運転系統 ： 東海道線 - 横須賀線 - 湘南新宿ライン - 上野東京ライン - 京浜東北線 - 山手線 - 相鉄線直通支線 ： 品鶴線貨物線 ： 芝浦線（廃止） - 東京市場線（廃止） - 東海道貨物線 - 高島線
静岡地区 - 名古屋地区 - 垂井線支線 ： 美濃赤坂線 - 新垂井線貨物線 ： 沼津港線（廃止）- 古渡線（廃止） - 名古屋港線（廃止）- 西名古屋港線（名臨高に移管） - 南方貨物線（未成） - 稲沢線
琵琶湖線 - JR京都線 - JR神戸線 / 京阪神快速 - 京阪神緩行線貨物線 ： 浜大津線（廃止） - 山陰連絡線（廃止） - 京都市場線（廃止） - 北方貨物線 - 梅田貨物線 - 大阪貨物ターミナル線 - 尼崎市場線（廃止） - 神戸臨港線（廃止）
旧東海道本線 ： 根岸線（横浜・桜木町間） - 御殿場線 - 奈良線（稲荷・京都間） - 清水港線（旧貨物線、廃止）- 阪急京都本線・千里線（吹田・淡路・南方間）新幹線 ： 東海道新幹線 - 山陽新幹線（新大阪・新神戸間）その他の路線 ： 横須賀線（大船・横須賀間） - 武豊線 - 大津線（廃止） - JR東西線(線増扱い) - その他東海道線に含まれる路線
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