BG63285B2 - Production of human pluripotent granulocytic colony-stimulation factor - Google Patents

Production of human pluripotent granulocytic colony-stimulation factor Download PDF

Info

Publication number
BG63285B2
BG63285B2 BG096058A BG9605892A BG63285B2 BG 63285 B2 BG63285 B2 BG 63285B2 BG 096058 A BG096058 A BG 096058A BG 9605892 A BG9605892 A BG 9605892A BG 63285 B2 BG63285 B2 BG 63285B2
Authority
BG
Bulgaria
Prior art keywords
csf
hpg
cells
dna sequence
expression
Prior art date
Application number
BG096058A
Other languages
Bulgarian (bg)
Inventor
Lawrence SOUZA
Original Assignee
Kirin-Amgen Inc.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Kirin-Amgen Inc. filed Critical Kirin-Amgen Inc.
Publication of BG63285B2 publication Critical patent/BG63285B2/en

Links

Landscapes

  • Peptides Or Proteins (AREA)

Abstract

The invention relates to new polypeptides possessing part or the entire primary structural conformation and one or more biological properties of pluropotent granulocytic colony-stimulation factor (hpG-CSF) from a mammal. They are characterized by preferable forms as a product of prokaryotic and eukariotic expression in a host of exogenous DNA sequence. Sequences encoding part of the entire sequence of the amino acid residues of hpG-CSF or its analogues are incorporated in an autonomously replicating plasmide or viral vectors used for the transformation or transfection of suitable cells of prokaryotic or eukaryotic hosts such as bacteria, yeasts or cellular cultures of vertebrates. The products of the DNA sequence expression indicate the physical and the immunological properties and in vitro biological activities of hpG-CSF isolates originating from natural sources. The invention also relates to chemically synthesized polypeptides sharing the biochemical and the immunological properties of the hpG-CSF. 5 claims, 1 figure

Description

ТЕХНИЧЕСКА СЪЩНОСТ НА ИЗОБРЕТЕНИЕТОSUMMARY OF THE INVENTION

Съгласно настоящето изобретение се предоставят ДНК последователности , кодиращи цял или част от hpG-CSF. Такива последователности могат да включват: инкорпориране на кодони , “предпочитани” за експресия от избрани безгръбначни гостоприемници; предвиждането на сайтове за разцепване от рестрикционни ендонуклеазни ензими; и осигуряването на допълнителни първоначални терминални или междинни ДНК последователности, което улеснява конструирането на бързо експресирани вектори. Настоящото изобретение предоставя също така ДНК последователности, кодиращи за микробиална експресия на полипептидни аналози или производни на hpG-CSF, които се различават от естествено съществуващите в природата форми по идентичност или месторазположение на един или повече аминокиселинни остатъци (т.е. делеционни аналозисъдър жащи по-малко от всички други остатъци, определен и за hpGCSF; аналози със замествания като [Ser17] hpG-CSF, при които един или повече определени остатъци се заместват с други остатъци; и аналози с прибавяне, при които един или повече аминокиселинни остатъци се прибавят към краен или среден участък на полипептида) и които споделят едно или повече свойства на естествено съществуващите в природата форми.According to the present invention, DNA sequences encoding all or part of hpG-CSF are provided. Such sequences may include: incorporation of codons "preferred" for expression by selected invertebrate hosts; predicting cleavage sites from restriction endonuclease enzymes; and providing additional initial terminal or intermediate DNA sequences, which facilitates the construction of rapidly expressed vectors. The present invention also provides DNA sequences encoding for microbial expression of polypeptide analogs or hpG-CSF derivatives that differ from naturally occurring forms by identity or location of one or more amino acid residues (i.e., deletion analogs containing least of all the other residues, designated as hpGCSF; analogs with substitutions as [Ser 17] hpGCSF, in which one or more residues specified are replaced by other residues; and analogs of addition in which a single yl more amino acid residues are added to a terminal or middle portion of the polypeptide) and which share one or more properties of the naturally occurring forms.

Новите ДНК последователности на изобретението включват последователности, полезни за осигуряване на експресията в прокариотни или еукариотни клетки гостоприемници на полипептидни продукти.притежаващи поне част от първоначалната структурна конформация и едно или повече от биологичните свойства на естествено съществуващ в природата плурипотентен гранулоцитен колониястимул и ращ фактор. Установено е, че ДНК последователностите на изобретението специфично включват : а) ДНК последователноста, посочена на таблица 7 и таблица 8 или техните комплементарни вериги; б) ДНК последователност, която хибридизира (при условия на хибридизация, както са илюстрирани в настоящото или по-строги условия) към ДНК последователностите от таблица 7 или към техни фрагмени; и в) ДНК последователност, която поради разпадане на генетичния код би хибридизирала към ДНК последователноста от таблица 7. Характерно, към точка б) се включват геномни ДНК последователности,кодиращи форми на алелни варианти на hpG-CSF и/или кодиращи плурипотентен гранулоцитен колония-стимулиращ фактор от други видове бозайници. Характерно, към точка в) се включват произведени ДНК последователности , кодиращи hpG-CSF, фрагменти на hpG-CSF и аналози на hpG-CSF, чиито ДНК последователности могат да включват кодони, улесняващи транслацията на информационна РНК в микробиални гостоприемници. Такива произведени последователности лесно могат да се конструират съгласно методите на Alton, et al., РСТ публикувана заявка WO 83/04053.The novel DNA sequences of the invention include sequences useful for providing expression in prokaryotic or eukaryotic host cells of polypeptide products having at least part of the initial structural conformation and one or more of the biological properties of a naturally occurring pluripotent granulocyte colony stimulator. It has been found that the DNA sequences of the invention specifically include: a) the DNA sequence shown in Table 7 and Table 8 or their complementary strands; b) a DNA sequence that hybridizes (under hybridization conditions as illustrated herein or more stringent conditions) to the DNA sequences of Table 7 or to fragments thereof; and c) a DNA sequence which, due to the breakdown of the genetic code, would hybridize to the DNA sequence of Table 7. Typically, item b) includes genomic DNA sequences encoding allelic variants of hpG-CSF and / or encoding a pluripotent granulocyte colony- stimulating factor of other mammalian species. Typically, item c) includes DNA sequences encoding hpG-CSF, fragments of hpG-CSF, and analogs of hpG-CSF, whose DNA sequences may include codons that facilitate translation of RNA into microbial hosts. Such produced sequences can be readily constructed according to the methods of Alton, et al., PCT published application WO 83/04053.

В настоящото изобретение също се включват този клас полипептиди,кодирани от участъци на ДНК комплемент към top веригата на човешки сДНК или геномни ДНК последователности от таблица 7 или таблица 8 от настоящото, т.е. “комплементарни инвертирани протеини, както е описано от Tramontano, et al., Nucleic Acids Res., 12,5049-5059 (1984).The present invention also includes this class of polypeptides encoded by strands of DNA complement to the top strand of human cDNA or genomic DNA sequences of Table 7 or Table 8 of the present, i. Complementary inverted proteins, as described by Tramontano, et al., Nucleic Acids Res., 12.5049-5059 (1984).

Настоящото изобретение предоставя пречистени и изолирани полипептидни продукти.. притежаващи част или цялата от първичната структурна конформация (т.е. непрекъсната последователност на аминокиселинни остатъци) и едно или повече от биологичните свойства (например, имунологични свойства и in vitro биологична активност) и физични свойства (например молекулно тегло) на естествено съществуващи в природата hpG-CSF включително техни алелни варианти. Тези полипептиди също така се характеризират с това, че са продукт на химични процедури на синтез или на експресия в прокариотен или еукариотен гостоприемник (например от бактерии, дрожди, висши растения, насекоми и клетъчни култури от гръбначни) на екзогенни ДНК последователности, получен и чрез геномно или сДНК кпониране или чрез генен синтез. Продуктите на типични дрожди (например, Saccharomyces cerevisiae) или прокариотни [Escherichia coli (E. coli)] клетки гостоприемници не са в асоциация с които и да са протеини от бозайници. Продуктите от микробиална експресия в клетки на гръбначни (например, бозайници не-хора и птици) не са асоциирани с които и да са човешки протеини. Според използвания гостоприемник полипептидите на изобретението могат да са гликолизилирани с въглехидрати от бозайници и други еукариотни или могат да не са гликозилирани. Полипептидите на изобретението също така могат да включват един първоначален метионинов аминокиселинен остатък (в позиция -1).The present invention provides purified and isolated polypeptide products .. having part or all of the primary structural conformation (i.e., a continuous sequence of amino acid residues) and one or more biological properties (e.g., immunological properties and in vitro biological activity) and physical properties (e.g. molecular weight) of naturally occurring hpG-CSFs including allelic variants. These polypeptides are also characterized by being the product of chemical procedures for synthesis or expression in a prokaryotic or eukaryotic host (e.g., from bacteria, yeast, higher plants, insects and vertebrate cell cultures) of exogenous DNA sequences obtained also by genomic or cDNA coupling or by gene synthesis. The products of typical yeast (e.g., Saccharomyces cerevisiae) or prokaryotic [Escherichia coli (E. coli)] host cells are not associated with any mammalian proteins. Microbial expression products in vertebrate cells (e.g., non-human and bird mammals) are not associated with any human proteins. According to the host used, the polypeptides of the invention may be glycosylated with carbohydrates from mammals and other eukaryotes or may not be glycosylated. The polypeptides of the invention may also include an initial methionine amino acid residue (at position -1).

Изобретението включва също така фармацевтични състави, съдържащи ефективно количество полипептидни продукти от изобретението заедно с подходящ разредител, помощни средства и/или носители полезни в hpG-CSF терапията.The invention also includes pharmaceutical compositions containing an effective amount of the polypeptide products of the invention together with a suitable diluent, adjuvants and / or carriers useful in hpG-CSF therapy.

Полипептидните продукти на изобретението могат да бъдат “белязани” чрез асоцииран е' с откриваеми маркерни вещества (например, белязан е изотопи с 1251)> за да се предоставят реагенти .полезни за откриване или количествено определяне на човешки hpG-CSF в твърди тъкани и течни проби като кръв или урина. ДНК продуктите на изобретението могат също да се бележат с откриваеми маркери (като радиомаркери и не-изотопни макери като биотин) и да се използуват при процесите на ДНК хибридизиране, за да се локализира позицията на гена на човешкия hpG-CSF и/или позицията на което и да е свързано генно семейство в хромозомната карта. Те могат също така да се използуват за идентифициране на човешки hpG-CSF генни нарушения наThe polypeptide products of the invention may be " labeled " associated with " detectable marker substances (e.g., isotope labeled with 125 l) < / RTI > to provide reagents useful for detecting or quantifying human hpG-CSF in solid tissues and liquid samples such as blood or urine. The DNA products of the invention can also be labeled with detectable markers (such as radiomarkers and non-isotope markers such as biotin) and used in DNA hybridization processes to localize the position of the human hpG-CSF gene and / or the position of any related gene family in the chromosome map. They can also be used to identify human hpG-CSF gene disorders

ДНК ниво и да се използуват като генни маркери за идентифициране на съседните гени и тяхни нарушения.DNA level and to be used as gene markers to identify neighboring genes and their disorders.

Полипептидните продукти на настоящото изобретение могат да са полезни самостоятелно или в комбинация с други хематопоетични фактори или лекарствени средства при лечението на хематопоетични нарушения като апластична анемия. Те могат също така да са полезни за лечение на хематопоетичен дефицит, получен в следствие на хемотерапия или на радиационна терапия. Успехът на трансплантирането на костен мозък например може да се засили чрез прилагане на hpG-CSF. Оздравителният процес при лечение на рани от изгаряне и лечението на бактериално възпаление също може да се възползува от прилагането на hpG-CSF. Освен това hpG-CSF може също да е полезен при лечението на левкемия 5 основаваща се на съобщена способност за диференцииране на левкемичните клетки. Welte, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA), 82, 1526-1530 (1985) u Sachs, no-rope.The polypeptide products of the present invention may be useful alone or in combination with other hematopoietic factors or drugs in the treatment of hematopoietic disorders such as aplastic anemia. They may also be useful for treating hematopoietic deficits resulting from chemotherapy or radiation therapy. For example, the success of bone marrow transplantation can be enhanced by the administration of hpG-CSF. The healing process in the treatment of burn wounds and the treatment of bacterial inflammation may also benefit from the administration of hpG-CSF. In addition, hpG-CSF may also be useful in the treatment of leukemia 5 based on the reported ability to differentiate leukemic cells. Welte, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA), 82, 1526-1530 (1985) in Sachs, no-rope.

Многобройни аспекти и предимства на изобретението ще станат явни за специалистите в областа след разглеждане на следващото подробно описание, което предоставя илюстративен материал за практическото приложение на изобретението в предпочетани варианти за изпълнение на изобретението.Numerous aspects and advantages of the invention will become apparent to those skilled in the art upon consideration of the following detailed description, which provides illustrative material for the practical application of the invention in preferred embodiments of the invention.

КРАТКО ОПИСАНИЕ НА ФИГУРИТЕBRIEF DESCRIPTION OF THE FIGURES

Фигурата е частична рестрикционна ендонуклеазна карта на hpG-CSF гена > придружена от стрелки, обозначаващи използуваната стратегия за секвениране за получаване на геномната последователност.The figure is a partial restriction endonuclease map of the hpG-CSF gene> accompanied by arrows indicating the sequencing strategy used to obtain the genomic sequence.

ПОДРОБНО ОПИСАНИЕ НА ИЗОБРЕТЕНИЕТОDETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION

Съгласно настоящето изобретение са изолирани и охарактеризирани ДНК последователноститеч кодиращи част или цялата полипептидна последователност на hpG-CSF.According to the present invention, the DNA sequences h encoding part or all of the hpG-CSF polypeptide sequence are isolated and characterized.

Следващите примери са предоставени за илюстриране на изобретението и по-специално са насочени към процедурите, провеждани преди идентифицирането на сДНК на hpG-CSF и на геномните клонове, към процедури водещи до такова идентифициране и до секвенирането, развитието на експресионните системи, основаващи се на сДНК, геномни и произведени гени и проверката на експресията на hpG-CSF и аналогични продукти при такива системи.The following examples are provided to illustrate the invention and in particular are directed to procedures carried out prior to the identification of hpG-CSF cDNA and genomic clones, to procedures leading to such identification and to the sequencing, development of cDNA-based expression systems. , genomic and produced genes and verification of hpG-CSF expression and similar products in such systems.

По-специално пример 1 се отнася до секвениране на аминокиселинната последователност на hpG-CSF. Пример 2 се отнася до изготвянето на сДНК библиотека за скрининг за хибридизация на колонии. Пример 3 се отнася до конструирането на хибридизационни проби. Пример 4 се отнася до информация за хибридизационен скрининг, идентифициране на положителни клонове, ДНК секвениране на положителен сДНК клон и генериране на полипептидна първична структурна конформция (аминокиселинна последователност ). Пример 5 се отнася до идентифициране и секвениране на геномен клон,кодиращ hpG-CSF. Пример 6 се отнася до конструирането на произведен ген, кодиращ hpGCSF, при което се използуват за предпочитане кодони на Е. coli.In particular, Example 1 relates to the sequencing of the amino acid sequence of hpG-CSF. Example 2 relates to the preparation of a cDNA library for screening for colony hybridization. Example 3 relates to the construction of hybridization samples. Example 4 relates to hybridization screening information, identification of positive clones, DNA sequencing of a positive cDNA clone, and generation of a polypeptide primary structural conformation (amino acid sequence). Example 5 relates to the identification and sequencing of a genomic clone encoding hpG-CSF. Example 6 relates to the construction of a produced gene encoding hpGCSF, using preferably E. coli codons.

Пример 7 се отнася до процедури за конструиране на Е. coli трансформационен вектор,включващ ДНК кодираща hpG-CSF, използването на вектора при прокариотна експресия на hpG-CSF , и до анализ на свойствата на рекомбинантните продукти на изобретението. Пример 8 се отнася до процедури за генериране на аналози на hpG-CSF, при което цистеинови остатъци се заместват от други подходящи аминокиселинни остатъци чрез средствата на мутагенеза, осъществен върху ДНК кодираща hpG-CSF. Пример 9 се отнася до процедури за конструиране на вектор, включващ hpG-CSF аналог-кодираща ДНК,произлизаща от положителен сДНК клон, използуването на вектора за трансфериране на COS-1 клетки, и култивирането на трансфектираните клетки. Пример 10 се отнася до физичните и биологични свойства или до рекомбинантните полипептидни продукти на изобретението.Example 7 relates to procedures for constructing an E. coli transformation vector comprising DNA encoding hpG-CSF, using the vector for prokaryotic expression of hpG-CSF, and analyzing the properties of the recombinant products of the invention. Example 8 relates to procedures for generating hpG-CSF analogs, wherein cysteine residues are replaced by other suitable amino acid residues by means of mutagenesis performed on DNA encoding hpG-CSF. Example 9 relates to procedures for constructing a vector comprising the hpG-CSF analog-coding DNA derived from a positive cDNA clone, using the vector to transfer COS-1 cells, and culturing the transfected cells. Example 10 relates to the physical and biological properties or recombinant polypeptide products of the invention.

ПРИМЕР 1 (А) Секвениране на материал .предоставен от методи в литературатаEXAMPLE 1 (A) Sequencing of material provided by methods in the literature

Проба (3-4 pg, 85-90% чист SDS, оцветена със сребро PAGE) на hpG-CSF се получава от Sloan Kettering Institute, New York, N.Y., каро е изолиран и пречистен съгласно Welte, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA), 82, 1526-1530 (1985).A sample (3-4 pg, 85-90% pure SDS stained with silver PAGE) of hpG-CSF was obtained from the Sloan Kettering Institute, New York, N.Y., the crust was isolated and purified according to Welte, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA), 82, 1526-1530 (1985).

N-крайната аминокиселинна последователност на тази проба на hpG-CSF се определя в изпълнение # 1 чрез микросеквенционен анализ при използване на АВ407А газово-фазов секвенатор (Applied Biosystems, Foster City, Calif.) за доставяне на информация за последователности, посочена в Таблица 1 по-долу. В тдблйци 1 - 4 се използва еднобуквеният код, “X” означава остатък който не е определен недвусмислено и остатъците в скоби са определени само алтернативно или временно.The N-terminal amino acid sequence of this hpG-CSF sample was determined in embodiment # 1 by micro-sequencing analysis using an AB407A gas-phase sequencer (Applied Biosystems, Foster City, Calif.) To supply the sequence information indicated in Table 1 below. In letters 1-4, the one-letter code is used, "X" means a residue that is not clearly defined and residuals in parentheses are only determined alternatively or temporarily.

Таблица 1Table 1

5 10 155 10 15

K-P-L-G-P-A-S-K-L-K-Q - (G,V.S) -G-L-X-X-XK-P-L-G-P-A-S-K-L-K-Q - (G, V.S) -G-L-X-X-X

При всеки цикъл на изпълнението присъства висок фон? за което резултатите са представени в таблица 1, означавайки, че резултатите от пробата имат много замърсяващи съставки, вероятно под формата на химични остатъци от пречистването. Последователността се запазва само за използване за сравнение.Is there a high backdrop for each execution cycle ? for which the results are presented in Table 1, indicating that the results of the sample have many contaminants, probably in the form of chemical residues from the purification. The sequence is reserved for reference only.

При изпълнение # 2 втора проба (5-6 pg, ~ 95% чистота) се получава от Sloan Kettering. както в изпълнение # 1 и процедурата за секвениране се изпълнява както в изпълнение # 1. Тази проба се изпълнява от същата партида материал, използван за генериране на фигура 4 от Welte, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA), 82, 1526-1530 (1985). Резултатите ca посочени в таблица 2.In run # 2, a second sample (5-6 pg, ~ 95% purity) was obtained from Sloan Kettering. as in embodiment # 1 and the sequencing procedure is performed as in embodiment # 1. This sample is made from the same batch of material used to generate Figure 4 by Welte, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA), 82, 1526-1530 (1985). The results are shown in Table 2.

Таблица 2Table 2

5 10 15 20 (S) (L)5 10 15 20 (S) (L)

T-P-L-G-P-A-S-(S)-L-P-Q- X - M - (M) -X-K-(R)-X-X-(R)-(L)-XT-P-L-G-P-A-S- (S) -L-P-Q-X - M - (M) -X-K- (R) -X-X- (R) - (L) -X

Въпреки че са идентифицирани повече остатъци, изпълнение # 2 не доставя достатъчно дълга недвусмислена последователност0 от която биха могли да се конструират разумен брой проби за търсене на hpG-CSF ДНК. Бе пресметнато, че биха били необходими най-малко 1536 проби, за да се направи опит да се изолира сДНК на основата на последователността от таблица 2. Отново се предполага, че проблемът се състои в онечиствания в пробата.Although more residues have been identified, embodiment # 2 does not provide a sufficiently long unambiguous sequence 0 from which a reasonable number of hpG-CSF DNA search samples can be constructed. It was estimated that at least 1536 samples would be needed to attempt to isolate the cDNA based on the sequence of Table 2. Again, the problem is implied by impurities in the sample.

В съответствие трета проба (3-5 дд, ~ 40% чистота) се получава от Sloan Kettering, както по-горе. Този препарат се подлага на електроблотинг след разделяне чрез SDS-PAGE в опит за последващо пречистване. Секвенционният анализ на тази проба не дава никакви данни.Accordingly, a third sample (3-5 dd, ~ 40% purity) was obtained from Sloan Kettering as above. This preparation was electroblotched after separation by SDS-PAGE in an attempt for subsequent purification. Sequential analysis of this sample does not provide any data.

(В) Секвениране на материали, доставени от подобрени методи(C) Sequencing of materials supplied by improved methods

С цел да се получи достатъчно количество чист материал- за осъществяване на подходящ окончателен анализ на аминокиселинната последователност, клетки от клетъчна линия от карцином на пикочния мехур 5637 (субклон 1А6) продуцирани от Sloan Kettering са получени от Dr. Е. Platzer. Първоначално клетките се култивират в Iscove’s среда (GIBCO, Grand Island, N.Y.) в колби до сливане. Когато се слеят, кУЛТУРИТЕ се обработват с трипсин и се посяват във ролерни бутилки (1½ колби/бутилка), всяка съдържаща 25 ml предварително кондиционирана Iscove’s среда под 5% СО2. Клетките се култивирдт цяла нощ при 37°С, при 0,3 грт (оборота в минута).In order to obtain a sufficient amount of pure material - to perform a suitable final analysis of the amino acid sequence, bladder carcinoma cell line 5637 (subclone 1A6) produced by Sloan Kettering was obtained from Dr. E. Platzer. Cells were initially cultured in Iscove's medium (GIBCO, Grand Island, NY) in flasks until confluent. When merged, the CULTURES were treated with trypsin and sown in roller bottles (1½ flasks / bottle), each containing 25 ml of pre-conditioned Iscove's medium below 5% CO 2 . The cells were cultured overnight at 37 ° C, at 0.3 gm (rpm).

