Os primeiros capítulos da trama giram em torno do festival de música Beach Stage Festival, em uma praia do Ceará. Os personagens interagem com os novos e todos retornam ao colégio Múltipla Escolha, que passa por uma crise financeira.
A política do Múltipla Escolha muda, e o colégio deixa de ser um internato. Os alunos temem ter que se separar, mas Peralta aluga um apartamento perto da escola e os convida para dividir o espaço.
As participações especiais na temporada 2009 contaram com as bandas Agnela e Capital Inicial, os cantores Ja Rule, Cláudia Leitte e Wanessa Camargo, o ator Erik Marmo e o diretor Jorge Fernando.
A música 'Bem Ou Mal', de Nx Zero com participação especial de Túlio Dek, era o tema de abertura de 'Malhação 2009'.
Autoria: Patrícia Moretzsohn, Glória Barreto, Alessandra Poggi, Cláudio Lisboa, Ricardo Tiezzi e Chico Soares | Redação final: Patrícia Moretzsohn | Direção-geral: Marcos Paulo.