RAD1

RAD1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3A1J, 3G65, 3GGR
Ідентифікатори
Символи	RAD1, HREC1, RAD1 homolog, RAD1 checkpoint DNA exonuclease
Зовнішні ІД	OMIM: 603153 MGI: 1316678 HomoloGene: 37695 GeneCards: RAD1
шифр КФ	3.1.11.2
Онтологія гена Молекулярна функція • damaged DNA binding • exodeoxyribonuclease III activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • 3'-5' exonuclease activity • nuclease activity • exonuclease activity • hydrolase activity Клітинна компонента • внутрішньоклітинна мембранна органела • хромосома • нуклеоплазма • checkpoint clamp complex • клітинне ядро Біологічний процес • substantia nigra development • DNA damage checkpoint signaling • cellular response to DNA damage stimulus • реплікація ДНК • meiotic recombination checkpoint signaling • cellular response to ionizing radiation • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • regulation of signal transduction by p53 class mediator • GO:0100026 Репарація ДНК Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5810	19355
Ensembl	ENSG00000113456	ENSMUSG00000022248
UniProt	O60671	Q9QWZ1
RefSeq (мРНК)	NM_001033673 NM_002853 NM_133282 NM_133377	NM_001289447 NM_001289448 NM_011232
RefSeq (білок)	NP_002844	NP_001276376 NP_001276377 NP_035362
Локус (UCSC)	Хр. 5: 34.91 – 34.92 Mb	Хр. 15: 10.49 – 10.5 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RAD1 (англ. RAD1 checkpoint DNA exonuclease) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 282 амінокислот, а молекулярна маса — 31 827.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPLLTQQIQD		EDDQYSLVAS		LDNVRNLSTI		LKAIHFREHA		TCFATKNGIK
VTVENAKCVQ		ANAFIQAGIF		QEFKVQEESV		TFRINLTVLL		DCLSIFGSSP
MPGTLTALRM		CYQGYGYPLM		LFLEEGGVVT		VCKINTQEPE		ETLDFDFCST
NVINKIILQS		EGLREAFSEL		DMTSEVLQIT		MSPDKPYFRL		STFGNAGSSH
LDYPKDSDLM		EAFHCNQTQV		NRYKISLLKP		STKALVLSCK		VSIRTDNRGF
LSLQYMIRNE		DGQICFVEYY		CCPDEEVPES		ES

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, екзонуклеаз, нуклеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Локалізований у ядрі.

Література

• Dean F.B., Lian L., O'Donnell M. (1998). cDNA cloning and gene mapping of human homologs for Schizosaccharomyces pombe rad17, rad1, and hus1 and cloning of homologs from mouse, Caenorhabditis elegans, and Drosophila melanogaster. Genomics. 54: 424—436. PMID 9878245 DOI:10.1006/geno.1998.5587
• Udell C.M., Lee S.K., Davey S. (1998). HRAD1 and MRad1 encode mammalian homologues of the fission yeast rad1+ cell cycle checkpoint control gene. Nucleic Acids Res. 26: 3971—3976. PMID 9705507 DOI:10.1093/nar/26.17.3971
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• St Onge R.P., Udell C.M., Casselman R., Davey S. (1999). The human G2 checkpoint control protein hRAD9 is a nuclear phosphoprotein that forms complexes with hRAD1 and hHUS1. Mol. Biol. Cell. 10: 1985—1995. PMID 10359610 DOI:10.1091/mbc.10.6.1985
• Hang H., Lieberman H.B. (2000). Physical interaction among human checkpoint control proteins HUS1p, RAD1p, and RAD9p, and implications for the regulation of cell cycle progression. Genomics. 65: 24—33. PMID 10777662 DOI:10.1006/geno.2000.6142
• Cai R.L., Yan-Neale Y., Cueto M.A., Xu H., Cohen D. (2000). HDAC1, a histone deacetylase, forms a complex with Hus1 and Rad9, two G2/M checkpoint Rad proteins. J. Biol. Chem. 275: 27909—27916. PMID 10846170 DOI:10.1074/jbc.M000168200

Див. також

• Хромосома 5