SBF2

білок-кодуючий ген Homo Sapiens

SBF2 (англ. SET binding factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 849 амінокислот, а молекулярна маса — 208 464[5].

SBF2
Ідентифікатори
Символи SBF2, CMT4B2, DENND7B, MTMR13, SET binding factor 2
Зовнішні ІД OMIM: 607697 MGI: 1921831 HomoloGene: 41810 GeneCards: SBF2
Пов'язані генетичні захворювання
рак підшлункової залози, Charcot-Marie-Tooth disease type 4B2[1]
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_030962
NM_001386339
NM_001386342
NM_177324
NM_178769
RefSeq (білок)
NP_112224
NP_796298
NP_001391316
NP_001391317
NP_001391318
Локус (UCSC) Хр. 11: 9.78 – 10.3 Mb Хр. 7: 109.91 – 110.21 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MARLADYFIVVGYDHEKPGSGEGLGKIIQRFPQKDWDDTPFPQGIELFCQ
PGGWQLSRERKQPTFFVVVLTDIDSDRHYCSCLTFYEAEINLQGTKKEEI
EGEAKVSGLIQPAEVFAPKSLVLVSRLYYPEIFRACLGLIYTVYVDSLNV
SLESLIANLCACLVPAAGGSQKLFSLGAGDRQLIQTPLHDSLPITGTSVA
LLFQQLGIQNVLSLFCAVLTENKVLFHSASFQRLSDACRALESLMFPLKY
SYPYIPILPAQLLEVLSSPTPFIIGVHSVFKTDVHELLDVIIADLDGGTI
KIPECIHLSSLPEPLLHQTQSALSLILHPDLEVADHAFPPPRTALSHSKM
LDKEVRAVFLRLFAQLFQGYRSCLQLIRIHAEPVIHFHKTAFLGQRGLVE
NDFLTKVLSGMAFAGFVSERGPPYRSCDLFDELVAFEVERIKVEENNPVK
MIKHVRELAEQLFKNENPNPHMAFQKVPRPTEGSHLRVHILPFPEINEAR
VQELIQENVAKNQNAPPATRIEKKCVVPAGPPVVSIMDKVTTVFNSAQRL
EVVRNCISFIFENKILETEKTLPAALRALKGKAARQCLTDELGLHVQQNR
AILDHQQFDYIIRMMNCTLQDCSSLEEYNIAAALLPLTSAFYRKLAPGVS
QFAYTCVQDHPIWTNQQFWETTFYNAVQEQVRSLYLSAKEDNHAPHLKQK
DKLPDDHYQEKTAMDLAAEQLRLWPTLSKSTQQELVQHEESTVFSQAIHF
ANLMVNLLVPLDTSKNKLLRTSAPGDWESGSNSIVTNSIAGSVAESYDTE
SGFEDSENTDIANSVVRFITRFIDKVCTESGVTQDHIKSLHCMIPGIVAM
HIETLEAVHRESRRLPPIQKPKILRPALLPGEEIVCEGLRVLLDPDGREE
ATGGLLGGPQLLPAEGALFLTTYRILFRGTPHDQLVGEQTVVRSFPIASI
TKEKKITMQNQLQQNMQEGLQITSASFQLIKVAFDEEVSPEVVEIFKKQL
MKFRYPQSIFSTFAFAAGQTTPQIILPKQKEKNTSFRTFSKTIVKGAKRA
GKMTIGRQYLLKKKTGTIVEERVNRPGWNEDDDVSVSDESELPTSTTLKA
SEKSTMEQLVEKACFRDYQRLGLGTISGSSSRSRPEYFRITASNRMYSLC
RSYPGLLVVPQAVQDSSLPRVARCYRHNRLPVVCWKNSRSGTLLLRSGGF
HGKGVVGLFKSQNSPQAAPTSSLESSSSIEQEKYLQALLNAVSVHQKLRG
NSTLTVRPAFALSPGVWASLRSSTRLISSPTSFIDVGARLAGKDHSASFS
NSSYLQNQLLKRQAALYIFGEKSQLRNFKVEFALNCEFVPVEFHEIRQVK
ASFKKLMRACIPSTIPTDSEVTFLKALGDSEWFPQLHRIMQLAVVVSEVL
ENGSSVLVCLEEGWDITAQVTSLVQLLSDPFYRTLEGFQMLVEKEWLSFG
HKFSQRSSLTLNCQGSGFAPVFLQFLDCVHQVHNQYPTEFEFNLYYLKFL
AFHYVSNRFKTFLLDSDYERLEHGTLFDDKGEKHAKKGVCIWECIDRMHK
RSPIFFNYLYSPLEIEALKPNVNVSSLKKWDYYIEETLSTGPSYDWMMLT
PKHFPSEDSDLAGEAGPRSQRRTVWPCYDDVSCTQPDALTSLFSEIEKLE
HKLNQAPEKWQQLWERVTVDLKEEPRTDRSQRHLSRSPGIVSTNLPSYQK
RSLLHLPDSSMGEEQNSSISPSNGVERRAATLYSQYTSKNDENRSFEGTL
YKRGALLKGWKPRWFVLDVTKHQLRYYDSGEDTSCKGHIDLAEVEMVIPA
GPSMGAPKHTSDKAFFDLKTSKRVYNFCAQDGQSAQQWMDKIQSCISDA

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.

Література

ред.
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Robinson F.L., Dixon J.E. (2005). The phosphoinositide-3-phosphatase MTMR2 associates with MTMR13, a membrane-associated pseudophosphatase also mutated in type 4B Charcot-Marie-Tooth disease. J. Biol. Chem. 280: 31699—31707. PMID 15998640 DOI:10.1074/jbc.M505159200
  • Yoshimura S., Gerondopoulos A., Linford A., Rigden D.J., Barr F.A. (2010). Family-wide characterization of the DENN domain Rab GDP-GTP exchange factors. J. Cell Biol. 191: 367—381. PMID 20937701 DOI:10.1083/jcb.201008051

Примітки

ред.
  1. Захворювання, генетично пов'язані з SBF2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2135 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  5. UniProt, Q86WG5 (англ.) . Архів оригіналу за 20 січня 2018. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

ред.