Аденозинтрифосфат

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Версия для печати больше не поддерживается и может содержать ошибки обработки. Обновите закладки браузера и используйте вместо этого функцию печати браузера по умолчанию.
Аденозинтрифосфат
Изображение химической структуры
Изображение молекулярной модели
Изображение молекулярной модели
Общие
Сокращения АТФ (англ. ATP)
Хим. формула C10H16N5O13P3
Физические свойства
Молярная масса 507,18 г/моль
Термические свойства
Температура
 • разложения 144 °C[1]
Химические свойства
Растворимость
 • в воде растворимость в воде (20 °C) - 5 г/100 мл
Классификация
Рег. номер CAS 56-65-5
PubChem
Рег. номер EINECS 200-283-2
SMILES
InChI
ChEBI 15422
ChemSpider
Приведены данные для стандартных условий (25 °C, 100 кПа), если не указано иное.
Логотип Викисклада Медиафайлы на Викискладе
3D-молекула аденозинтрифосфорной кислоты (GIF)

Аденозинтрифосфа́т (ион), Аденозинтрифосфорная кислота, АТФ (англ. АТР) — нуклеозидтрифосфат, играющий основную роль в обмене энергии в клетках живых организмов. Это универсальный источник энергии для всех биохимических процессов, протекающих в живых системах[2].

Хотя в биохимических процессах используются и другие фосфорилированные нуклеотиды с запасом энергии в молекуле, только АТФ является универсальной молекулой для всех процессов накопления и использования энергии в клетках[2].

История исследований

Аденозинтрифосфорная кислота была выделена в 1929 году группой немецких учёных Карлом Ломаном, Сайрусом Фиске и Йеллапрагадой Суббарао[3].

В 1941 году Фриц Липман показал, что АТФ является основным переносчиком энергии в клетке[4].

В 2018–2022 годах группа биохимиков под руководством британского учёного Ника Лейна (англ. Nick Lane) выяснила, что синтез АТФ из аденозиндифосфата (АДФ) и ацетилфосфата возможен в предбиологических условиях, в которых синтезируется и сам ацетилфосфат, причём это единственная «энергетическая» молекула биохимических процессов, синтез которой не требует ферментов[2].

Структура

АТФ состоит из аденина, присоединенного 9-атомом азота к 1'-атому углерода сахара (рибозы), который, в свою очередь, присоединен к 5'-атому углерода сахара к трифосфатной группе. Во многих реакциях, связанных с метаболизмом, адениновые и сахарные группы остаются неизменными, но трифосфат превращается в ди- и монофосфат, давая соответственно производные АДФ и АМФ. Три фосфорильные группы помечены как альфа (α), бета (β) и, для концевого фосфата, гамма (γ).

В нейтральном растворе ионизированный АТФ существует в основном в виде ATP4−, с небольшой долей ATP3−[5].

Связывание катионов металлов с АТФ

Будучи полианионной и содержащей потенциально хелатирующую полифосфатную группу, АТФ связывает катионы металлов с высоким сродством. Константа связывания для Mg2+ равна (9 554)[6]. Связывание двухвалентного катиона, почти всегда магния, сильно влияет на взаимодействие АТФ с различными белками. Из-за силы взаимодействия АТФ-Mg2+ АТФ существует в клетке в основном в виде комплекса с Mg2+, связанного с фосфатно-кислородными центрами[5][7].

Второй ион магния имеет решающее значение для связывания АТФ в домене киназы[8]. Присутствие Mg2+ регулирует активность киназы[9].

Химические свойства

Структура аденозинтрифосфорной кислоты

Систематическое наименование АТФ:

9-β-D-рибофуранозиладенин-5'-трифосфат, или
9-β-D-рибофуранозил-6-амино-пурин-5'-трифосфат.

Химически АТФ представляет собой трифосфорный эфир аденозина, который является производным аденина и рибозы.

Пуриновое азотистое основание — аденин — соединяется β-N-гликозидной связью с 1'-углеродом рибозы. К 5'-углероду рибозы последовательно присоединяются три молекулы фосфорной кислоты, обозначаемые соответственно буквами: α, β и γ.

АТФ относится к так называемым макроэргическим соединениям, то есть к химическим соединениям, содержащим связи, при гидролизе которых происходит освобождение значительного количества энергии. Гидролиз макроэргических связей молекулы АТФ, сопровождаемый отщеплением 1 или 2 остатков фосфорной кислоты, приводит к выделению, по различным данным, от 40 до 60 кДж/моль.

АТФ + H2O → АДФ + H3PO4 + энергия
АТФ + H2O → АМФ + H4P2O7 + энергия

Высвобождённая энергия используется в разнообразных процессах, протекающих с затратой энергии.

Роль в организме

Главная роль АТФ в организме связана с обеспечением энергией многочисленных биохимических реакций. Являясь носителем двух высокоэнергетических связей, АТФ служит непосредственным источником энергии для множества энергозатратных биохимических и физиологических процессов. Всё это реакции синтеза сложных веществ в организме: осуществление активного переноса молекул через биологические мембраны, в том числе и для создания трансмембранного электрического потенциала; осуществления мышечного сокращения.

Помимо энергетической, АТФ выполняет в организме ещё ряд других не менее важных функций:

  • Вместе с другими нуклеозидтрифосфатами АТФ является исходным продуктом при синтезе нуклеиновых кислот.
  • Кроме того, АТФ отводится важное место в регуляции множества биохимических процессов. Являясь аллостерическим эффектором ряда ферментов, АТФ, присоединяясь к их регуляторным центрам, усиливает или подавляет их активность.
  • АТФ является также непосредственным предшественником синтеза циклического аденозинмонофосфата — вторичного посредника передачи в клетку гормонального сигнала.
  • Также известна роль АТФ в качестве медиатора в синапсах и сигнального вещества в других межклеточных взаимодействиях (пуринергическая передача сигнала).

