Malhação continuou a ser gravado nos estúdios da Cinédia, no Rio de Janeiro, mas os cenários foram completamente modificados e reconstruídos de forma a permitir que um ambiente fosse rapidamente transformado em outro.

Entre as novidades, havia uma sauna a vapor, com paredes de mosaicos e detalhes em fórmica; um fliperama com quatro máquinas de pinball; um restaurante; um sushi-bar; uma parede de alpinismo e uma rampa de patinação.

A sala de artes marciais das aulas de Dado (Cláudio Heinrich) ganhou uma atmosfera oriental, com flâmulas com ideogramas japoneses. Já a nova piscina da academia foi projetada para permitir que fossem feitos planos de sequência ou ângulos que mostrassem a movimentação dos atores dentro da água.

Entre as participações especiais que passaram pela segunda temporada de Malhação estão a cantora canadense Alanis Morrissete, e os atores Ana Luiza Barros, Antonio Calloni, Castro Gonzaga, Maria Ribeiro, Nívea Stelmann, Oscar Magrini, Patrick de Oliveira, Pedro Brício, Tatiane Goulart, Thiago Fragoso, Thierry Figueira, Viviane Ribeiro, Xuxa Lopes e outros.