nr.9106) 로 현상하였다. 면역블롯을 액틴에 결합하는 항체 (Abcam, ab20272) 로 리프로브하였다.
세포-세포 파종 검정 (산란 검정)
0.5% FCS 를 갖는 RPMI 중 96-웰 E-플레이트 (Roche, 05232368001) 에서의 총 부피 200 ㎕ 로의 화합물 처리 전날, A549 (웰 당 4000 개 세포) 또는 A431 (웰 당 8000 개 세포) 를 시딩하였다. 임피던스를 모니터링하는 15 분 마다 스위핑하여 실시간 세포 분석기 (Real Time Cell Analyzer machine) 로 부착 및 세포 성장을 밤새 모니터링하였다. 다음날, 15 분 마다 스위핑하여 PBS 중 각각의 항체 희석물 5 ㎕ 로 세포를 예비인큐베이션하였다. 30 분 후, 20 ng/㎖ 의 최종 농도를 산출시키는 2,5 ㎕ 의 HGF 용액을 첨가하고, 추가 72 시간 동안 실험이 진행되게 하였다. 180 분 동안 1 분 마다 스위핑한 후 남은 시간 동안 15 분 마다 스위핑하여 즉각적인 변화를 모니터링하였다.
유세포측정 검정 (FACS)
a) 결합 검정
c-Met 및 ErbB-1 발현 세포를 분리시키고 계수하였다. 원추형 96-웰 플레이트의 웰 당 1.5x10e5 세포를 시딩하였다. 세포를 스핀 다운시키고 (1500 rpm, 4℃, 5 분), 2% FCS (송아지 태아 혈청) 를 갖는 PBS 중 각각의 이중특이적 항체의 연속 희석물 50 ㎕ 중 얼음에서 30 분 동안 인큐베이션하였다. 세포를 다시 스핀 다운시키고 2% FCS 를 함유하는 200 ㎕ PBS 로 1 회 세척한 후, 2% FCS 를 함유하는 PBS 중 희석된 인간 Fc 에 대해 유도된 피코에리트린-결합 항체 (Jackson Immunoresearch, 109116098) 로 30 분 동안 2 차 인큐베이션하였다. 세포를 스핀 다운시켜 2% FCS 를 함유하는 200 ㎕ PBS 로 2 회 세척하고, BD CellFix 용액 (BD Biosciences) 에 재현탁시키고 얼음에서 10 분 이상 동안 인큐베이션하였다. 세포의 평균 형광 세기 (mfi) 를 유세포측정 (FACS Canto, BD) 으로 측정하였다. 두 독립적 염색의 적어도 이반복물에서 Mfi 를 측정하였다. FlowJo 소프트웨어 (TreeStar) 를 사용하여 유세포측정 스펙트럼을 추가 프로세싱하였다. XLFit 4.0 (IDBS) 및 용량 반응 1 위치 모델 205 (dose response one site model 205) 를 사용하여 절반-최대 결합 (half-maximal binding) 을 측정하였다.
b) 내재화 검정
세포를 분리시키고 계수하였다. 5x10e5 세포를 에펜도르프 튜브 중 50 ㎕ 완전 배지에 넣고 37℃ 에서 각각의 이중특이적 항체 5 ㎍/㎖ 와 함께 인큐베이션하였다. 표시한 시간 지점 이후 시간 추이가 완료될 때까지 세포를 얼음에서 저장하였다. 이후, 세포를 FACS 튜브에 옮기고, 스핀 다운시키고 (1500 rpm, 4℃, 5 분), PBS + 2% FCS 로 세척하고, 2% FCS 를 함유하는 PBS 중 희석된 인간 Fc 에 대해 유도된 50 ㎕ 피코에리트린-결합 제 2 항체 (Jackson Immunoresearch, 109116098) 중 30 분 동안 인큐베이션하였다. 세포를 다시 스핀 다운시키고, PBS + 2% FCS 로 세척하고, 유세포측정 (FACS Canto, BD) 에 의해 형광 세기를 측정하였다.
세포 역가 글로우 검정
세포 역가 글로우 검정 (Promega) 을 사용하여 세포 생육성 및 증식을 정량화하였다. 제조사의 지시사항에 따라 검정을 수행하였다. 간략하게는, 원하는 시간 기간 동안 총 부피 100 ㎕ 로 96-웰 플레이트 내에서 세포를 배양하였다. 증식 검정을 위해서, 세포를 인큐베이터에서 제거하고 30 분 동안 실온에 두었다. 100 ㎕ 의 세포 역가 글로우 시약을 첨가하고 다중-웰 플레이트를 2 분 동안 궤도 진탕기에 두었다. 마이크로플레이트 판독기 (Tecan) 에서 15 분 후 발광을 정량화하였다.
Wst-1 검정
Wst-1 생육성 및 세포 증식 검정을 대사 활성 세포의 수를 검출하는 종말점 분석으로서 수행하였다. 간략하게는, 20 ㎕ 의 Wst-1 시약 (Roche, 11644807001) 을 200 ㎕ 의 배양 배지에 첨가하였다. 염료가 견고하게 (robust) 전개될 때까지 30 분 내지 1 시간 동안 96-웰 플레이트를 추가로 인큐베이션하였다. 450 nm 의 파장에서의 마이크로플레이트 판독기 (Tecan) 에서 염색 세기를 정량화하였다.
이중특이적 <ErbB1-c-Met> 항체의 설계
하기의 발현 및 정제된 이중특이적 <ErbB-1-c-Met> 항체 모두는 결국 하기에 나타낸 바와 같이 개질된 불변 부위 또는 적어도 IgG1 서브클래스의 Fc 부분 (SEQ ID NO:11 의 인간 불변 IgG1 부위) 을 포함한다.
표 1 에서: 표 1 에 나타낸 각각의 특징을 갖는 c-Met 항체 (cMet 5D5) 로부터의 하나의 단일쇄 Fab 단편 및 전장 ErbB-1 항체 (세투시맙 또는 인간화 ICR62) 를 기준으로 하는 3가, 이중특이적 <ErbB1-c-Met> 항체 (기본적 구조 도식에 대해서는 도 5a 참조) 는 상기 기재된 일반적인 방법에 따라 발현 및 정제되었거나 발현 및 정제될 수 있다. 인간화 ICR62 또는 세투시맙의 상응하는 VH 및 VL 을 서열 목록에 나타내었다.
