CAMK1D

CAMK1D
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2JC6
Ідентифікатори
Символи	CAMK1D, CKLiK, CaM-K1, CaMKID, calcium/calmodulin dependent protein kinase ID
Зовнішні ІД	OMIM: 607957 MGI: 2442190 HomoloGene: 121858 GeneCards: CAMK1D
Пов'язані генетичні захворювання
анорексія, ожиріння
Реагує на сполуку
бозутиніб
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • protein kinase activity • kinase activity • protein serine/threonine kinase activity • каталітична активність • ATP binding • calmodulin-dependent protein kinase activity • calmodulin binding Клітинна компонента • клітинне ядро • цитоплазма Біологічний процес • regulation of granulocyte chemotaxis • positive regulation of phagocytosis • фосфорилювання • negative regulation of apoptotic process • regulation of dendrite development • нейробіологія розвитку • protein phosphorylation • positive regulation of CREB transcription factor activity • positive regulation of apoptotic process • обмін речовин • inflammatory response • positive regulation of respiratory burst • positive regulation of neutrophil chemotaxis • positive regulation of neuron projection development • GO:0035404 peptidyl-serine phosphorylation • peptidyl-threonine phosphorylation • GO:0007243 intracellular signal transduction Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57118	227541
Ensembl	ENSG00000183049	ENSMUSG00000039145
UniProt	Q8IU85	Q8BW96
RefSeq (мРНК)	NM_020397 NM_153498 NM_001351032	NM_001290374 NM_001290375 NM_001290376 NM_177343
RefSeq (білок)	NP_065130 NP_705718 NP_001337961	NP_001277303 NP_001277304 NP_001277305 NP_796317
Локус (UCSC)	Хр. 10: 12.35 – 12.84 Mb	Хр. 2: 5.3 – 5.72 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CAMK1D (англ. Calcium/calmodulin dependent protein kinase ID) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 385 амінокислот, а молекулярна маса — 42 914.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MARENGESSS		SWKKQAEDIK		KIFEFKETLG		TGAFSEVVLA		EEKATGKLFA
VKCIPKKALK		GKESSIENEI		AVLRKIKHEN		IVALEDIYES		PNHLYLVMQL
VSGGELFDRI		VEKGFYTEKD		ASTLIRQVLD		AVYYLHRMGI		VHRDLKPENL
LYYSQDEESK		IMISDFGLSK		MEGKGDVMST		ACGTPGYVAP		EVLAQKPYSK
AVDCWSIGVI		AYILLCGYPP		FYDENDSKLF		EQILKAEYEF		DSPYWDDISD
SAKDFIRNLM		EKDPNKRYTC		EQAARHPWIA		GDTALNKNIH		ESVSAQIRKN
FAKSKWRQAF		NATAVVRHMR		KLHLGSSLDS		SNASVSSSLS		LASQKDCLAP
STLCSFISSS		SGVSGVGAER		RPRPTTVTAV		HSGSK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як запальна відповідь, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, молекулою кальмодуліну, іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Verploegen S., Lammers J.-W.L., Koenderman L., Coffer P.J. (2000). Identification and characterization of CKLiK, a novel granulocyte Ca++/calmodulin-dependent protein kinase. Blood. 96: 3215—3223. PMID 11050006

Див. також

• Хромосома 10