René Peeters werd geboren in Anderlecht en groeide op in de wijk Goede Lucht. Hij sloot zich op 11-jarige leeftijd aan bij de jeugdopleiding van RSC Anderlecht. Begin jaren 80 maakte hij de overstap naar de A-kern. Veel speelkansen kreeg de middenvelder niet. Pas in het seizoen 1981/82 kreeg hij een invalbeurt van trainer Tomislav Ivić. In een competitiewedstrijd tegen KSK Tongeren mocht hij toen Michel De Groote vervangen.
Het bleef bij die ene speelkans en dus trok Peeters in 1983 naar tweedeklasser Eendracht Aalst. Een seizoen later zakte hij zelfs af naar derde klasse; eerst bij KSV Bornem, vervolgens twee seizoenen bij La Louvière. In 1987 haalde Aalst hem terug naar de tweede klasse. In zijn eerste seizoen werd hij met de Ajuinen vicekampioen en greep hij in de eindronde net naast de promotie. Peeters speelde tot 1992 voor Eendracht Aalst, op uitzondering van het seizoen 1989/90 toen hij voor reeksgenoot KFC Eeklo uitkwam. In 1991 steeg hij met Aalst naar de hoogste afdeling.