Wikipedia

Nukleosida trifosfat

Sebuah nukleosida trifosfat adalah molekul yang mengandung basa nitrogen terikat pada gula 5-karbon (baik ribosa atau deoksiribosa), dengan tiga gugus fosfat terikat pada gula.[1]Ini adalah contoh nukleotida. Mereka adalah prekursor molekul DNA dan RNA, yang merupakan rantai nukleotida yang dibuat melalui proses replikasi dan transkripsi DNA.[2] Trifosfat nukleosida juga berfungsi sebagai sumber energi untuk reaksi seluler [3] dan terlibat dalam jalur sinyal.[4]

Nukleosida trifosfat tidak dapat diserap dengan baik, sehingga biasanya disintesis di dalam sel.[5] Jalur sintesis berbeda tergantung pada nukleosida trifosfat spesifik yang dibuat, tetapi mengingat banyak peran penting nukleosida trifosfat, sintesis diatur secara ketat dalam semua kasus.[6] Analog nukleosida juga dapat digunakan untuk mengobati infeksi virus.[7] Misalnya, azidothymidine (AZT) adalah analog nukleosida yang digunakan untuk mencegah dan mengobati HIV/AIDS.[8]

Penamaan

sunting

Istilah nukleosida mengacu pada basa nitrogen terkait dengan gula 5-karbon (baik ribosa atau deoksiribosa).[9] Nukleutida adalah nukleosida yang terikat secara kovalen dengan satu atau lebih gugus fosfat.[10] Untuk memberikan informasi tentang jumlah fosfat, nukleotida dapat disebut sebagai nukleosida (mono, di, atau tri) fosfat. Jadi, nukleosida trifosfat adalah jenis nukleotida.[11]

Nukleotida biasanya disingkat dengan 3 huruf (4 atau 5 untuk deoksi- atau dideoksi-nukleotida). Huruf pertama menunjukkan identitas basa nitrogen (misalnya A untuk adenin, G untuk guanin), huruf kedua menunjukkan jumlah fosfat (mono, di, tri), dan huruf ketiga adalah P, singkatan dari fosfat.[12] Nukleosida trifosfat yang mengandung ribosa sebagai gula secara konvensional disingkat sebagai NTP, sedangkan nukleosida trifosfat yang mengandung deoksiribosa sebagai gula disingkat dNTP. Misalnya, dATP adalah singkatan dari deoxyribose adenosine triphosphate. NTP adalah bahan penyusun RNA, dan dNTP adalah bahan penyusun DNA.[13]

Karbon gula dalam nukleosida trifosfat diberi nomor di sekitar cincin karbon mulai dari karbonil asli gula. Secara konvensional, nomor karbon dalam gula diikuti dengan simbol prima (‘) untuk membedakannya dari karbon basa nitrogen. Basa nitrogen dihubungkan dengan karbon 1 'melalui ikatan glikosidik, dan gugus fosfat terikat secara kovalen dengan karbon 5'.[14] Gugus fosfat pertama yang terikat dengan gula disebut -fosfat, yang kedua adalah -fosfat, dan yang ketiga adalah -fosfat.[15]

Sintesis DNA dan RNA

sunting

Proses seluler replikasi dan transkripsi DNA melibatkan sintesis DNA dan RNA, masing-masing. Sintesis DNA menggunakan dNTP sebagai substrat, sedangkan sintesis RNA menggunakan NTP sebagai substrat.[16] NTP tidak dapat dikonversi langsung ke dNTP. DNA mengandung empat basa nitrogen yang berbeda: adenin, guanin, sitosin, dan timin. RNA juga mengandung adenin, guanin, dan sitosin, tetapi menggantikan timin dengan urasil.[17] Dengan demikian, sintesis DNA membutuhkan dATP, dGTP, dCTP, dan dTTP sebagai substrat, sedangkan sintesis RNA membutuhkan ATP, GTP, CTP, dan UTP.

