Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
NEUROG2
Ідентифікатори
Символи
NEUROG2 , Atoh4, Math4A, NGN2, bHLHa8, ngn-2, neurogenin 2
Зовнішні ІД
OMIM : 606624 MGI: 109619 HomoloGene: 7633 GeneCards: NEUROG2
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • E-box binding • protein dimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро
Біологічний процес
• multicellular organism development • нейробіологія розвитку • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • neuron differentiation • диференціація клітин • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 4: 112.51 – 112.52 Mb
Хр. 3: 127.43 – 127.43 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
NEUROG2 (англ. Neurogenin 2 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 272 амінокислот , а молекулярна маса — 28 621[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MFVKSETLEL KEEEDVLVLL GSASPALAAL TPLSSSADEE EEEEPGASGG
ARRQRGAEAG QGARGGVAAG AEGCRPARLL GLVHDCKRRP SRARAVSRGA
KTAETVQRIK KTRRLKANNR ERNRMHNLNA ALDALREVLP TFPEDAKLTK
IETLRFAHNY IWALTETLRL ADHCGGGGGG LPGALFSEAV LLSPGGASAA
LSSSGDSPSP ASTWSCTNSP APSSSVSSNS TSPYSCTLSP ASPAGSDMDY
WQPPPPDKHR YAPHLPIARD CI
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів , білків розвитку .
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція , регуляція транскрипції , диференціація, нейрогенез.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші