Subordinada a Capitania dos Portos de São Paulo, a Delegacia de São Sebastião localiza-se no litoral Norte do Estado de São Paulo. O Porto de São Sebastião apresenta condições excepcionais de calado, com profundidades entre 16 e 40 metros e abrigo a navegação. Dada a sua configuração natural, é considerado a terceira melhor região portuária do mundo.
O Terminal Marítimo Almirante Barroso (TEBAR), da Petrobrás, situado no canal de São Sebastião, é o maior terminal de graneis líquidos da América Latina.