NUP205

NUP205
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 5IJN, 5IJO
Ідентифікатори
Символи	NUP205, C7orf14, NPHS13, nucleoporin 205kDa, nucleoporin 205
Зовнішні ІД	OMIM: 614352 MGI: 2141625 HomoloGene: 45971 GeneCards: NUP205
Пов'язані генетичні захворювання
mammary Paget's disease
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0005487 structural constituent of nuclear pore • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • ядерна мембрана • nuclear envelope • мембрана • nuclear periphery • nuclear pore inner ring • ядерна пора • клітинне ядро • host cell Біологічний процес • mRNA transport • nuclear pore complex assembly • viral transcription • protein sumoylation • mitotic nuclear membrane disassembly • nucleocytoplasmic transport • regulation of cellular response to heat • protein transport • GO:0022415 viral process • GO:0046795 intracellular transport of virus • tRNA export from nucleus • mRNA export from nucleus • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • regulation of glycolytic process • GO:0015915 транспорт • nuclear pore organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23165	70699
Ensembl	ENSG00000155561	ENSMUSG00000038759
UniProt	Q92621	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_015135 NM_001329434	NM_027513
RefSeq (білок)	NP_001316363 NP_055950	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 7: 135.56 – 135.65 Mb	Хр. 6: 35.15 – 35.22 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NUP205 (англ. Nucleoporin 205) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 012 амінокислот, а молекулярна маса — 227 922.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATPLAVNSA		ASLWGPYKDI		WHKVGNALWR		RQPEAVHLLD		KILKKHKPDF
ISLFKNPPKN		VQQHEKVQKA		STEGVAIQGQ		QGTRLLPEQL		IKEAFILSDL
FDIGELAAVE		LLLAGEHQQP		HFPGLTRGLV		AVLLYWDGKR		CIANSLKALI
QSRRGKTWTL		ELSPELASMT		TRFTDELMEQ		GLTYKVLTLV		SQIDVNNEFE
KLQRERGLGS		EKHRKEVSDL		IKECRQSLAE		SLFAWACQSP		LGKEDTLLLI
GHLERVTVEA		NGSLDAVNLA		LLMALLYCFD		ISFIEQSTEE		RDDMIHQLPL
LTEKQYIATI		HSRLQDSQLW		KLPGLQATVR		LAWALALRGI		SQLPDVTALA
EFTEADEAMA		ELAIADNVFL		FLMESVVVSE		YFYQEEFYIR		RVHNLITDFL
ALMPMKVKQL		RNRADEDARM		IHMSMQMGNE		PPISLRRDLE		HLMLLIGELY
KKNPFHLELA		LEYWCPTEPL		QTPTIMGSYL		GVAHQRPPQR		QVVLSKFVRQ
MGDLLPPTIY		IPYLKMLQGL		ANGPQCAHYC		FSLLKVNGSS		HVENIQGAGG
SPVSWEHFFH		SLMLYHEHLR		KDLPSADSVQ		YRHLPSRGIT		QKEQDGLIAF
LQLTSTIITW		SENARLALCE		HPQWTPVVVI		LGLLQCSIPP		VLKAELLKTL
AAFGKSPEIA		ASLWQSLEYT		QILQTVRIPS		QRQAIGIEVE		LNEIESRCEE