Sintesis asam nukleat dikatalisis oleh DNA polimerase atau RNA polimerase masing-masing untuk sintesis DNA dan RNA.[18] Enzim-enzim ini secara kovalen menghubungkan gugus -OH bebas pada karbon 3' dari rantai nukleotida yang sedang tumbuh ke -fosfat pada karbon 5' NTP berikutnya, melepaskan gugus - dan -fosfat sebagai pirofosfat (PPi).[19] Ini menghasilkan hubungan fosfodiester antara dua (d)NTP. Pelepasan PPi memberikan energi yang diperlukan untuk terjadinya reaksi.[19] Penting untuk dicatat bahwa sintesis asam nukleat terjadi secara eksklusif dalam arah 5 'ke 3'.

Referensi

sunting
  1. ^ "PLoS Genetics Issue Image | Vol. 4(11) November 2008". PLoS Genetics. 4 (11): ev04.i11. 2008-11-28. doi:10.1371/image.pgen.v04.i11. ISSN 1553-7404. 
  2. ^ The nucleic acids. Volume III. Erwin Chargaff, J. N. Davidson. New York: Academic Press. 1960. ISBN 978-0-323-14477-3. OCLC 820457150. 
  3. ^ "PS1 Original focuses on increased efficiency". World Pumps. 2017 (11): 11. 2017-11. doi:10.1016/s0262-1762(18)30019-1. ISSN 0262-1762. 
  4. ^ Seybold, Patricia (2011-03). "Nature's Scitable: Going Mobile". Boston, MA. 
  5. ^ Melignomon eisentrauti Louette. Yellow-footed Honeyguide; Eisentraut’s Honeyguide; Coe’s Honeyguide. Indicateur de Eisentraut. Academic Press Limited. 
  6. ^ Wyngaarden, James B. (1976-01). "Regulation of purine biosynthesis and turnover". Advances in Enzyme Regulation. 14: 25–42. doi:10.1016/0065-2571(76)90006-6. ISSN 0065-2571. 
  7. ^ Galmarini, CM; Mackey, JR; Dumontet, C (2001-06). "Nucleoside analogues: mechanisms of drug resistance and reversal strategies". Leukemia. 15 (6): 875–890. doi:10.1038/sj.leu.2402114. ISSN 0887-6924. 
  8. ^ "Grain Transportation Report, November 30, 2017". 2017-11-30. 
  9. ^ Carlyle, Thomas. CROWN-PRINCE RETRIEVED: LIFE AT CUSTRIN NOVEMBER 1730-FEBRUARY 1732. Cambridge: Cambridge University Press. hlm. 342–406. 
  10. ^ Secrist, Jack (2005-09-01). "John A. Montgomery, March 29, 1924–May 24, 2004". Nucleosides, Nucleotides & Nucleic Acids. 24 (10-12): 1387–1394. doi:10.1080/15257770500482340. ISSN 1525-7770. 
  11. ^ compiler., Favre, Henri A., compiler. Powell, Warren H., 1934- (2014). Nomenclature of Organic Chemistry : IUPAC Recommendations and Preferred Names 2013. Royal Society of Chemistry. ISBN 978-1-84973-306-9. OCLC 865143943. 
  12. ^ ASS, Editor (2009-02-09). "Asian Social Science, Vol. 4, No. 11, November, 2008". Asian Social Science. 4 (11). doi:10.5539/ass.v4n11p0. ISSN 1911-2025. 
  13. ^ "Figure 3—figure supplement 1. Comparison of LACV and HTNV-NP/NC, RNA-binding model". dx.doi.org. Diakses tanggal 2021-11-17. 
  14. ^ M., Kevin (2011-09-26). DNA Replication in Repair. InTech. 
  15. ^ Sepielli, Andrew (2013-01-24). "What to Do When You Don't Know What to Do When You Don't Know What to Do…". Noûs. 48 (3): 521–544. doi:10.1111/nous.12010. ISSN 0029-4624. 
  16. ^ Chargaff E (2012-12-02). The Nucleic Acids. Elsevier. ISBN 9780323144773. 
  17. ^ "Do You Know the Differences Between DNA and RNA?". ThoughtCo. Diakses tanggal 2017-11-11. 
  18. ^ "Difference Between DNA Polymerase and RNA Polymerase". 2011-12-24. Diakses tanggal 2017-11-11. 
  19. ^ a b Lodish H, Berk A, Zipursky SL, Matsudaira P, Baltimore D, Darnell J (2000). Nucleic Acid Synthesis. 
Diperoleh dari "https://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Nukleosida_trifosfat&oldid=22671599"