Водич за фармакологију
 | |
|---|---|
| Контент | |
| Опис | Онлајн портал са отвореним приступом за фхармаколошке информације о свим биолошким метама лекова на рецепат |
| Типови података | Номенклатура биолошких мета, фармаколошки подаци, структуре лиганда |
| Организам | Човек, миш, пацов |
| Контакт | |
| Приступ | |
| Веб страница | www |
| Алати | |
| Разно | |
| Верзије | Контент се ажурира приближно тромесечно (и.е. 2016.2 је урађено у марту) |
| Садашња смерница | Мануал, унутар организације |
ИУПХАР/БПС Водич за фрамакологију је вебсајт отвореног приступа, који делује као портал информација о биолошким метама лиценцираних лекова и других малих молекула. Водич за пармакологију (чија стандардна скраћеницапри је ГтоПдб) је развијен као заједнички подухват Међународне уније за базичну и клиничку фармакологију (ИУПХАР) и Британског фармаколошког друштва (БПС). Овај пројекат замењује и проширује оригиналну 2009 ИУПХАР базу података (стандардна скраћеница ИУПХАР-ДБ). Циљ Водича за фармакологију је да пружи концизни преглед свих фармаколошких циљева, и да их учини доступним свим члановима научних и клиничких заједница и заинтерасованог јавног мњења, са линковима ка детаљима за одабрани сет циљева. Подаци обухватају фармаколошке податке, номенклатуру циљева и гена, као и обрађене хемијске информације о лигандима. Дати су прегледи и кцоментари о свакој фамилији циљева, са линковима ка кључним референцама.
Залеђина и развој
[уреди | уреди извор]Водич за фармакологију је инитицајално био доступан на Интернету у децембру 2011, а додатни материјал је објављен јула 2012. Водич одржава тим кустоса базираних на Единбуршком универзитету. Водич за фармакологију је развила међународна мрежа сарадника, која обухвата едиторе Концизног видича за фармакологију. Као и у случају оригиналног ИУПХАР-ДБ, Комитет за номенклатуру рецептора и класификацију лекова (НЦ-ИУПХАР) Међународне уније за базну и клиничку фармакологију (ИУПХАР), делује као научни саветодавини и едиториски одбор за базу података. Мрежа од преко 700 специализованих саветника (организованих у ~60 поткомитета) доприноси експертизама и подацима. Тренутни принципални истраживач и носилац стипендије ГтоПдб пројекта је проф. Јамие А. Давиес. Развој и објављивање прве верзије ГтоПдб 2012. године је описан у уводнику објављеном у Бритисх Јоурнал оф Пхармацологy под насловом енгл. Guide to Pharmacology.org- an update.[1] ИУПХАР-ДБ се више не развија и садржај тог сајта је сад доступан у Водичу за фармакологију (ИУПХАР-ДБ линкови би требало да буду преусмерени).
Контент и својства
[уреди | уреди извор]Следеће циљне групе су тренутно уврштене у Водич за фармакологију:
- Каталитички рецептори
- Ензими
- Г протеин-спрегнути рецептори
- Јонски канали
- Киназе
- Нуклеарни рецептори
- Транспортери
- Друге протеинске мете, укључујући протеине који везују масне киселине, сигма рецепторе и адипонектинске рецепторе
Информације о групама мета су подељене у фамилије на основу класификације, са засебним странама података за сваку фамилију. Унутар сваке стране, биолошке мете су организоване у спискове табела, при чему свака табела садржи протеинску и генску номенклатуру мете са везама ка базама података генске номенклатуре. Одабрани лиганди су наведени заједно са вредностима њихових активности на датој мети, укључујући агонисте, антагонисте, инхибиторе и радиолиганде. Фармаколошки подаци и референце су дати, и за сваки лиганд је наведен хиперлинк ка страници лиганда која садржи номенклатуру и хемијску структуру или пептидну секвенцу, заједно са синонимима и релевантним линковима ка базама података. Водич за фармакологију исто тако садржи списак свих молекула лиганда који су укључен у сајт. Списак је подељен у категорије, као што су мали органски молекули (укључујући сисарске метаболите, хормоне и неуротрансмитере), синтетичке органске молекуле, природне продукте, пептиде, неорганске молекуле и антитела. Комплетан списак свих одобрених лекова који су уврштени у вебсајт је такође доступан са списка лиганда. У току је проширење Водича за фармакологију којим се уносе клинички подаци о метама и лигандима, као и образовни ресурси.
Функције претраге вебсајта обухватају брзе и напредне опције претраге, и претраге рецептора и лиганда, укључујући подршку за структуре лиганда користећи хемијске структуре. Друга својства су вести 'врућих тема' и списак недавно дефинисаних парова рецептора и лиганда.
Сажети водич за фармакологију
[уреди | уреди извор]Водич за фармакологију обухвата онлајн базу података отвореног приступа Концизног водича за фармакологију, који се раније звао "Водич за рецепторе и канале"[2] Она је доступна у ХТМЛ, ПДФ и штампаном формату. Штампани преглед ове онлајн базе података је објављен као Концизни водич за фармакологију 2015/2016,[3] у облику серије чланака који су полугодишни додаци у Бритисх Јоурнал оф Пхармацологy.
Базе података
[уреди | уреди извор]Водич за фармакологију садржи линкове на низ релевантних ресурса широм страница о метама и лигандима. То важи за концизне, као и детаљне прегледе. Многи од тих ресурса одржавају реципрочне линкове на релевантне стране Водича за фрмакологију.
- ХУГО комитет за генску номенклатуру
- Геномска информатика миша
- Геномска база података пацова
- Енсембл
- УниПрот
- Ентрез
- ПубЦхем
- ЦхемСпидер
- ЦхЕМБЛ
- ЦхЕБИ
- КЕГГ
- Менделовско наслеђивање код човека (ОМИМ)
- ДругБанк
- Протеинска банка података (ПДБ)
Види још
[уреди | уреди извор]Референце
[уреди | уреди извор]- ^ Алеxандер, С. П.; Бенсон, Х. Е.; Давенпорт, А.; Матхие, А.; МцГратх, I. Ј.; Паwсон, А. Ј.; Петерс, Ј. А.; Схарман, Ј. L.; Спеддинг, M.; Хармар, А. Ј. (2012). „ГуидеТоПхармацологy.орг - ан упдате”. Бритисх Јоурнал оф Пхармацологy. 167 (4): 697—698. ПМЦ 3575771
. ПМИД 23003568. дои:10.1111/ј.1476-5381.2012.02141.x.
- ^ Алеxандер, СП; Матхие, А; Петерс, ЈА (2011). „Гуиде то Рецепторс анд Цханнелс (ГРАЦ), 5тх едитион.”. Бритисх Јоурнал оф Пхармацологy. 164 Суппл 1: С1—324. ПМИД 22040146. дои:10.1111/ј.1476-5381.2011.01649_1.x.
- ^ Алеxандер, С.П.Х.; et al. (2015). „Тхе Цонцисе Гуиде то ПХАРМАЦОЛОГY”. Бритисх Јоурнал оф Пхармацологy. 172: 5729—5743. дои:10.1111/бпх.13347.
