David Goodsell
David Goodsell | ||||
---|---|---|---|---|
Goodsell bij een bijeenkomst van National Science Teachers Association in 2013
| ||||
Persoonlijke gegevens | ||||
Geboortedatum | 1961 | |||
Wetenschappelijk werk | ||||
Vakgebied | Structuurbiologie, wetenschappelijke illustratie | |||
Promotor | Richard E. Dickerson[1] | |||
Alma mater | Universiteit van Californië | |||
Instituten | Rutgers-universiteit (2016–) | |||
Officiële website | ||||
|
David S. Goodsell is een Amerikaans biochemicus en structuurbioloog. Hij is universitair hoofddocent aan het Scripps Research Institute en onderzoeksprofessor aan de Rutgers-universiteit, New Jersey.[2] Goodsell is voornamelijk bekend om zijn illustraties (veelal aquarellen) van de moleculaire organisatie van cellen en virussen.[3]
Opleiding en onderzoek
[bewerken | brontekst bewerken]David Goodsell studeerde biologie en scheikunde aan de Universiteit van Californië, Irvine.[4] Nadat hij deze Bachelor of Science had voltooid volgde hij een PhD aan de Universiteit van Californië, Los Angeles. Hij deed onderzoek daar naar röntgenkristallografie van DNA. In 1987 voltooide hij zijn PhD-traject.
Na het afronden van zijn doctoraat werkte Goodsell als structuurbioloog bij het Scripps Research Institute (met een tussenliggende periode van twee jaar aan de Universiteit van Californië in 1992-94).[4] Hij paste zijn kennis van structuurbiologie en moleculaire dynamica toe op eiwit-eiwitinteracties en computationele geneesmiddelen-ontwikkeling, met name op het gebied van lead optimization en structuur-activiteitsrelaties.
Goodsell is een ontwikkelaar van AutoDock, een veelgebruikt programma om molecular docking (de manier waarop moleculen met elkaar binden) te onderzoeken.[5] Zijn belangrijkste onderzoeksgebieden zijn resistentie tegen hiv-medicijnen en de structuur en functie van bacteriële cellen.[6]
Illustraties
[bewerken | brontekst bewerken]Goodsell heeft een kenmerkende stijl van wetenschappelijke illustratie ontwikkeld. Hij begon al vroeg in zijn jeugd met schilderen. Tijdens zijn universitaire studie raakte Goodsell geïnteresseerd in wetenschappelijke illustratie. Hij stelde zich ten doel de moleculaire structuren zoals eiwitten en DNA met behulp van tekeningen tastbaar te maken.[7]
De stijl van Goodsell typeert zich door de zeer vlakke schakeringen en eenvoudige kleurenschema's.[8] Hoewel zijn illustraties een vereenvoudigde weergave zijn van het onderwerp, worden de belangrijke kenmerken in realistische termen behouden.[9][10] Zijn illustraties vallen grofweg uiteen in twee categorieën: individuele eiwitten en moleculaire landschappen.
Goodsells illustraties van individuele eiwitten zijn meestal computergegenereerde, ruimtevullende representaties van eiwitmoleculen, vaak met duidelijk weergegeven bindingsplaatsen en cofactoren. Zijn illustraties van het inwendige van cellen (moleculaire landschappen) zijn met de hand geschilderde aquarellen. Dit zijn doorsnedes van cellen met sterk vereenvoudigde eiwitstructuren in een platte stijl om de algehele organisatie vast te leggen zonder overweldigende details. De moleculaire landschappen hebben vaak een vergroting van 1.000.000x.[11] De schilderijen delen hierdoor een consistente stijl, waardoor ze eenvoudig en intuïtief geïnterpreteerd kunnen worden.[12]
De tekeningen van Goodsell zijn gepubliceerd in de serie "Molecule of the Month" door de Protein Data Bank, een grote database van eiwitstructuren.[7] Zijn illustraties zijn inmiddels gebruikt in leermiddelen, in studieboeken, in wetenschappelijke publicaties en als omslag voor wetenschappelijke tijdschriften.[13]
Bibliografie
[bewerken | brontekst bewerken]Naast zijn bezigheden als wetenschappelijk illustrator is Goodsell de auteur van verschillende wetenschappelijke boeken met de nadruk op visualisatie van cellen en moleculen:[9]
- Atomic Evidence: Seeing the Molecular Basis of Life (Springer International, 2016)
- Bionanotechnology: Lessons from Nature (J. Wiley and Sons, 2004)
- Our Molecular Nature: The Body's Motors, Machines, and Messages (Springer-Verlag, 1996)
- The Machinery of Life (Springer-Verlag, 1993).
Externe links
[bewerken | brontekst bewerken]- (en) Molecule of the Month
- (en) David Goodsell op CCSB
Referenties
- ↑ https://vivo.scripps.edu/display/GoodsellDavid.
- ↑ (en) Profile: David Goodsell. researchwithrutgers.com. Rutgers University. Gearchiveerd op 26 november 2020. Geraadpleegd op 29 augustus 2020.
- ↑ (en) (2013). David Goodsell and the RCSB PDB's Molecule of the Month (RCSB). Gearchiveerd van origineel op 16 september 2020. Geraadpleegd op 29 augustus 2020.
- ↑ a b (en) CV of Goodsell, David. vivo.scripps.edu. Gearchiveerd op 29 september 2020. Geraadpleegd op 30 augustus 2020.
- ↑ (en) Sousa, Sérgio Filipe, Fernandes, Pedro Alexandrino, Ramos, Maria João (2006). Protein–ligand docking: Current status and future challenges. Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics 65 (1): 15–26. PMID 16862531. DOI: 10.1002/prot.21082.
- ↑ (en) Goodsell, David, Goodsell Home Page: Science. scripps.edu. Gearchiveerd op 1 september 2020. Geraadpleegd op 30 augustus 2020.
- ↑ a b (en) Miller, Mary K., Interview with David Goodsell. exploratorium.edu. Exploratorium Magazine. Gearchiveerd op 21 april 2021. Geraadpleegd op 31 augustus 2020.
- ↑ (en) Zackowitz, Maggie, It's The Zika Virus In Action, Drawn By A Scientist-Artist. NPR.org (28 mei 2016). Gearchiveerd op 11 april 2021. Geraadpleegd op 31 augustus 2020.
- ↑ a b (en) Cohen, Jon, Meet the scientist painter who turns deadly viruses into beautiful works of art. Science (11 april 2019). Gearchiveerd op 25 september 2020. Geraadpleegd op 31 augustus 2020.
- ↑ (en) Goodsell, David S., Franzen, Margaret A., Herman, Tim (2018). From Atoms to Cells: Using Mesoscale Landscapes to Construct Visual Narratives. Journal of Molecular Biology 430 (21): 3954–3968. ISSN: 0022-2836. PMC 6186495. DOI: 10.1016/j.jmb.2018.06.009.
- ↑ (en) Shikov, Sergei, David Goodsell: The master of mol art. www.asbmb.org. American Society for Biochemistry and Molecular Biology Today (2011). Gearchiveerd op 11 juli 2019. Geraadpleegd op 31 augustus 2020.
- ↑ (en) Goodsell, David (2016). Cellular Landscapes in Watercolor. Journal of Biocommunication 40 (1). DOI: 10.5210/jbc.v40i1.6627.
- ↑ (en) Söderqvist, Thomas (2010). Selling point: David Goodsell. Nature Medicine 16 (9): 943. DOI: 10.1038/nm0910-943.