Cytodex-1 перли (Pharmacia, Uppsala, Sweden) се промиват и стерилизират при използване на следните процедури. Осем грама перли се поставят в бутилка и се прибавят 400 ml PBS. Перлите се суспендират клто внимателно се върти в продължение на три часа. След като се оставят перлите да се утаят, PBS се извежда, перлите се промиват в PBS и се прибавя свеж PBS. Перлите се автоклавират 15 минути. Преди използване перлите се промиват в Iscove’s среда плюс 10% зародишен телешки серум (FCS) преди прибавяне на свежа среда плюс 10% FCS за получаване на обработени перли.Cytodex-1 beads (Pharmacia, Uppsala, Sweden) were washed and sterilized using the following procedures. Eight grams of pearls are placed in a bottle and 400 ml of PBS are added. The pearls were suspended until rotated gently for three hours. After the beads were allowed to precipitate, PBS was removed, the beads were washed in PBS, and fresh PBS was added. The beads were autoclaved for 15 minutes. Before use, the beads were washed in Iscove's medium plus 10% fetal calf serum (FCS) before fresh medium was added plus 10% FCS to obtain the treated beads.

След отстраняване от всяка ролерна бутилка на всичко освен 30 ml от средата, към бутилките се прибавят 30 ml свежа среда плюс 10% FCS и 40 ml третирани перли. Бутилките се насищат с 5% СО2 и всички мехурчета се отстраняват чрез изтегляне. Бутилките се поставят в ролерни рамки при 3 грт в продължение на % час преди скоростта да се намали на 0,3 грт. След три часа една допълнителна колба се обработва с трипсин и се добавя към всяка въртяща се бутилка.съдържаща перли.After removing from each roller bottle all but 30 ml of medium, 30 ml of fresh medium plus 10% FCS and 40 ml of treated pearls are added to the bottles. The bottles were saturated with 5% CO 2 and all bubbles were removed by withdrawal. The bottles were placed in roller frames at 3 rpm for% h before the speed was reduced to 0.3 rpm. After three hours, an additional flask was treated with trypsin and added to each rotating bottle containing pearls.

При 40% до 50% сливане културите от ролерните бутилки се промиват с 50 ml PBS и се въртят 10 минути преди да се отстрани PBS. Клетките се култивират 48 часа в среда А [Iscove’s среда съдържаща 0,2% FCS, 10'8 М хидрокортизон, 2 тМ глутамин, 100 единици/ml пеницилин и 100 pg/ml стрептомицин]. След това супернатантата на културата се събира чрез центрофугиране при 3000 грт за 15 минути и се съхранява при -70°С. Културите се допълват със среда А, съдържаща 10% FCS* и се култивират 48 часа. След отстраняването на средата клетките се промиват с PBS както по-горе и се култивират 48 часа в среда А. Супернатантата отново се събира и се третира, както е описано по-горе.At 40% to 50% confluence, the roller bottle cultures were washed with 50 ml PBS and rotated for 10 minutes before removing PBS. The cells were cultured for 48 hours in medium A [Iscove's medium containing 0.2% FCS, 10 ' 8 M hydrocortisone, 2 mM glutamine, 100 units / ml penicillin and 100 pg / ml streptomycin]. The culture supernatant was then collected by centrifugation at 3000 rpm for 15 minutes and stored at -70 ° C. The cultures were supplemented with medium A containing 10% FCS * and cultured for 48 hours. After removal of the medium, the cells were washed with PBS as above and cultured for 48 hours in medium A. The supernatant was re-harvested and treated as described above.

Приблизително 30 литра среда, кондиционирана с 1А6 клетки t се концентрират до приблзително 2 литра върхуApproximately 30 liters of medium conditioned with 1A6 cells t were concentrated to about 2 liters on

Millipore Pellicon единица,снабдена c 2 касети притежаващи 10000 M.W. прекъсване при скорост на филтриране от приблизително 200 ml/min и при скорост на задържане от приблизително 1000 ml/min. Концентратът се диафилтрира с приблизително 10 литра 50 mM Tris (pH 7,8) при използуване на същия апарат и при същата скорост на потока. Диафилтрираният концентрат се зарежда на колона, уравновесена с 50 mM Tris (pH 7,8) с 1 литър DE целулоза при 40 ml/min. След зареждането колоната се промива при същата скорост с 1 литър 50 mM Tris (pH 7,8), а след това с 2 литра 50 mM Tris (pH 7,8) с 50 тМ NaCI. След това колоната се елуира на порции с шест еднолитрови разтвора на 50 ml Tris (pH 7,5), съдържащи следните концентрации на NaCI : 75 mM; 100 тМ; 125 тМ; 150 тМ; 200 тМ; и 300 тМ. Събират се фракции (50 ml), като активните фракции се обединяват и се концентрират до 65 ml върху Amicon ултрафилтрационна клетъчна единица с разбъркване, снабдена с YM5 мембрана. Този конце нтрат се зарежда върху 2-литрова АсА54 гелфилтрационна колона? ура вновесена в PBS. Колоната се пуска при 80 ml/час и се събират Ю-ml фракции. Активните фракции се обединяват и се зареждат директно върху С4 колона за Високо Ефективна Течна Хроматография (ВЕТХ).Millipore Pellicon unit equipped with 2 cartridges having a 10,000 MW cutoff at a filtration rate of approximately 200 ml / min and a retention rate of approximately 1000 ml / min. The concentrate was diafiltered with approximately 10 liters of 50 mM Tris (pH 7.8) using the same apparatus and at the same flow rate. The diafiltered concentrate was loaded onto a column equilibrated with 50 mM Tris (pH 7.8) with 1 liter of DE cellulose at 40 ml / min. After loading, the column was washed at the same rate with 1 liter of 50 mM Tris (pH 7.8) and then with 2 liters of 50 mM Tris (pH 7.8) with 50 mM NaCl. The column was then eluted in portions of six 1 liter solutions of 50 ml Tris (pH 7.5) containing the following NaCl concentrations: 75 mM; 100 mM; 125 mM; 150 mM; 200 mM; and 300 mM. Fractions (50 ml) were collected, and the active fractions were pooled and concentrated to 65 ml on an Amicon agitated ultrafiltration cell unit equipped with a YM5 membrane. This concentrate is loaded onto a 2 liter AcA54 gel filtration column ? hurray introduced on PBS. Start the column at 80 ml / h and collect the 10 ml fractions. The active fractions were pooled and loaded directly onto a C4 column for High Performance Liquid Chromatography (HPLC).

Проби с обем в границите от 125 ml до 850 ml и съдържащиI 1-8 mg протеин, приблизително 10% от който е hpG-CSF, се зареждат върху колоната при скорост на потока от 1 ml до 4 ml на минута. След зареждането и едно първоначално промиване с 0,1 М амониев ацетат (pH 6,0-7,0) в 80% 2-пропанол при скорост на потока от 1/ml/min. Едно17 милилитрови фракции се събират и се следят за протеини приSamples with a volume in the range of 125 ml to 850 ml and containing 1-8 mg of protein, approximately 10% of which is hpG-CSF, are loaded onto the column at a flow rate of 1 ml to 4 ml per minute. After loading and one initial wash with 0.1 M ammonium acetate (pH 6.0-7.0) in 80% 2-propanol at a flow rate of 1 / ml / min. 17 ml fractions were collected and monitored for protein at

220 nm, 260 nm u 280 nm.220 nm, 260 nm in 280 nm.

Като резултат от пречистването фракциите,съдържащи hpG-CSF, ясно се разделят (както фракции 72 и 73 от 80) от останалите фракции, съдържащи протеини. hpG-CSF се изолира (150 - ЗООцд) с чистота от приблизително 85+5% и с добив от прибли, зително 50%. От този пречистен продукт 9 цд се използуват при изпълнение # 4, един аминокиселинен анализ, при който протеиновата проба се полага върху активиран с TFA диск от фибростъкло без полибрен. Секвенционният анализ се провежда с AB 470А секвенатор съгласно методите на Hewick, et al.,J. Biol. Chem., 256, 79907997 (1981) and Lai, Anal. Chim. Acta, 163, 243-248 (1984). Резултатите от изпълнение #4 са изведени в таблица 3.As a result of the purification, the fractions containing hpG-CSF were clearly separated (as fractions 72 and 73 of 80) from the other fractions containing proteins. The hpG-CSF was isolated (150 - 300Cd) with a purity of approximately 85 + 5% and an approximate yield of 50%. Of this purified product, 9 µg were used in embodiment # 4, an amino acid assay in which the protein sample was applied to a TFA-activated fiberglass disc without polybrene. Sequence analysis was performed with an AB 470A sequencer according to the methods of Hewick, et al., J. Biol. Chem., 256, 79907997 (1981) and Lai, Anal. Chim. Acta, 163, 243-248 (1984). The results of embodiment # 4 are summarized in Table 3.

Таблица 3Table 3

510510

Thr - Pro - Leu - Gly - Pro - Ala - Ser - Ser - Leu - Pro 1520Thr - Pro - Leu - Gly - Pro - Ala - Ser - Ser - Leu - Pro 1520

Gin - Ser - Phe - Leu - Leu - Lys - (Lys) - Leu - (Glu) - Glu 2530Gin - Ser - Phe - Leu - Leu - Lys - (Lys) - Leu - (Glu) - Glu 2530

Vai-Arg-Lys- lie - (Gin) - Gly - Vai - Gly - Ala - AlaLeu-X - X При изпълнение #4 след 31-вия цикъл (съответстващ на остатък 31 в таблица 3) повече не се получава някаква значима информация. С цел да се получи по-дълга недвусмислена последователност, при изпълнение #5, 14 цд hpGCSF, пречистен от кондиционираната среда, се редуцирдтс 10 μΙ β-меркаптоетанол в продължение на 1 час при 45°С, след което се изсушават под вакуум. Протеиновият остатък след това се рзтваря в 5% мравчена киселина преди да се приложи върху полибренирания диск от фибростъкло. Секвенционният анализ се провежда както при изпълнение #4 по-горе. Резултатите от изпълнение #5 са показани на таблица 4.Vai-Arg-Lys-lie - (Gin) - Gly - Vai - Gly - Ala - AlaLeu-X - X At run # 4, after the 31th cycle (corresponding to residue 31 in Table 3), no more relevant information is obtained . In order to obtain a longer unambiguous sequence, in embodiment # 5, 14 µg hpGCSF purified from the conditioned medium, 10 μΙ β-mercaptoethanol was reduced for 1 hour at 45 ° C and then dried under vacuum. The protein residue is then dissolved in 5% formic acid before being applied to the fiberglass polybrenched disc. Sequential analysis was performed as in embodiment # 4 above. The results of embodiment # 5 are shown in Table 4.

Таблица 4Table 4

510510

Thr - Pro - Leu - Gly - Pro - Ala - Ser - Ser - Leu - Pro 1520Thr - Pro - Leu - Gly - Pro - Ala - Ser - Ser - Leu - Pro 1520

Gin - Ser - Phe - Leu - Leu - Lys - Cys - Leu - Glu - Gin 2530Gin-Ser-Phe-Leu-Leu-Lys-Cys-Leu-Glu-Gin 2530

Val-Arg-Lys- lie - Gin - Gly-Asp - Gly - Ala - Ala3540Val-Arg-Lys-lie - Gin - Gly-Asp - Gly - Ala - Ala3540

Leu - Gin - Phe - Lys - Leu - Gly - Ala - Thr - Tyr - Lys 45Leu-Gin-Phe-Lys-Leu-Gly-Ala-Thr-Tyr-Lys 45

Val - Phe - Ser - Thr - (Arg) - (Phe) - (Met) - XVal - Phe - Ser - Thr - (Arg) - (Phe) - (Met) - X

Аминокиселинната последователност посочена в таблица 4^е достатъчно дълга (44 остатъка) и недвусмислена.The amino acid sequence shown in Table 4 is sufficiently long (44 residues) and unambiguous.

за да се конструират проби за получаване на сДНК на hpGCSF, както е описано по-горе.to construct samples for the preparation of hpGCSF cDNA as described above.

ПРИМЕР 2EXAMPLE 2

Сред стандартните процедури за изолиране на сДНК последователности, представляващи интерес, е изготвянето на произлизаща от плазмид сДНК “библиотека”, получена чрез обратна транскрипция на иРНК > изобилстваща в донорни клетки, подбрани въз основа на тяхната експресия на гена мишена. Когато значителни участъци от аминокиселинната последователност са известни белязани едноверижни последователности на ДНК проби, дублиращи последователност, за която се предполага, че присъства в сДНК “мишена”, може да се използва в ДНК/ДНК процедури на хибридизация, осъществени върху кпонирани копия на сДНК, които са били денатурирани до едноверижна форма. Weissman, et al., U.S.Pat No. 4,394,443; Wallace, et al., Nucleic Acids Res., 6, 3543-3557 (1979), u Reyes, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA), 79, 3270-3274 (1982), u Jaye, et al., Nucleic Acids Res., 11, 2325-2335 (1983). Виж също, U.S. Pat No. 4,358,535 за Falkow, et al., във връзка c ДНК/ДНК процедури на хибридизация при поставянето на диагноза; u Davis, et al., “A Manual for Genetic Engineering, Advanced Bacterial Genetics”, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, N.Y. (1980) at pp. 55-58 I 174-176, отнасящо се до хибридизационни техники на колонии и плаки.Among the standard procedures for isolating cDNA sequences of interest is the preparation of a plasmid-derived cDNA "library" obtained by reverse transcription of mRNA> abundant into donor cells selected based on their gene expression of the target. When significant strands of the amino acid sequence are known to label single stranded DNA sequences, duplicating a sequence suspected to be present in a "target" cDNA, DNA / DNA hybridization procedures performed on cloned cDNA copies can be used, which have been denatured to single-stranded form. Weissman, et al., U.S. Pat. 4,394,443; Wallace, et al., Nucleic Acids Res., 6, 3543-3557 (1979), in Reyes, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA), 79, 3270-3274 (1982), in Jaye, et al., Nucleic Acids Res., 11, 2325-2335 (1983). See also U.S. Pat. Pat No. No. 4,358,535 to Falkow, et al., In reference to DNA / DNA hybridization procedures at diagnosis; in Davis, et al., “A Manual for Genetic Engineering, Advanced Bacterial Genetics,” Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, N.Y. (1980) at pp. 55-58 I 174-176 relating to the hybridization techniques of colonies and plates.

Общата РНК се екстрахира от приблизително един грам клетки от клетъчна линия 5637 (1А6) от карцином на пикочния мехур при използване на гуанидин тиоцианатната процедура за количествено изолиране на интактна РНК. [Chirgwin, et al.,Total RNA was extracted from approximately one gram of bladder cell line 5637 (1A6) cell carcinoma using the guanidine thiocyanate procedure to quantitatively isolate intact RNA. [Chirgwin, et al.,

Biochemistry, 18, 5294-5299 (1979)].Biochemistry, 18, 5294-5299 (1979)].

Стерилният воден разтвор на РНК, съдържа обща РНК от IA6 клетките. За получаване единствено на информационната РНК от разтвора на общата РНК, разтворът се пропуска през колона, съдържаща олигодезокситимидилирани [олиго(сПГ)] (Collaborative Reseach, Inc., Waltham, Mass. PolyAdenylated (poly-A+) опашки, характерни за прилепването на информационната ДНК към колоната, докато рибозомалната РНК се елуира. В резултат на тази процедура се изолират приблизително 90 ц.д полиаденилирана информационна РНК (poly-A+ иРНК). Изолираната poly-A+ информационна РНК предварително се обработва с метилживачен хидроксид (Alpha Ventron, Danvers, Mass.) при крайна концентрация от 4 тМ за 5 минути при стайна температура преди използване в сДНК реакция. Третирането с метилживачен хидроксид денатурира взаимодействието на информационната РНК, и с двете, както със себе си, така и със замърсяващите молекули, които инхибират транслацията. Payvar, et al., J.Biol.Chem., 258, 7636-7642 (1979).Sterile aqueous RNA solution contains total RNA from IA6 cells. To obtain information RNA only from the total RNA solution, the solution is passed through a column containing oligodeoxythymidylated [oligo (cG)] (Collaborative Reseach, Inc., Waltham, Mass. PolyAdenylated (poly-A + ) tails characteristic of adhering to the information DNA to the column while the ribosomal RNA was eluted resulting in the isolation of approximately 90 µg of polyadenylated RNA (poly-A + mRNA) The isolated poly-A + RNA was pretreated with methyl mercury hydroxide (Alpha Ventron , Danvers, Mass.) At final concentration of 4 mM for 5 minutes at room temperature prior to use in the cDNA reaction Treatment with methylmercury hydroxide denatures the interaction of the RNA with both itself and the contaminating molecules that inhibit translation Payvar, et al. J. Biol.Chem., 258, 7636-7642 (1979).

Съгласно Okayama procedure [Okayama, et al., Molecular & Cellular Biology, 2, 161-170 (1982)] се изготвя сДНК банка при използване на иРНК,получена от IA6 клетки. сДНК се трансформират след това чрез инкубиране в микроорганизъм гостоприемник Е. coli К-12 щам НВ101 за амплифициране.According to the Okayama procedure [Okayama, et al., Molecular & Cellular Biology, 2, 161-170 (1982)], a cDNA bank was prepared using the mRNA obtained from IA6 cells. the cDNAs are then transformed by incubation in the host E. coli K-12 strain HB101 microorganism for amplification.

ПРИМЕР 3EXAMPLE 3

Хибридизационни проби, проектирани на основата на hpG-CSF амино терминална последователност от таблица 4, се състоят от комплект от 24 олигонуклеотида, всеки с дължина от 23 бази и съдържащ три инозинови остатъка. Олигонуклеотидите на пробите се произвеждат съгласно процедурата на Caruthers, et al., Genetic Engineering, 4, 1-18 (1982) и се бележат с γ-32Ρ АТР чрез обработване с полинуклеогидна киназа. Олигонуклеотидите на пробите съответстващи на информационната РНК за остатъци 23 - 30 от последователността от таблица 4 са илюстрирани в таблица 5.Hybridization assays designed on the basis of the hpG-CSF amino terminal sequence of Table 4 consist of a set of 24 oligonucleotides, each with a length of 23 bases and containing three inosine residues. The oligonucleotides of the samples are produced according to the procedure of Caruthers, et al., Genetic Engineering, 4, 1-18 (1982) and are labeled with γ- 32 Ρ ATP by polynucleotide kinase treatment. The oligonucleotides of the samples corresponding to the RNA information for residues 23-30 of the sequence of Table 4 are illustrated in Table 5.

__________________________________________Таблица 5 hpG-CSF Проби__________________________________________ Table 5 hpG-CSF Samples

А Т G ТA T G T

5’ GC IGC ICC ТС ICC TG АТ ТТ 3’5 'GC IGC ICC TC ICC TG AT TT 3'

G С А СG C A C

ТT.

Определянето на неутралност към I’s се основава на публикуваната работа на Takahashi et al., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA), 82,1931-1935 (1985) u Ohtsuka et al., J.Biol. Chem., 260, 2605-2608 (1985). Въпреки това инозинът може да има дестабилизиращо действие ако образува базова двойка с G или Т. В Takahashi, et al., инозините могат да се явят като притежаващи неутрален ефект, тъй като се усредняват като група с близка неутралност (например три образуващи двойки благоприятни за С и две неблагоприятни за образуване на двойки сТ).The determination of neutrality to I's is based on the published work of Takahashi et al., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA), 82,1931-1935 (1985) in Ohtsuka et al., J. Biol. Chem., 260, 2605-2608 (1985). However, inosine can have a destabilizing effect if it forms a base pair with G or T. In Takahashi, et al., Inosins can appear as having a neutral effect as they are averaged as a group with close neutrality (e.g., three forming pairs favorable to C and two unfavorable for the formation of pairs cT).

За тестване на ефекта от притежаване на I’s базова двойка с G’s се проектират контролни експерименти при изоползване на N-myc генна последователност и клон. Последователностите,взети от N-myc гена,имат същото общо съдържание на G и С при първите две позиции на всеки кодон, както бе предписано от hpG-CSF пробите. Следователно N-myc тестовите проби са със същата дължина, съдържат I’s в относително същата позиция и притежават потенциално същата средна Тт (62-66°С, без да се взимат предвид 3 или 4 инозинови остатъци, включително) както hpG-CSF пробите.To test the effect of owning I's base pair with G's, control experiments were designed using the N-myc gene sequence and clone. The sequences taken from the N-myc gene have the same G and C content at the first two positions of each codon as prescribed by the hpG-CSF samples. Therefore, the N-myc test samples are the same length, contain I's in the relatively same position and have potentially the same mean Tm (62-66 ° C, without taking into account 3 or 4 inosine residues, inclusive) as the hpG-CSF samples.

Два комплекта N-myc тестови проби се конструират съгласно процедурата на Caruthers et al., по-горе. Комплект I, както е илюстриран в таблица 6..включва: 1. 23-мер с перфектно съвпадане; 2. в който три трети позиции C’s са заместени с I’s,като се генерира възможно най-лошият случай за прибавяне на I’s; и 3. в който четири трети позиции C’s са заместени с I’s. Вторият комплект тестови проби се проектира да представлява по-случайно разпределение на инозиновите базови двойки, което трябва да даде един общ неутрален ефект на свързване на базовите двойки. Комплект 2л<акто е илюстрирано в таблица 6}включва : 4. съдържащ две I’s който ще образува базова двойка с C’s и една с G; и 5. идентичен на 4 с прибавяне на още една I: G базова двойка.Two sets of N-myc test samples were constructed according to the procedure of Caruthers et al., Supra. Set I, as illustrated in Table 6..includes: 1. 23-meter with perfect match; 2. in which three-thirds of C's are replaced by I's, generating the worst case for adding I's; and 3. in which four thirds of C's are replaced by I's. The second set of test samples is designed to represent a more random distribution of inosine base pairs, which should give an overall neutral base pair binding effect. Set 2l <as illustrated in Table 6 } includes: 4. containing two I's which will form a base pair with C's and one with G; and 5. identical to 4 with the addition of another I: G base pair.