이중특이적 항체에 대한 분자 명칭 scFab-Ab-명명법 BsAB01 BsAB03
특징:
놉-인-홀 돌연변이 S354C:
T366W/ Y349'C:
T366'S: L368'A:
Y407'V
S354C:
T366W/ Y349'C:
T366'S: L368'A:
Y407'V
전장 항체 골격의 유래 세투시맙 인간화 ICR62
단일쇄 Fab 단편의 유래 cMet 5D5
(인간화)
cMet 5D5
(인간화)
항체에 부착된 scFab 의 위치 C-말단 놉 중쇄 C-말단 놉 중쇄
링커 (ScFab) (G4S)5GG (G4S)5GG
펩티드 연결기 (G4S)2 (G4S)2
ScFab 이황 VH44/ VL100 안정화 - -
실시예 1:
이중특이적 항체의 ErbB-1 및 c-Met 에 대한 결합
(표면 플라스몬 공명)
25℃ 에서 표준 결합 검정, 예컨대 표면 플라스몬 공명 기술 (BIAcore
Figure pct00004
GE-Healthcare Uppsala, Sweden) 로 결합 친화도를 측정하였다. 친화도 측정을 위해서, SPR 기기 (Biacore T100) 에서 표준 아민-결합 및 블로킹 화학 반응에 의해 30 ㎍/㎖ 의 항 Fcγ 항체 (염소로부터의 것, Jackson Immuno Research) 를 CM-5 센서 칩의 표면에 결합시켰다. 접합 후, 단일- 또는 이중특이적 ErbB1/cMet 항체를 유속 5 ㎕/분에서 25℃ 에서 주입한 후, 인간 ErbB1 또는 c-Met ECD 의 연속 희석물 (0 nM 에서 1000 nM) 을 30 ㎕/분에서 주입하였다. 결합 실험에 대한 실행 완충액으로서 PBS/0.1% BSA 를 사용하였다. 이후 10 mM 글리신-HCl, pH 2.0 용액의 60s 펄스로 칩을 재생시켰다.
표면 플라스몬 공명에 의해 측정되는 ErbB1/cMet 에 대한 이중특이적 항체의 결합 특성
결합
특이성
BsAB01
[Mol]
c-Met ka (1/Ms) 1.10E+04
kd (1/s) 5.80E-05
KD (M) 5.50E-09
ErbB-1 ka (1/Ms) 1.54E+06
kd (1/s) 8.84E-04
KD (M) 5.75E-10
실시예 2:
이중특이적 HER1/c-Met 항체 포맷에 의한 HGF-유도 c-Met 수용체 인산화의 저해
이중특이적 Her1/c-Met 항체에서의 c-Met 부분의 기능성을 확인하기 위해서, c-Met 인산화 검정을 수행하였다. 상기 실험에서 A549 폐암 세포 또는 A431 결장 직장암 세포를 HGF 에 노출시키기 전 이중특이적 항체 또는 부모 대조군 항체로 처리하였다. 부모 또는 이중특이적 항체의 결합은 수용체 인산화의 저해를 일으킨다. 대안적으로, 예를 들어 오토크린 HGF 루프를 갖는 U87MG 세포를 또한 사용할 수 있으며, 부모 또는 이중특이적 항체의 부재 또는 존재 하에 c-Met 수용체 인산화를 평가할 수 있다.
실시예 3:
HER1/cMet 이중특이적 항체로의 처리 후 HER1 수용체 인산화의 분석
이중특이적 HER1/cMet 항체에서의 EGFR-결합 부분의 기능성을 확인하기 위해서, A431 을 부모 EGFR 항체 또는 이중특이적 HER1/cMet 항체로 인큐베이션하였다. 부모 또는 이중특이적 항체의 결합 (관련이 없는 IgG 대조군 항체의 결합은 아님) 은 수용체 인산화의 저해를 일으킨다. 대안적으로는, 부모 또는 이중특이적 항체의 존재 또는 부재 하에 ErbB1/HER1 수용체 인산화가 유도되도록 EGF 로 자극한 세포를 또한 사용할 수 있다.
실시예 4:
HER1/cMet 이중특이적 항체로 처리한 후 PI3K 신호전달의 분석
EGFR 뿐 아니라 c-Met 수용체는 미토겐 신호를 전달하는 PI3K 통로를 통해 신호를 전달할 수 있다. AKT 의 EGFR 및 c-Met 수용체 인산화의 동시 표적화를 입증하기 위해서, PI3K 통로에서의 하류 표적을 모니터링할 수 있다. 이를 위해서, 미자극 세포, EGF 또는 HGF 로 처리한 세포, 또는 두 사이토카인 모두로 처리한 세포를 비특이적, 부모 대조군 또는 이중특이적 항체와 함께 병행하여 인큐베이션하였다. 대안적으로는, ErbB1/HER1 를 과발현하고/하거나 c-Met 신호전달을 활성화시키는 오토크린 HGF 루프를 갖는 세포를 또한 평가할 수 있다. AKT 는 PI3K 통로의 주요한 하류 신호전달 성분이며, 상기 단백질의 인산화는 상기 통로를 통한 신호전달의 핵심 표시자이다.
실시예 5:
HER1/cMet 이중특이적 항체로의 처리 후 MAPK 신호전달의 분석
ErbB1/Her1 및 c-Met 수용체는 MAPK 통로를 통해 신호를 전달할 수 있다. ErbB1/Her1 및 c-Met 수용체의 표적화를 입증하기 위해서, MAPK 통로에서의 주요한 하류 표적, ERK1/2 의 인산화를 모니터링할 수 있다. 이를 위해서, 미자극 세포, EGF 또는 HGF 로 처리한 세포 또는 사이토카인 둘다로 처리한 세포를 비특이적, 부모 대조군 또는 이중특이적 항체와 함께 병행하여 인큐베이션하였다. 대안적으로는, ErbB1/Her1 을 과발현하고/거나 c-Met 신호전달을 활성화시키는 오토크린 HGF 루프를 갖는 세포를 또한 평가할 수 있다.
실시예 6:
이중특이적 HER1/c-Met 항체 포맷에 의한 HGF-유도 HUVEC 증식의 저해
HUVEC 증식 검정을 수행하여 HGF 의 혈관생성 및 미토겐 효과를 입증할 수 있다. HGF 를 HUVEC 에 첨가하는 것은 세포 증식에 있어서의 증가를 일으키는데, 이는 용량-의존적 방식으로 c-Met 결합 항체에 의해 저해될 수 있다.
실시예 7:
이중특이적 Her1/c-Met 항체에 의한 A431 증식의 저해.
a) A431 세포는 유세포측정에서 독립적으로 확인한 바와 같이 HER1 의 높은 표면 수준 및 c-Met 의 중간으로 높은 세포 표면 발현을 나타내었다. 이중특이적 HER1/c-Met 항체에 의한 A431 세포 증식의 저해를 48 시간 후 CellTiterGlowTM 검정에서 측정하였다. 결과를 도 8a 에 나타내었다. 대조군은 PBS 완충액이었다.
두번째 측정은 EGFR 항체 세투시맙의 20% 의 저해를 나타내었다 (0% 저해로 설정한 완충액 대조군과 비교하여). 이중특이적 HER1/c-Met BsAB01 (BsAb) 항체는 암 세포 증식의 더욱 현저한 저해를 유발하였다 (38% 저해). 1 가 c-Met 항체 1-완 (one-armed) 5D5 (OA5D5) 는 증식에 대해 효과를 나타내지 않았다. EGFR 항체 세투시맙 및 1 가 c-Met 항체 1-완 5D5 (OA5D5) 의 조합은 덜 현저한 감소를 유발하였다 (20% 저해).
b) A431 은 주로 EGFR 신호전달에 의존적이다. 활성 EGFR - c-Met-수용체 신호전달 네트워크가 발생하는 위치를 자극하기 위해, a) 에 기재한 바와 같으나 HGF-조건화 배지의 존재 하에 추가적인 증식 검정을 수행하였다 (48 시간 후 CellTiterGlowTM 검정). 결과를 도 8b 에 나타내었다.
