POLR2B

POLR2B
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5IY9, 5IYA, 5IYC, 5IYB, 5IY7, 5IY8, 5IYD, 5IY6
Ідентифікатори
Символи	POLR2B, POL2RB, RPB2, hRPB140, hsRPB2, polymerase (RNA) II subunit B, RNA polymerase II subunit B
Зовнішні ІД	OMIM: 180661 MGI: 2388280 HomoloGene: 722 GeneCards: POLR2B
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • DNA binding • nucleotidyltransferase activity • ribonucleoside binding • RNA polymerase II activity • chromatin binding • зв'язування з іоном металу • DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • мембрана • РНК-полімераза II • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • somatic stem cell population maintenance • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • 7-methylguanosine mRNA capping • transcription by RNA polymerase II • positive regulation of viral transcription • transcription-coupled nucleotide-excision repair • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • snRNA transcription by RNA polymerase II • fibroblast growth factor receptor signaling pathway • transcription, DNA-templated • RNA metabolic process • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5431	231329
Ensembl	ENSG00000047315	ENSMUSG00000029250
UniProt	P30876	Q8CFI7
RefSeq (мРНК)	NM_001303269 NM_000938 NM_001303268	NM_153798
RefSeq (білок)	NP_000929 NP_001290197 NP_001290198	NP_722493
Локус (UCSC)	Хр. 4: 56.98 – 57.03 Mb	Хр. 5: 77.46 – 77.5 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

POLR2B (англ. RNA polymerase II subunit B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 174 амінокислот, а молекулярна маса — 133 897.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MYDADEDMQY		DEDDDEITPD		LWQEACWIVI		SSYFDEKGLV		RQQLDSFDEF
IQMSVQRIVE		DAPPIDLQAE		AQHASGEVEE		PPRYLLKFEQ		IYLSKPTHWE
RDGAPSPMMP		NEARLRNLTY		SAPLYVDITK		TVIKEGEEQL		QTQHQKTFIG
KIPIMLRSTY		CLLNGLTDRD		LCELNECPLD		PGGYFIINGS		EKVLIAQEKM
ATNTVYVFAK		KDSKYAYTGE		CRSCLENSSR		PTSTIWVSML		ARGGQGAKKS
AIGQRIVATL		PYIKQEVPII		IVFRALGFVS		DRDILEHIIY		DFEDPEMMEM
VKPSLDEAFV		IQEQNVALNF		IGSRGAKPGV		TKEKRIKYAK		EVLQKEMLPH
VGVSDFCETK		KAYFLGYMVH		RLLLAALGRR		ELDDRDHYGN		KRLDLAGPLL
AFLFRGMFKN		LLKEVRIYAQ		KFIDRGKDFN		LELAIKTRII		SDGLKYSLAT
GNWGDQKKAH		QARAGVSQVL		NRLTFASTLS		HLRRLNSPIG		RDGKLAKPRQ
LHNTLWGMVC		PAETPEGHAV		GLVKNLALMA		YISVGSQPSP		ILEFLEEWSM
ENLEEISPAA		IADATKIFVN		GCWVGIHKDP		EQLMNTLRKL		RRQMDIIVSE
VSMIRDIRER		EIRIYTDAGR		ICRPLLIVEK		QKLLLKKRHI		DQLKEREYNN
YSWQDLVASG		VVEYIDTLEE		ETVMLAMTPD		DLQEKEVAYC		STYTHCEIHP
SMILGVCASI		IPFPDHNQSP		RNTYQSAMGK		QAMGVYITNF		HVRMDTLAHV
LYYPQKPLVT		TRSMEYLRFR		ELPAGINSIV		AIASYTGYNQ		EDSVIMNRSA
VDRGFFRSVF		YRSYKEQESK		KGFDQEEVFE		KPTRETCQGM		RHAIYDKLDD
DGLIAPGVRV		SGDDVIIGKT		VTLPENEDEL		ESTNRRYTKR		DCSTFLRTSE
TGIVDQVMVT		LNQEGYKFCK		IRVRSVRIPQ		IGDKFASRHG		QKGTCGIQYR
QEDMPFTCEG		ITPDIIINPH		AIPSRMTIGH		LIECLQGKVS		ANKGEIGDAT
PFNDAVNVQK		ISNLLSDYGY		HLRGNEVLYN		GFTGRKITSQ		IFIGPTYYQR
LKHMVDDKIH		SRARGPIQIL		NRQPMEGRSR		DGGLRFGEME		RDCQIAHGAA
QFLRERLFEA		SDPYQVHVCN		LCGIMAIANT		RTHTYECRGC		RNKTQISLVR
MPYACKLLFQ		ELMSMSIAPR		MMSV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як транскрипція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном магнію. Локалізований у ядрі.

Література

• Acker J., Wintzerith M., Vigneron M., Kedinger C. (1992). Primary structure of the second largest subunit of human RNA polymerase II (or B). J. Mol. Biol. 226: 1295—1299. PMID 1518060 DOI:10.1016/0022-2836(92)91071-V
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kershnar E., Wu S.-Y., Chiang C.-M. (1998). Immunoaffinity purification and functional characterization of human transcription factor IIH and RNA polymerase II from clonal cell lines that conditionally express epitope-tagged subunits of the multiprotein complexes. J. Biol. Chem. 273: 34444—34453. PMID 9852112 DOI:10.1074/jbc.273.51.34444
• Lee J.H., Skalnik D.G. (2008). Wdr82 is a C-terminal domain-binding protein that recruits the Setd1A Histone H3-Lys4 methyltransferase complex to transcription start sites of transcribed human genes. Mol. Cell. Biol. 28: 609—618. PMID 17998332 DOI:10.1128/MCB.01356-07

Див. також

• Хромосома 4