Таблица 6Table 6

N - тус тестови проби N is the test sample 1. 1. 5’сас 5 'sass ААС AAS TAT TAT GCC GCC GCC GCC CCC CCC TCC TCC cc3'cc 3 ' 2. 2. 5’сас 5 'sass ААС AAS TAT TAT GCI GCI GCC GCC CCI CCI TCI TCI cc3cc 3 ' 3. 3. 5'cai 5 'cai ААС AAS TAT TAT GCI GCI GCC GCC CCI CCI TCI TCI cc3 cc 3 4. 4. 5 ААС 5 AAS GAG GAG CTG CTG TGI TGI GGC GGC AGI AGI CCI CCI GC 3 GC 3 5. 5. 5’ AAI 5 'AAI GAG GAG CTG CTG TGI TGI GGC GGC AGI AGI CCI CCI GC 3'GC 3 '

Пет репликационни филтъра, съдържащи N - тус ДНК последователности и ДНК последователности от пилешки растежен хормон (като отрицателна контрола), се изпичат на вакуумна фурна в продължение на 2 часа при 80°С преди хибридизацията. Всички филтри се хибридизират, както е описано в пример 4 за hpG-CSF пробите ,с изключение на това, че периодът на хибридизация е само 6 часа. Филтрите се промиват три пъти на стайна температура, след това веднъж при 45°С за 10 минути всеки. Филтрите се следят с Гайгеров брояч.Five replication filters containing N - Tus DNA sequences and the DNA sequences of chicken growth hormone (as a negative control) were baked in a vacuum oven for 2 hours at 80 ° C before hybridization. All filters were hybridized as described in Example 4 for the hpG-CSF samples, except that the hybridization period was only 6 hours. The filters were washed three times at room temperature, then once at 45 ° C for 10 minutes each. The filters are monitored with a Geiger counter.

Филтърът, представляващ N-myc проба 3,дава много тих сигнал по отношение на останалите 4 филтъра с проби и повече не се промива. След 10 минути промиване на 50°С, Гайгеровият брояч дава следния процентен сигнал, като проба 1 се нормализира до 100% ; проба 2,20%; проба 3 (45°С), 2%; проба 4, 92%; и проба 5, 75%. След промиване при 55°С процентите стават : проба 2. 16%; проба 4, 100%; и проба 5,The filter representing the N-myc sample 3 gives a very quiet signal with respect to the remaining 4 sample filters and is no longer flushed. After washing at 50 ° C for 10 minutes, the Geiger counter gives the following percentage signal, normalizing sample 1 to 100%; sample 2,20%; sample 3 (45 ° C), 2%; sample 4, 92%; and sample 5, 75%. After washing at 55 ° C the percentages become: sample 2. 16%; sample 4, 100%; and sample 5,

80%. Крайно промиване при 6О°С дава следните проценти :80%. Final washing at 6 ° C gives the following percentages:

проба 2 , 1,6%; проба 4, 90%; и проба 5, 70%.sample 2, 1.6%; sample 4, 90%; and sample 5, 70%.

Следователно, в присъсътвието на 3 I’s, както в проби 2 и 4 се наблюдава до 60 пъти разлика в сигнала спрямо теоретичната Tm (I’s не се включва в сметките), се доближава [на основата на най-лошия случай I на образуване на базови двойки (проба 2) и относително неутрален I случай на образуване на базови двойки (проба 4)].Therefore, in the presence of 3 I's, as in Samples 2 and 4, a signal difference of up to 60 times the theoretical Tm (I's not included in the calculations) is approached [based on worst case I of base pair formation (sample 2) and the relatively neutral base pair formation case (sample 4)].

Получената стандартизирана информация чрез N-myc тест хибридизации се използва при промиването и онагледяването на hpG-CSF хибридизацията, както е посочено по-долу за проверка на степента на доверие,с която резултатите под строгото промиване трябва да бъдат приети.The standardized information obtained through the N-myc hybridization test is used in flushing and visualizing hpG-CSF hybridization, as outlined below, to test the confidence level with which rigorous flushing results should be accepted.

ПРИМЕР 4EXAMPLE 4

Съгласно процедурата на Hanahan, et al., J.Mol. Biol., 166, 557-580 (1983) бактерии, съдържащи рекомбинанти със сДНК инсерти, както са получени в пример 2,се разпръскват върху 24 нитроцелулозни филтри (Millipore, Betford, Mass.), положени върху агарови блюда. След това блюдата се инкубират до установяване на приблизително 150000 колонии, които репликативно се посяват на други 24 нитроцелулозни филтъра. Репликите се инкубират до появата на отделни колонии. Бактериите върху филтрите се лизират върху листове Watman 3 ММ хартия слабо наситена с натриев хидроксид (0,5 М) за 10 минути, след което се накапват с Tris (1 М) за 2 минути, следван от накапване с Tris (0,5 М) съдържащ NaCI (1,5 М) за 10 минути. Когато филтрите са почти изсушени де се изпичат в продължение на 2 часа приAccording to the procedure of Hanahan, et al., J. Mol. Biol., 166, 557-580 (1983) bacteria containing recombinants with cDNA inserts, as obtained in Example 2, were sprayed onto 24 nitrocellulose filters (Millipore, Betford, Mass.) Deposited on agar plates. The plates were then incubated until approximately 150,000 colonies were identified, which were replicated inoculated with another 24 nitrocellulose filters. The replicas were incubated until the appearance of individual colonies. The bacteria on the filters were lysed on sheets of Watman 3MM paper slightly saturated with sodium hydroxide (0.5M) for 10 minutes, then added with Tris (1M) for 2 minutes followed by Tris (0.5M). ) containing NaCI (1.5 M) for 10 minutes. When the filters are almost dry, bake for 2 hours at

80°С във вакуумна фурна преди хибридизацията на нуклеиновата киселина. [Wahl, et al., Proc. Natl. Acad. Sci.80 ° C in a vacuum oven prior to nucleic acid hybridization. [Wahl, et al., Proc. Natl. Acad. Sci.

(USA), 76, 3683-3687 (1979)]; u Maniatis, et al., Cell, 81, 163-182 (1976).(USA), 76, 3683-3687 (1979)]; in Maniatis, et al., Cell, 81, 163-182 (1976).

Филтрите предварително се хибридизират 2 часа при 65°С във 750 ml 10х Denhardt’s, 0,2% SDS и 6х SSC. Филтрите се промиват в 6xSSC, след което четири се поставят в торбичка и се хибридизират 14 часа в 6xSSC и 10х Denhardt’s. Има приблизително по 15 ml оазтвор на торбичка ,съдържаща 50x106 срт проби (олигонуклеотиди),белязани с 32Р.The filters were pre-hybridized for 2 hours at 65 ° C in 750 ml of 10 Denhardt's, 0.2% SDS and 6x SSC. The filters are washed in 6xSSC, then four are bagged and hybridized for 14 hours in 6xSSC and 10x Denhardt's. There are approximately 15 ml of injectable solutions bag containing 50x10 6 cpm samples (oligonucleotides), labeled with 32 P.

След хибридизирането филтрите се промиват три пъти в 6xSSC (1 литър/промиване) при стайна температура за 10 минути всеки. След това филтрите се промиват два пъти при 45°С за 15 минути всеки, веднъж при 50°С за 15 минути и веднъж при 55°С за 15 минути при използване на 1-литрови обеми от 6xSSC. Филтрите се авторадиографират 2 часа при -70°С при използване на усилващ екран и Kodak XAR-2 филм. На този авторадиограф има 40-50 открити позитивни сигнала, включително 5 много силни сигнала. Полетата, включващи петте най-силни сигнала и допълнителни пет позитивни, се остъргват от главните блюда и отново се посяват за вторично скриниране при използване на същата смес за проби при същите условия. Процедурата по промиването се различава по това, че промиванията при висока температура се състоят от две при 55°С за 15 минути всяко, след което едно при 60°С за 15 минути. На базата на изследването на N-myc проба от пример 3 последната температура на промиване при второто скриниране се повишава, тъй като температурата на топене на агрегата на 24-те 23-мери е 60-68°С, подобна на тази на Nгпус пробите. Едва след второто промиване на 55°С филтрите се овлажняват и се прави авторадиография. Сравняването на тази авторадиография с втората авторадиография,проведена за подобен период от време след последното промиване при 60°С показва, че само 10 клона от тестваните не страдат от значителна загуба на сигнал при повишаване от 55-60°С. За тези два клона по-късно бе доказано, че са с почти идентична дължина и модели на рестрикционна ендонуклеаза. За скрининга се подбира един клон,назован Рро2.After hybridization, the filters were washed three times in 6xSSC (1 liter / wash) at room temperature for 10 minutes each. The filters were then washed twice at 45 ° C for 15 minutes each, once at 50 ° C for 15 minutes and once at 55 ° C for 15 minutes using 1 liter volumes of 6xSSC. The filters were autoradiographically 2 hours at -70 ° C using a gain screen and Kodak XAR-2 film. There are 40-50 positive signals detected on this autoradiograph, including 5 very strong signals. The fields including the five strongest signals and the additional five positive are scraped from the main dishes and re-sown for secondary screening using the same sample mixture under the same conditions. The flushing procedure differs in that the high temperature washes consist of two at 55 ° C for 15 minutes each and then one at 60 ° C for 15 minutes. Based on the study of the N-myc sample of Example 3, the last rinsing temperature at the second screening rises, since the melting temperature of the aggregate of the 24 23-m is 60-68 ° C, similar to that of N-myc samples. Only after the second rinse at 55 ° C are the filters moistened and autoradiography performed. Comparison of this autoradiography with the second autoradiography conducted for a similar period of time after the last rinse at 60 ° C shows that only 10 clones tested did not suffer significant signal loss at a rise of 55-60 ° C. These two clones were later shown to have nearly identical lengths and patterns of restriction endonuclease. For screening, one clone named PP2 is selected.

Секвенирането на рекомбинантния сДНК клон на hpGCSF, Рро2, получен по горните процедури, се извършва чрез дидезокси метода на Sanger, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA), 74, 5463-5467 (1977). Едноверижният ДНК-ов фаг M-13 се използва като вектор за клониране за доставяне на едноверижни ДНК матрици от двуверижни сДНК клонове. Методът на Sanger, et al., извежда последователността,както е показана на таблица 7 , придружена от нейната аминокиселинна транслация и комплементарна верига в кодиращата област на полипептида.The sequencing of the recombinant cDNA clone of hpGCSF, PP2 obtained by the above procedures was performed by the dideoxy method of Sanger, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA), 74, 5463-5467 (1977). The single-stranded DNA phage M-13 was used as a cloning vector to deliver single-stranded DNA matrices from double-stranded cDNA clones. The method of Sanger, et al., Derives the sequence as shown in Table 7, accompanied by its amino acid translation and complementary strand in the coding region of the polypeptide.

HindlllHindlll

5’-AGCTTGGACTCAGCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG[NNNNN]5'-AGCTTGGACTCAGCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG [NNNNN]

I— I— < < o o o o 0 0 Ι- Ο- Ι- Ο- o o 0 0 0 0 0 0 >4 > 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ra ra 0 0 0 0 Q Q =3 = 3 1— 1— < < < < Φ —1 Φ —1 0 0 0 0 0 0 0 0 o o 0 0 0 0 L— CL L— CL 0 0 0 0 0 0 0 0 V“ + In “+ 0 0 0 0

ra < ra < 0 0 0 0 0 0 11 1— 1— Ξ5 Ξ5 < 0 < 0 1— 1— 0 0 0 0 0 0 0 0 CZ CZ < < 1— 1— 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - 1— 1— < < ra > ra > 0 0 0 0 < < H H u_ u_ 0 0 0 0 -Ci'll Ι- -Ci'll Ι- < < H H 0 0 0 0 ο. ο. 0 0 0 0 1— 1— H H < < Z5 Φ Z5 Φ 0 0 0 0 < < 0 0 0 0 < < H H ra ra 0 0 0 0 < < 0 0 0 0 < < 1— 1— < < σ σ Φ Φ 0 0 0 0 T T ω ω < < l_ l_ 0 0 0 0 o o to that < < H H 1 1 T T 0 0 0 0 CL t— CL t— 0 0 0 0 0 0 0 0 1— 1— H H < < 0 0 0 0 CM V~ CM V ~ Ξ3 Φ Ξ3 Φ 1— 1— < < —I —I 0 0 0 0

Ci o CL co ± co >> O rs Φ —ICi o CL co ± co >> O rs Φ —I

I— ra <I— ra <

co >·. oco> ·. o

Σ5Σ5

ΦΦ

COCO., LTD

J3 cJ3 c

Z5 Φ —1 o CO CO <Z5 Φ —1 o CO CO <

_Φ <_Φ <

2? 02? 0

Q_ co <Q_ co <

2^2 ^

GGC GAT GGC GCA GCG CTC CAG GAG AAG CTG TGT GCC ACC TAG AAG CTG TGC CAC CCC GAG CCG CTA CCG CGT CGC GAG GTC СТС TTC GAC ACA CGG TGG ATG TTC GAC ACG GTG GGG CTCGGC GAT GGC GCA GCG CTC CAG GAG AAG CTG TGT GCC ACC TAG AAG CTG TGC CAC CCC GAG CCG CTA CCG CGT CGC GAG GTC STC TTC GAC ACA CGG TGG ATG TTC GAC ACG GTG GGG CTC

CM (Продължение)CM (Continued)

0 0 < < >> Η >> Η Η- Η- 0 0 Η- Η- φ φ 0 0 -J -J 0 0 φ φ Η Η JZ SW Κ- Κ- 0_ 0_ Ι— Ι— Φ Φ ο ο —1 —1 0 0 >4 > 4 0 0 0 0 0 0 0 0 ο ο U— φ ω U— φ ω 0 0 00 00 < < 1— 1— ω ω < < ± ± 0 0 0 0 Η- Η- φ φ 0 0 —1 —1 C C 5 5 0 0 0 0 0 0 ι_ Φ ι_ Φ 0 0 ω ω < < 0 0 Φ Φ l·- l · - —1 —1 1— 1— ω >> ω >> 0 0 0 0 0 0 1— 1— 0 0 >. >. 0 0 Ο Ο 0 0 < < Φ Φ 0 0 < < 0 0 0 0 Φ Φ 1— 1— _1 _1 0 0 0 0 ο ο C C < < b- b- 0 0 0 0 =5 = 5 0 0 Φ Φ 1— 1— _J _J 0 0 Φ Φ 0 0 < < 0 0 0 0 C C 0 0 0 0 < Ο < Ο k_ φ k_ φ 0 0 ω ω 0 0 < <

Η <Η <

ο <ο <

□ ο□ ο

<<

<<

ο οο ο

ο Η <ο Η <

Η <Η <

F Η- F Η -

ΟΟ

I— οI— ο

$ ο$ ο

<<

ο ο οο ο ο

<<

Ο Η οΟ Η ο

<<

οο

Η 0Η 0

ΗΗ

ΗΗ

ΗΗ

Η 0 οΗ 0 ο

$$

I— <I— <

I—I—

Η <Η <

Η 0 (Продължение)Η 0 (Continued)

I— ο ο ο < 0 ο Η I— οI— ο ο ο <0 ο Η I— ο

ΙΟ I— ο ο I— οΙΟ I— ο ο I— ο

Ο ο <Ο ο <

ΗΗ

Η οΗ ο

_Φ <_Φ <

οο

CLCL

ο ο 0 ΙΟ ο ο ο 0ο ο 0 ΙΟ ο ο ο 0

Η <Η <

οο

ΙΟ <ΙΟ <

<<

οο

ο ί— οο ί— ο

<<

ο <ο <

ΟΟ

>4 Η> 4 Η

_3_3

Φ οΦ ο

<0 φ χζ 0_<0 φ χζ 0_

JTO <JTO <

φφ

>.>.

φ <φ <

σ>σ>

U.U.

<<

σ>σ>

<<

ι< οι <ο

Ο Ο ΙΟ ο 00 Ο ΙΟ ο 0

ΙΟΙΟ

Ο I—Ο I—

Η < ο <Η <ο <

ο < ο ο I— ο οο <ο ο I— ο ο

<<

ο Η ο i— 0 ο <ο Η ο i— 0 ο <

<<

I— οI— ο

<<

ο ο ο <ο ο ο <

< ο ο ο ο<ο ο ο ο

ΙΟ οΙΟ ο

ΙΟ ο ο ο 0 ο 0ΙΟ ο ο ο 0 ο 0

(Продължение)(Continued)

- Η Η ι— ι— ο ο < < ο ο ο ο ο ο ο ο 0 0 0 0 ο ο 1— 1— ο ο < < ο ο Η Η ο ο < < ο ο ο ο - 1— 1— ο ο < < Ι- Ι- ο ο ι— ι— Ο Ο 1— 1— Ο Ο ο ο ο ο I— I— 1— 1— ο ο 0 0 0 0 Η Η 1— 1— 0 0 < < 0 0 (— (- Ρ Ρ 1— 1— ο ο Η Η 0 0 ο ο Η ί Η ί 1— 1— Ι- Ι- ο ο Ο Ο ο ο 0 0 0 0 - S S 0 0 Σ5 •4—* Σ5 • 4— * !— ! - < < ω ω Η Η ο ο Η Η ο ο < < ο ο 0 0 Ι- Ι- ο ο < < Ο Ο 0 0 0 0 1— 1— < < Η Η

(Продължение)(Continued)

υ ο ο υ ο ο ο ο 1- ο ο 1- TGG TGG ο ο < < ο 0 ο 0 Ι- Ι- ο ο ο ο 0 0 - - 0 0 ο ο Η Η Ο Ο Η Η 0 0 < < - ο ο 0 0 ο ο ο ο ο ο Η Η < < < < ο ο < < 0 0 ο ο ο ο ο ο 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 < < 0 0 0 0 ο ο 0 0 < < < < 0 0 0 0 -<· - <· < < 0 0 - ο ο 0 0 ο ο ί ί < < Ι- Ι- < < Η Η 0 0 Ο Ο 0 0 Η Η 0 0 0 0 < < Η Η < < 1— 1— 0 0 0 0 Η Η < < < < < < - < < 0 0 ο ο ο ο ο ο ο ο I— I— -X» -X » ο ο 0 0 - - 0 0 0 0 ο ο 0 0 < < 1— 1— Η Η 0 0 0 0 ο ο Ι- Ι- 0 0 Q Q Ο Ο < < - ο ο ο ο 0 0 - Η Η 0 0 < < 0 0 0 0 ο ο ο ο 1— 1— 0 0 - < < 0 0 < < ο ο ο ο 1— 1— < < Η Η < < ο ο ο ο < < < < < < < < < < ο ο ο ο 0 0 0 0 < < Ι- Ι- 0 0 0 0 0 0 Ο Ο 1— 1— 0 0 < < ο ο ο ο 0 0 0 0 0 0 ο ο - 0 0 ο ο ο ο ο ο 0 0 < < ο ο 0 0 Η Η 0 0 0 0 Η Η 0 0 0 0 0 0 Η Η

сч (Продължение)mid (Continued)

I— ο < ο ο ι— ο ο ο ο I— ο I— 0 < ο ο [_ ο < ο ο ο ο ο ο <I— ο <ο ο ι - ο ο ο ο ο I— ο I— 0 <ο ο [_ ο <ο ο ο ο ο ο <

ο I—ο I—

Η οΗ ο

I— ο ο < ο ο I— ο ο ο < ο I— οI— ο ο <ο ο I— ο ο ο <ο I— ο

I— ο < ω ο I— ο <I— ο <ω ο I— ο <

< ο ο I— ο ο<ο ο I— ο ο

ΗΗ

ΗΗ

Η0Η0

<<

< ο Η<ο Η

Η ο <Η ο <

< ο Η ο<ο Η ο

co Ico I

Η >χ τ φ τ οΗ> χ τ φ τ ο

S ΣΓS ΣΓ

=5 > ΟΚΟ= 5> ΟΚΟ

XX

CD φCD φ

ΟΓ φΟΓ φ

ΟχΟχ

Εί τ π:Εί τ π:

X сеX se

CO qCO q

XX

X co 05 ю ο co ю сч ο qX co 05 yo ο co yu sch o q q

x <x <

>.>.

Ο Q.Ο Q.

X co 05X co 05

ЮYu

O OO O

CNCN

I o coAnd about co

Следните характеристики на последователността от таблица 7 са за отбелязване. При 5’ края на последователността са показани бази, съответстващи на тези от поли G сДНК линкер. Тогава там се появяват около пет бази (означени с “М”)^чиято последователност не може направо да се определи недвусмислено по метода на Sanger et. al., поради предшестващите многобройни G’s. По - нататък последователността показва серия от 12 кодона, кодиращи част от предполагаема лидерна последователност за полипептида. На основата на съответствие на аминотерминалната последователност на естествени изолати от hpCSF, описани в пример 1 иницииращия треонинов остатък на предполагаемата “зряла” форма hpG-CSF, се отбелязва чрез +1. След това бе показано за зрелия hpG-CSF, че включва 174 остатъка, както е посочено. След “стоп” кодона (ОР кодона, TGA) има приблизително 856 бази от една нетранслирана 3’ последователност и многобройни A’s от poly А “опашка”. Уникалните HgiAi, и Apal рестрикционни ендонуклеазни сайтове за разпознаване, както и два Stul сайтове (обсъждани по-долу, с оглед конструирането на прокариотни и еукариотни експресионни системи) също са посочени в таблица 7. Поради липсата на аспергинови остатъци в полипептида няма явни сайтове за Nгликозилиране. Подчертаните 6 бази близо до края на 3’ нетранслираната последователност представляват потенциален сайт за полиаденилиране.The following sequence characteristics of Table 7 are noteworthy. At the 5 'end of the sequence, bases corresponding to those of the poly G cDNA linker are shown. Then about five bases (denoted by “M”) appear there, whose sequence cannot be determined unambiguously by the method of Sanger et. al., due to previous numerous G's. The sequence further shows a series of 12 codons encoding part of a putative leader sequence for the polypeptide. Based on the correspondence of the amino-terminal sequence of the natural isolates of hpCSF described in Example 1, the threonine-initiating residue of the putative "mature" hpG-CSF form is +1. The mature hpG-CSF was then shown to include 174 residues as indicated. Following the stop codon (OP codon, TGA), there are approximately 856 bases of one untranslated 3 'sequence and numerous A's of poly A' tail '. The unique HgiAi and Apal restriction endonuclease recognition sites, as well as two Stul sites (discussed below for the construction of prokaryotic and eukaryotic expression systems) are also listed in Table 7. Due to the lack of aspergine residues, no polypeptide is present in the polypeptide Nglycosylation. The underlined 6 bases near the end of the 3 'untranslated sequence represent a potential polyadenylation site.

За отбелязване е, че всеки от два допълнителни сДНК клона,идентифицирани чрез процедурите на хибридизация, описани по-горе, от общо 450 000 клона не успяват да включатOf note, each of the two additional cDNA clones identified by the hybridization procedures described above out of a total of 450,000 clones failed to include

ДНК,кодираща цялата лидерна последователност от сайта за иницииране на транскрипцията напред. Всъщност всичките три hpG-CSF клона, завършващи в 5’ областта точно при същия сайт, посочва, че вторичната структура на иРНК строго транскрибира задните сДНК образувания отвъд този сайт. Следователно, от практична гледна точка сКринингът на сДНК експресията, както е описан от Okayama et al., Mol. and Cell. Biol., 3, 280-289 (1983) и използван всъщност за изолиране на GM-CSF във Wong, et al., Science, 228, 810-814 (1985) не може направо да се приложи за изолиране на hpCSF ДНК, тъй като такива системи за изолиране обикновенно се базират на присъствието на сДНК транскрипт в пълна дължина в изследваните клонове.DNA encoding the entire leader sequence from the forward transcription initiation site. In fact, all three hpG-CSF clones terminating in the 5 'region at exactly the same site indicate that the secondary mRNA structure strictly transcribes the posterior cDNAs beyond this site. Therefore, from a practical point of view, cDNA expression screening, as described by Okayama et al., Mol. and Cell. Biol., 3, 280-289 (1983) and actually used to isolate GM-CSF in Wong, et al., Science, 228, 810-814 (1985) cannot be directly applied to isolate hpCSF DNA, since such isolation systems are usually based on the presence of full-length cDNA transcript in the clones examined.