두번째 측정은 EGFR 항체 세투시맙 (0% 저해) 및 1가 c-MET 항체 1-완 5D5 (OA5D5) (1% 저해) 의 저해 효과를 거의 나타내지 않았다. 이중특이적 HER1/c-Met BsAB01 (BsAb) 항체 (39% 저해) 는 A431 세포의 암 세포 증식의 현저한 저해를 보였다. EGFR 항체 세투시맙 및 1 가 c-Met 항체 1-완 5D5 (OA5D5) 의 조합은 세포 증식의 덜 현저한 감소를 유발하였다 (20% 저해).
실시예 8:
이중특이적 HER1/c-Met 항체 포맷에 의한 암 세포주 DU145 에서의 HGF-유도 세포-세포 파종 (산란) 저해의 분석
HGF-유도 산란은 세포의 형태학적 변화를 유도하여, 세포의 원형화, 사상위족형 돌출, 스핀들형 구조 및 세포의 특정 운동성을 야기한다. 이중특이적 HER1/cMet 항체는 HGF-유도 세포-세포 파종을 억제하였다.
실시예 9:
ErbB-1 및 c-Met 발현 암 세포주에서의 항체-매개 수용체 내재화의 분석
HER1 또는 c-Met 에 특이적으로 결합하는 항체와 함께 세포를 인큐베이션하는 것은 수용체의 내재화를 촉발하는 것으로 나타났다. 이중특이적 항체의 내재화 능력을 평가하기 위해서, 실험 장치를 항체-유도 수용체 내재화를 연구하기 위해 설계하였다. 이러한 목적을 위하여, OVCAR-8 세포 ((NCI 세포주 호칭; NCI (국립 암 연구소) OVCAR-8-NCI 로부터 구입; Schilder RJ, et al Int J Cancer. 1990 Mar 15;45(3):416-22; Ikediobi ON, et al., Mol Cancer Ther. 2006;5;2606-12; Lorenzi, P.L., et al Mol Cancer Ther 2009; 8(4):713-24)) (HER1 뿐 아니라 c-Met 를 발현하는 것을 유세포측정에 의해 확인함 - 도 7b 참조) 를 상이한 시간 기간 동안 (예를 들어 0, 30, 60, 120 분 = 0, 0.5, 1, 2 시간 (시)) 37℃ 에서 각각의 제 1 항체와 함께 인큐베이션하였다. 세포를 4℃ 로 급속히 냉각시켜 세포 과정을 중단시켰다. 제 1 항체의 Fc 에 특이적으로 결합하는 제 2 형광물질 (fluorophor)-결합 항체를 사용하여 세포 표면에 결합하는 항체를 검출하였다. 항체-수용체 복합체의 내재화는 세포 표면 상의 항체-수용체 복합체를 고갈시키며, 감소된 평균 형광 세기를 야기한다. Ovcar-8 세포에서 내재화를 연구하였다. 하기 표 및 도 9 에서 결과를 나타내었다. 각 수용체의 내재화% 를 각 항체의 내재화를 통해 측정하였다 (도 9 에서, 이중특이적 <ErbB1-cMet> 항체 BsAB01 는 cMet/HER1 로서 지정되고, 부모 단일특이적, 2 가 항체는 <HER1> 및 <cMet> 로서 지정됨).
OVCAR-8 세포에서 2 시간 (2h) 후 FACS 검정으로 측정한, 부모 단일특이적, 2 가 c-Met 항체와 비교한 바와 같은 이중특이적 HER1/cMet 항체에 의한 c-Met 수용체의 내재화%. 0 시간에서의 (= 항체의 부재) 세포 표면 상의 c-Met 수용체의 측정% 는 세포 표면 상의 100% 의 c-Met 수용체로서 설정함.
항체 OVCAR-8 세포 상에서 2 시간 후 측정된 c-Met 수용체 % OVCAR-8 세포 (ATCC No. CRL-1555) 상에서 2 시간 후 c-Met 의 내재화 %
(= 100- 세포 표면 상의 항체%)
A) 단일특이적 <c-Met> 부모 항체
Mab 5D5 54 44
B) 이중특이적 <ErbB1-cMet > 항체
BsAB01 114 -14
실시예 10:
이중특이적 HER1/c-Met 항체의 당조작형의 제조
이중특이적 HER1/c-Met 항체의 DNA 서열을 합성 폴리A 위치의 상류 및 MPSV 프로모터의 제어 하 포유류 발현 벡터 내로 서브클로닝하였다 (각각의 벡터는 EBV OriP 서열을 수반함).
인산칼슘-트랜스펙션 접근법을 사용하여 HEK293-EBNA 세포를 포유류 이중특이적 항체 발현 벡터로 동시-트랜스펙션시켜 이중특이적 항체를 제조하였다. 지수 증식하는 HEK293-EBNA 세포를 인산칼슘 방법에 의해 트랜스펙션시켰다. 당조작 항체의 제조를 위해서, 세포를 2 개의 추가적인 플라스미드로 동시-트랜스펙션시켰는데, 각각 4:4:1:1 의 비에서, 하나는 융합 GnTIII 폴리펩티드 발현용 (GnT-III 발현 벡터) 이고 하나는 만노시다아제 II 발현용 (골지 (Golgi) 만노시다아제 II 발현 벡터) 이었다. 세포를 10% FCS 가 보충된 DMEM 배양 배지를 사용하여 T 플라스크에서 부착성 단일층 배양물로서 성장시키고, 이를 50 내지 80% 합류일 때 트랜스펙션시켰다. T150 플라스크의 트랜스펙션을 위해서, FCS 가 보충된 DMEM 배양 배지 25 ㎖ (10% V/V 최종) 에서 트랜스펙션하기 24 시간 전에 1500 만 개의 세포를 시딩하고, 5% CO2 대기를 갖는 인큐베이터 내에 37℃ 에서 세포를 밤새 두었다. 트랜스펙션할 각각의 T150 플라스크에 대해서, 경쇄 및 중쇄 발현 벡터 사이에 동등하게 분리된 94 ㎍ 총 플라스미드 벡터 DNA, 최종 부피 469 ㎕ 에 대한 물 및 469 ㎕ 의 1M CaCl2 용액을 혼합하여 DNA, CaCl2 및 물의 용액을 제조하였다. 상기 용액에, 938 ㎕ 의 50 mM HEPES, 280 mM NaCl, 1.5 mM Na2HPO4 용액 (pH 7.05) 을 첨가하고, 즉시 10 초 동안 혼합하고, 20 초 동안 실온에서 정치시켰다. 현탁액을 2% FCS 가 보충된 10 ㎖ 의 DMEM 으로 희석하고, 존재하는 배지 대신 T150 에 첨가하였다. 이후 추가적인 13 ㎖ 의 트랜스펙션 배지를 첨가하였다. 세포를 약 17 내지 20 시간 동안 37℃, 5% CO2 에서 인큐베이션한 후, 배지를 25 ㎖ DMEM, 10% FCS 로 대체하였다. 조건화된 배양 배지를 트랜스펙션 7 일 후 210 x g 에서 15 분 동안 원심분리에 의해 수확하고, 용액을 멸균 여과 (0.22 ㎛ 필터) 하고 최종 농도 0.01% w/v 의 나트륨 아자이드를 첨가하고, 4℃ 에서 유지시켰다.
