SYBR Green

SYBR Green I

Ogólne informacje
Wzór sumaryczny	C32H37N4S+
Masa molowa	509,73 g/mol
Identyfikacja
Numer CAS	163795-75-3
PubChem	10436340
SMILES CCCN(CCCN(C)C)C1=[N+](C2=CC=CC=C2C(=C1)/C=C/3\N(C4=CC=CC=C4S3)C)C5=CC=CC=C5
Niebezpieczeństwa Globalnie zharmonizowany system klasyfikacji i oznakowania chemikaliów Wiarygodne źródła oznakowania tej substancji według kryteriów GHS są niedostępne.

SYBR Green I (SG), zieleń SYBR – organiczny związek chemiczny, jeden z rodziny asymetrycznych cyjaninowych barwników fluorescencyjnych, wybarwiający dwuniciowy DNA. Jest on powszechnie używany do wybarwiania jąder komórkowych lub chromosomów (poprzez wizualizację DNA) w mikroskopii fluorescencyjnej.

Kompleks SYBR-DNA ma maksimum absorpcji przypadające na długość fali świetlnej równą 498 nm (kolor niebieski), a maksimum emisji przy 522 nm (kolor zielony).

Spektrogram SYBR Green I

Z powodu podobnych właściwości, a braku toksyczności, może on zastępować silne mutageny: DAPI, bromek etydyny czy Hoechst. Jego wpływ na organizmy żywe nie jest do końca poznany.

Ponieważ SYBR bardzo silnie i specyficznie wiąże się do DNA, dając silny sygnał wprost proporcjonalny do ilości DNA w próbie, jest on używany jako najprostsza sonda w ilościowej reakcji łańcuchowej polimerazy.

Podobne barwniki cyjaninowe:

• SYBR Green II
• SYBR Gold
• żółcień oksazolowa (YO, od ang. oxazole yellow)
• oranż tiazolowy (TO, od ang. thiazole orange)
• PicoGreen (PG)

Bibliografia

• Zipper H., Brunner H., Bernhagen J., Vitzthum F. Investigations on DNA intercalation and surface binding by SYBR Green I, its structure determination and methodological implications.. „Nucleic Acids Res”. 32. 12, s. e103, 2004. DOI: 10.1093/nar/gnh101. PMID: 15249599.