Горната последователност не е точно чувствителна на подсигуряване на директна еспресия на hpG-CSF в микробиален гостоприемник. За подсигуряване на такава експресия, кодиращата област на hpG-CSF трябва да бъде снабдена с ATG кодон за иницииране и последователността трябва да бъде инсерирана във вектор за трансформиране в сайт под контрола на подходяща промоторна/регулаторна ДНК последователност.The above sequence is not exactly sensitive to ensuring the direct expression of hpG-CSF in a microbial host. To ensure such expression, the hpG-CSF coding region must be provided with an ATG initiation codon and the sequence must be inserted into a vector to be transformed into a site under the control of a suitable promoter / regulatory DNA sequence.

ПРИМЕР 5EXAMPLE 5

В този пример сДНК кодираща hpG-CSF, както е изолирана в предходния пример,се използва за скриниране на геномен клон. Геномна библиотека на ламбда фага на човешки зародишен черен дроб [изготвена съгласно процедурата на Lawn, et al., Cell. 15, 1157-1174 (1978) и получен от Т. Maniatis] се скринира при използване на nick транслирана проба, състояща се от два hpG-CSF сДНК фрагмента, изолирана чрез смилане с HgiAl u Stul (HgiAl до Stul, 649 bp; Stul до Stul, 639 bp). Общо около 500 000 фага се посяват върху 12 (15 cm) петриеви блюда и плаките се отделят и хибридизират с пробата при използване на процедурата на Benton/Davison [Benton et al., Science, 196, 180 (1977)]. Наблюдават се общо 12 позитивни клона. Три клона (1-3),даващи най-силните сигнали при авторадиография при второ скриниране.се култивират в 1-о литрови култури и се картират чрез смилане с рестрикционен ензим и Southern blotting при използване на белязан с изотоп 24-мерен олигонуклеотид (обработен с киназа с γ-32Ρ АТР) 5OTGCACTGTCCAGAGTGCACTGTG3’. Резултатите от картирането показват, че изолати 1 и 3 са идентични, а 2 съдържа 2000 допълнителни бази 5’ към hpG-CSF гена. Поради това клон 2 се използва за последващо охарактеризиране. ДНК от клон 2 се смила с R1 за освобождаване на фрагмент от 850 Ьр, съдържащ hpG-CSF, който след това се субклонира в pBR322 с последващо картиране чрез смилане с рестрикционни ендонуклеази, Southern blotting, М13 субклониране и секвениране. Получената последователност е посочената на таблица 8.In this example, the cDNA encoding hpG-CSF, as isolated in the preceding example, is used to screen for a genomic clone. Human germline lambda phage genomic library [prepared according to the procedure of Lawn, et al., Cell. 15, 1157-1174 (1978) and obtained by T. Maniatis] was screened using a nick-translated sample consisting of two hpG-CSF cDNA fragments isolated by digestion with HgiAl and Stul (HgiAl to Stul, 649 bp; Stul to Stul, 639 bp). A total of about 500,000 phages were seeded on 12 (15 cm) petri dishes and plates were separated and hybridized with the sample using the Benton / Davison procedure [Benton et al., Science, 196, 180 (1977)]. A total of 12 positive clones were observed. Three clones (1-3) yielding the strongest autoradiography signals at second screening were cultured in 1 liter cultures and mapped by restriction enzyme digestion and Southern blotting using an isotope-labeled 24-oligonucleotide (treated with kinase with γ- 32 Ρ ATP) 5OTGCACTGTCCAGAGTGCACTGTG3 '. The mapping results show that isolates 1 and 3 are identical and 2 contains 2000 additional bases 5 'to the hpG-CSF gene. Therefore, clone 2 is used for subsequent characterization. Clone 2 DNA was digested with R1 to release a 850 bp fragment containing hpG-CSF, which was then subcloned into pBR322 with subsequent mapping by restriction endonuclease digestion, Southern blotting, M13 subcloning and sequencing. The resulting sequence is shown in Table 8.

Ο Ο xtXt Ο xt

ο coο co

ΣΣ

ο.ο.

ΐΟ ω cω ω c

I— ΧΖI— ΧΖ

I— го <I — it <

οο

L-. 0_ ο ο to <L-. 0_ ο ο to <

ΟΟ

Ο Ο Ο Ο < Ο ο οΟ Ο Ο Ο <Ο ο ο

5κ ο5κ ο

οο

Η ο ο <Η ο ο <

I— ο 0 0 Η < ο ο ο <I— ο 0 0 Η <ο ο ο <

< ο ο ο < ο ο ο ο 0 <<ο ο ο <ο ο ο ο 0 <

ο ο ο < ο г-~ <-<Ί (Продължение)ο ο ο <ο g- ~ <- <Ί (Continued)

II

Ο ο CDCD ο CD

Ο Ο h~Ο Ο h ~

II

(I)(I)

Φ coΦ co

Φ co <Φ co <

CLCL

Φ _J o Οχ:J _J o Οχ:

HH

ACCCCCCTGGGCCCTGCCAGCTCCCTGCCCACCCCCCTGGGCCCTGCCAGCTCCCTGCCC

00

Φ I— οο m (Продължение) ο OJ (ϋ >Φ I— οο m (Continued) ο OJ (ϋ>

οο

Σ5 Φ co >. Ο co >ZJ φΣ5 Φ co>. Ο co> ZJ φ

Ζ3 φ —J φ xz CLΖ3 φ —J φ xz CL

Φ ω ο ο co $ ο 0 < 0 < Η Η0 0 Η 0 S ο I— ο 0 [— ο 0 Η I— ο 0 < 0 < ο ю co ο co co >.$ Ω ο ο co $ ο 0 <0 <Η Η0 0 Η 0 S ο I— ο 0 [- ο 0 Η I— ο 0 <0 <ο ju co ο co co>.

CC

Φ _Φ <Φ _Φ <

_Φ <_Φ <

ClCl

CO <CO <

2?2?

φ co >чφ co> h

Ο)Ο)

L<L <

Ο Ο σ>Σ Ο σ>

ο <ο <

<<

I— ο ο ο <I— ο ο ο <

<<

<<

ΗΗ

ΙΟ <ΙΟ <

<<

I—I—

ΙΟ <ΙΟ <

ΙΟ <ΙΟ <

I— 0 < I— Η < Η <I— 0 <I— Η <Η <

< 0 <<0 <

I<I <

Ο <Ο <

<<

<<

ΙΟ Η Ο οΙΟ Η Ο ο

Η < ο <Η <ο <

<<

ο 0 0 < ο 0 I— οο 0 0 <ο 0 I— ο

< 0 ι—<0 ι—

I— ο 0 Ο ΙΟ 0 0 0I— ο 0 Ο ΙΟ 0 0 0

Ο Η οΟ Η ο

Η <Η <

I— 0 0 π-I— 0 0 π-

ω < ο ο ο Η ο ο < οω <ο ο ο ο Η ο ο <ο

GACCAGAGAGTCGGGGAGGACCCGGGAAGGAGCGGCGACCCGGCCACGGC 1200GACCAGAGAGTCGGGGAGGACCCGGGAAGGAGCGGCGACCCGGCCACGGC 1200

(Продължение)(Continued)

GAGTCTCACTCAGCATCCTTCCATCCCCAGGAGTCTCACTCAGCATCCTTCCATCCCCAG

< φ ><φ>

ο.ο.

σ) <σ) <

ο ’Г οο 'Г ο

σ>σ>

Ο < 0 Ο I— ο 0 0 0 0 Ο ο 0 < 0 0Ο <0 Ο I— ο 0 0 0 0 Ο ο 0 <0 0

Ζ5Ζ5

Φ _Ζ5 ο_Φ _Ζ5 ο_

1— φ ω >s 01— φ ω> s 0

Ζ5 ΦΖ5 Φ

Φ χζ 0_Φ χζ 0_

Ζ5Ζ5

ΦΦ

Ο Ο CD (Продължение) ο οοΟ Ο CD (Continued) ο οο

2>2>

φ ω ωφ ω ω

XX

ZJZJ

ΦΦ

Η 0 0 1=Η 0 0 1 =

ΟΟ

I— 0 0 0 Η ΙΟ < 0 0 0 0 0 0 Η 0 I— < 0 0 0 $ 0 0 I— 0 0 0 0I— 0 0 0 Η ΙΟ <0 0 0 0 0 0 Η 0 I— <0 0 0 $ 0 0 I— 0 0 0 0

I— 0 <I— 0 <

Η 0 <Η 0 <

ΗΗ

ΗΗ

ΟΟ

U. ο.U. ο.

<<

< 0 0 Η Η 0 0<0 0 Η Η 0 0

0 ο CN0 ο CN

CLCL

I—I—

ΦΦ

-C Η k— χ: Iro < φ JZ ο.-C Η k— χ: Iro <φ JZ ο.

Ο Ο Γ-Ο Ο Γ-

ϊ < 0 0 I— 0ϊ <0 0 I— 0

Q.Q.

(Λ < 0(Λ <0

(Продължение)(Continued)

(Продължение)(Continued)

TTATGTCTATTTAAGCCTCATATTTAAAGACAGGGAAGAGCAGAACGGAGTTATGTCTATTTAAGCCTCATATTTAAAGACAGGGAAGAGCAGAACGGAG

TCTGGGTGCCCTCGGGACACCTGCCCTGCCCCCACGAGGGTCAGGACTGT 2600 (Продължение)TCTGGGTGCCCTCGGGACACCTGCCCTGCCCCCACGAGGGTCAGGACTGT 2600 (Continued)

GACTCTTTTTAGGGCCAGGCAGGTGCCTGGACATTTGCCTTGCTGGATGGGACTCTTTTTAGGGCCAGGCAGGTGCCTGGACATTTGCCTTGCTGGATGG

ο ο ο coο ο ο co

Подробно е показана на фигура 1 рестрикционна ендонуклеазна карта (приблизително 3,4 КЬ) на геномна ДНК, съдържаща hpG-CSF гена, Рестрикционните ендонуклеази, показани на фигура 1,са: Ncol, N; Pstl, Р; BanHI, В; Apal, A; Xhol, X ; u Kpn, K. Стрелките под картата показват стратегията на секвениране, използвана за получаване на геномна последователност. Областите оградени в правоъгълници,са откритите в сДНК клона, като правоъгълниците с пунктир представляват последователност . неприсъстваща в сДНК клона, но идентифицирана чрез изследване на иРНК петна. Идентифицирането на кодиращи последователности, предложени за екзон 1,се провежда чрез Northern blot анализ. 24-мерна олигонуклеотидна проба 5’CAGCAGCTGCAGGGCCATCAGCTT3’, заемаща предсказаните места на свързване за екзони 1 и 2 се хибридизира с hpG-CSF и РНК в Northern blot формат. Полученото петно показва иРНК със същият размер (—1650 Ьр) като установената с екзон 2 олигонуклеотидна проба. Тези данни, комбинирани със способността на pSVGM-Ppol вектора да провежда експресията на hpG-CSF (пример 9) при използване на Met кодон за иницииране, посочен на таблица 8, дефинира кодиращите последователности.включени в екзон 1. Екзони 2 -5 се дефинират чрез кодиращите последователности получени в сДНК клона (Рро2) на hpG-CSF гена (таблица 7).The restriction endonuclease map (approximately 3.4Kb) of the genomic DNA containing the hpG-CSF gene is shown in Figure 1. The restriction endonuclease shown in Figure 1 are: Ncol, N; Pstl, P; BanHI, B; Apal, A; Xhol, X; u Kpn, K. The arrows below the map indicate the sequencing strategy used to obtain the genomic sequence. The areas enclosed in rectangles are found in the cDNA clone, the dotted rectangles being a sequence. not present in the cDNA clone, but identified by mRNA spot testing. The identification of the coding sequences proposed for exon 1 was performed by Northern blot analysis. The 24′C oligonucleotide sample 5′CAGCAGCTGCAGGGCCATCAGCTT3 ′ occupying the predicted binding sites for exons 1 and 2 is hybridized with hpG-CSF and RNA in Northern blot format. The resulting spot shows an mRNA of the same size (-1650 bp) as the exon 2 oligonucleotide probe established. This data, combined with the ability of the pSVGM-Ppol vector to carry out the expression of hpG-CSF (Example 9) using the Met initiation codon indicated in Table 8, defines the coding sequences included in exon 1. Exons 2 - 5 are defined by the coding sequences obtained in the cDNA clone (PP2) of the hpG-CSF gene (Table 7).

ПРИМЕР 6EXAMPLE 6

Този пример се отнася до приготвянето на произведен ген,кодиращ hpG-CSF и включващ предпочитани кодони на Е. coli.This example relates to the preparation of a gene produced encoding hpG-CSF and including preferred E. coli codons.

Накратко, използваният протокол най-общо е като описаният в РСТ публикация No W083/04053 в съпритежание на Alton, et al., който е включен в настоящото за справка. Гените—се—проектират—за—първоначално—събиране—на-— съставните олигонуклеотиди в многобройни дуплекси, които на свой ред се събират в три отделни секции. Тези секции се проектират за бързо амплифициране и, след отстраняване от системата за амплифициране, могат да се сглобят по секвенции или чрез многобройно лигиране на фрагменти в подходящ експресионен вектор.In short, the protocol used is generally as described in PCT Publication No. W083 / 04053 co-authored with Alton, et al., Which is incorporated herein by reference. The genes are designed to initially assemble the constituent oligonucleotides into multiple duplexes, which in turn are assembled into three distinct sections. These sections are designed for rapid amplification and, after removal from the amplification system, can be assembled sequentially or by multiple ligation of fragments into a suitable expression vector.

Конструирането на секции I, II u III е илюстрирано в таблици 9 до 14. При конструирането на секция I, както е илюстрирано в таблица 9 и 10, олигонуклеотиди 1-14 се сглобяват в 7 дуплекса (1 и 8; 2 и 9; 3 и 10; 4 и 11; 5 и 12; 6 и 13; и 7 и 14). Седемте дуплекса след това се лигират}за да образуват секция I, както е показано на таблица 10. Може да се отбележи също на таблица 10, че секция I включва в посока upstream един Xbal леплив край, а в посока downstream BamHI леплив край, използвани за лигиране към амплификационни и експресионни вектори и за лигиране към секция II.The construction of Sections I, II and III is illustrated in Tables 9 to 14. In the construction of Sections I, as illustrated in Tables 9 and 10, oligonucleotides 1-14 are assembled into 7 duplexes (1 and 8; 2 and 9; 3 and 10; 4 and 11; 5 and 12; 6 and 13; and 7 and 14). Seven duplex then ligated} to form Section I, as shown in Table 10. It can be noted in Table 10 that the section I comprises upstream from an Xbal sticky end and towards the downstream BamHI sticky-end used for ligation to amplification and expression vectors and for ligation to section II.

__________________________________________Таблица 9__________________________________________ Table 9

EchpG-CSFDNA - СЕКЦИЯ IEchpG-CSFDNA - SECTION I

CTAGAAAAAACCAAGGAGGTAATAA 1CTAGAAAAAACCAAGGAGGTAATAA 1

TAATGACTCCATTAGGTCCTGCTTCTTCT 2TAATGACTCCATTAGGTCCTGCTTCTTCT 2

CTGCCGCAAAGCTTTCTGCTGCTGAAATGTCTGG 3 (продължение)CTGCCGCAAAGCTTTCTGCTGCTGAAATGTCTGG 3 (continued)

AACAGGTTCGTAAAATCCAGGGTGACGGT4AACAGGTTCGTAAAATCCAGGGTGACGGT4

GCTGCACTGCAAGAAAAACTGTGCGCTA5GCTGCACTGCAAGAAAAACTGTGCGCTA5

CTTACAAACTGTGCCATCCGGAAGAGC6CTTACAAACTGTGCCATCCGGAAGAGC6

TGGTACTGCTGGGTCATTCTCTTGG7TGGTACTGCTGGGTCATTCTCTTGG7

CATTATTTATTACCTCCTTGGTTTTTT8CATTATTTATTACCTCCTTGGTTTTTT8

GCAGAGAAGAAGCAGGACCTAATGGAGT9GCAGAGAAGAAGCAGGACCTAATGGAGT9

TGTTCCAGACATTTCAGCAGAAAGCTTTGCG10TGTTCCAGACATTTCAGCAGAAAGCTTTGCG10

CAGCACCGTCACCCTGGATTTTACGAACC11CAGCACCGTCACCCTGGATTTTACGAACC11

TAAGTAGCGCACAGTTTTTCTTGCAGTG12TAAGTAGCGCACAGTTTTTCTTGCAGTG12

ACCAGCTCTTCGGGATGGCACAGTTTG13ACCAGCTCTTCGGGATGGCACAGTTTG13

GATCCCAAGAGAATGACCCAGAAGT14 гТАБЛИЦА 10GATCCCAAGAGAATGACCCAGAAGT14 TABLE 10

н n о и 9 o and 9 и and ь s - н < - n < н n б—< b— < ф f и ф and f и and < < Ф о гч Ф U F o rh F U δ δ ф и н < f and n <

Както е показано на таблица 11 и 12 при конструирането на секция II, олигонуклеотиди 15-30 се сглобяват в осем дуплекса (15 и 23; 16 и 24; 17 и 25; 18 и 26; 19 и 27; 20 и 28; 21 и 29 и 22 и 30). Тези осем дуплекса след това се лигират,за да образуват секция II;както е показано на таблица 12. Както е показано след това на таблица 12, секция II включва в посока upstream един BamHI леплив край и в посока downstream EcoRI леплив край , използвани за лигиране към амплификационен вектор и за лигиране към секция I. Близо до нейния downstream край секция II включва също така downstream Sstl сайт, използван при евентуално лигиране на секция II и III.As shown in Tables 11 and 12 in the construction of section II, oligonucleotides 15-30 are assembled into eight duplexes (15 and 23; 16 and 24; 17 and 25; 18 and 26; 19 and 27; 20 and 28; 21 and 29 and 22 and 30). These eight duplexes are then ligated to form section II ; as shown in Table 12. As shown subsequently in Table 12, section II includes upstream one BamHI adhesive end and downstream EcoRI adhesive end used for ligation to the amplification vector and for ligation to section I. Near its the downstream end of section II also includes the downstream Sstl site used for eventual ligation of sections II and III.

____________________________________________Таблица 11 EchpG-CSFDNA - СЕКЦИЯ II____________________________________________ Table 11 EchpG-CSFDNA - SECTION II

GATCCCGTGGGCTCCGCTGTCTTCT15GATCCCGTGGGCTCCGCTGTCTTCT15

TGTCCATCTCAAGCTCTTCAGCTGGC16TGTCCATCTCAAGCTCTTCAGCTGGC16

TGGTTGTCTGTCTCAACTGCATTCTGGT17TGGTTGTCTGTCTCAACTGCATTCTGGT17

CTGTTCCTGTATATCAGGGTCTTCTG18CTGTTCCTGTATATCAGGGTCTTCTG18

CAAGCTCTGGAAGGTATCTCTCCGGA19CAAGCTCTGGAAGGTATCTCTCCGGA19

ACTGGGTCCGACTCTGGACACTCTGCA20ACTGGGTCCGACTCTGGACACTCTGCA20

GCTAGATGTAGCTGACTTTGCTACTACT21 (продължение)GCTAGATGTAGCTGACTTTGCTACTACT21 (continued)

ATTTGGCAACAGATGGAAGAGCTCAAAG22ATTTGGCAACAGATGGAAGAGCTCAAAG22

GACAAGAAGACAGCGGAGCCCACGG23GACAAGAAGACAGCGGAGCCCACGG23

ACCAGCCAGCTGAAGAGCTTGAGATG24ACCAGCCAGCTGAAGAGCTTGAGATG24

ACAGACCAGAATGCAGTTGAGACAGACA25ACAGACCAGAATGCAGTTGAGACAGACA25

CTTGCAGAAGACCCTGATACAGGA26CTTGCAGAAGACCCTGATACAGGA26

CAGTTCCGGAGAGATACCTTCCAGAG27CAGTTCCGGAGAGATACCTTCCAGAG27

TAGCTGCAGAGTGTCCAGAGTCGGACC28TAGCTGCAGAGTGTCCAGAGTCGGACC28

AAATAGTAGTAGCAAAGTCAGCTACATC29AAATAGTAGTAGCAAAGTCAGCTACATC29

AATTCTTTGAGCTCTTCCATCTGTTGCC30AATTCTTTGAGCTCTTCCATCTGTTGCC30

ТАБЛИЦА 12TABLE 12

ο ο φ φ ο < ο < Η- Η - < < Ε—ι Φ Ε — ι Φ < φ < φ cs Η cs Η < U <U Ο 00 Ο 00 Η φ Η φ Η Η Φ 21 ΐ Φ 21 ΐ U U τ—~4 τ— ~ 4 φ φ Η φ Η φ < φ ΕΗ ΕΗ Η Η Η Η φ φ φ φ Φ Φ U U Γ-4| Γ-4 | Η Η Η Η < < φ φ L · CNl CNl φ φ φ φ φ φ Η Η < < < < φ φ φ φ υ υ Φ Φ φ φ

φ φ ο Ε-*ο Ε - * ο Η ο Η < < Ξ ο c Ο ο c 52 δ 52 δ φ φ φ и φ and Φ Φ φ φ < !- <! - < < Η Η < ь- <b- Η Η φ * '“ί 04 φ * '' Ί 04 δ Φ δ Φ Φ Φ < ΙΝΙ <ΙΝΙ φ φ Ε—1 Ε— 1 < < Η < Η < < < φ φ Q Φ Q Φ Φ Φ < < Η < Η < < <

U U Φ Φ ο ο Η Η < < Ο Ο Η Η Φ < Φ < ο ο ο ο и and Φ Φ ο ο Η Η Η Η < < ’—‘ '-' φ φ < и <and Η φ Η φ αο] αο] φ φ φ φ δ- δ- U U Η Η < < —Ί —Ί φ φ U U φ φ Ο Ο φ φ < < (— (- Ι- Ι- Ε-< Ε- < < < и and 2 2 Ο Ο < < Η Η Ε—! Ε—! < < Η Η Φ Φ φ φ < < 1- 1- υ υ

Η ο ϋυ wl < Η <! ηΗ ο ϋυ wl <Η <! η

ΟΙ mlΟΙ ml

Последно, секция III се конструира, както е показано на таблици 13 и 14. За тази конструкция олигонукпеотиди 31-42 се сглобяват в 6 дуплекса (31 и 37; 32 и 38; 33 и 39; 34 и 40; 35 и 41; и 36 и 42). Шестте дуплекса след това се лигират за да образуват секция III, както е показано на таблица 14. Както е показано след това на таблица 14, секция III включва в посока upstream един BamHI леплив край, а в посока downstream EcoRI леплив край, използвани за лигиране към амплификационен вектор, и поне в случая на EcoRI края, в експресионен вектор. В допълнение секция II има в посока upstream Sstl сайт, използван при евентуално лигиране на секция II и III.Lastly, Section III was constructed as shown in Tables 13 and 14. For this construction, oligonucleotides 31-42 were assembled into 6 duplexes (31 and 37; 32 and 38; 33 and 39; 34 and 40; 35 and 41; and 36 and 42). The six duplexes are then ligated to form Section III as shown in Table 14. As shown in Table 14 thereafter, Section III includes an upstream BamHI adhesive end and downstream EcoRI adhesive end used for ligation to an amplification vector, and at least in the case of the EcoRI terminus, into an expression vector. In addition, section II has an upstream Sstl site used for eventual ligation of sections II and III.