분비된 이중특이적 아포큐실레이션된 (afocusylated) 당조작 항체를 단백질 A 친화도 크로마토그래피, 이후 양이온 교환 크로마토그래피 및 Superdex 200 컬럼 (Amersham Pharmacia) 상의 최종 크기 배제 크로마토그래피 단계 (25 mM 인산칼륨, 125 mM 염화나트륨, 100 mM 글리신 용액 (pH 6.7) 으로 완충액을 교체하고 순수 단량체 IgG1 항체를 수집함) 에 의해 정제하였다. 280 nm 에서의 흡광도로부터 분광광도계를 사용하여 항체 농도를 추정하였다.
항체의 Fc 부위에 부착된 올리고당을 기재된 바와 같이 MALDI/TOF-MS 에 의해 분석하였다. PVDF 멤브레인 상에서 또는 용액 내에서 고정되는 항체로, 올리고당을 PNGaseF 소화에 의해 항체로부터 효소적으로 방출시켰다. 방출된 올리고당을 함유하는 생성된 소화 용액을 MALDI/TOF-MS 분석을 위해 직접적으로 제조하거나, MALDI/TOF-MS 분석을 위한 샘플 제조 전에 EndoH 글리코시다아제로 추가 소화시켰다.
실시예 11:
이중특이적 HER1/c-Met 항체의 당구조 분석
푸코오스- 및 비-푸코오스 (a-푸코오스) 함유 올리고당 구조의 상대비를 측정하기 위해서, 정제된 항체 물질의 방출된 글리칸을 MALDI-Tof-질량분석에 의해 분석하였다. 이를 위해, 항체 샘플 (약 50 ㎍) 을 0.1 M 인산나트륨 완충액 (pH 6.0) 중 5 mU N-글리코시다아제 F (Prozyme# GKE-5010B) 와 함께 37℃ 에서 밤새 인큐베이션하여, 단백질 골격으로부터 올리고당을 방출시켰다. 이후, NuTip-Carbon 피펫 팁 (Glygen 에서 입수: NuTip1-10 ㎕, 카탈로그 번호 NT1CAR) 을 사용하여, 방출된 글리칸 구조를 단리하고 탈염하였다. 제 1 단계로서, 3 ㎕ 1 M NaOH 이후 20 ㎕ 순수 (예를 들어 Baker 사로부터의 HPLC-구배 등급, # 4218), 3 ㎕ 30% v/v 아세트산 및 다시 20 ㎕ 순수로 세척하여, NuTip-Carbon 피펫 팁을 올리고당 결합을 위해 제조하였다. 이를 위해, 각각의 용액을 NuTip-Carbon 피펫 팁 내 크로마토그래피 물질의 상부에 로딩하고 이를 통해 밀어넣었다. 이후, 상기 기재된 N-글리코시다아제 F 소화물을 4 내지 5 회 밀어올리고 내려, 10 ㎍ 항체에 상응하는 글리칸 구조를 NuTip-Carbon 피펫 팁 내 물질에 결합시켰다. NuTip-Carbon 피펫 팁 내 물질에 결합한 글리칸을 상기 기재된 방법으로 20 ㎕ 순수로 세척하고, 각각 0.5 ㎕ 10% 및 2.0 ㎕ 20% 아세토니트릴로 점차적으로 용리하였다. 상기 단계에 대해서, 용리 용액을 0.5 ㎖ 반응 바이알에 채우고, 각각 4 내지 5 회 밀어올리고 내렸다. MALDI-Tof 질량분석에 의한 분석을 위해, 용리물 모두를 조합하였다. 상기 측정을 위해, 0.4 ㎕ 의 조합된 용리물을 MALDI 표적 상에서 1.6 ㎕ SDHB 매트릭스 용액 (5 mg/㎖ 에서 20% 에탄올/5 mM NaCl 에 용해한 2.5-디히드록시벤조산/2-히드록시-5-메톡시벤조산 [Bruker Daltonics #209813]) 과 혼합하고, 적합하게 조정된 Bruker Ultraflex TOF/TOF 기기로 분석하였다. 일상적으로, 50-300 샷을 기록하고 단일 실험으로 요약하였다. 수득한 스펙트럼을 flex 분석 소프트웨어 (Bruker Daltonics) 에 의해 평가하고, 검출한 각각의 피크에 대해 질량을 측정하였다. 이후, 각각의 구조 (예를 들어, 각각 푸코오스를 갖고 푸코오스를 갖지 않는 복합체, 수소화물 및 올리고- 또는 고-만노오스) 에 대해 계산한 질량 및 이론적 예측 질량을 비교하여, 푸코오스 또는 a-푸코오스 (비-푸코오스) 함유 글리콜 구조에 대해 피크를 할당하였다.
수소화물 구조의 비율 측정을 위해, 항체 샘플을 N-글리코시다아제 F 및 엔도-글리코시다아제 H 로 부수적으로 소화시켰다. N-글리코시다아제 F 는 단백질 골격으로부터 모든 N-연결 글리칸 구조 (복합체, 수소화물 및 올리고- 및 고 만노오스 구조) 를 방출하며, 엔도-글리코시다아제 H 는 글리칸의 환원 말단에서의 2 개의 GlcNAc-잔기 사이에서 추가적으로 모든 수소화물 유형 글리칸을 절단한다. 이러한 소화물을 이후 N-글리코시다아제 F 소화 샘플에 대해 상기 기재된 바와 동일한 방법으로 처리하고 MALDI-Tof 질량분석에 의해 분석하였다. N-글리코시다아제 F 소화물, 및 조합된 N-글리코시다아제 F / 엔도 H 소화물로부터의 패턴을 비교함으로써, 특이적 당 (glyco) 구조의 신호 감소 정도를 수소화물 구조의 상대적 함량을 추정하는데 사용하였다.
각각의 당구조의 상대량을 개별적인 글리콜 구조의 피크 높이 및 검출된 모든 당 구조의 피크 높이 합의 비로부터 계산하였다. 푸코오스의 양은 N-글리코시다아제 F 처리된 샘플 (예를 들어, 각각 복합체, 수소화물 및 올리고- 및 고-만노오스 구조) 에서 확인된 모든 당 구조에 대한 푸코오스-함유 구조의 백분율이다. 아푸코실화량은 N-글리코시다아제 F 처리된 샘플 (예를 들어, 각각 복합체, 수소화물 및 올리고- 및 고-만노오스 구조) 에서 확인된 모든 당 구조에 대한 푸코오스-결핍 구조의 백분율이다.
실시예 12:
HER1/cMet 이중특이적 항체로의 처리 후 세포 이동의 분석
활성 c-Met 신호전달의 한 중요한 양상은 이동성 및 침습성 프로그램의 유도이다. c-Met 저해 항체의 효능은 HGF-유도 세포 이동의 저해를 측정함으로써 측정될 수 있다. 이러한 목적을 위해, HGF-유도성 암 세포주 A431 을 이중특이적 항체 또는 IgG 대조군 항체의 부재 또는 존재 하에 HGF 로 처리하고, 임피던스 정보판독을 갖는 CIM-플레이트를 사용하여 Acea 실시간 세포 분석기 상에서 시간 의존적 방법으로 8 ㎛ 포어를 통과해 이동하는 세포 수를 측정하였다.
