UBD

UBD
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2MBE
Ідентифікатори
Символи	UBD, FAT10, GABBR1, UBD-3, ubiquitin D
Зовнішні ІД	OMIM: 606050 MGI: 1344410 HomoloGene: 4665 GeneCards: UBD
Онтологія гена Молекулярна функція • proteasome binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • aggresome • клітинне ядро • fibrillar center • гіалоплазма Біологічний процес • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • response to tumor necrosis factor • myeloid dendritic cell differentiation • protein modification by small protein conjugation • Убіквітин-залежний протеоліз • ubiquitin-dependent protein catabolic process • response to interferon-gamma • протеоліз • aggresome assembly • positive regulation of apoptotic process • посттрансляційна модифікація • regulation of mitotic cell cycle phase transition Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10537	24108
Ensembl	ENSG00000228913 ENSG00000231968 ENSG00000206468 ENSG00000206513 ENSG00000224654 ENSG00000213886 ENSG00000226898	ENSMUSG00000035186
UniProt	O15205	P63072
RefSeq (мРНК)	NM_006398	NM_023137
RefSeq (білок)	NP_006389	NP_075626
Локус (UCSC)	Хр. 6: 29.56 – 29.56 Mb	Хр. 17: 37.5 – 37.51 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

UBD (англ. Ubiquitin D) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 165 амінокислот, а молекулярна маса — 18 473.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAPNASCLCV		HVRSEEWDLM		TFDANPYDSV		KKIKEHVRSK		TKVPVQDQVL
LLGSKILKPR		RSLSSYGIDK		EKTIHLTLKV		VKPSDEELPL		FLVESGDEAK
RHLLQVRRSS		SVAQVKAMIE		TKTGIIPETQ		IVTCNGKRLE		DGKMMADYGI
RKGNLLFLAC		YCIGG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hipp M.S., Raasi S., Groettrup M., Schmidtke G. (2004). NEDD8 ultimate buster-1L interacts with the ubiquitin-like protein FAT10 and accelerates its degradation. J. Biol. Chem. 279: 16503—16510. PMID 14757770 DOI:10.1074/jbc.M310114200
• Hipp M.S., Kalveram B., Raasi S., Groettrup M., Schmidtke G. (2005). FAT10, a ubiquitin-independent signal for proteasomal degradation. Mol. Cell. Biol. 25: 3483—3491. PMID 15831455 DOI:10.1128/MCB.25.9.3483-3491.2005
• Lim C.-B., Zhang D., Lee C.G. (2006). FAT10, a gene up-regulated in various cancers, is cell-cycle regulated. Cell Div. 1: 20—20. PMID 16959044 DOI:10.1186/1747-1028-1-20
• Zhang D.W., Jeang K.-T., Lee C.G. (2006). p53 negatively regulates the expression of FAT10, a gene upregulated in various cancers. Oncogene. 25: 2318—2327. PMID 16501612 DOI:10.1038/sj.onc.1209220
• Chiu Y.-H., Sun Q., Chen Z.J. (2007). E1-L2 activates both ubiquitin and FAT10. Mol. Cell. 27: 1014—1023. PMID 17889673 DOI:10.1016/j.molcel.2007.08.020

Див. також

• Хромосома 6