Таблица 13Table 13

EchpG-CSFDNA СЕКЦИЯ IIIEchpG-CSFDNA SECTION III

GATCCAAAGAGCTCGGTATGGCACCAG31GATCCAAAGAGCTCGGTATGGCACCAG31

CTCTGCAACCGACTCAAGGTGCTATGCCG32CTCTGCAACCGACTCAAGGTGCTATGCCG32

GCATTCGCTTCTGCATTCCAGCGTCGTGC33GCATTCGCTTCTGCATTCCAGCGTCGTGC33

AGGAGGTGTACTGGTTGCTTCTCATCTG34AGGAGGTGTACTGGTTGCTTCTCATCTG34

CAATCTTTCCTGGAAGTATCTTACCGTGT35CAATCTTTCCTGGAAGTATCTTACCGTGT35

TCTGCGTCATCTGGCTCAGCCGTAATAG36TCTGCGTCATCTGGCTCAGCCGTAATAG36

AGAGCTGGTGCCATACCGAGCTCTTTG37 (Продължение)AGAGCTGGTGCCATACCGAGCTCTTTG37 (Continued)

ATGCCGGCATAGCACCTTGAGTCGGTTGCATGCCGGCATAGCACCTTGAGTCGGTTGC

TCCTGCACGACGCTGGAATGCAGAAGCGATCCTGCACGACGCTGGAATGCAGAAGCGA

ATTGCAGATGAGAAGCAACCAGTACACCATTGCAGATGAGAAGCAACCAGTACACC

CAGAACACGGTAAGATACTTCCAGGAAAGCAGAACACGGTAAGATACTTCCAGGAAAG

AATTCTATTACGGCTGAGCCAGATGACGAATTCTATTACGGCTGAGCCAGATGACG

Xbal към BamHI фрагмент, образуван в секция I, се лигира в М13тр11 фагов вектор,отворен с Xbal и BamHI. След това векторът отново се отваря чрез смилане BamHI и EcoRI, следвано от лигиране с BamHI към EcoRI фрагмент, образуван чрез секция II. На този етап секции I u II са свързани в правилна ориентация. След това друг M13mpll вектор се отваря чрез BamHI до EcoRI смилане, след което се лигира с BamHI към EcoRI фрагмента, образуван чрез секция III.The Xbal to BamHI fragment formed in section I was ligated into an M13tr11 phage vector opened with Xbal and BamHI. The vector was then reopened by digestion of BamHI and EcoRI, followed by ligation with BamHI to the EcoRI fragment formed by section II. At this stage, sections I and II are connected in the correct orientation. Then another M13mpl1 vector was opened by BamHI to EcoRI digestion and then ligated with BamHI to the EcoRI fragment formed by section III.

Векторът,съдържащ секции I u П,се смила с Xbal u Sstl. Подобно, векторът,съдържащ секция lllzce смила със Sstl и EcoRI. И двата по-малки от двата фрагмента,получени от всяко смилане; се лигират в плазмид pCFM1156, който предварително е отворен с Xbal и EcoRI. Продуктът на тази реакция е експресионен плазмид. съдържащ непрекъсната ДНК последователност, както е показано на таблица 15, кодиращ целия hpG-CSF полипептид с амино терминален метионинов кодон (ATG) за иницииране на транслацията в Е. coli.The vector containing sections I and P was ground with Xbal u Sstl. Similarly, the vector containing section lll z is digested with Sstl and EcoRI. Both smaller of the two fragments obtained by each grinding ; were ligated into plasmid pCFM1156, which was previously opened with Xbal and EcoRI. The product of this reaction is an expression plasmid. containing the continuous DNA sequence as shown in Table 15 encoding the entire hpG-CSF polypeptide with the amino terminal methionine codon (ATG) to initiate translation into E. coli.

ТАБЛИЦА 14TABLE 14

ΟΟ

ο Ο ο н уο Ο ο n у

οο

οο| mlοο | ml

’xt’l ml'Xt'l ml

οι •^l <οι • ^ l <

<<

Ε—Ε—

Φ υ ο <Φ υ ο <

Η и и φ <Η and and φ <

Η < ΗΗ <Η

Η <Η <

сч| 'tl wlsch | 'tl wl

ο τΓο τΓ

φ φ φ φ Ο Ο υ υ φ φ Ό Ό φ φ 40 40 φ φ < < Η Η < < φ φ Φ Φ Φ Φ φ φ φ φ < < φ φ φ φ Η Η '< '< 40 40 Η Η < < φ φ φ φ m m φ φ φ φ Η Η < < < < φ φ φ φ < < Η Η φ1 φ 1 φ φ φ φ φ φ

< φ φ (—<<φ φ (- <

υ υ ου υ ο

οο

1Г.1D.

ΗΗ

Φ υ φΦ υ φ

Η οΗ ο

ΗΗ

Η φ Η < υ φ υ δ иΗ φ Η <υ φ υ δ and

<<

ο Η <ο Η <

< Η φ 6 mlgg<Η φ 6 mlgg

Η <Η <

Ρ < ΗΡ <Η

Г-| mlMr- | ml

Ο ml mlΟ ml ml

Φ U Φ < Φ υ ΕΕ— <Φ U Φ <Φ υ ΕΕ— <

φ υ φ φ φ φ <φ υ φ φ φ φ <

<<

φφ

ο 'Τ φ φ φ Η <ο 'Τ φ φ φ Η <

< φ < Η <<φ <Η <

οο

Φ Η ΗΦ Η Η

Η φ ο tΗ φ ο t

Η φ Η Η φ φ φ Η Η φΗ φ Η Η φ φ φ φ Η

< φ <<φ <

< φ φ φ <<φ φ φ <

<<

m| mlm | ml

Η φ φΗ φ φ

Η Η φ Η Η φ φ <Η Η φ Η Η φ φ <

φ φ ίφ φ ί

Въпреки че може да се използва който и да е подходящ вектор за екпресиране на тази ДНК, експресионният плазмид pCFM1156 лесно може да се конструира от плазмид pCFM836, чиято конструкция е описана в публикувана заявка за Европейски Патент No 136,490. pCFM836 първо се срязва с Ndel а после се прави с тъпи краища с Poll, като по този начин се разрушават двата съществуващи Ndel сайта. След това векторът се смила с Clal и Sacll за отстраняване на съществуващия полилинкер преди лигирането към заместващ полилинкер, както е показано на таблица 16. Този заместващ полилинкер може да се конструира съгласно процедурата на Alton, et al., по-горе. Контролът на експресията в експресионния OCFM1156 плазмид се осъществява посредством лам6да Pl промотор, който от своя страна може да бъде под контрола на С|857 репресорен ген (какъвто е доставен в Е. coli щам K12AHtrp).Although any suitable vector for expressing this DNA can be used, the expression plasmid pCFM1156 can be readily constructed from plasmid pCFM836, the construction of which is described in published application for European Patent No. 136,490. pCFM836 first cuts to Ndel and then blunt ends with Poll, thus destroying the two existing Ndel sites. The vector was then milled with Clal and Sacll to remove the existing polylinker prior to ligation to a replacement polylinker, as shown in Table 16. This replacement polylinker can be constructed according to the procedure of Alton, et al., Above. The expression control in the expression OCFM1156 plasmid is carried out by the lam6 to Pl promoter, which in turn can be controlled by C | 85 7 repressor gene (as supplied in E. coli strain K12AHtrp).

ПРИМЕР 7EXAMPLE 7

Този пример се отнася до експресия на hpG-CSF полипептид в Е. coli посредством ДНК последователност, кодираща [Met1] hpCSF. Използваната последователност частично е синтетична и частично произлиза от сДНК. Синтетичната последователност използва предпочитаните кодони за Е. coli.This example relates to the expression of a hpG-CSF polypeptide in E. coli by a DNA sequence encoding [Met 1 ] hpCSF. The sequence used is partially synthetic and partly derived from cDNA. The synthetic sequence uses the preferred codons for E. coli.

Таблица 15Table 15

1 1 г— CL r— CL 0 0 — 5 0 ο 0 0 - 5 0 ο 0 0 < 0 0 < φ (Λ φ (Λ 0 0 C C ο ο 0 0 <L Ο <L Ο 0 0 φ φ ΙΟ ΙΟ ο ο ° 8 ° 8 ο ο Ο co < Ο co < < < Ο Ο □_ □ _ 0 0

(Продължение)(Continued)

ГMr

IT;IT;

Ο CD слΟ CD ff

1— <1— <

Z5 φ го >Z5 φ it>

cn <cn <

го >it>

_Z5_Z5

ZJ α>ZJ α>

φ χζ ο.φ χζ ο.

Η 0 I-CΗ 0 I-C

Ζ3Ζ3

Φ (Ο τ ία» GOGO (Ο τ ία »GO

ГО <GO <

(Продължение)(Continued)

ΗΗ

ΙΟΙΟ

Η I—Η I—

I— οI— ο

Η ο ΗΗ ο Η

I—I—

I—I—

ΙΟΙΟ

Η ο ΗΗ ο Η

ΙΟ 0ΙΟ 0

ГОGO

ΙΟ 0ΙΟ 0

_cz_cz

ГО <GO <

Ζ3 0 Φ Η -* ο ο Γ-03 0 Φ Η - * ο ο Γ-

IT)IT)

Таблица 16Table 16

I— I— o o o o c c o o T T H Q H Q LO co LO co O H O H μ Q l·< μ Q l · < Φ Ό z Ό Ό z 0 0 CD CM CD CM Ι- Ι- __7 __7 Ο Ο 03 x> 03 x> s s X X CM CM Ι- Ι- No Ο Ο 0 0 αί αί £ £ ο ο

CDCD

Плазмид Рро2, съдържащ hpG-CSF гена, показан на таблица 7, се смила с HgiAl и Stul като се предоставя фрагмент от приблизително 645 базови двойки.включващ гена на зрелия hpCSF (както е показано на таблица 7) със седем остатъчни кодони на лидерната последователност в 5’ края и приблизително 100 базови двойки от 3’ некодиращата област. Смилане с HgiAl води до 5’ 4-базов леплив край, идентичен на този от Pstl, a Stul води до тъпи краища. Това позволява бързо инсериране на фрагмента в М13 mp8 (Rf) .срязан с Pstl и с рестрикционния ензим Hindi,образуващ тъпи краища. След амплифициране в М13, hpG-CSF ДНК се изрязва чрез смилане с Apal u BamHI, които съответно срязват при Ара! сайта, разполагайки кодоните за остатъци +3 до +5 на hpCSF и при BamHI сайта в посока “downstream” на Hindi сайта в М13 тр8 рестрикционния полилинкер. С цел да се позволи експресирането на hpG-CSF полипептида в Е. coli .се изготвя синтетичен фрагмент, както е показано на таблица 17 по-допу.Plasmid PP2 containing the hpG-CSF gene shown in Table 7 was digested with HgiAl and Stul to provide a fragment of approximately 645 base pairs. at the 5 'end and approximately 100 base pairs from the 3' non-coding region. Grinding with HgiAl results in a 5 '4-base adhesive end identical to that of Pstl, and Stul leads to blunt ends. This allows for the rapid insertion of the fragment into M13 mp8 (Rf) cut with Pst1 and with the Hindi restriction enzyme forming blunt ends. After amplification in M13, the hpG-CSF DNA was excised by digestion with Apal and BamHI, which were truncated at Apa! site, having residual codons +3 to +5 on hpCSF and at the BamHI site downstream of the Hindi site in the M13 tr8 restriction polylinker. In order to allow expression of the hpG-CSF polypeptide in E. coli, a synthetic fragment was prepared as shown in Table 17 below.

Таблица 17 5’ - С TAG AAA AAA CCA AGG AGG TAA TAA ATATable 17 5 '- With TAG AAA AAA CCA AGG AGG TAA TAA ATA

3’- TTT TTT GGT TCC TCC ATT ATT TAT3'- TTT TTT GGT TCC TCC ATT ATT TAT

XbalXbal

-1 +1-1 +1

Met Thr Pro LeuMet Thr Pro Leu

ATG ACA CCT CTG GGC C-5’ATG ACA CCT CTG GGC C-5 '

TAC TGT GGA GAC - 3’TAC TGT GGA GAC - 3 '

ApalApal

Както може да бъде определено от анализа на таблица 17, линкерът включва Apal леплив край, кодони, характеризиращи първоначалните три остатъка от амино края на hpG-CSF (“възстановяващ” Thr1, Pro2, Leu3 характеризиращи кодони,делетирани след смилане с Apal на М13 ДНК описано по-горе и при използване на кодони, за предпочитане експресирани в Е. coli) иницииращ транслацията ATG, последователност от 24 базови двойки, предоставяща сайт за свързване на рибозоми, и Xbal леплив край.As can be determined from the analysis of Table 17, the linker includes the Apal adhesive end, codons characterizing the original three amino acid residue residues of hpG-CSF ("restoring" Thr 1 , Pro 2 , Leu 3 characterizing codons deleted after grinding with Apal of M13 DNA described above and using codons, preferably expressed in E. coli) initiating ATG translation, a 24 base pair sequence providing a ribosome binding site, and an Xbal adhesive end.

Експресионният вектор използван за експресиране в Е. coli е този,описан като pCFM536 в заявка за Европейски Патент No 136,490 от Morris, публикувана на 10.04.1985. (Виж също А.Т.С.С. 39934, Е. coli JM103 съдържащ pCFM536). Накратко, плазмид pCFM536 се смила с Xbal u BamHI. hpG-CSF фрагментът (Apal/BamHI) и линкер (Xbal/Apal),описан по-горе, след това се лигира към него.за да образува плазмид,означен като р536Рро2.The expression vector used for expression in E. coli is the one described as pCFM536 in European Patent Application No. 136,490 by Morris, published April 10, 1985. (See also ATCC 39934, E. coli JM103 containing pCFM536). Briefly, plasmid pCFM536 was digested with Xbal u BamHI. The hpG-CSF fragment (Apal / BamHI) and the linker (Xbal / Apal) described above are then ligated thereto to form a plasmid designated p536Pro2.

Плазмид р536Рро2 се трансформира във вариант на Е. coli щам АМ7, устойчив на фаги, който предварително е трансформиран с плазмид pMW1 (А.Т.С.С. No 39933) включващ CI857 ген. Трансформирането се проверява на основата на маркерен ген (amp) за устойчивост на антибиотици, пренесен от родителски плазмид pCFM536. Култури на клетки в LB бульон (ампицилин 50 цд 1 ml) се поддържа при 28°С и след прорастването на клетките в културата до А600=0,5, hpCSF експресията се индуцира чрез повишаване температурата на култивиране до 42°С в продължение на 3 часа. Крайната O.D. на културата еPlasmid p536Pro2 was transformed into a variant of E. coli strain AM7, phage resistant, which had previously been transformed with plasmid pMW1 (ATCC No 39933) comprising the CI 857 gene. The transformation is verified on the basis of the antibiotic resistance marker gene (amp) transferred from the parent plasmid pCFM536. Cell cultures in LB broth (ampicillin 50 µg 1 ml) were maintained at 28 ° C and after cell growth in culture to A600 = 0.5, hpCSF expression was induced by raising the culture temperature to 42 ° C for 3 o'clock. The ultimate OD of culture is

А600=1,2.A600 = 1.2.

Определено е върху SDS-полиакриламиден гел. оцветен с coomassie blue багрило, че степента на експресиране на hpG-CSF от трансформираните клетки е 3-5% от общия клетъчен протеин.It was determined on an SDS-polyacrylamide gel. stained with coomassie blue dye that the expression rate of hpG-CSF from the transformed cells is 3-5% of the total cellular protein.

Клетките се събират чрез центрофугиране при 3500 g в продължение на 10 минути в JS-4.2 ротор. Клетки при 25% (тегло/обем) във вода се разрушават чрез трикратно преминаване през French Pressure Cell при 10 000 p.s.i. Суспенсията от разрушени клетки се центрофугира при 10 000 g в продължение на 15 минути на JA-20 ротор. Плътната утайка се суспендира отново във вода и се разтваря до приблизително 5 mg/ml общ протеин в 1% лауринова киселина, 50 mM Tris, pH 8,7. Разтворената плътна утайка се центрофугира при 15 000 g в продължение на 10 минути и към супернатантата се прибавя CuSOz; до 20 тМ. След 1 час тази проба се пропуска на С4 ВЕТХ колона за пречистване съгласно процедурите от пример 1 (Б) с нагласяване на обема и концентрацията.Cells were harvested by centrifugation at 3500 g for 10 minutes in a JS-4.2 rotor. Cells at 25% (w / v) in water were destroyed by passing through French Pressure Cell at 10,000 p.s.i. The slurry cell suspension was centrifuged at 10,000 g for 15 minutes on a JA-20 rotor. The solid precipitate was resuspended in water and dissolved to approximately 5 mg / ml total protein in 1% lauric acid, 50 mM Tris, pH 8.7. The dissolved solid precipitate was centrifuged at 15,000 g for 10 minutes and CuSO2 was added to the supernatant; up to 20 tM. After 1 hour, this sample was passed onto a C4 HPLC purification column according to the procedures of Example 1 (B) with volume and concentration adjustment.

Разработва се втора процедура на пречистване за получаване на по-големи количества hpG-CSF в неорганичен съдържащ буфер. Този продукт е подходящ за in vivo изследвания. 150 грама клетъчна паста отново се суспендира в приблизително 600 ml 1 mM DTT и 4 пъти се пропуска през Manton Gualin Homogenizer при приблизително 7 000 PSI. Суспенсията от разрушени клетки се центрофугира при 10 000 g за 30 минути и плътната утайка отново се суспендира в 400 ml 1% дезоксихолат (DOC), 5 mM EDTA, 5 тМ DTT и 50 тМA second purification procedure is being developed to obtain larger amounts of hpG-CSF in an inorganic containing buffer. This product is suitable for in vivo studies. 150 grams of cell paste was resuspended in approximately 600 ml of 1 mM DTT and passed 4 times through a Manton Gualin Homogenizer at approximately 7,000 PSI. The slurry cell suspension was centrifuged at 10,000 g for 30 minutes and the solid was resuspended in 400 ml of 1% deoxycholate (DOC), 5 mM EDTA, 5 mM DTT and 50 mM

Tris, pH 9. Тази суспенсия се разбърква при стайна температура в продължение на 30 минути и се центрофугира при 10 000 g в продължение на 30 минути. Плътната утайка отново се суспендира в приблизително 400 ml вода и се центрофугира при 10 000 g в продължение на 30 минути. Плътната утайка се разтваря в 100 ml 2% Sarkosyl и 50 тМ Tris при pH 8. Прибавя се CuSO4 до 20 μΜ и сместта се разбърква 16 часа при стайна температура, след което се центрофугира при 20 000 g в продължение на 30 минути. Към супернатантата се прибавят 300 ml ацетон. Сместа се слага върху лед в продължение на 20 минути? след което се центрофугира при 5 000 g в продължение на 30 минути. Плътната утайка се разтваря в 250 ml 6М гуанидин и 40 тМ натриев ацетат при pH 4, и се слага върху 1,200 ml G-25 уравновесена колона и се пропуска в 20 тМ натриев ацетат при pH 5,4. Пикът на hpG-CSF (около 400 ml) се обединява и се зарежда върху 15 ml-ова колона СМ-целулоза уравновесена в 20 тМ натриев ацетат при pH 5,4. След зареждане колоната се промива с 60 ml 20 тМ натриев ацетат при pH 5,4 и с 25 тМ натриев хлорид, след което колоната се елуира с 200 ml 20 тМ натриев ацетат при pH 5,4 и с 37 тМ натриев хлорид. 150 ml от този елуент се концентрират до 10 ml и се прилагат към 300 ml G-75 уравновесена колона и се пропускат в 20 тМ натриев ацетат и 100 тМ натриев хлорид при pH 5,4. Пиковите фракции, съдържащи 35 ml > се обединяват и се стерилизират през филтър. Крайната концентрация на hpG-CSF, която е 1,5 mg/ml е с чистота над 95% чистота, както е определено чрез анализ върху гел и съдържа по-малко от 0,5 ng пироген на 0,5 mg hpG-CSF.Tris, pH 9. This suspension was stirred at room temperature for 30 minutes and centrifuged at 10,000 g for 30 minutes. The solid precipitate was resuspended in approximately 400 ml of water and centrifuged at 10,000 g for 30 minutes. The solid precipitate was dissolved in 100 ml of 2% Sarkosyl and 50 mM Tris at pH 8. CuSO 4 was added to 20 μΜ and the mixture was stirred for 16 hours at room temperature, then centrifuged at 20,000 g for 30 minutes. 300 ml of acetone were added to the supernatant. Put the mixture on ice for 20 minutes? then centrifuged at 5,000 g for 30 minutes. The solid precipitate was dissolved in 250 ml of 6M guanidine and 40 mM sodium acetate at pH 4, and placed on a 1,200 ml G-25 equilibration column and passed into 20 mM sodium acetate at pH 5.4. The hpG-CSF peak (about 400 ml) was pooled and loaded onto a 15 ml CM-cellulose column equilibrated in 20 mM sodium acetate at pH 5.4. After loading, the column was washed with 60 ml of 20 mM sodium acetate at pH 5.4 and 25 mM sodium chloride, after which the column was eluted with 200 ml of 20 mM sodium acetate at pH 5.4 and 37 mM sodium chloride. 150 ml of this eluent was concentrated to 10 ml and applied to a 300 ml G-75 equilibration column and passed into 20 mM sodium acetate and 100 mM sodium chloride at pH 5.4. The peak fractions containing 35 ml> were pooled and filter sterilized. The final concentration of hpG-CSF, which is 1.5 mg / ml, has a purity above 95% purity as determined by gel analysis and contains less than 0.5 ng pyrogen per 0.5 mg hpG-CSF.