실시예 13:
이중특이적 HER1/c-Met 항체의 시험관내 ADCC
본 발명에 따른 HER1/cMet 이중특이적 항체는 두 수용체 모두를 발현하는 세포 상에서 감소된 내재화를 나타낸다 (상응하는 단일특이적 부모 c-MET 항체와 비교할 때). 감소된 내재화는, 세포 표면 상 항체-수용체 복합체의 연장된 노출이 Nk 세포에 의해 인지되는 경우가 더 많다는 것으로서, 이들 항체를 당조작하기 위한 이론적 설명을 강력하게 지지한다. 감소된 내재화 및 당조작은 부모 항체에 비해 증강된 항체 의존적 세포 독성 (ADCC) 으로 환언된다. 세포 표면 상에서 HER1 및 cMet 를 모두 발현하는 암 세포, 예를 들어 A431, 및 Nk 세포주 또는 PBMC 와 같은 효과기 세포를 사용하여, 이러한 효과를 입증하기 위한 시험관내 실험 기구를 설계할 수 있다. 종양 세포를 부모 단일특이적 항체 또는 이중특이적 항체와 함께 24 시간까지 동안 예비인큐베이션한 후 효과기 세포주를 첨가하였다. 세포 용해를 정량화하고 단일- 및 이중특이적 항체를 판별하였다.
표적 세포, 예를 들어 PC-3 (DSMZ #ACC 465, 전립선 샘암종, Ham's F12 영양 혼합물 + 2 mM L-알라닐-L-글루타민 + 10% FCS 에서 배양) 을 지수 증식상에서 트립신/EDTA (Gibco # 25300-054) 로 수집하였다. 세척 단계 및 세포 수 및 생육성 확인 후 필요한 분취액을 칼세인 (Invitrogen #C3100MP; 1 바이알을 5 ㎖ 배지 중 5 Mio 세포에 대해 50 ㎕ DMSO 에 재현탁하였음) 과 함께 세포 인큐베이터에서 37℃ 에서 30 분 동안 라벨링하였다. 이후, 세포를 AIM-V 배지로 3 회 세척하고, 세포 수 및 생육성을 확인하고 세포 수를 0.3 Mio/㎖ 으로 조정하였다.
그 사이, 효과기 세포로서의 PBMC 를 제조사의 프로토콜에 따라 밀도 구배 원심분리 (Histopaque-1077, Sigma # H8889) 에 의해 제조하였다 (각각, 400g 에서 1x 및 350g 에서 2x 10 분 세척 단계). 세포 수 및 생육성을 확인하고 세포 수를 15 Mio/㎖ 로 조정하였다.
100 ㎕ 칼세인-염색된 표적 세포를 둥근 바닥 96-웰 플레이트에 플레이팅하고, 50 ㎕ 희석 항체를 첨가하고 50 ㎕ 효과기 세포를 첨가하였다. 일부 실험에서 표적 세포를 10 mg/㎖ Redimune 의 농도에서 Redimune
Figure pct00005
NF 액체 (ZLB Behring) 와 혼합하였다.
자연 발생적 용해를 제공하는 대조군으로서, 항체 없이 표적 및 효과기 세포를 동시-배양하여 측정하고, 최대 용해를 제공하는 대조군으로서, 표적 세포만의 1% Triton X-100 용해에 의해 측정하였다. 플레이트를 가습 세포 인큐베이터에서 37℃ 에서 4 시간 동안 인큐베이션하였다.
제조사의 지시사항에 따라 세포독성 검출 키트 (LDH 검출 키트, Roche # 1 644 793) 를 사용하여 손상된 세포로부터 LDH 방출을 측정함으로써 표적 세포의 사멸을 평가하였다. 간략하게는, 각 웰로부터의 100 ㎕ 상청액을 투명한 편평 바닥 96 웰 플레이트 내에서 키트로부터의 100 ㎕ 기질과 혼합하였다. 기질의 색 반응의 Vmax 값을 10 분 이상 동안 490 nm 에서 ELISA 판독기에서 측정하였다. 특이적 항체-매개 사멸의 백분율을 하기와 같이 계산하였다: ((A - SR)/(MR - SR) x 100 [식 중, A 는 특이적 항체 농도에서의 Vmax 의 평균이고, SR 은 자연 발생적 방출의 Vmax 의 평균이고, MR 은 최대 방출의 Vmax 의 평균임].
실시예 14
파라크린 HGF 루프를 갖는 피하 이종이식편 모델에서의 이중특이적 HER1 / cMet 항체의 생체내 효능
Mrc-5 세포와 동시주사한 피하 A549 모델은 c-Met 에 대한 파라크린 활성 루프를 모방한다. A549 는 c-Met 뿐 아니라 HER1 를 세포 표면 상에 발현한다. A549 및 Mrc-5 세포를 대수 생장상에서 표준 세포 배양 조건 하에 유지시켰다. A549 및 Mrc-5 세포를 천만개 A549 세포 및 백만개 Mrc-5 로 10:1 비로 주사하였다. 세포를 SCID 베이지 마우스에 이식하였다. 종양이 확립되고 100-150 ㎣ 크기에 도달한 후 처리를 시작하였다. 마우스를 20 mg/kg 의 항체 / 마우스의 로딩 용량으로 처리한 후 10 mg/kg 의 항체 / 마우스로 1 주 1 회 처리하였다. 종양 부피를 1 주 2 회 측정하고 동물의 체중을 병행하여 모니터링하였다. 단일 처리 및 단일 항체의 조합을 이중특이적 항체로의 치료요법과 비교하였다.
실시예 15
파라크린 HGF 루프를 갖는 피하 이종이식편 모델에서의 이중특이적 HER1 / cMet 항체의 생체내 효능
Mrc-5 세포와 동시주사한 피하 A431 모델은 c-Met 에 대한 파라크린 활성 루프를 모방한다. A431 는 c-Met 뿐 아니라 HER1 를 세포 표면 상에 발현한다. A431 및 Mrc-5 세포를 대수 생장상에서 표준 세포 배양 조건 하에 유지시켰다. A431 및 Mrc-5 세포를 천만개 A431 세포 및 백만개 Mrc-5 로 10:1 비로 주사하였다. 세포를 SCID 베이지 마우스에 이식하였다. 종양이 확립되고 100-150 ㎣ 크기에 도달한 후 처리를 시작하였다. 마우스를 20 mg/kg 의 항체 / 마우스의 로딩 용량으로 처리한 후 10 mg/kg 의 항체 / 마우스로 1 주 1 회 처리하였다. 종양 부피를 1 주 2 회 측정하고 동물의 체중을 병행하여 모니터링하였다. 단일 처리 및 단일 항체의 조합을 이중특이적 항체로의 치료요법과 비교하였다.
실시예 16
이중특이적 Her1/c-Met 항체에 의한 OVCAR-8 증식의 저해
a) OVCAR-8 세포는 유세포측정에서 독립적으로 확인한 바와 같이 HER1 의 높은 표면 수준 및 c-Met 의 중간으로 높은 세포 표면 발현을 나타내었다. 이중특이적 HER1/c-Met 항체에 의한 OVCAR-8 세포 증식의 저해를 48 시간 후 CellTiterGlowTM 검정에서 측정하였다. 결과를 도 10a 에 나타내었다. 대조군은 PBS 완충액이었다.
