ASAP1

ASAP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2D1X, 2DA0, 2ED1, 2RQT, 2RQU
Ідентифікатори
Символи	ASAP1, AMAP1, CENTB4, DDEF1, PAG2, PAP, ZG14P, ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1
Зовнішні ІД	OMIM: 605953 MGI: 1342335 HomoloGene: 7684 GeneCards: ASAP1
Онтологія гена Молекулярна функція • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate binding • зв'язування з іоном металу • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • phosphatidylserine binding • cadherin binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • dendritic spine • мембрана • podosome • cell projection membrane • клітинна мембрана Біологічний процес • cilium assembly • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • negative regulation of dendritic spine development • cell projection organization • positive regulation of podosome assembly • positive regulation of membrane tubulation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	50807	13196
Ensembl	ENSG00000153317	ENSMUSG00000022377
UniProt	Q9ULH1	Q9QWY8
RefSeq (мРНК)	NM_001247996 NM_018482 NM_001362925 NM_001362926 NM_001362924	NM_001276461 NM_001276462 NM_001276463 NM_001276467 NM_010026
RefSeq (білок)	NP_001234925 NP_060952 NP_001349854 NP_001349855 NP_001349853	NP_001263390 NP_001263391 NP_001263392 NP_001263396 NP_034156
Локус (UCSC)	Хр. 8: 130.05 – 130.44 Mb	Хр. 15: 63.96 – 64.25 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ASAP1 (англ. ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 129 амінокислот, а молекулярна маса — 125 498.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRSSASRLSS		FSSRDSLWNR		MPDQISVSEF		IAETTEDYNS		PTTSSFTTRL
HNCRNTVTLL		EEALDQDRTA		LQKVKKSVKA		IYNSGQDHVQ		NEENYAQVLD
KFGSNFLSRD		NPDLGTAFVK		FSTLTKELST		LLKNLLQGLS		HNVIFTLDSL
LKGDLKGVKG		DLKKPFDKAW		KDYETKFTKI		EKEKREHAKQ		HGMIRTEITG
AEIAEEMEKE		RRLFQLQMCE		YLIKVNEIKT		KKGVDLLQNL		IKYYHAQCNF
FQDGLKTADK		LKQYIEKLAA		DLYNIKQTQD		EEKKQLTALR		DLIKSSLQLD
QKEDSQSRQG		GYSMHQLQGN		KEYGSEKKGY		LLKKSDGIRK		VWQRRKCSVK
NGILTISHAT		SNRQPAKLNL		LTCQVKPNAE		DKKSFDLISH		NRTYHFQAED
EQDYVAWISV		LTNSKEEALT		MAFRGEQSAG		ENSLEDLTKA		IIEDVQRLPG
NDICCDCGSS		EPTWLSTNLG		ILTCIECSGI		HREMGVHISR		IQSLELDKLG
TSELLLAKNV		GNNSFNDIME		ANLPSPSPKP		TPSSDMTVRK		EYITAKYVDH
RFSRKTCSTS		SAKLNELLEA		IKSRDLLALI		QVYAEGVELM		EPLLEPGQEL
GETALHLAVR		TADQTSLHLV		DFLVQNCGNL		DKQTALGNTV		LHYCSMYSKP
ECLKLLLRSK		PTVDIVNQAG		ETALDIAKRL		KATQCEDLLS		QAKSGKFNPH
VHVEYEWNLR		QEEIDESDDD		LDDKPSPIKK		ERSPRPQSFC		HSSSISPQDK
LALPGFSTPR		DKQRLSYGAF		TNQIFVSTST		DSPTSPTTEA		PPLPPRNAGK
GPTGPPSTLP		LSTQTSSGSS		TLSKKRPPPP		PPGHKRTLSD		PPSPLPHGPP
NKGAVPWGND		GGPSSSSKTT		NKFEGLSQQS		STSSAKTALG		PRVLPKLPQK
VALRKTDHLS		LDKATIPPEI		FQKSSQLAEL		PQKPPPGDLP		PKPTELAPKP
QIGDLPPKPG		ELPPKPQLGD		LPPKPQLSDL		PPKPQMKDLP		PKPQLGDLLA
KSQTGDVSPK		AQQPSEVTLK		SHPLDLSPNV		QSRDAIQKQA		SEDSNDLTPT
LPETPVPLPR		KINTGKNKVR		RVKTIYDCQA		DNDDELTFIE		GEVIIVTGEE
DQEWWIGHIE		GQPERKGVFP		VSFVHILSD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як біогенез та деградація війок, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kaieda S., Matsui C., Mimori-Kiyosue Y., Ikegami T. (2010). Structural basis of the recognition of the SAMP motif of adenomatous polyposis coli by the Src-homology 3 domain. Biochemistry. 49: 5143—5153. PMID 20509626 DOI:10.1021/bi100563z

Див. також

• Хромосома 8