Пути синтеза

В организме

В организме АТФ синтезируется путём фосфорилирования АДФ:

АДФ + H3PO4 + энергия → АТФ + H2O.

Фосфорилирование АДФ возможно тремя способами:

В первых двух способах используется энергия окисляющихся веществ. Основная масса АТФ образуется на мембранах митохондрий в ходе окислительного фосфорилирования H-зависимой АТФ-синтазой. Субстратное фосфорилирование АДФ не требует участия мембранных ферментов, оно происходит в цитоплазме в процессе гликолиза или путём переноса фосфатной группы с других макроэргических соединений.

Одно из таких соединений — ацетилфосфат. При синтезе АТФ из АДФ и ацетилфосфата фосфорильную группу из ацетилфосфата на АДФ переносит фермент ацетаткиназа[2].

Реакции фосфорилирования АДФ и последующего использования АТФ в качестве источника энергии образуют циклический процесс, составляющий суть энергетического обмена.

В организме АТФ является одним из самых часто обновляемых веществ; так, у человека продолжительность жизни одной молекулы АТФ менее 1 мин. В течение суток одна молекула АТФ проходит в среднем 2000—3000 циклов ресинтеза (человеческий организм синтезирует около 40 кг АТФ в день, но содержит в каждый конкретный момент примерно 250 г), то есть запаса АТФ в организме практически не создаётся, и для нормальной жизнедеятельности необходимо постоянно синтезировать новые молекулы АТФ.

Вне организма

Вне организма синтез АТФ из ацетилфосфата через АДФ идёт в кислой среде в присутствии ионов трёхвалентного железа, которое в реакции работает катализатором, и такая реакция, маловероятно, происходила на древней Земле в предбиологическое время[2].

Каталитическое действие трёхвалентного железа в реакции ацетилфосфат + АДФ → АТФ состоит в том, что Fe3+ связывается с атомом азота N7 пуринового кольца АДФ, одновременно «подтягивая» к нему ацетилфосфат (уменьшает силу отталкивания между молекулами)[2].

См. также

Примечания

  1. CRC Handbook of Chemistry and Physics (англ.) / W. M. Haynes — 97 — Boca Raton: 2016. — P. 3—10. — ISBN 978-1-4987-5428-6
  2. 1 2 3 4 5 6 Куракин, 2022.
  3. Lohmann, K. Über die Pyrophosphatfraktion im Muskel : [нем.] // Naturwissenschaften : журн. — 1929. — Bd. 17. — S. 624–625. — doi:10.1007/BF01506215.
  4. Lipman, F. Metabolic Generation Andutilization of Phosphate Bond Energy : [англ.] : [арх. 11 декабря 2022] // Advances in Enzymology and Related Subjects of Biochemistry : журн. — 1941. — Vol. 1. — P. 99–162. — doi:10.1002/9780470122464.ch4.
  5. 1 2 A. C. Storer, A. Cornish-Bowden. Concentration of MgATP2- and other ions in solution. Calculation of the true concentrations of species present in mixtures of associating ions // The Biochemical Journal. — 1976-10-01. — Т. 159, вып. 1. — С. 1–5. — ISSN 0264-6021. — doi:10.1042/bj1590001. Архивировано 22 сентября 2022 года.
  6. J. E. Wilson, A. Chin. Chelation of divalent cations by ATP, studied by titration calorimetry // Analytical Biochemistry. — 1991. — Т. 193, вып. 1. — С. 16–19. — ISSN 0003-2697. — doi:10.1016/0003-2697(91)90036-s. — PMID 1645933.
  7. L. Garfinkel, R. A. Altschuld, D. Garfinkel. Magnesium in cardiac energy metabolism // Journal of Molecular and Cellular Cardiology. — 1986. — Т. 18, вып. 10. — С. 1003–1013. — ISSN 0022-2828. — doi:10.1016/s0022-2828(86)80289-9. Архивировано 22 сентября 2022 года.
  8. P. Saylor, C. Wang, T. J. Hirai, J. A. Adams. A second magnesium ion is critical for ATP binding in the kinase domain of the oncoprotein v-Fps // Biochemistry. — 1998-09-08. — Т. 37, вып. 36. — С. 12624–12630. — ISSN 0006-2960. — doi:10.1021/bi9812672. — PMID 9730835.
  9. Xiaofeng Lin, Marina K. Ayrapetov, Gongqin Sun. Characterization of the interactions between the active site of a protein tyrosine kinase and a divalent metal activator // BMC biochemistry. — 2005-11-23. — Т. 6. — С. 25. — ISSN 1471-2091. — doi:10.1186/1471-2091-6-25. Архивировано 22 сентября 2022 года.

Литература

  • Voet D, Voet JG. Biochemistry Vol 1 3rd ed (англ.). — Wiley: Hoboken, NJ., 2004. — ISBN 978-0-471-19350-0.
  • Lodish, H, Berk A, Matsudaira P, Kaiser CA, Krieger M, Scott MP, Zipursky SL, Darnell J. Molecular Cell Biology, 5th ed (англ.). — New York: WH Freeman, 2004. — ISBN 9780716743668.
  • Куракин, Г. АТФ стал универсальной «энергетической валютой» благодаря простоте пребиотического синтеза : [арх. 11 декабря 2022] // Элементы. — 2022. — 11 декабря.