EGFR 항체 세투시맙은 저해를 나타내지 않았다 (0% 저해로 설정한 완충액 대조군과 비교하여). 이중특이적 HER1/c-Met BsAB01 (BsAb) 항체는 암 세포 증식의 작지만 유의한 저해를 유발하였다 (8% 저해). 1 가 c-Met 항체 1-완 5D5 (OA5D5) 는 증식에 대해 효과를 나타내지 않았다. EGFR 항체 세투시맙 및 1 가 c-Met 항체 1-완 5D5 (OA5D5) 의 조합은 증식의 감소를 거의 초래하지 않았다 (2% 저해).
b) OVCAR-8 는 HGF 로 추가로 자극될 수 있다. 활성 EGFR - c-Met-수용체 신호전달 네트워크가 발생하는 위치를 자극하기 위해, a) 에 기재한 바와 같으나 HGF-조건화 배지의 존재 하에 추가적인 증식 검정을 수행하였다 (48 시간 후 CellTiterGlowTM 검정). 결과를 도 10b 에 나타내었다.
HGF 의 첨가는 증식의 증가 (10%) 를 초래했다. 0% 저해로 설정된 오직 HGF 만으로 처리된 세포와 비교할 때, EGFR 항체 세투시맙 뿐만 아니라 1가 c-MET 항체 1-완 5D5 (OA5D5) 은 증식에 오직 미미한 저해 효과 (2%, 7%) 를 나타냈다. 이중특이적 HER1/c-Met 항체 BsAB01 (BsAb) (15% 저해) 는 Ovcar-8 세포의 암 세포 증식의 현저한 저해를 나타내었다. EGFR 항체 세투시맙 및 1 가 c-Met 항체 1-완 5D5 (OA5D5) 의 조합은 세포 증식에 있어서 덜 현저한 감소를 유발하였다 (10% 저해).
SEQUENCE LISTING <110> Roche Glycart AG <120> Bispecific anti-ErbB-1/anti-c-Met antibodies <130> 26066 WO <150> EP 09005109.5 <151> 2009-04-07 <160> 34 <170> PatentIn version 3.2 <210> 1 <211> 119 <212> PRT <213> mus musculus <400> 1 Gln Val Gln Leu Lys Gln Ser Gly Pro Gly Leu Val Gln Pro Ser Gln 1 5 10 15 Ser Leu Ser Ile Thr Cys Thr Val Ser Gly Phe Ser Leu Thr Asn Tyr 20 25 30 Gly Val His Trp Val Arg Gln Ser Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Leu 35 40 45 Gly Val Ile Trp Ser Gly Gly Asn Thr Asp Tyr Asn Thr Pro Phe Thr 50 55 60 Ser Arg Leu Ser Ile Asn Lys Asp Asn Ser Lys Ser Gln Val Phe Phe 65 70 75 80 Lys Met Asn Ser Leu Gln Ser Asn Asp Thr Ala Ile Tyr Tyr Cys Ala 85 90 95 Arg Ala Leu Thr Tyr Tyr Asp Tyr Glu Phe Ala Tyr Trp Gly Gln Gly 100 105 110 Thr Leu Val Thr Val Ser Ala 115 <210> 2 <211> 107 <212> PRT <213> mus musculus <400> 2 Asp Ile Leu Leu Thr Gln Ser Pro Val Ile Leu Ser Val Ser Pro Gly 1 5 10 15 Glu Arg Val Ser Phe Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Gly Thr Asn 20 25 30 Ile His Trp 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Gly Arg Cys Arg 210 215 220 Gly Lys Ser Pro Ser Asp Cys Cys His Asn Gln Cys Ala Ala Gly Cys 225 230 235 240 Thr Gly Pro Arg Glu Ser Asp Cys Leu Val Cys Arg Lys Phe Arg Asp 245 250 255 Glu Ala Thr Cys Lys Asp Thr Cys Pro Pro Leu Met Leu Tyr Asn Pro 260 265 270 Thr Thr Tyr Gln Met Asp Val Asn Pro Glu Gly Lys Tyr Ser Phe Gly 275 280 285 Ala Thr Cys Val Lys Lys Cys Pro Arg Asn Tyr Val Val Thr Asp His 290 295 300 Gly Ser Cys Val Arg Ala Cys Gly Ala Asp Ser Tyr Glu Met Glu Glu 305 310 315 320 Asp Gly Val Arg Lys Cys Lys Lys Cys Glu Gly Pro Cys Arg Lys Val 325 330 335 Cys Asn Gly Ile Gly Ile Gly Glu Phe Lys Asp Ser Leu Ser Ile Asn 340 345 350 Ala Thr Asn Ile Lys His Phe Lys Asn Cys Thr Ser Ile Ser Gly Asp 355 360 365 Leu His Ile Leu Pro Val Ala Phe Arg Gly Asp Ser Phe Thr His Thr 370 375 380 Pro Pro Leu Asp Pro Gln Glu Leu Asp Ile Leu Lys Thr Val Lys Glu 385 390 395 400 Ile Thr Gly Phe Leu Leu Ile Gln Ala Trp Pro Glu Asn Arg Thr Asp 405 410 415 Leu His Ala Phe Glu Asn Leu Glu Ile Ile Arg Gly Arg Thr Lys Gln 420 425 430 His Gly Gln Phe Ser Leu Ala Val Val Ser Leu Asn Ile Thr Ser Leu 435 440 445 Gly Leu Arg Ser Leu Lys Glu Ile Ser Asp Gly Asp Val Ile Ile Ser 450 455 460 Gly Asn Lys Asn Leu Cys Tyr Ala Asn Thr Ile Asn Trp Lys Lys Leu 465 470 475 480 Phe Gly Thr Ser Gly Gln Lys Thr Lys Ile Ile Ser Asn Arg Gly Glu 485 490 495 Asn Ser Cys Lys Ala Thr Gly Gln Val Cys His Ala Leu Cys Ser Pro 500 505 510 Glu Gly Cys Trp Gly Pro Glu Pro Arg Asp Cys Val Ser Cys Arg Asn 515 520 525 Val Ser Arg Gly Arg Glu Cys Val Asp Lys Cys Asn Leu Leu Glu Gly 530 535 540 Glu Pro Arg Glu Phe Val Glu Asn Ser Glu Cys Ile Gln Cys His Pro 545 550 555 560 Glu Cys Leu Pro Gln Ala Met Asn Ile Thr Cys Thr Gly Arg Gly Pro 565 570 575 Asp Asn Cys Ile Gln Cys Ala His Tyr Ile Asp Gly Pro His Cys Val 580 585 590 Lys Thr Cys Pro Ala Gly Val Met Gly Glu Asn Asn Thr Leu Val Trp 595 600 605 Lys Tyr Ala Asp Ala Gly His Val Cys His Leu Cys His Pro Asn Cys 610 615 620 Thr Tyr Gly Cys Thr Gly Pro Gly Leu Glu Gly Cys Pro Thr Asn Gly 625 630 635 640 Pro Lys Ile Pro Ser Ile Ala Thr Gly Met Val Gly Ala Leu Leu Leu 645 650 655 Leu Leu Val Val Ala Leu Gly Ile Gly Leu Phe Met Arg Arg Arg His 660 665 670 Ile Val Arg Lys Arg Thr Leu Arg Arg Leu Leu Gln Glu Arg Glu Leu 675 680 685 Val Glu Pro Leu Thr Pro Ser Gly Glu Ala Pro Asn Gln Ala Leu Leu 690 695 700 Arg Ile Leu Lys Glu Thr Glu Phe Lys Lys Ile Lys Val Leu Gly Ser 705 710 715 720 Gly Ala Phe Gly Thr Val Tyr Lys Gly Leu Trp Ile Pro Glu Gly Glu 725 730 735 Lys Val Lys Ile Pro Val Ala Ile Lys Glu Leu Arg Glu Ala Thr Ser 740 745 750 Pro Lys Ala Asn Lys Glu Ile Leu Asp Glu Ala Tyr Val Met Ala Ser 755 760 765 Val Asp Asn Pro His Val Cys Arg Leu Leu Gly Ile Cys Leu Thr Ser 770 775 780 Thr Val Gln Leu Ile Thr Gln Leu Met Pro Phe Gly Cys Leu Leu Asp 785 790 795 800 Tyr Val Arg Glu His Lys Asp Asn Ile Gly Ser Gln Tyr Leu Leu Asn 805 810 815 Trp Cys Val Gln Ile Ala Lys Gly