Нивото на пироген се определя при използване на тестов комплект Limulus Amebocite Lysate (LAL) (M.A. Bioproducts,Pyrogen levels were determined using a Limulus Amebocite Lysate (LAL) (M.A. Bioproducts,

Walkersville, Md).Walkersville, Md.).

ПРИМЕР 8EXAMPLE 8

Настоящият пример се отнася до използване на рекомбинантни методи за генериране на аналози на hpG-CSF, при което цистеиновите остатъци,присъстващи в позиции 17, 36, 42, 64, и 74 поотделно са заместени с подходящ аминокиселинен остатък.This example relates to the use of recombinant methods for the generation of hpG-CSF analogs, wherein the cysteine residues present at positions 17, 36, 42, 64, and 74 are individually substituted with a suitable amino acid residue.

Провеждат се процедури за сайт насочен мутагенез съгласно Souza, et al., публикувана РСТ заявка No W085/00817, публикувана на 28.02.1985, върху [Met-1] кодираща ДНК на плазмид р536Рро2, описан по-долу, при използване на синтетични олигонуклеотиди с размер от 20 до 23 бази, както е посочено в таблица 18 по-долу. Олигонуклеотид No 1 позволява образуването на ген,кодиращ [Ser17] hpG-CSF; олигонуклеотид No 2 позволява образуването на [Ser36] hpG-CSF, и т.н.Site directed mutagenesis procedures were performed according to Souza, et al., Published PCT Application No. W085 / 00817, published February 28, 1985, on the [Met -1 ] coding DNA of plasmid p536Pro2 described below, using synthetic oligonucleotides ranging from 20 to 23 bases as indicated in Table 18 below. Oligonucleotide No 1 allows the formation of a gene encoding [Ser 17 ] hpG-CSF; oligonucleotide No 2 allows the formation of [Ser 36 ] hpG-CSF, etc.

Таблица 18 Олигонуклеотид ПоследователностTable 18 Oligonucleotide Sequence

1. 5’-CTG СТС AAG ТСС ТТА GAG CAA GT-3’1. 5'-CTG STS AAG TCC TTA GAG CAA GT-3 '

2. 5’ -GAG AAG CTG ТСТ GCC ACC TACA - 3’2. 5 '-GAG AAG CTG TST GCC ACC TACA - 3'

3. 5’ -TAC AAG CTG ТСС CAC CCC GAG - 3’ (Продължение)3.5 '-TAC AAG CTG TCC CAC CCC GAG - 3' (Continued)

4. 5’ -TGA GCA GCT CCC CCA GCC AG-3’4. 5 '-TGA GCA GCT CCC CCA GCC AG-3'

5. 5’ -CTG GCA GGC TCC TTG AGC CAA-3’5. 5 '-CTG GCA GGC TCC TTG AGC CAA-3'

Рестрикциите на сайт насоченият мутагенез от Cys до Ser се провеждат при използване на М13 трЮ, съдържащ Xbal-BamHi hpG-CSF фрагмент, изолиран от р536Рро2 като матрица. ДНК от всеки М13тр10 клон,съдържащ Cys-Ser заместване се третира с Xbal u BamHI. Полученият фрагмент се клонира в експресионен вектор pCFM746 и продуктите на експресията се изолират както в пример 7.Restriction of site-directed mutagenesis from Cys to Ser was performed using an M13 trYu containing an Xbal-BamHi hpG-CSF fragment isolated from p536Pro2 as template. DNA from each M13tr10 clone containing the Cys-Ser substitution was treated with Xbal and BamHI. The resulting fragment was cloned into the expression vector pCFM746 and the expression products were isolated as in Example 7.

Плазмид pCFM746 може да бъде конструиран чрез разцепване на плазмид pCFM736 (конструирането на който, от депозирани и достъпни за обществото материали,е описано в Morris, публикувана РСТ заявка No W085/00829, публикувана на 28.02.1985) с Clal u BamHI за отстраняване на съществуващ полилинкер и чрез заместването на следния полилинкер.Plasmid pCFM746 can be constructed by cleavage of plasmid pCFM736 (the construction of which, from deposited and publicly available materials, is described in Morris, PCT Application No. W085 / 00829, published 28.02.1985) with Clal u BamHI for removal of existing polylinker and by replacing the following polylinker.

Табл и ца 19Table 19

Clal 5' CGATTTGATTCTAGAATTCGTTAACGGTACCATGGAA 3' TAAACTAAGATCTTAAGCAATTGCCATGGTACCTTClal 5 'CGATTTGATTCTAGAATTCGTTAACGGTACCATGGAA 3 ' TAAACTAAGATCTTAAGCAATTGCCATGGTACCTT

GCTTACTCGAGGATCCGCGGATAAATAAGTAAC* 3 * CGAATGAGCTCCTAGGCGCCTATTTATTCATTGCTAG5 GCTTACTCGAGGATCCGCGGATAAATAAGTAAC * 3 * CGAATGAGCTCCTAGGCGCCTATTTATTCATTGCTAG 5

Sau3aSau3a

При процеса на пречистване на аналози на Cys до Ser съгласно настоящото изобретение, приблизително 10-15 g клетъчна паста се ресуспендират в 40 ml 1 mM DTT и три пъти се прокарват през French Pressure Cell при 10 000 psi. Суспенсията от разрушени клетки се центрофугира при 1000 g за 30 минути. Плътната утайка се суспендира отново в 1% DOC, 5 mM EDTA, 5 mM DTT, 50 mM Tris, pH 9 и се разбърква 30 минути при стайна температура. Сместта се центрофугира при 10 000 g за 30 минути, отново се суспендира в 40 ml Н2О и отново се центрофугира при 10 000 g за 30 минути. Плътната утайка се разтваря в 10 ml 2% Sarkosyl, 50 mM DTT, 50 mM Tris, pH 8. След разбъркване в продължение на един час сместта се избистря чрез центрофугиране на 20 000 g в продължение на 30 минути, след което се прилага на 300 mlова G-75 уравновесена колона и се пропуска в 1% Sarkosyl, 50 mM Tris, pH 8. Фракциите ? съдържащи аналога , се обединяват и се оставят да се окислят на въздух чрез излагането им на въздух поне за 1 ден. Крайните концентрации варират от 0,5 - 5 mg/ml.In the process of purifying Cys to Ser analogs of the present invention, approximately 10-15 g of cell paste were resuspended in 40 ml of 1 mM DTT and passed three times through French Pressure Cell at 10,000 psi. The slurry cell suspension was centrifuged at 1000 g for 30 minutes. The solid precipitate was resuspended in 1% DOC, 5 mM EDTA, 5 mM DTT, 50 mM Tris, pH 9 and stirred for 30 minutes at room temperature. The mixture was centrifuged at 10,000 g for 30 minutes, resuspended in 40 ml of H 2 O and again centrifuged at 10,000 g for 30 minutes. The solid precipitate was dissolved in 10 ml of 2% Sarkosyl, 50 mM DTT, 50 mM Tris, pH 8. After stirring for one hour, the mixture was clarified by centrifugation at 20,000 g for 30 minutes and then applied at 300 ml G-75 equilibrated column and passed in 1% Sarkosyl, 50 mM Tris, pH 8. Fractions ? containing the analogue are pooled and allowed to oxidize by exposure to air for at least 1 day. Final concentrations range from 0.5 - 5 mg / ml.

ПРИМЕР 9EXAMPLE 9

В този пример експресионна система от клетки на бозайници се разделяла да се удостовери дали един активен полипептиден продукт на hpG-CSF ДНК би могъл да бъде експресиран във и секретиран от клетки на бозайници (COS-1, А.Т.С.С. CRL 1650). Тази система е проектирана да осигури секретиране на полипептиден аналог на hpG-CSF чрез експресионен и секреторен процесинг на частично синтетичен, частично получена от сДНК кодираща структура [Ala1] hpG66In this example, the mammalian cell expression system was split to verify whether an active hpG-CSF DNA polypeptide product could be expressed in and secreted by mammalian cells (COS-1, ATC CRL 1650). This system is designed to provide secretion of a polypeptide analog of hpG-CSF by expression and secretory processing of a partially synthetic, partially derived from cDNA coding structure [Ala 1 ] hpG66

CSF ., предхождана от лидерен полипептид 5 притежаващ последователността от остатъци на приписана на човек GMCSF във Wong, et al., Science, 228, 810-815 (1985) и Lee et al.,CSF., Preceded by leader polypeptide 5 having the sequence of human attributed GMCSF residues in Wong, et al., Science, 228, 810-815 (1985) and Lee et al.,

Proc. Natl. Acad. Sci. (USA), 82, 4360 - 4364 (1985).Proc. Natl. Acad. Sci. (USA), 82, 4360 - 4364 (1985).

Експресионният вектор , използван за предварителни изследвания на полипептидните продукти на експресията от изобретението е вектор “совалка’] включващ и двете pBR322 и SV40 ДНК, които са били проектирани, за да позволят автономна репликация в Е. coli, както и в клетки от бозайници, с експресия в клетките на бозайници на инсерирана екзогенна ДНК под контрола на вирусна промоторна/регулаторна ДНК последователност. Този вектор, означен като pSVDM-19, се пренася от Е. coli 101, депозиран на 23.08.1985 в American Type Culture Collection, 12301 Parklawn Drive, Rockville, Md., и входящ номер No А.Т.С.С. 53241.The expression vector used for preliminary studies of the expression polypeptide products of the invention is a shuttle vector] including both pBR322 and SV40 DNA that have been designed to allow autonomous replication in E. coli as well as in mammalian cells, with expression in mammalian cells of inserted exogenous DNA under the control of a viral promoter / regulatory DNA sequence. This vector, designated pSVDM-19, was transmitted from E. coli 101, deposited on 08/23/1985 at American Type Culture Collection, 12301 Parklawn Drive, Rockville, Md., And entry no. 53241.

Специфичните манипулации,включени в конструкцията на експресионния вектор,са както следва. Лидерна-кодираща ДНК последователност се синтезира , както е посочено в таблица 20 по-долу.The specific manipulations involved in the construction of the expression vector are as follows. The leader-coding DNA sequence was synthesized as indicated in Table 20 below.

Таблица 20Table 20

Hindlll Met TrpHindlll Met Trp

5’ - A GCT TCC AAC ACC ATG TGG5 '- A GCT TCC AAC ACC ATG TGG

3’-AGG TGG TGG TAC ACC ♦3'-AGG TGG TGG TAC ACC ♦

(Продължение)(Continued)

Leu Leu Gin Gin Ser Sir Leu Leu Leu Leu Leu Leu Leu Leu Gly Gly Thr Thr Val Val CTG CTG CAG CAG AGC AGC CTG CTG CTG CTG CTC CTC TTG TTG GGC GGC ACT ACT GTG GTG GAC GAC GTC GTC TCG TCG GAC GAC GAC GAC GAG GAG AAC AAC CCG CCG TGA TGA CAC CAC -1 -1 + 1 + 1 Ala Ala Cys Cys Ser Sir lie lie Ser Sir Ala Ala Pro Pro Leu Leu GCC GCC TGC TGC AGC AGC ATC ATC TCT TCT GCA GCA CCC CCC CTG CTG GGC GGC G-3’ G-3 ' CGG CGG ACG ACG TCG TCG TAG TAG AGA CGT GGG AGA CGT GGG GAC GAC -5’ -5 '

ApalApal

Както е посочено в таблица 20, последователността включва Hindlll u Apal лепливи краища и кодони за 17 аминокиселинни остатъци?приписвани на “лидер” от човешки GM-CSF. Следват кодони^характеризиращи аланинов остатък, пролинов остатък и левцинов остатък. Пролиновите и левциновите остатъци дублират аминокиселините, присъстващи в позиции +2 и +3 на hpG-CSF, докато аланиновият остатък е предимно дублиращ на първоначалния амино терминален (+1) остатък на GM-CSF, отколкото на hpGCSF. Заместването на треонин от аланин е проектирано,за да улесни правилния “processing off” в клетката гостоприемник на GM-CSF лидер чрез клетъчни механизми , обикновенно включени в GM-CSF секреторния процесинг.As indicated in Table 20, the sequence includes HindIII and Apal adhesive ends and codons for 17 amino acid residues ascribed to a "leader" by human GM-CSF. Following are codons characterizing the alanine residue, proline residue and leucine residue. Proline and leucine residues duplicate the amino acids present at positions +2 and +3 of hpG-CSF, while the alanine residue is more duplicate of the original amino-terminal (+1) residue of GM-CSF than of hpGCSF. The alanine threonine substitution is designed to facilitate proper “processing off” in the GM-CSF leader host cell by cellular mechanisms commonly involved in GM-CSF secretory processing.

Плазмид pSVDM-19 се смила с Kpnl и сайтът се прави с тъп край с ензим на Klenow. След това ДНК се скъсва с Hindlll. Полученият голям фрагмент се комбинира и лигира сPlasmid pSVDM-19 was digested with Kpnl and the site was blunted with a Klenow enzyme. The DNA is then digested with HindIII. The resulting large fragment was combined and ligated with

Hindlll/Pvull фрагмент 7 показан на таблица 7 (изолиран от плазмид Рро2, като вторият най-голям фрагмент,получен от смилане с Hindlll и частично смилане с Pvul!)}3a да образува плазмид pSV-Ppol. Произведеният фрагмент на GM-CSF лидерна последователност от таблица 8 след това се лигира в pSV-Ppol (след неговото скъсване с Hindlll и Ара1);за да се получи плазмид pSVGM-Ppol.Hindlll / Pvull fragment 7 shown in Table 7 (isolated from plasmid Rro2, as the second largest fragment resulting from digestion with Hindlll and partial digestion with Pvul!)} 3a to form plasmid pSV-Ppol. The resulting GM-CSF leader sequence fragment from Table 8 was then ligated into pSV-Ppol (after its cleavage with HindIII and Ara1) ; to obtain plasmid pSVGM-Ppol.

ДНК на плазмид pSVGM-Ppol?утаена с калциев фосфат (1-5 цд)усе трансформира с повторение в 60 mm-ови блюда с COS-1 клетки по същество, както е описано от Wigler, et al., Cell, 14, 725-731 (1978). Като контрола плазмид pSVDM-19 също се трансформира в COS-1 клетки. Супернатанти от тъканна култура се събират 5 дни след трансфекцията и се изследват за hpG-CSF аггивност. Добивът на [Ala1] hpG-CSF от супернатантата на културата е в рамките от 1 до 2,5 pg/ml.Plasmid DNA pSVGM-Ppol ? precipitated with calcium phosphate (1-5 ug) y is transformed repeatedly with 60 mm-ew plates COS-1 cells essentially as described by Wigler, et al., Cell, 14, 725-731 (1978). As a control, plasmid pSVDM-19 was also transformed into COS-1 cells. Tissue culture supernatants were harvested 5 days after transfection and assayed for hpG-CSF aggression. The yield of [Ala 1 ] hpG-CSF from the culture supernatant is in the range of 1 to 2.5 pg / ml.

След успешното експресиране на [Ala1] hpG-CSF продукта, кодиран от плазмид pSVGM-Ppol,в COS-1 клетки се конструира друг вектор, който включва човешка GM-CSF лидерна последователност, но притежаваща кодон за треонинов остатък (естествено,намиращ се позиция 1 на hpGCSF), който замества кодона за аланин в тази позиция. Накратко, синтезира се олигонуклеотид (5’ CAGCATCTCTACACCTCTGGG) за сайт насочен мутагенез (SDM). Hindlll до BamHI hpG-CSF фрагмента в pSVGM-Ppol се лигира в М13 трЮ за SDM. Новосинтезираният hpG-CSF ген съдържащ Thr кодон в позиция 1,се изолира чрез разцепване с Hindlll u EcoRI. След това фрагментът се клонира в pSVDM19>изготвен чрез разцепване със същите две рестрикционни ендонуклеази. Полученият вектор pSVGM-Ppo(Thr) се трансформира в COS клетки и добивът на hpG-CSF, измерен в супернатантата на културите, е в границите от 1 до 5 цд/т1.Following the successful expression of the [Ala 1 ] hpG-CSF product encoded by plasmid pSVGM-Ppol, another vector was constructed in COS-1 cells that included a human GM-CSF leader sequence but having a codon for the threonine residue (naturally found hpGCSF position 1), which replaces the codon for alanine at this position. Briefly, oligonucleotide (5 'CAGCATCTCTACACCTCTGGG) was synthesized for site-directed mutagenesis (SDM). The HindIII to BamHI hpG-CSF fragment in pSVGM-Ppol was ligated into M13 trY for SDM. The newly synthesized hpG-CSF gene containing the Thr codon at position 1 was isolated by cleavage with HindIII and EcoRI. The fragment was then cloned into pSVDM19> prepared by cleavage with the same two restriction endonucleases. The resulting vector pSVGM-Ppo (Thr) was transformed into COS cells and the yield of hpG-CSF measured in the culture supernatant was in the range of 1 to 5 µg / ml.

Накрая геномната последователност, чието изолиране е описано в пример 5, се използва за образуване на експресионен вектор за експресия на hpG-CSF в клетки на бозайници. По-специално, pSVDM-19 се смила с Κρηϊ u Hindlll и големият фрагмент се използва в четирипосочно лигиране със синтетичен линкер с Hindlll u Ncol лепливи краища, както е показано на таблица 21. Ncol-BamHI фрагмент, съдържащ екзон 1, изолиран от pBR322 (8 500 hpG-CSF), геномен субклон, и BamHI-Kpnl фрагмент; съдържащ екзони 2-5, изолирани от плазмид pBR322 (8 500 hpG-CSF, геномен субклон). Полученият експресионен вектор за бозайници, pSV/ghG-CSF продуцира 1 до 2,5 цд/т1 hpG-CSF от трансформирани COS клетки.Finally, the genomic sequence, the isolation of which is described in Example 5, is used to form an expression vector for expression of hpG-CSF in mammalian cells. In particular, pSVDM-19 was digested with Κρηϊ u HindIII and the large fragment was used in four-way synthetic linker ligation with HindIII and Ncol adhesive ends, as shown in Table 21. Ncol-BamHI fragment containing exon 1 isolated from pBR32 (8,500 hpG-CSF), a genomic subclone, and a BamHI-Kpnl fragment ; containing exons 2-5 isolated from plasmid pBR322 (8,500 hpG-CSF, genomic subclone). The mammalian expression vector obtained, pSV / ghG-CSF, produces 1 to 2.5 µg / ml hpG-CSF from transformed COS cells.

Таблица 21 Hindlll 5'agcttccaacac AGGTTGTGGTAC5 NcolTable 21 Hindlll 5 'agcttccaacac AGGTTGTGGTAC 5 Ncol

ПРИМЕР 10EXAMPLE 10

Този пример се отнася до физичните и биологични свойства на рекомбинантни полипептидни продукти на настоящото изобретение.This example relates to the physical and biological properties of the recombinant polypeptide products of the present invention.

1. Молекулно тегло1. Molecular Weight

Рекомбинантни hpG-CSF продукти от експресия в Е. colli, както в пример 7, имат явно молекулно тегло от 18,8 kD при определяне с редуцираща SDS-PAGE (както би било предсказано от изведения аминокиселинен анализ от таблица 7, където естествени изолати, като описаните в пример 1,имат явно молекулно тегло от 19,6 kD. Присъсътвието на N-гликани. асоциирани с естествени изолати ^действително може да бъде изключено на основата на липса на аспергинови остатъци в първичната последователност на hpG-CSF от таблца 7 и, следователно. се отделя процедура за определяне дали О-гликани са отговорни за разликата в молекулното тегло между естествени изолати и негликозилираните рекомбинантни продукти. Приблизително 5 ц.д материал от естествен изолат се обработват с невраминидаза (Calbiochem, LaJolla, California), отстранява се проба от 0,5 цд и останалият материал се инкубира с 4 mU О-гликаназа (ендо-х-пацетилгалактозаминидаза, Genzyme, Boston, Mass.) при 37°С. Апиквотни части се отстраняват след 1/2, 2 и 4 часа от инкубирането. Тези проби се подлагат на SDS-PAGE една до друга с рекомбинантен продукт, произлизащ от Е. colli. След обработването с невраминидаза явното молекулно тегло на изолата се измества от 19,6 kD на 19,2 kD, което подсказва отстраняването на остатък на сиалова киселина. Два часа след обработването с О-гликаназа явното молекулно тегло се измества от 18,8 kD - идентично с явното молекулно тегло на продукт 7 произлизащ от Е. colli. Чувствителността на въглехидратната структура към невраминидаза и О-гликаназа подсказва следната структура за въглехидратната съставка: N-ацетил-невраминова киселина-а(2-6)галактоза β (1-3) N-ацетилгалактозамин -R, където R е серин или треонин.Recombinant hpG-CSF expression products in E. colli, as in example 7, have an apparent molecular weight of 18.8 kD when determined by reducing SDS-PAGE (as would be predicted from the deduced amino acid analysis of Table 7, where the natural isolates, such as those described in Example 1 have an apparent molecular weight of 19.6 kD The presence of N-glycans associated with natural isolates can indeed be ruled out on the basis of the lack of aspergine residues in the primary sequence of hpG-CSF of Table 7 and , therefore, a procedure is used to determine whether O-gl the moles are responsible for the difference in molecular weight between the natural isolates and the non-glycosylated recombinant products Approximately 5 µg of the natural isolate material is treated with neuraminidase (Calbiochem, LaJolla, California), a sample of 0.5 µg is removed and the remaining material is incubated with 4 mU O-glycanase (endo-x-acetylgalactosaminidase, Genzyme, Boston, Mass.) at 37 ° C. Abiquitous portions were removed after 1/2, 2 and 4 hours of incubation. These samples were subjected to SDS-PAGE side by side with a recombinant product derived from E. colli. After neuraminidase treatment, the apparent molecular weight of the isolate shifts from 19.6 kD to 19.2 kD, suggesting the removal of a sialic acid residue. Two hours after treatment with O-glycanase, the apparent molecular weight shifts from 18.8 kD - identical to the apparent molecular weight of product 7 derived from E. colli. The sensitivity of the carbohydrate structure to neuraminidase and O-glycanase is suggested by the following structure for the carbohydrate component: N-acetyl-neuramic acid-a (2-6) galactose β (1-3) N-acetylgalactosamine-R, where R is serine or threonine.

