« BRENDA » : différence entre les versions
Contenu supprimé Contenu ajouté
Aucun résumé des modifications |
m →Utilisation : orthographe |
||
(40 versions intermédiaires par 32 utilisateurs non affichées) | |||
Ligne 1 :
{{homonyme|Brenda}}
'''BRENDA''' est la banque de données intuitive d'informations sur les [[enzyme]]s. Cette banque de données est entretenue et développée par l'Institut de biochimie de l'[[Université de Cologne]]. Les données sur les fonctions enzymatiques sont extraites directement de la littérature primaire. Des vérifications formelles ainsi que des vérifications de consistance sont effectuées par des programmes informatiques ; de plus chacune des données introduites est vérifiée "manuellement". La dernière révision remonte à [[janvier]] [[2004]] et comprenait :▼
{{Traduction incomplète|date=juillet 2017}}
▲'''BRENDA''' est
* Importante accélération de la vitesse de mise à jour
* Développement d'un nouveau [[Navigateur web|fureteur]] <!--browser -->de l'arborescence [[Nomenclature EC|EC]]
* Fureteur <!--browser -->de l'arborescence de la [[taxonomie]]
* Moteur de recherche des sous-structures chimiques pour les structures des
* Développement d'un vocabulaire contrôlé
* Ontologie de certains champs d'information
Ligne 10 ⟶ 12 :
==Utilisation==
La base de données couvre 40 entrées, avec des informations à propos de la nomenclature, des réactions, de la spécificité, de la structure de l'enzyme, de sa méthode d'isolement ou de préparation, les références dans la littérature scientifique et des références croisées pour la séquence ou la structure 3D.
La base de données est accessible gratuitement pour des usages académiques et sans but lucratif, les usages commerciaux ont besoin d'acquérir une licence. Pour utiliser la base de données, il est nécessaire de s'enregistrer par e-mail. La base de données peut être parcourue par la [[nomenclature EC]], le nom de l'enzyme, l'organisme ou une recherche avancée combinant ces entrées.
▲== Autres banques de données==
▲<!--BRENDA also links to other databases. Including KEGG which provides information about the pathway that the enzyme is involved in. It also links to gene ontology information through the GO website. There is also links to the literature through PubMed. Other databases that BRENDA link to include:
* ExPASy
* NCBI databases (Protein, nucleotide, structure, genome, OMIM, Domains
Ligne 44 ⟶ 27 :
* SCOP
* CATH
* InterPro
== Références ==
* Springer Handbook of Enzymes, Schomburg, D., Schomburg, I. (2001) {{2nd}} Ed. Springer, Heidelberg
* Enzyme data and metabolic information: BRENDA, a resource for research in biology, biochemistry, and medicine Schomburg, I., Hofmann, O., Bänsch, C., Chang, A., Schomburg, D. Gene Funct. Dis. (2000) 3-4, 109-18
* BRENDA, enzyme data and metabolic information. Schomburg, I., Chang, A., Schomburg, D.Nucleic Acids Res. (2002) 30, 47-9
* BRENDA: a resource for enzyme data and metabolic information. Schomburg I., Chang A., Hofmann O., Ebeling C., Ehrentreich F., Schomburg D. [[Trends in Biochemical Sciences|Trends Biochem. Sci.]] 2002 Jan;27(1):54-6. ▼
▲* BRENDA: a resource for enzyme data and metabolic information. Schomburg I., Chang A., Hofmann O., Ebeling C., Ehrentreich F., Schomburg D.Trends Biochem Sci. 2002 Jan;27(1):54-6.
*Review of the BRENDA Database. Pharkya P., Nikolaev E.V., Maranas C.D. Metab Eng. 2003 Apr;5(2):71-3.
* BRENDA, the enzyme database: updates and major new developments. Schomburg I., Chang A., Ebeling C., Gremse M., Heldt C., Huhn G., Schomburg D. Nucleic Acids Res. 2004 Jan 1;32 Database issue:D431-3.
== Liens externes==
* [http://www.brenda
* [http://www.empproject.com/ EMP: Enzymes and Metabolic Pathways database]
* [http://www.worthington-biochem.com/default.html Worthington Biochemical Corporation Enzyme Manual]
* [http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/ Enzyme Nomenclature]
{{Portail
[[Catégorie:Métabolisme]]
[[Catégorie:Protéomique]]
[[Catégorie:Recherche scientifique sur Internet]]
[[Catégorie:Base de données Enzymes]]
|