Met Asn Tyr Leu Glu Asp Arg Arg 820 825 830 Leu Val His Arg Asp Leu Ala Ala Arg Asn Val Leu Val Lys Thr Pro 835 840 845 Gln His Val Lys Ile Thr Asp Phe Gly Leu Ala Lys Leu Leu Gly Ala 850 855 860 Glu Glu Lys Glu Tyr His Ala Glu Gly Gly Lys Val Pro Ile Lys Trp 865 870 875 880 Met Ala Leu Glu Ser Ile Leu His Arg Ile Tyr Thr His Gln Ser Asp 885 890 895 Val Trp Ser Tyr Gly Val Thr Val Trp Glu Leu Met Thr Phe Gly Ser 900 905 910 Lys Pro Tyr Asp Gly Ile Pro Ala Ser Glu Ile Ser Ser Ile Leu Glu 915 920 925 Lys Gly Glu Arg Leu Pro Gln Pro Pro Ile Cys Thr Ile Asp Val Tyr 930 935 940 Met Ile Met Val Lys Cys Trp Met Ile Asp Ala Asp Ser Arg Pro Lys 945 950 955 960 Phe Arg Glu Leu Ile Ile Glu Phe Ser Lys Met Ala Arg Asp Pro Gln 965 970 975 Arg Tyr Leu Val Ile Gln Gly Asp Glu Arg Met His Leu Pro Ser Pro 980 985 990 Thr Asp Ser Asn Phe Tyr Arg Ala Leu Met Asp Glu Glu Asp Met Asp 995 1000 1005 Asp Val Val Asp Ala Asp Glu Tyr Leu Ile Pro Gln Gln Gly Phe 1010 1015 1020 Phe Ser Ser Pro Ser Thr Ser Arg Thr Pro Leu Leu Ser Ser Leu 1025 1030 1035 Ser Ala Thr Ser Asn Asn Ser Thr Val Ala Cys Ile Asp Arg Asn 1040 1045 1050 Gly Leu Gln Ser Cys Pro Ile Lys Glu Asp Ser Phe Leu Gln Arg 1055 1060 1065 Tyr Ser Ser Asp Pro Thr Gly Ala Leu Thr Glu Asp Ser Ile Asp 1070 1075 1080 Asp Thr Phe Leu Pro Val Pro Glu Tyr Ile Asn Gln Ser Val Pro 1085 1090 1095 Lys Arg Pro Ala Gly Ser Val Gln Asn Pro Val Tyr His Asn Gln 1100 1105 1110 Pro Leu Asn Pro Ala Pro Ser Arg Asp Pro His Tyr Gln Asp Pro 1115 1120 1125 His Ser Thr Ala Val Gly Asn Pro Glu Tyr Leu Asn Thr Val Gln 1130 1135 1140 Pro Thr Cys Val Asn Ser Thr Phe Asp Ser Pro Ala His Trp Ala 1145 1150 1155 Gln Lys Gly Ser His Gln Ile Ser Leu Asp Asn Pro Asp Tyr Gln 1160 1165 1170 Gln Asp Phe Phe Pro Lys Glu Ala Lys Pro Asn Gly Ile Phe Lys 1175 1180 1185 Gly Ser Thr Ala Glu Asn Ala Glu Tyr Leu Arg Val Ala Pro Gln 1190 1195 1200 Ser Ser Glu Phe Ile Gly Ala 1205 1210 <210> 17 <211> 11 <212> PRT <213> mus musculus <400> 17 Ala Leu Thr Tyr Tyr Asp Tyr Glu Phe Ala Tyr 1 5 10 <210> 18 <211> 16 <212> PRT <213> mus musculus <400> 18 Val Ile Trp Ser Gly Gly Asn Thr Asp Tyr Asn Thr Pro Phe Thr Ser 1 5 10 15 <210> 19 <211> 5 <212> PRT <213> mus musculus <400> 19 Asn Tyr Gly Val His 1 5 <210> 20 <211> 9 <212> PRT <213> mus musculus <400> 20 Gln Gln Asn Asn Asn Trp Pro Thr Thr 1 5 <210> 21 <211> 7 <212> PRT <213> mus musculus <400> 21 Tyr Ala Ser Glu Ser Ile Ser 1 5 <210> 22 <211> 11 <212> PRT <213> mus musculus <400> 22 Arg Ala Ser Gln Ser Ile Gly Thr Asn Ile His 1 5 10 <210> 23 <211> 11 <212> PRT <213> Artificial <220> <223> heavy chain CDR3H, <ErbB-1> humanized ICR62 <400> 23 Leu Ser Pro Gly Gly Tyr Tyr Val Met Asp Ala 1 5 10 <210> 24 <211> 17 <212> PRT <213> Artificial <220> <223> heavy chain CDR2H, <ErbB-1> humanized ICR62 <400> 24 Tyr Phe Asn Pro Asn Ser Gly Tyr Ser Thr Tyr Ala Gln Lys Phe Gln 1 5 10 15 Gly <210> 25 <211> 5 <212> PRT <213> Artificial <220> <223> heavy chain CDR1H, <ErbB-1> humanized ICR62 <400> 25 Asp Tyr Lys Ile His 1 5 <210> 26 <211> 8 <212> PRT <213> Artificial <220> <223> light chain CDR3L, <ErbB-1> humanized ICR62 <400> 26 Leu Gln His Asn Ser Phe Pro Thr 1 5 <210> 27 <211> 7 <212> PRT <213> Artificial <220> <223> light chain CDR2L, <ErbB-1> humanized ICR62 <400> 27 Asn Thr Asn Asn Leu Gln Thr 1 5 <210> 28 <211> 11 <212> PRT <213> Artificial <220> <223> light chain CDR1L, <ErbB-1> humanized ICR62 <400> 28 Arg Ala Ser Gln Gly Ile Asn Asn Tyr Leu Asn 1 5 10 <210> 29 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial <220> <223> heavy chain CDR3H, <c-Met> Mab 5D5 <400> 29 Tyr Arg Ser Tyr Val Thr Pro Leu Asp Tyr 1 5 10 <210> 30 <211> 17 <212> PRT <213> Artificial <220> <223> heavy chain CDR2H, <c-Met> Mab 5D5 <400> 30 Met Ile Asp Pro Ser Asn Ser Asp Thr Arg Phe Asn Pro Asn Phe Lys 1 5 10 15 Asp <210> 31 <211> 5 <212> PRT <213> Artificial <220> <223> heavy chain CDR1H, <c-Met> Mab 5D5 <400> 31 Ser Tyr Trp Leu His 1 5 <210> 32 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial <220> <223> light chain CDR3L, <c-Met> Mab 5D5 <400> 32 Gln Gln Tyr Tyr Ala Tyr Pro Trp Thr 1 5 <210> 33 <211> 7 <212> PRT <213> Artificial <220> <223> light chain CDR2L, <c-Met> Mab 5D5 <400> 33 Trp Ala Ser Thr Arg Glu Ser 1 5 <210> 34 <211> 17 <212> PRT <213> Artificial <220> <223> light chain CDR1L, <c-Met> Mab 5D5 <400> 34 Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Tyr Thr Ser Ser Gln Lys Asn Tyr Leu 1 5 10 15 Ala

Claims (13)

  1. OVCAR-8 세포 상에서 흐름 세포측정 검정으로 2 시간 후 측정되는 경우, 이중특이적 항체의 부재 하에서의 c-Met 의 내재화에 비해 15 % 이하의 c-Met 의 내재화를 보이는 것을 특징으로 하는, 인간 ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 제 1 항원-결합 자리 및 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 제 2 항원-결합 자리를 포함하는 인간 ErbB-1 및 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 이중특이적 항체.