2. 3Н-тимидин ориентиране2. 3 H-thymidine orientation

Индуцирането на пролиферация на клетки от костен мозък на човек се изследва на основата на повишено включване на 3Н-тимидин. Човешки костен мозък от здрави донори се подлага на плътностно срязване с Ficoll-Hypaque (1.077 g/ml Pharmacia) и клетките с ниска плътност се суспендират в Iscove’s среда (GIBCO), съдържаща 10% зародишен говежди серум и глутамин pen-strep. След това 2x104 клетки от костен мозък на човек се инкубират или с контролна среда или с материал от рекомбинантна Е. colli от пример 7 в 96-ямкови блюда с плоско дъно при 37°С в 5% СО2 на въздух в продължение на два дни. Пробите се изследват в повторение и концентрацията варира над 10 000 пъти. След това в културите се прокарват в продължение на 4 часа с 0,5 μ Ci/ямка 3Н-тимидин (New England Nuclear, Boston, Mass.). 3Н-тимидин ориентирането се измерва, както е описано в Ventua, et al., Blood, 61, 781 (1983). В това изследване човешки hpG-CSF изолати могат да се индуцират с включване на 3Н-тимидин в клетки от костен мозък на човек, при приблизителни нива 4-10 пъти по-високи от контролните супернатанти. hpG-CSF продукт, произлизащ от Е. colli от пример 6 притежава подобни свойства.The induction of human bone marrow cell proliferation has been investigated on the basis of increased 3 H-thymidine incorporation. Human bone marrow from healthy donors was slotted for density with Ficoll-Hypaque (1.077 g / ml Pharmacia) and the low-density cells were suspended in Iscove's medium (GIBCO) containing 10% fetal bovine serum and glutamine pen-strep. Then 2x10 4 human bone marrow cells were incubated with either control medium or recombinant E. colli material from Example 7 in 96-well flat bottom plates at 37 ° C in 5% CO 2 in air for two days. Samples were tested in duplicate and the concentration varied over 10,000 times. The cultures were then cultured for 4 hours with 0.5 μCi / well 3 H-thymidine (New England Nuclear, Boston, Mass.). 3 H-thymidine orientation was measured as described in Ventua, et al., Blood, 61, 781 (1983). In this study, human hpG-CSF isolates could be induced by including 3 H-thymidine in human bone marrow cells at approximately levels 4-10 times higher than control supernatants. The hpG-CSF product derived from E. colli of Example 6 has similar properties.

Провежда се второ изследване на пролиферацията на клетки от костен мозък на човек при използване на културална среда на трансфектирани COS-1 клетки, както е приготвена в пример 9, и дава подобни резултати, което показва, че кодираните полипептидни продукти действително се секретират в културалната среда като активни продукти.A second study of human bone marrow cell proliferation was performed using the culture medium of transfected COS-1 cells as prepared in Example 9, and yielded similar results, indicating that the encoded polypeptide products are indeed secreted into the culture medium as active products.

3. WEHI - 3B D+ индуциране на диференциация Способността на рекомбинантни продукти произлизащи от Е. colli да продуцират диференциация на миши миеломоноцитна левкемична клетъчна линия WEHI - ЗВ D+?ce изследва в полутвърда агарова среда както е описано в Metcalf, Int. J. Cancer, 25, 225 (1980). Рекомбинантният hpG-CSF продукт и контроли на средата се инкубират с 60 WEHI - ЗВ D+ кпетки/ямка при 37°С в 5% СО2 на въздух в продължение на 7 дни. Пробите се инкубират в 24 ямкови блюда с плоско дъно и концентрациите варират над 2 000 пъти. Колониите се класифицират като недиференциирани, частично диференциирани или напълно диференциирани и преброяването на клетъчните колонии се извършва под микроскоп. Открито бе, че рекомбинантният продукт от Е. colli индуцира диференцииране.3. WEHI - 3B D + induction of differentiation The ability of recombinant products derived from E. colli to produce differentiation of the murine myelomonocytic leukemic cell line WEHI - 3B D + ? is tested in semi-solid agar medium as described in Metcalf, Int. J. Cancer, 25, 225 (1980). The recombinant hpG-CSF product and media controls were incubated with 60 WEHI - 3B D + kettle / well at 37 ° C in 5% CO 2 in air for 7 days. Samples were incubated in 24 flat bottom well plates and concentrations varied over 2,000 times. Colonies are classified as undifferentiated, partially differentiated, or fully differentiated, and cell colonies are counted under a microscope. The recombinant product of E. colli was found to induce differentiation.

4. CFU-GM, BFU-E и CFU-GEMM изследвания4. CFU-GM, BFU-E and CFU-GEMM studies

Открито бе, че естествени изолати от плурипотентен човешки G-CSF (hpG-CSF) и рекомбинантен плурипотентен човешки G-CSF (rhpG-CSF) причиняват пролиферация и диференциация на клетки от костен мозък на човек. Тези действия се измерват при CFU-GM [Broxmayer, et al., Exp. Hematol., 5, 87, (1971)] BFU-E и CFU-GEMM изследвания [Lu, et al., Blood, 61, 250 (1983)] при използване на ниска плътност, не прилепващи клетки от костен мозък на здрав човек доброволец. Сравнение на CFU-GM, BFU-E и CFU-GEMM биологичните активности чрез използване на 500 единици hpG-CSF или rhpG-CSF са показани на таблица 22 по-долу.Natural isolates of pluripotent human G-CSF (hpG-CSF) and recombinant pluripotent human G-CSF (rhpG-CSF) have been found to cause proliferation and differentiation of human bone marrow cells. These actions are measured at CFU-GM [Broxmayer, et al., Exp. Hematol., 5, 87, (1971)] BFU-E and CFU-GEMM studies [Lu, et al., Blood, 61, 250 (1983)] using low-density, non-adherent human bone marrow cells volunteer. Comparisons of CFU-GM, BFU-E, and CFU-GEMM biological activities using 500 units of hpG-CSF or rhpG-CSF are shown in Table 22 below.

Всички изследвания на колониите са проведени с ниска плътност, не прилепващи клетки от костен мозък. Клетки от костен мозък на човек се подлагат на плътностно срязване с Ficoll-Hypaque (плътност 1,077 g/cm3; Pharmacia). След това клетките с ниска плътност отново се суспендират в Iscove’s модифицирана Dulbecco’s среда, съдържаща зародишен телешки серум и се поставят за адхезия върху Falcon блюда с тъканна кутура (No 3003, Becton Dickenson, Cockeysville, Md.) за ГЛчаса при 37°С.All colony studies were performed at low density, non-adherent bone marrow cells. Human bone marrow cells were slotted for density with Ficoll-Hypaque (density 1.077 g / cm 3 ; Pharmacia). The low-density cells were then resuspended in Iscove's modified Dulbecco's medium containing fetal calf serum and plated for Falcon tissue culture plates (No 3003, Becton Dickenson, Cockeysville, Md.) For GL at 37 ° C.

Таблица 22Table 22

CFU-GM CFU-GM BFU-E BFU-E CFU-GEMM CFU-GEMM Среда Wednesday 0±0 0 ± 0 26+1 26 + 1 0±0 0 ± 0 Неутрален hpG-CSF HpG-CSF neutral 83+5.4 83 + 5.4 83+6.7 83 + 6.7 4+0 4 + 0 rhpG-CSF rhpG-CSF 87+5 87 + 5 81+0.1 81 + 0.1 6+2 6 + 2

Контролната среда се състои от Iscove’s модифицирана Dulbecco’s среда плюс 10% FCS, 0,2 тМ хемин и една единица ракомбинантен еритропоетин.The control medium consisted of Iscove's modified Dulbecco's medium plus 10% FCS, 0.2 mM hemin and one unit of recombinant erythropoietin.

За CFU-GM изследването клетките мишени се посяват при 1x105 в 1 ml 0,3% агарова културална среда, която включва допълнена McCoy’s 5А среда и 10% топлинно инактивиран зародишен телешки серум. Културите се преброяват за колонии (над 40 клетки на агрегат) и морфологично се определят на 7-мия ден от култивирането. Броят на колониите е показан като средно от ±SEM, както е определено от блюда в четири повторения.For the CFU-GM assay, target cells were seeded at 1x10 5 in 1 ml of 0.3% agar culture medium, which included supplemented McCoy's 5A medium and 10% heat-inactivated fetal calf serum. The cultures were counted for colonies (over 40 cells per unit) and morphologically determined on day 7 of cultivation. The number of colonies is shown as a mean of ± SEM, as determined by dishes in four replicates.

За BFU-E u CFU-GEMM изследването, клетки (1x105) се прибавят към 1 ml смес на Iscove’s модифицирана Dulbecco’s среда (Gibco), 0,8% метилцелулоза, 30% зародишен телешки серум, 0,05 пМ 2-меркаптоетанол 0,2 тМ хемин и една единица рекомбинантен еритропоетин. Блюдата се инкубират във влажна атмосфера на 5% СО2 и 5% О2. Ниско кислородно налягане се получава при използване на оксиредюсер от Reming Bioinstruments (Syracuse, N.Y.). Колониите се преброяват след 14 дни инкубиране. Броят на колониите е показан като тяхната средна стойност ± SEM, както е определено от дублираните блюда.For BFU-E and CFU-GEMM assay, cells (1x10 5 ) were added to 1 ml of a mixture of Iscove's modified Dulbecco's medium (Gibco), 0.8% methylcellulose, 30% fetal calf serum, 0.05 nM 2-mercaptoethanol 0 , 2 mM hemin and one unit of recombinant erythropoietin. The dishes were incubated in a humidified atmosphere of 5% CO 2 and 5% O 2 . Low oxygen pressure was obtained using an oxidizer from Reming Bioinstruments (Syracuse, NY). Colonies were counted after 14 days of incubation. The number of colonies is shown as their mean ± SEM as determined by the duplicate dishes.

За всички колонии, образувани при CFU-GM изследването бе открито, че са хлорацетат естераза позитивни и негативни към неспецифична естераза (алфа-нафтил ацетат естераза), което съответства с колониите гранулоцитни по тип. И за двата естествени hpG-CSF и rhpG-CSF е открито, че притежават специфична активност на приблизително 1х108 U/mg чист протеин, при изследвания със серийно разреждане при CFU-GM изследването. BFU-E и CFU-GEMM данните от таблица 22 са представителни за три отделни експеримента и са подобни на данните^посочени преди това за естествен hpGCSF. Важно е да се отбележите rhpG-CSF е изключително чист и лишен от други потенциални растежни фактори на бозайници, благодарение на продуцирането му в Е. coli. Следователно rhpG-CSF е способен да поддържа образуването на смесени колони (CFU-GEMM) и BFU-E когато се прибавя в присъствие на рекомбинантен еритропоетин.For all colonies formed in the CFU-GM study, chloroacetate esterase was found to be positive and negative to nonspecific esterase (alpha-naphthyl acetate esterase), which was consistent with granulocyte-type colonies. Both natural hpG-CSF and rhpG-CSF were found to have a specific activity of approximately 1x10 8 U / mg pure protein in serial dilution studies in the CFU-GM study. The BFU-E and CFU-GEMM data in Table 22 are representative of three separate experiments and are similar to those previously reported for natural hpGCSF. It is important to note that rhpG-CSF is extremely pure and devoid of other mammalian potential growth factors due to its production in E. coli. Therefore, rhpG-CSF is capable of supporting mixed column formation (CFU-GEMM) and BFU-E when added in the presence of recombinant erythropoietin.

5. Изследване за клетъчно свързване5. Cell-binding assay

Докладвано е преди това, че WEHI-3B (D+) клетки и човешки левкьмийни клетки от новодиагностицирани левкЕмии свързват 1251-белязан миши G-CSF, и че това свързване може да бъде пълно чрез прибавяне на небелязан GCSF или човешки CSF-β. Тества се способноста на естествения hpG-CSF и rhpG-CSF да се съревновават при свързването на 125l-hpG-CSF към човешки и миши левкемични клетки. Високопречистен естествен hpG-CSF (>95% чистота; един pg) се йодира [Tejedor, et al., Anal. Biochem., 127, 143 (1982)], отделя се от реагиращите вещества чрез гел филтрация и йонообменна хроматография. Специфичната активност на естествения 125l-hpG-CSF е приблизително 100 pCi/pg протеин. Миши WEHI-3B (D+) и два препарата на миелоидни левкемични клетки от периферна кръв на човек (ANLL, едните класифицирани като М4, другите като М5В),се тестват за тяхната способност да свързват 125l-hpG-CSF.It has been reported previously that WEHI-3B (D + ) cells and human leukemia cells from newly diagnosed leukemias bind 125 1-labeled mouse G-CSF, and that this binding can be complete by the addition of unlabeled GCSF or human CSF-β. The ability of native hpG-CSF and rhpG-CSF to compete in the binding of 125 l-hpG-CSF to human and mouse leukemic cells was tested. Highly purified natural hpG-CSF (> 95% purity; one pg) is iodized [Tejedor, et al., Anal. Biochem., 127, 143 (1982)], is separated from the reactants by gel filtration and ion exchange chromatography. The specific activity of native 125 l-hpG-CSF is approximately 100 pCi / pg protein. Mouse WEHI-3B (D + ) and two human peripheral blood myeloid leukemia cell preparations (ANLL, one classified as M4, the other as M5B) were tested for their ability to bind 125 l-hpG-CSF.

Мишите и прясно получените миелоидни левкемични клетки от периферна кръв на човек трикратно се промиват с PBS/1% BSA. WEHI-3B(D+) клетки (5x106) или свежи левкемични клетки (3x106) се инкубират в повторение в PBS/1% BSA (100 pl) при отсъствие или присъствие на различни концентрации (обем: 10 pl) небелязан hpG-CSF, rhpG-CSF или GM-CSF и в присъствие на 125l-hpG-CSF (приблизително 100 000 срт или 1 ng) при 0°С за 90 минути (общ обем: 120 pl). След това клетките отново се суспендират и се разстилат на слой над 200 pl леденохггуден FCS в 350 pl пластмасови центрофужни епруветки и се центрофугират (1 000 д; 1 минута). Плътната утайка се събира чрез изрязване на дъното на епруветката и плътната утайка и супернатантата се изброяват псютделно в гама брояч (Packard).Mice and freshly obtained myeloid leukemic cells from human peripheral blood were washed three times with PBS / 1% BSA. WEHI-3B (D + ) cells (5x10 6 ) or fresh leukemic cells (3x10 6 ) were incubated repeatedly in PBS / 1% BSA (100 pl) in the absence or presence of different concentrations (volume: 10 pl) of unlabeled hpG- CSF, rhpG-CSF or GM-CSF and in the presence of 125 l-hpG-CSF (approximately 100,000 cpm or 1 ng) at 0 ° C for 90 minutes (total volume: 120 pl). The cells were then resuspended and spread over a layer of over 200 µg of ice-cold FCS in 350 µl plastic centrifuge tubes and centrifuged (1 000 g; 1 minute). The solid precipitate was collected by cutting the bottom of the tube and the solid precipitate and supernatant were counted individually in a gamma counter (Packard).

Специфичното свързване (срт) се определя като общо свързване при отсъствие на компетитор (средно от повторенията) минус свързването (срт) в присъствието на стократен излишък на небелязан hpG-CSF (неспецифично свързване). Неспецифичното свързване максимално е 2 503 срт за WEHI-3B (D+) клетки, 1 072 срт за ANLL (М4) клетки и 1 125 срт за ANLL (М5В) клетки. Експерименти 1 и 2 се провеждат в различни дни при използване на същите препарати 125i-hpG-CSF и се изобразява вътрешната същност в процентно инхибиране, регистрирано за 2 000 единици hpG-CSF. Получените данни са посочени на таблица 23 подолу.Specific binding (cpm) is defined as total binding in the absence of a competitor (mean of repetitions) minus binding (cpm) in the presence of a 100-fold excess of unlabeled hpG-CSF (nonspecific binding). Non-specific binding is a maximum of 2 503 cpm for WEHI-3B (D + ) cells, 1 072 cpm for ANLL (M4) cells and 1 125 cpm for ANLL (M5B) cells. Experiments 1 and 2 were performed on different days using the same 125 i-hpG-CSF preparations and depicted the intrinsic substance in percentage inhibition recorded for 2,000 hpG-CSF units. The data obtained are listed in Table 23 below.

Таблица 23Table 23

WEHI-3B(D+) ANLL(M4) ANLL(M5B)WEHI-3B (D + ) ANLL (M4) ANLL (M5B)

Компетитор The competitor (U/ml) (U / ml) cpm cpm % инхиб. % inhibition. cpm cpm % инхиб. % inhibition. cpm cpm % инхиб. % inhibition. Опит 1 Experience 1 0 0 6,608 6,608 th most common - - 1,218 1,218 th most common - - 122 122 - - няма there is no естествен natural 10,000 10,000 685 685 90 90 hpG-CSF: hpG-CSF: 2,000 2,000 1,692 1,692 th most common 74 74 34 34 97 97 -376 -376 0 0 200 200 2,031 2,031 th most common 69 69 rhpG-CSF; rhpG-CSF; 10,000 10,000 0 0 100 100 2,000 2,000 1,185 1,185 th most common 82 82 202 202 83 83 0 0 0 0 200 200 2,330 2,330 65 65 Опит 2 Experience 2 няма there is no 0 0 2,910 2,910 th most common 0 0 естествен natural hpG-CSF: hpG-CSF: 2,000 2,000 628 628 78 78 GM-CSF: GM-CSF: 2,000 2,000 3,311 3,311 th most common 0 0

Както е показано на таблица 23, 125l-hpG-CSF показва свързване към WEHI-ЗВ (D+) левкемични клетки. Свързването се инхибира по зависещ от дозата начин от небелязан естествен hpG-CSF или rhpG-CSF, но не и от GM-CSF. Освен това се наблюдава свързване на естествения hpG-CSF към човешки миеломоноцитни левкемични клетки (ANLL, М4). Свързването към тези клетки е паралелно по отговор на естествен hpG-CSF в течни култури чрез диференцииране в зрели макрофаги, както се съди по морфологията. Отсъствието на свързване на естествения 125l-hpG-CSF към моноцитни левкемични клетки от друг пациент (ANLL, М5В) подсказва, че някои левкемии могат диференциално да експресират или да им липсват рецептори за hpG-CSF. Способността на rhpG-CSF да се съревновава за свързването на естествения 125l-hpG-CSF, подобно на естествения hpG-CSF подсказва , че рецепторите еднакво добре разпознават и двете форми.As shown in Table 23, 125 l-hpG-CSF showed binding to WEHI-3B (D + ) leukemic cells. Binding was inhibited in a dose-dependent manner by unlabeled natural hpG-CSF or rhpG-CSF but not by GM-CSF. In addition, binding of natural hpG-CSF to human myelomonocytic leukemia cells (ANLL, M4) has been observed. Binding to these cells is parallel to the response to native hpG-CSF in liquid cultures by differentiation into mature macrophages, as judged by morphology. The absence of binding of natural 125 l-hpG-CSF to monocytic leukemia cells from another patient (ANLL, M5B) suggests that some leukemias may differentially express or lack receptors for hpG-CSF. The ability of rhpG-CSF to compete for the binding of native 125 l-hpG-CSF, similar to natural hpG-CSF suggests that receptors are equally well recognized in both forms.

Тези изследвания, демонстриращи свързването на естествения 1251-белязан hpG-CSF към левкемични клетки, са паралелни в култура по способността на естествения hpG-CSF да индуцира диференцииране на гранулоцити и моноцити на клетки от костен мозък с ниска плътност, получени от един пациент с остра промиелоцитна левкемия (M3) и втори пациент с остра миелобластна левкемия (M2). Клетки от всеки пациент се култивират 4 дни само в среда или в присъствието на 1х105 единици rhpG-CSF. Клетки от M3 контролни култури инкубирани само в среда,все още са промиелоцитен тип; докато клетки,култивирани в присъствие на rhpG-CSF, показват зрели клетки от миелоиден тип, включително метамиелоцити, гигантоивична форма и сегментирани неутрофили и моноцити. Действителното диференциално броене за този пациент, върху 100 клетки , изчислени спрямо контролата, 100% промиелоцити, и за клетки/третирани с rhpG-CSF; 22% бласти плюс промиелоцити, 7% миелоцити, 35% метамиелоцити, 20% ивични форми плюс сегментирани неутрофили, 14% моноцити и 2% макрофаги. Трябва да се отбележи факта, че един от полиморфонуклеарните гранулоцити все още съдържа забележителен auer rod, което подсказва, че поне тази клетка представя диференциална клетъчна принадлежност към левкемичния клон. Клетки от втория пациент с миелобластна левкемия (M2) също се култивират четири дни в присъствие или отсъствие на rhpG-CSF. Визуалният анализ на M2 клетки, култивирани само в среда, показват големи “бластоподобни” клетки, някои от които притежават ядрени телца. Някои от M2 клетките при третиране с rhpG-CSF се диференциират до зрели сегментирани неутрофили доказващи остатъчни auer rods в центъра на неутрофилите, което подсказва диференцииране , протичащо в клетка принадлежаща на левкемичен клон. Действителното диференцииране на сто клетки, оценен и морфологично .показва, че контролните клетки се състоят от 100% бласти. Клетки/третирани с rhpG-CSF, се състоят от 43% бласти, 1% миелоцити, 15% метамиелоцити, 28% ивични форми плюс сегментирани неутрофили, 2% промоноцити и 11% моноцити. Левкемичните клетки също се проверяват за диференцииране при четири други концентрации на rhpG-CSF (5x103, 1x104, 2,5x104 и 5x104 U/ml, данните не са показани). Даже и при най-ниските тествани концентрации (5x103 U/ml) на rhpG-CSF има значително дифенцииране (клетките се диференциират отвъд миелоцитите) на M3 (50%) и M2 (37%) левкемични клетки.These studies, demonstrating the binding of natural 125 1-labeled hpG-CSF to leukemic cells, are in parallel in culture for the ability of natural hpG-CSF to induce differentiation of low-density bone marrow granulocytes from a single patient with acute promyelocytic leukemia (M3) and a second patient with acute myeloblastic leukemia (M2). Cells from each patient were cultured for 4 days only in medium or in the presence of 1x10 5 units of rhpG-CSF. Cells from M3 control cultures incubated in medium alone are still promyelocyte type; while cells cultured in the presence of rhpG-CSF show mature myeloid-type cells, including metamyelocytes, a giant-shaped form, and segmented neutrophils and monocytes. The actual differential count for this patient, per 100 cells calculated from control, 100% promyelocytes, and for cells / treated with rhpG-CSF; 22% blasts plus promyelocytes, 7% myelocytes, 35% metamyelocytes, 20% stripe forms plus segmented neutrophils, 14% monocytes and 2% macrophages. It should be noted that one of the polymorphonuclear granulocytes still contains a remarkable auer genus, suggesting that at least this cell represents a differential cellular affiliation with the leukemic clone. Cells from the second patient with myeloblastic leukemia (M2) were also cultured for four days in the presence or absence of rhpG-CSF. Visual analysis of M2 cells cultured only in medium revealed large "blast-like" cells, some of which possess nuclear bodies. Some of the M2 cells upon rhpG-CSF treatment differentiate into mature segmented neutrophils showing residual auer rods in the center of the neutrophils, suggesting differentiation occurring in a cell belonging to a leukemic clone. The actual differentiation of one hundred cells, evaluated and morphologically, indicates that the control cells consist of 100% blasts. Cells / treated with rhpG-CSF consist of 43% blasts, 1% myelocytes, 15% metamyelocytes, 28% stripe plus segmented neutrophils, 2% promonocytes and 11% monocytes. Leukemic cells were also checked for differentiation at four other concentrations of rhpG-CSF (5x10 3 , 1x10 4 , 2.5x10 4 and 5x10 4 U / ml; data not shown). Even at the lowest tested concentrations (5x10 3 U / ml) of rhpG-CSF, there was significant differentiation (cells differentiate beyond myelocytes) of M3 (50%) and M2 (37%) leukemia cells.