YPLTRAFCQL		ISTLVESSFP		SNLGAGLRPP		GFDPYLQFLR		DSVFLRFRTR
AYRRAAEKWE		VAEVVLEVFY		KLLRDYEPQL		EDFVDQFVEL		QGEEIIAYKP
PGFSLMYHLL		NESPMLELAL		SLLEEGVKQL		DTYAPFPGKK		HLEKAVQHCL
ALLNLTLQKE		NLFMDLLRES		QLALIVCPLE		QLLQGINPRT		KKADNVVNIA
RYLYHGNTNP		ELAFESAKIL		CCISCNSNIQ		IKLVGDFTHD		QSISQKLMAG
FVECLDCEDA		EEFVRLEEGS		ELEKKLVAIR		HETRIHILNL		LITSLECNPP
NLALYLLGFE		LKKPVSTTNL		QDPGVLGCPR		TCLHAILNIL		EKGTEGRTGP
VAVRESPQLA		ELCYQVIYQL		CACSDTSGPT		MRYLRTSQDF		LFSQLQYLPF
SNKEYEISML		NQMSWLMKTA		SIELRVTSLN		RQRSHTQRLL		HLLLDDMPVK
PYSDGEGGIE		DENRSVSGFL		HFDTATKVRR		KILNILDSID		FSQEIPEPLQ
LDFFDRAQIE		QVIANCEHKN		LRGQTVCNVK		LLHRVLVAEV		NALQGMAAIG
QRPLLMEEIS		TVLQYVVGRN		KLLQCLHAKR		HALESWRQLV		EIILTACPQD
LIQAEDRQLI		IRDILQDVHD		KILDDEAAQE		LMPVVAGAVF		TLTAHLSQAV
LTEQKETSVL		GPAEAHYAFM		LDSCFTSPPP		EENPLVGFAS		IGDSSLYIIL
KKLLDFILKT		GGGFQRVRTH		LYGSLLYYLQ		IAQRPDEPDT		LEAAKKTMWE
RLTAPEDVFS		KLQRENIAII		ESYGAALMEV		VCRDACDGHE		IGRMLALALL
DRIVSVDKQQ		QWLLYLSNSG		YLKVLVDSLV		EDDRTLQSLL		TPQPPLLKAL
YTYESKMAFL		TRVAKIQQGA		LELLRSGVIV		RLAQCQVYDM		RPETDPQSMF
GMRDPPMFIP		TPVDRYRQIL		LPALQLCQVI		LTSSMAQHLQ		AAGQVLQFLI
SHSDTIQAIL		RCQDVSAGSL		QELALLTGII		SKAALPGILS		ELDVDVNEGS
LMELQGHIGR		FQRQCLGLLS		RFGGSDRLRQ		FKFQDDNVEG		DKVSKKDEIE
LAMQQICANV		MEYCQSLMLQ		SSPTFQHAVC		LFTPSLSETV		NRDGPRQDTQ
APVVPYWRLP		GLGIIIYLLK		QSANDFFSYY		DSHRQSVSKL		QNVEQLPPDE
IKELCQSVMP		AGVDKISTAQ		KYVLARRRLV		KVINNRAKLL		SLCSFIIETC
LFILWRHLEY		YLLHCMPTDS		QDSLFASRTL		FKSRRLQDSF		ASETNLDFRS
GLAIVSQHDL		DQLQADAINA		FGESLQKKLL		DIEGLYSKVR		SRYSFIQALV
RRIRGLLRIS		RN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація, ацетилювання. Локалізований у ядрі, мембрані, комплексі ядерної пори.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hase M.E., Cordes V.C. (2003). Direct interaction with nup153 mediates binding of Tpr to the periphery of the nuclear pore complex. Mol. Biol. Cell. 14: 1923—1940. PMID 12802065 DOI:10.1091/mbc.E02-09-0620
• Krull S., Thyberg J., Bjorkroth B., Rackwitz H.R., Cordes V.C. (2004). Nucleoporins as components of the nuclear pore complex core structure and Tpr as the architectural element of the nuclear basket. Mol. Biol. Cell. 15: 4261—4277. PMID 15229283 DOI:10.1091/mbc.E04-03-0165
• Hawryluk-Gara L.A., Shibuya E.K., Wozniak R.W. (2005). Vertebrate Nup53 interacts with the nuclear lamina and is required for the assembly of a Nup93-containing complex. Mol. Biol. Cell. 16: 2382—2394. PMID 15703211 DOI:10.1091/mbc.E04-10-0857

Див. також

• Хромосома 7