Idi na sadržaj

TIMM9

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
TIMM9
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

2BSK

Identifikatori
AliasiTIMM9
Vanjski ID-jeviOMIM: 607384 MGI: 1353436 HomoloGene: 40847 GeneCards: TIMM9
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 14 (čovjek)
Hrom.Hromosom 14 (čovjek)[1]
Hromosom 14 (čovjek)
Genomska lokacija za TIMM9
Genomska lokacija za TIMM9
Bend14q23.1Početak58,408,495 bp[1]
Kraj58,427,531 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 12 (miš)
Hrom.Hromosom 12 (miš)[2]
Hromosom 12 (miš)
Genomska lokacija za TIMM9
Genomska lokacija za TIMM9
Bend12 C2|12Početak71,169,947 bp[2]
Kraj71,183,458 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija vezivanje iona cinka
chaperone binding
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
protein homodimerization activity
vezivanje iona metala
transporter activity
Ćelijska komponenta mitochondrial inner membrane
mitochondrial intermembrane space
mitochondrial intermembrane space protein transporter complex
membrana
mitohondrija
TIM22 mitochondrial import inner membrane insertion complex
Biološki proces protein transport
protein insertion into mitochondrial inner membrane
protein targeting to mitochondrion
sluh
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)
NM_001304485
NM_001304486
NM_001304487
NM_001304488
NM_001304489

NM_001304490
NM_001304491
NM_012460

NM_001024853
NM_001024854
NM_001286203
NM_013896

RefSeq (bjelančevina)
NP_001291414
NP_001291415
NP_001291416
NP_001291417
NP_001291418

NP_001291419
NP_001291420
NP_036592

NP_001020024
NP_001020025
NP_001273132
NP_038924

Lokacija (UCSC)Chr 14: 58.41 – 58.43 MbChr 12: 71.17 – 71.18 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Podjedinica Tim9 mitohondrijske importne unutrašnjomembranske translokaze je enzim koji je kod ljudi kodiran genom TIMM9.[5][6][7]

TIMM9 pripada porodici evolucijski konzerviranih proteina, koji su organizirani u heterooligomerne komplekse u mitohondrijskom intermembranskom prostoru. Ovi proteini posreduju pri importu i inserciji proteina hidrofobne membrane u unutrašnju membranu mitohondrija.[7]

Analizom sekvenci i floorescentnom hibridizacijom in situ.[8] Bauer et al. (1999) lociraali su gen TIMM9 na hromosomu 14q21, analizom hibridne radijacije.[9]

Aminokiselinska sekvenca

[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 89 aminokiselina, a molekulska težina 10.378 Da[10].

1020304050
MAAQIPESDQIKQFKEFLGTYNKLTETCFLDCVKDFTTREVKPEETTCSE
HCLQKYLKMTQRISMRFQEYHIQQNEALAAKAGLLGQPR
Simboli

Kloniranje i ekspresija

[uredi | uredi izvor]

Pretražujući bazu podataka sa ljudskim i kvasac|S. pombe]] TIMM8A sekvenci kao upiti, Jin et al. (1999) identificirali su nekoliko novih članova porodice TIM, uključujući TIMM9. Protein TIMM9 sadrži 89 aminokiselina. Northern blot analiza otkrila je sveprisutnu ekspresiju transkripata TIMM9 od 1,2 i 2,4 kb u tkivima odraslih, s najvećom ekspresijom u skeletnim i srčanom mišiću i u gušterači.

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000100575 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000021079 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Jin H, Kendall E, Freeman TC, Roberts RG, Vetrie DL (Feb 2000). "The human family of Deafness/Dystonia peptide (DDP) related mitochondrial import proteins". Genomics. 61 (3): 259–67. doi:10.1006/geno.1999.5966. PMID 10552927.
  6. ^ Muhlenbein N, Hofmann S, Rothbauer U, Bauer MF (Mar 2004). "Organization and function of the small Tim complexes acting along the import pathway of metabolite carriers into mammalian mitochondria". J Biol Chem. 279 (14): 13540–6. doi:10.1074/jbc.M312485200. PMID 14726512.
  7. ^ a b "Entrez Gene: TIMM9 translocase of inner mitochondrial membrane 9 homolog (yeast)".
  8. ^ Jin et bal. (1999) mapirali su gen TIMM9 na hromosomu 14, pozicija 14q22.3-q24. Jin, H., Kendall, E., Freeman, T. C., Roberts, R. G., Vetrie, D. L. P. The human family of deafness/dystonia peptide (DDP) related mitochondrial import proteins. Genomics 61: 259-267, 1999. PubMed: 10552927
  9. ^ Bauer, M. F., Rothbauer, U., Muhlenbein, N., Smith, R. J. H., Gerbitz, K.-D., Neupert, W., Brunner, M., Hofmann, S. The mitochondrial TIM22 preprotein translocase is highly conserved throughout the eukaryotic kingdom. FEBS Lett. 464: 41-47, 1999. PubMed: 10611480
  10. ^ "UniProt, Q9Y5J7". Pristupljeno 11. 9. 2017.

Dopunska literatura

[uredi | uredi izvor]

Vanjski linkovi

[uredi | uredi izvor]