Variations on a Theme: The Classification of Benthic Macroinvertebrates

Open Access
Author:
Description:
Vain murto-osa maailman vesivarannoista on makeaa vettä. Jokapäiväisessä ympäristössämme olevat vesistöt, kuten joet, purot, lammet ja järvet ovat vain osajoukko makean veden kokonaismäärästä. Vesistöt kohtaavat nykyään enenevässä määrin erilaisia ympäristöpaineita muun muassa kemikaalipäästöjen muodossa. Tästä syystä vesistöjen tilojen tarkkailuun on viime vuosikymmenten aikana panostettu yhä enemmän. Vesistöjen tilojen seuranta voidaan suorittaa lyhyt- tai pitkäaikaisena. Lyhytaikaisessa seurannassa hyödynnetään usein kerättyjen vesinäytteiden kemiallista analyysia, kun taas pitkäaikaisten seurantojen yhteydessä käytetään apuna pohjaeläimiä, sillä ne reagoivat veden laadun muutoksiin hyvin ja niitä löytyy kaikista vesistöistä. Pohjaeläimet ovat pieniä selkärangattomia eläimiä, jotka ovat riippuvaisia vedenalaisesta alustastaan jossain vaiheessa niiden elinkaarta. Pohjaeläinten hyödyntäminen vesistön tilan seurannassa on monivaiheinen prosessi. Ensimmäiseksi vesistöstä kerätään lukuisia näytteitä, joista pohjaeläimet erotellaan ja säilötään yksitellen. Toiseksi biologi tai lajintunnistukseen erikoistunut taksonomisti määrittää näytteistä saatujen pohjaeläinten lajit tai yleisesti ottaen niiden taksonomiset ryhmät yksitellen. Näytteistä saatujen lajitietojen ja muun analysoinnin perusteella pystytään selvittämään vesistön tilan muuttuminen pitkältä aikaväliltä. Prosessin työläimpiä vaiheita on pohjaeläinten tunnistaminen, jonka automatisointi säästäisi huomattavasti resursseja. Väitöskirjassa keskitytään pohjaeläinten tunnistamiseen laskennallisin menetelmin, mikä on erittäin vähän tutkittu alue hahmontunnistuksen saralla. Pohjaeläinten laskennallinen tunnistaminen palautuu kuvien luokittelemiseen. Tutkimusaineistoina väitöskirjassa on käytetty kahta pohjaeläinkuva-aineistoa, joista ensimmäinen käsittää 1350 kuvaa yhteensä kahdeksasta taksonomisesta ryhmästä ja toinen kuvakokoelma pitää sisällään yli 4800 kuvaa yhteensä 50 pohjaeläinlajista. Väitöskirja koostuu viidestä artikkelista, joissa on sovellettu ...
Publisher:
Tampere University Press
Contributors:
Informaatiotieteiden yksikkö - School of Information Sciences ; University of Tampere
Year of Publication:
2012-11-09
Document Type:
fi=Väitöskirja | en=Doctoral dissertation| ; doctoralThesis ; [Doctoral and postdoctoral thesis]
Language:
en
Subjects:
Tietojenkäsittelyoppi - Computer Science
DDC:
006 Special computer methods (computed)
Rights:
This publication is copyrighted. You may download, display and print it for Your own personal use. Commercial use is prohibited. ; openAccess
Relations:
Acta Electronica Universitatis Tamperensis ; 1251 ; 1456-954X ; 978-951-44-8953-2 ; https://trepo.tuni.fi/handle/10024/66958 ; urn:isbn:978-951-44-8953-2
URL:
https://trepo.tuni.fi/handle/10024/66958
Content Provider:
Tampere University: Trepo  Flag of Finland