Fossiler og redskaper viser at Indonesia var bebodd av Homo erectus for mellom 35 000 og 1 million år siden. I århundrene evt. vokste hinduistiske riker frem på Java og Sumatra. Fra 1400-tallet ble islam stadig mer utbredt i Indonesia og ble på 1500- og 1600-tallet den dominerende religion; hinduismen holdt seg på Bali.
Omkring 1500 tok portugiserne kontroll over den viktige kryddereksporten fra Molukkene, men ble omkring 1600 fortrengt av nederlenderne.
På 1800-tallet sikret Nederland herredømme over Indonesia og innførte kolonistyre. Tidlig på 1900-tallet oppsto flere nasjonale frigjøringsbevegelser. Under andre verdenskrig var Indonesia under japansk okkupasjon fra 1942 til 1945. I de følgende årene prøvde Nederland å gjenerobre landet i kamp mot en frigjøringsbevegelse som under ledelse av president Sukarno hadde erklært landet uavhengig 17. august 1945. Etter forhandlinger i 1949 ble landet anerkjent som en selvstendig stat i en løs union med Nederland. Unionen fikk liten betydning, og i 1950 innførte Sukarno et sentralisert indonesisk styre.
Sør-Molukkene, som hadde levert mange soldater til den nederlandske kolonihæren, prøvde å rive seg løs i 1950, men opprøret ble slått ned. Mange av de molukkanske soldatene ble hentet til Nederland. Også på andre øyer var det separatistbevegelser og opprør sent på 1950-tallet; de ble alle slått ned. Den vestlige delen av Ny-Guinea, som Nederland hadde beholdt under forhandlingene i 1949, ble overført til Indonesia etter en militær konflikt og mekling i regi av FN i 1963.
I 1965 ble et kuppforsøk som førte til at seks offiserer ble drept, slått ned av hæren. Omstendighetene var dunkle, men hæren under ledelse av general Suharto la ansvaret for kuppforsøket på kommunistpartiet i landet. De følgende månedene ble mellom 500 000 og 1 000 000 ekte og påståtte kommunister massakrert i aksjoner organisert av hæren, men ofte utført av sivile antikommunistiske aktivister. Militære ledere avsatte president Sukarno i 1967.
Den portugisiske kolonien Øst-Timor, som var i en dekoloniseringsprosess etter «nellikrevolusjonen» i Portugal i 1974, ble invadert av Indonesia i 1975 og året etter annektert etter harde kamper.
På 1990-tallet rettet flere grupper sterk kritikk mot regimets autoritære politikk. Indonesia ble i dette tiåret hardt rammet av krisen i asiatisk økonomi, og det kom til opptøyer. I 1999 ble de første frie valg siden 1955 avviklet, og samme år ble Øst-Timor overført til en FN-administrasjon etter en folkeavstemning, og ble deretter selvstendig i 2002.
I 2004 valgte Indonesia for første gang en president ved direkte valg; Susilo Bambang Yudhoyono fikk mer enn 60 prosent av stemmene, og regjerte i to femårsperioder. I 2014 vant Joko Widodo presidentvalget, og ble gjenvalgt i 2019. Presidentvalget 14. februar 2024 ble vunnet av Prabowo Subianto (1951–), som fikk 58,59 prosent av stemmene. Subianto vil bli innsatt som president 20. oktober 2024.
Aceh-provinsen på Sumatra ble hardest rammet av tsunamien i desember 2004, da 220 000 indonesiere omkom.
I de senere år har Indonesia hatt en stabil økonomisk utvikling.
Kommentarer
Kommentarer til artikkelen blir synlig for alle. Ikke skriv inn sensitive opplysninger, for eksempel helseopplysninger. Fagansvarlig eller redaktør svarer når de kan. Det kan ta tid før du får svar.
Du må være logget inn for å kommentere.