  2. 제 1 항에 있어서, 인간 ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 1 개 또는 2 개의 항원-결합 자리 및 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 제 3 항원-결합 자리를 포함하는, 2가 또는 3가인 것을 특징으로 하는 이중특이적 항체.
  3. 제 2 항에 있어서, 하기를 포함하는 것을 특징으로 하는 항체:
    a) 2 개의 항체 중쇄 및 2 개의 항체 경쇄로 이루어지는, 인간 ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 전장 항체; 및
    b) 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 1 개의 단일쇄 Fab 단편,
    상기 b) 에서의 상기 단일쇄 Fab 단편은 상기 전장 항체의 중 또는 경쇄의 C- 또는 N- 말단에서 펩티드 연결기를 통해 a) 에서의 상기 전장 항체에 융합됨.
  4. 하기를 특징으로 하는, 인간 ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 제 1 항원-결합 자리 및 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 제 2 항원-결합 자리를 포함하는 인간 ErbB-1 및 인간 c-Met 에 특이적으로 결합하는 이중특이적 항체:
    i) 상기 제 1 항원-결합 자리는 중쇄 가변 도메인 내에 SEQ ID NO: 17 의 CDR3H 영역, SEQ ID NO: 18 의 CDR2H 영역, 및 SEQ ID NO:19 의 CDR1H 영역, 및 경쇄 가변 도메인 내에 SEQ ID NO: 20 의 CDR3L 영역, SEQ ID NO:21 의 CDR2L 영역, 및 SEQ ID NO:58 의 CDR1L 영역 또는 SEQ ID NO:22 의 CDR1L 영역을 포함하고;
    상기 제 2 항원-결합 자리는 중쇄 가변 도메인 내에 SEQ ID NO: 30 의 CDR3H 영역, SEQ ID NO: 31 의 CDR2H 영역, 및 SEQ ID NO: 32 의 CDR1H 영역, 및 경쇄 가변 도메인 내에 SEQ ID NO: 33 의 CDR3L 영역, SEQ ID NO: 34 의 CDR2L 영역, 및 SEQ ID NO: 35 의 CDR1L 영역을 포함함, 또는
    ii) 상기 제 1 항원-결합 자리는 중쇄 가변 도메인 내에 SEQ ID NO: 23 의 CDR3H 영역, SEQ ID NO: 24 의 CDR2H 영역, 및 SEQ ID NO:25 의 CDR1H 영역, 및 경쇄 가변 도메인 내에 SEQ ID NO: 26 의 CDR3L 영역, SEQ ID NO:27 의 CDR2L 영역, 및 SEQ ID NO:28 의 CDR1L 영역 또는 SEQ ID NO:29 의 CDR1L 영역을 포함하고;
    상기 제 2 항원-결합 자리는 중쇄 가변 도메인 내에 SEQ ID NO: 30 의 CDR3H 영역, SEQ ID NO: 31 의 CDR2H 영역, 및 SEQ ID NO: 32 의 CDR1H 영역, 및 경쇄 가변 도메인 내에 SEQ ID NO: 33 의 CDR3L 영역, SEQ ID NO: 34 의 CDR2L 영역, 및 SEQ ID NO: 35 의 CDR1L 영역을 포함함.
  5. 제 4 항에 있어서, 하기를 특징으로 하는 이중특이적 항체:
    i) ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 상기 제 1 항원-결합 자리는 중쇄 가변 도메인으로서 SEQ ID NO: 1 의 서열, 및 경쇄 가변 도메인으로서 SEQ ID NO: 2 의 서열을 포함하고;
    c-Met 에 특이적으로 결합하는 상기 제 2 항원-결합 자리는 중쇄 가변 도메인으로서 SEQ ID NO: 5 의 서열, 및 경쇄 가변 도메인으로서 SEQ ID NO: 6 의 서열을 포함함; 또는
    ii) ErbB-1 에 특이적으로 결합하는 상기 제 1 항원-결합 자리는 중쇄 가변 도메인으로서 SEQ ID NO: 3 의 서열, 및 경쇄 가변 도메인으로서 SEQ ID NO: 4 의 서열을 포함하고;
    c-Met 에 특이적으로 결합하는 상기 제 2 항원-결합 자리는 중쇄 가변 도메인으로서 SEQ ID NO: 5 의 서열, 및 경쇄 가변 도메인으로서 SEQ ID NO: 6 의 서열을 포함함.
  6. 제 1 항 내지 제 5 항 중 어느 한 항에 있어서, IgG1 또는 IgG3 서브클래스의 불변 영역을 포함하는 것을 특징으로 하는 이중특이적 항체.
  7. 제 1 항 내지 제 6 항 중 어느 한 항에 있어서, Asn297 에서 당쇄로 글리코실화되어 상기 당쇄 내의 푸코오스의 양이 65 % 이하인 것을 특징으로 하는 이중특이적 항체.
  8. 제 1 항 내지 제 7 항 중 어느 한 항에 따른 이중특이적 항체를 인코딩하는 핵산.
  9. 제 1 항 내지 제 7 항 중 어느 한 항에 따른 이중특이적 항체를 포함하는 약학 조성물.
  10. 제 9 항에 있어서, 암 치료를 위한 약학 조성물.
  11. 제 1 항 내지 제 7 항 중 어느 한 항에 있어서, 암 치료를 위한 이중특이적 항체.
  12. 암 치료용 약제의 제조를 위한, 제 1 항 내지 제 7 항 중 어느 한 항에 따른 이중특이적 항체의 용도.
  13. 치료를 필요로 하는 환자에게 제 1 항 내지 제 7 항 중 어느 한 항에 따른 이중특이적 항체를 투여하는 것에 의하는 암 환자의 치료 방법.
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