6. Имунно изследване6. Immunoassay

За получаване на поликпонални антитела за имунно изследване използваният антиген е плурипотентен G-CSF, пречистен от карциномна клетъчна линия 5637 (1А6) от пикочен мехур на човек, както се получава в пример 1 (В). Преценява се ,че този продукт е 85% чист на основата на оцветяване на полиакриламидни гелове със сребърен нитрат. Ваю/С мишки на възраст 6 седмици се имунизират с подкожни инжекции с антиген. Антигенът се суспендира отново в PBS и се емулгира с равни обеми пълно помощно средство на Freund. Дозата е от 5 до 7 цд антиген на мишка на инжектиране. 18 дни по-късно се прилагат спомагащи имунизации със същото количество антиген, емулгиран с равен обем непълно помощно средство на Freund. След 4 дни се взима серум от мишки за тестване на специфично антитяло за човешки плурипотентен G-CSF.For the preparation of polyclonal antibodies for immunoassay, the antigen used is pluripotent G-CSF purified from human bladder carcinoma cell line 5637 (1A6) as obtained in Example 1 (B). This product is estimated to be 85% pure based on silver nitrate staining of polyacrylamide gels. Vayu / C mice at 6 weeks of age are immunized with subcutaneous antigen injections. The antigen was resuspended in PBS and emulsified with equal volumes of Freund's complete adjuvant. The dose is 5 to 7 µg of mouse antigen per injection. 18 days later, auxiliary immunizations with the same amount of antigen emulsified with an equal volume of incomplete Freund adjuvant were administered. After 4 days, serum from mice was taken to test a specific antibody for human pluripotent G-CSF.

Dynatech Immulon II Removawell ивици в рамки (Dynatech Lab., Inc., Alexandria, Va.) се покриват c hpG-CSF 5 pg/ml в 50 mM карбонат-бикарбонатен буфер, pH 9,2. Ямките се покриват с 0,25 pg в обем от 50 μΙ. Блюдата с покритие от антиген се инкубират два часа при стайна температура и цяла нощ при 4°С. Разтворът се отдекантира и блюдата се инкубират 30 минути с РВБ,съдържащ 5% BSA за блокиране на реактивната повърхност. Този разтвор се отдекантира и разредени пре-имунни или тестови серуми се прибавят към ямките и се инкубират 2 часа при стайна температура. Серумите се разреждат с PBS, pH 7,0 съдържащ 1% BSA.Dynatech Immulon II Removawell frames in frames (Dynatech Lab., Inc., Alexandria, Va.) Were coated with hpG-CSF 5 pg / ml in 50 mM carbonate-bicarbonate buffer, pH 9.2. The wells were covered with 0.25 pg in a volume of 50 μΙ. Antigen-coated dishes were incubated for two hours at room temperature and overnight at 4 ° C. The solution was decanted and the plates were incubated for 30 minutes with PBB containing 5% BSA to block the reactive surface. This solution was decanted and diluted pre-immune or test sera were added to the wells and incubated for 2 hours at room temperature. Sera were diluted with PBS pH 7.0 containing 1% BSA.

Серумният разтвор се отдекантира и блюдата се промиват трикратно с промивен разтвор (KPL, Gaithersburg, Md.). Към всяка ямка се прибавят приблизително 200 000 срт йодиран заешки антймиши IgG (NEN, Boston, Mass.) в 50 μΙ PBS, pH 7,0 съдържащ 1% BSA. След 1½ часа инкубиране при стайна температура разтворът се отдекантира и блюдата се промиват пет пъти с промивен разтвор. Ямките се изваждат от рамките и се преброяват на Beckman 5 500 гама брояч. Високотитърните миши серуми показват повече· от 12 пъти по-висока реактивоспособност, отколкото съответните преимунни серуми при разреждане 1:100.The serum solution was decanted and the dishes were washed three times with washing solution (KPL, Gaithersburg, Md.). Approximately 200,000 cpm iodinated rabbit antimouse IgG (NEN, Boston, Mass.) In 50 μΙ PBS, pH 7.0 containing 1% BSA was added to each well. After 1 hour of incubation at room temperature, the solution was decanted and the dishes were washed five times with washing solution. The wells are removed from the frames and counted on a Beckman 5 500 gamma counter. High titer mouse sera show more than 12 times higher reactivity than the corresponding preimmune sera at a 1: 100 dilution.

Имунологичните свойства на hpG-CSF, произлизащ от Е. coli у се определят чрез реактивоспособноста на високотитърни миши серуми,специфични към hpG-CSF, получен от клетки на бозайници. 0,25 pg протеин с 90% чистота5получен от Е. coli^ce покрива с immulon II Removawells в обем 50 μ! и мишият серум се изследва, както е описано по-горе.The immunological properties of hpG-CSF derived from E. coli y are determined by the reactivity of high-titer mouse sera specific for hpG-CSF derived from mammalian cells. A 0.25 pg protein with 90% purity 5 obtained from E. coli was coated with 50 μm immulon II Removawells! and the mouse serum was examined as described above.

Високотитърните миши серуми показват повече от 24 пъти по-висока реактивоспособност към продукт,получен от Е. coli, отколкото съответните пре-имунни серуми при разреждане 1:100.High titer mouse sera show more than 24 times higher reactivity to a product derived from E. coli than the corresponding pre-immune sera at a dilution of 1: 100.

7. Биоизследвания на аналог на серин [Ser17]hpG-CSF, [Ser36]hpG-CSF, [Ser42]hpG-CSF, [Ser64]hpG-CSF u [Ser74]hpG-CSF продукти, получени съгласно пример 9,се изследват за hpG-CSF активност при изследвания за 3Н-тимидин ориентиране, CFU-GM u WEHI-3B D+ клетки. Във всяко изследване [Ser17] аналогът е с активност7сравнима с тази на рекомбинантни молекули, притежаващи нативната структура. Останалите аналози притежават около 100 пъти по ниска активност при изследването за 3Н-тимидин ориентиране, 250 пъти по-ниска активност при изследването за CFU-GM и 500 пъти по-ниска активност при изследването за WEHI-3B D+. Тези данни поддържат предположението, че цистеините в позиции 36, 42, 64 и 74 може да са необходими за пълна биологична активност.7. Bioassay of the serine analogue [Ser 17 ] hpG-CSF, [Ser 36 ] hpG-CSF, [Ser 42 ] hpG-CSF, [Ser 64 ] hpG-CSF and [Ser 74 ] hpG-CSF products obtained according to Example 9 were tested for hpG-CSF activity in 3 H-thymidine orientation assays, CFU-GM and WEHI-3B D + cells. In each assay [Ser 17 ], the analogue had activity 7 comparable to that of recombinant molecules having the native structure. The remaining analogues have about 100 times lower activity in the 3 H-thymidine orientation study, 250 times lower activity in the CFU-GM study, and 500 times lower activity in the WEHI-3B D + study. These data support the suggestion that cysteines at positions 36, 42, 64 and 74 may be required for full biological activity.

8. In vivo биоизследване8. In vivo bioassay

Alzet® осмотични помпи (Alzet Corp., Palo Alto, Calif.; Model 2001) се свързват към постоянни катетри на дясната югуларна вена и се имплантират подкожно на седем мъжки Syrian golden хамстери. Четири от помпите съдържат буфер [20 тМ натриев ацетат (pH 5,4) и 37 тМ натриев хлорид] и 1,5 mg/ml hpG-CSF, получен от Е. coli, докато три от помпите съдържат само буфер. Претендиралата скорост на осмотичните помпи е 1 микролитър/час до 7 дни. На третия ден след имплантирането на помпите средният брой гранулоцити на четирите третирани хамстера е 6 пъти повисок от този на трите (буфер) контролни и повишеният брой гранулоцити дава отражение на четирикратно увеличение на общите лимфоцити. Броят на еритроцитите не се променя след третиране. Тези резултати показват, че рекомбинантният продукт води до специфично засилване на продуцирането и/или освобождаване на гранулоцити в бозайници.Alzet® osmotic pumps (Alzet Corp., Palo Alto, Calif .; Model 2001) are connected to permanent catheters of the right jugular vein and implanted subcutaneously into seven male Syrian golden hamsters. Four of the pumps contained buffer [20 mM sodium acetate (pH 5.4) and 37 mM sodium chloride] and 1.5 mg / ml hpG-CSF obtained from E. coli, while three of the pumps contained only buffer. The claimed rate of osmotic pumps is 1 microliter / hour for up to 7 days. On the third day after pump implantation, the average granulocyte count of the four treated hamsters was 6-fold higher than that of the three (buffer) controls, and the increased granulocyte count reflected a fourfold increase in total lymphocytes. The erythrocyte count did not change after treatment. These results indicate that the recombinant product results in a specific enhancement of the production and / or release of granulocytes in mammals.

В допълнение, към естествено съществуващите в природата алелни форми на hpG-CSF, настоящото изобретение също включва други hpG-CSF продукти като полипептидни аналози на hpG-CSF и фрагменти на hpG-CSF. Следвайки методите на горепосочената публикувана заявка на Alton, et al., (W083/04053), специалистът в областа лесно може да проектира и микробиална експресия първични конформации, да произведе гени, кодиращи на полипептиди , притежаващи които се различават от тук посочените по идентичността или месторазположението на един или два остатъка (например, заместване, крайно или междинно прибавяне или делеции). Алтернативно, модификации на сДНК и на геномни гени лесно може да се осъществи с добре известни техники за сайт-насочен мутагенез и да се използват за генериране на аналози и производни. Такива продукти биха споделяли най-малко едно от билогичните свойства на hpG-CSF, но могат и да се различават по други. Например планувани продукти съгласно изобретението включват такива, които са съкратени например чрез делеции; или такива,които са по-стабилни към хидролиза (и следователно могат да имат по-подчертан или подълготраен ефект, отколкото естествено съществуващите в природата); или които са били променени да делетират един или по-вече от потенциалните сайтове за о-гликозилиране (което може да доведе до по-високи активности на продукти, продуцирани в дрожди); или които могат да притежават един или повече цистеинови остатъка,делетирани или заместени от, например, аланинови или серинови остатъци, и потенциално по-лесно могат да бъдат изолирани в активна форма от микробиални системи; или които притежават един или повече тирозинови остатъци,заместени от фенилаланин,и могат да се свържат повече или по-малко лесно към рецептори на hpGCSF на клетки мишени. Включват се също така полипептидни фрагменти , дублиращи само част от непрекъсната аминокиселинна последователност или вторични конформации в hpG-CSF, които фрагменти могат да притежават една активност (например, за свързване на рецептор), а не и други (например активност за стимулиране растежа на колонии). Трябва да се отбележи, че не е необходимо активността за някой или повече продукти от изобретението да притежават терапевтична полза [виж, Weiland, et al., Blut, 44, 173-175 (1982)] или полза в друг контекст, например изследвания за hpG-CSF антагонизъм. Компетитивните антагонисти могат да бъдат доста полезни, например при случай на свръхпродуциране на hpG-CSF.In addition to the naturally occurring allelic forms of hpG-CSF, the present invention also includes other hpG-CSF products such as hpG-CSF polypeptide analogs and fragments of hpG-CSF. Following the methods of the aforementioned published application by Alton, et al., (W083 / 04053), one of ordinary skill in the art can also easily design microbial expression of primary conformations, to produce genes encoding polypeptides having different from the identities identified herein or the location of one or two residues (e.g., substitution, terminal or intermediate addition, or deletions). Alternatively, modifications of the cDNA and genomic genes can be readily accomplished with well-known techniques for site-directed mutagenesis and used to generate analogs and derivatives. Such products would share at least one of the biological properties of hpG-CSF, but may differ from others. For example, planned products according to the invention include those that are abbreviated, for example, by deletions; or those that are more resistant to hydrolysis (and may therefore have a more pronounced or prolonged effect than naturally occurring in nature); or which have been altered to deletion one or more of the potential o-glycosylation sites (which may result in higher activity of yeast products); or which may have one or more cysteine residues, deleted or substituted by, for example, alanine or serine residues, and potentially more readily isolated in active form by microbial systems; or which have one or more tyrosine residues substituted by phenylalanine and can bind more or less readily to the hpGCSF receptors of target cells. Also included are polypeptide fragments that duplicate only part of a continuous amino acid sequence or secondary conformations in hpG-CSF, which fragments may have one activity (e.g., for receptor binding) and not others (e.g., activity to stimulate colony growth ). It should be noted that the activity of some or more of the products of the invention need not have a therapeutic benefit [see, Weiland, et al., Blut, 44, 173-175 (1982)] or a benefit in another context, for example studies of hpG-CSF antagonism. Competitive antagonists can be quite useful, for example in the case of hpG-CSF overproduction.

Съгласно друг вариант на настоящото изобретение, описаната ДНК последователност, която кодира hpG-CSF полипептиди, е ценна за информацията,която се предоставя по отношение на аминокиселинната последователност на протеина от бозайници, която досега не бе достъпна, въпреки аналитичния подход на изолиране на естествено съществуващи в природата продукти. ДНК последователностите също са очевидно ценни като продукти, полезни за извършване на микробиален синтез на hpG-CSF в голям мащаб чрез голямо разнообразие от рекомбинантни техники. От друга страна ДНК последователностите ? предоставени от настоящото изобретение,се използват за генериране на нови и полезни вирусни и кръгови плазмидни ДНК-ови вектори, нови и полезни трансформирани и трансФеИтирани! микробиални прокариотни и еукариотни клетки гостоприемници (включително бактериални и дрождеви клетки и клетки от бозайници, растящи в култура), и нови и полезни методи за прорастване в култура на такива микробиални клетки гостоприемници, способни да експресират hpG-CSF и свързаните с него продукти. ДНК последователностите от настоящото изобретение са също така особено подходящи продукти за използване като белязани проби при изолиране на hpG-CSF и свързаните протеини, кодиращи геномна ДНК на човек, както и сДНК и геномни ДНК последователности от други видове бозайници. ДНК последователностите също могат да се използват при различни алтернативни методи за синтез на протеини (например в клетки на насекоми) или в генната терапия на хора и други бозайници. Очаква се ДНК последователностите от настоящото изобретение да се използват в развитието на трансгенни видове бозайници, които могат да послужат като еукариотни “гостоприемници” за количествено получаване на hpG-CSF и hpG-CSF продукти. Виж най-общо Palmiter, et al., Science, 222 (4625), 809-814 (1983).According to another embodiment of the present invention, the described DNA sequence encoding hpG-CSF polypeptides is valuable for the information provided with respect to the amino acid sequence of a mammalian protein that was not yet available, despite the analytical approach of isolating naturally occurring in nature products. DNA sequences are also clearly valuable as products useful for carrying out microbial synthesis of hpG-CSF on a large scale through a wide variety of recombinant techniques. On the other hand DNA sequences ? provided by the present invention are used to generate new and useful viral and circular plasmid DNA vectors, new and useful transformed and transfected! host microbial prokaryotic and eukaryotic cells (including bacterial and yeast cells and cultured mammalian cells), and novel and useful methods for culturing such microbial host cells capable of expressing hpG-CSF and related products. The DNA sequences of the present invention are also particularly suitable products for use as labeled probes for the isolation of hpG-CSF and related proteins encoding human genomic DNA, as well as cDNA and genomic DNA sequences from other mammalian species. DNA sequences can also be used in various alternative methods for protein synthesis (eg in insect cells) or in gene therapy for humans and other mammals. It is expected that the DNA sequences of the present invention will be used in the development of transgenic mammalian species that can serve as eukaryotic "hosts" for the quantitative production of hpG-CSF and hpG-CSF products. See generally Palmiter, et al., Science, 222 (4625), 809-814 (1983).

За приложимостта на hpG-CSF фрагменти и полипептидни аналози на изобретението съществуват доклади за имунологична активност на синтетични пептиди, които по същество дублират съществуващите аминокиселинни последователности в естествено съществуващите в природата протеини, гликопротеини и нуклеопротеини. По-специално, за полипептидите с относително ниско молекулно тегло е показано, че участват в имунни реакции, които са подобни по времетраене и обхват на имунните реакции на физиологично значими протеини, като вирусни антигени, полипептидни хормони и други подобни. Сред имунните реакции на такива полипептиди се включва провокирането на образуване на специфични антитела в имунологично активни животни. Виж например, Lerner, et al.,For the applicability of the hpG-CSF fragments and polypeptide analogs of the invention, there are reports of immunological activity of synthetic peptides that essentially duplicate existing amino acid sequences in naturally occurring proteins, glycoproteins and nucleoproteins. In particular, relatively low molecular weight polypeptides have been shown to participate in immune responses that are similar in duration and range to the immune responses of physiologically relevant proteins, such as viral antigens, polypeptide hormones and the like. The immune responses of such polypeptides include the provocation of the formation of specific antibodies in immunologically active animals. See, for example, Lerner, et al.,

23, 309-310 (1981); Ross, et al., Nature 294, 654-656 (1981);23, 309-310 (1981); Ross, et al., Nature 294, 654-656 (1981);

Walter, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA), 77, 5197-5200 (1980);Walter, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA), 77, 5197-5200 (1980);

Lerner, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA), 78, 3403-3407 (1981);Lerner, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA), 78, 3403-3407 (1981);

Walter, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA), 78, 4882-4886 (1981);Walter, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA), 78, 4882-4886 (1981);

Wong, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA), 78, 7412-7416 (1981);Wong, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA), 78, 7412-7416 (1981);

Green, et al., Cell, 28, 477-487 (1982); Nigg, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA), 79, 5322-5326 (1982); Baron, et al., Cell, 28, 395-404 (1982); Dreesman, et al., Nature, 295, 185-160 (1982); u Lerner, Scientific American, 248, No.2, 66-74 (1983). Виж също Kaiser, et al., Science, 223, 249-255 (1984))отнасящи се до биологичните и имунологични активности на синтетичните пептиди, които приблизително споделят вторичните структури на пептидни хормони, но не споделят тяхната първична конформация.Green, et al., Cell, 28, 477-487 (1982); Nigg, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA), 79, 5322-5326 (1982); Baron, et al., Cell 28, 395-404 (1982); Dreesman, et al., Nature, 295, 185-160 (1982); in Lerner, Scientific American, 248, No.2, 66-74 (1983). See also Kaiser, et al., Science, 223, 249-255 (1984) ) for biological and immunological activities of synthetic peptides that approximately share the secondary structures of peptide hormones but do not share their primary conformation.

Тъй като настоящото изобретение е описано по отношение на предпочитаните варианти на изпълнение, трябва да се разбира, че специалистите в областа биха използвали вариации и модификации. Следователно се подразбира, че прилежащите претенции включват всички такива еквивалентни вариации, които се включват в обхвата на изобретението съгласно патентните претенции.As the present invention is described with respect to preferred embodiments, it should be understood that those skilled in the art would use variations and modifications. It is therefore understood that the appended claims include all such equivalent variations that are included within the scope of the invention according to the claims.

Claims (5)

ПАТЕНТНИ ПРЕТЕНЦИИPatent Claims 1. Пречистена и изолирана ДНК последователност, състояща се по същество от ДНК последователност,кодираща човешки плурипотентен гранулоцитен колония-стимулращ фактор.A purified and isolated DNA sequence consisting essentially of a DNA sequence encoding a human pluripotent granulocyte colony-stimulating factor. 2. Пречистена и изолирана ДНК последователност съгласно претенция 1, характеризираща се с това, че посочената ДНК последователност е сДНК последователност.The purified and isolated DNA sequence of claim 1, wherein said DNA sequence is a cDNA sequence. 3. Плазмид или вирусен ДНК-ов вектор,включващ ДНК последователност съгласно претенция 1.A plasmid or viral DNA vector comprising the DNA sequence of claim 1. 4. Прокариотна или еукариотна клетка гостоприемник, стабилно трансформирана или трансфектирана с ДНК последователност съгласно претенция 1, по начин, позволяващ експресия на пол.урипотентен колония-стимулращ фактор.A prokaryotic or eukaryotic host cell, stably transformed or transfected with the DNA sequence of claim 1, in a manner allowing expression of a semi-uripotent colony-stimulating factor. 5. Метод за получаване на полипептиден продукт, характеризиращ се с това, че се култивират при подходящи хранителни условия прокариотни или еукариотни клетки гостоприемници,трансформирани или трансфектирани с ДНК последователност т кодираща човешки плурипотентен гранулоцитен колония-стимулиращ фактор по начин, позволяващ експресия на посочения полипептиден продукт, и се изолира желаниятполипептиден продукт от експресията на посочената ДНК последователност.5. Process for the preparation of a polypeptide product, wherein the culturing under suitable nutrient conditions procaryotic or eucaryotic host cells transformed or transfected with a DNA sequence encoding human t pluripotent granulocyte colony-stimulating factor in a manner allowing expression of said polypeptide product, and the desired polypeptide product is isolated from the expression of said DNA sequence.
BG096058A 1989-03-06 1992-03-13 Production of human pluripotent granulocytic colony-stimulation factor BG63285B2 (en)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US66803689A 1989-03-06 1989-03-06

Publications (1)

Publication Number Publication Date
BG63285B2 true BG63285B2 (en) 2001-08-31

Family

ID=24680735

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
BG096058A BG63285B2 (en) 1989-03-06 1992-03-13 Production of human pluripotent granulocytic colony-stimulation factor

Country Status (1)

Country Link
BG (1) BG63285B2 (en)

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US5582823A (en) Methods of treating bacterial inflammation and granulocytopoiesis by administering human pluripotent granulocyte colony-stimulating factor
US6004548A (en) Analogs of pluripotent granulocyte colony-stimulating factor
US4999291A (en) Production of human pluripotent granulocyte colony-stimulating factor
EP1018552B1 (en) Production of pluripotent granulocyte colony-stimulating factor
BG63285B2 (en) Production of human pluripotent granulocytic colony-stimulation factor
BG63065B2 (en) Analogues of pluripotent granulocytic colony-stimulating factor
AU727724B2 (en) Production of pluripotent granulocyte colony-stimulating factor
DK175551B1 (en) Poly:peptide with granulocyte colony stimulating factor activity - obtd. by recombinant DNA procedures for treating haematopoietic disorders
AU769969B2 (en) Production of pluripotent granulocyte colony-stimulating factor
AU2004202013A1 (en) Production of pluripotent granulocyte colony-stimulating factor