Biologia strukturalna: Różnice pomiędzy wersjami

Przeglądaj historię interaktywnie

[wersja nieprzejrzana]

[wersja przejrzana]

← poprzednia edycja następna edycja →

Usunięta treść Dodana treść

WizualnieWikikod

Jednokolumnowy

Wersja z 08:20, 17 wrz 2009

Biologia strukturalna – dziedzina biologii znajdująca się na pograniczu biologii molekularnej, biochemii oraz biofizyki, zajmująca się badaniem przestrzennej struktury dużych biocząsteczek, takich jak białka i kwasy nukleinowe. Badania te mają podstawowe znaczenie dla wyjaśnienia mechanizmu większości procesów zachodzących w komórce takich jak oddychanie komórkowe czy obróbka informacji genetycznej, ponieważ zaangażowane są w nie cząsteczki białek, których funkcja jest ściśle powiązana z ich budową.

Kryształ białka (enzymu DNazy) otrzymany na potrzeby rozwiązania jego struktury przestrzennej

Z powodu mikroskopijnego rozmiaru nawet największe układy biocząsteczek (takie jak proteasomy oraz rybosomy) są niedostrzegalne w mikroskopie optycznego. Zazwyczaj do rozwiązywania struktury białek i kwasów nukleinowych wykorzystuje się metody biofizyczne, takie jak krystalografia rentgenowska oraz spektroskopia NMR, pozwalające na uzyskanie dokładnych współrzędnych przestrzennych atomów budujących daną cząsteczkę. Wykorzystanie metod, takich jak superszybka spektroskopia laserowa, mikroskopia elektronowa, mikroskopia sił atomowych, spektroskopia w podczerwieni z wykorzystaniem transformacji Fouriera, dichroizm kołowy oraz spektrometria mas pozwala na zdobycie uzupełniających informacji na temat budowy dużych cząsteczek. Często stosowane są one do badania związków, które nie tworzą kryształów lub są zbyt złożone by badać je za pomocą NMR. Ponadto za ich pomocą możliwe jest nie tylko badanie statycznych konformacji natywnych, ale także dynamiki biomolekuł, a zwłaszcza procesu zwijania białek.

Obecnie poza metodami eksperymentalnymi duże znaczenie ma teoretyczna biologia strukturalna. Wykorzystuje ona różnorodne metody bioinformatyczne oraz modelowanie molekularne do przewidywania struktury oraz badania mechanizmów zwijania się biocząsteczek. Stosowane są zarówno techniki modelowania homologicznego polegające na tworzeniu modelu cząsteczki w oparciu o znane struktury spokrewnionych białek, jak i metody fizyczne takie jak dynamika molekularna i metoda Monte Carlo.

Linki zewnętrzne

@@ Linia 1: / Linia 1: @@
-[[image:Nucleosome 1KX5 2.png|thumb|[[Nukleosom]] stanowi reprezentatywny przykład obiektu badań biologii strukturalnej]]
+[[Plik:Nucleosome 1KX5 2.png|thumb|[[Nukleosom]] stanowi reprezentatywny przykład obiektu badań biologii strukturalnej]]
-'''Biologia strukturalna''' to dziedzina [[biologia|biologii]] znajdująca się na pograniczu [[biologia molekularna|biologii molekularnej]], [[biochemia|biochemii]] oraz [[biofizyka|biofizyki]] zajmująca się badaniem przestrzennej struktury dużych biocząsteczek takich jak [[białka]] i [[kwasy nukleinowe]]. Badania te mają podstawowe znaczenie dla wyjaśnienia mechanizmu większości procesów zachodzących w komórce takich jak [[oddychanie komórkowe]] czy obróbka informacji genetycznej ponieważ zaangażowane są w nie cząsteczki białek, których funkcja jest ściśle powiązana z ich budową.
+'''Biologia strukturalna''' – dziedzina [[biologia|biologii]] znajdująca się na pograniczu [[biologia molekularna|biologii molekularnej]], [[biochemia|biochemii]] oraz [[biofizyka|biofizyki]], zajmująca się badaniem przestrzennej struktury dużych biocząsteczek, takich jak [[białka]] i [[kwasy nukleinowe]]. Badania te mają podstawowe znaczenie dla wyjaśnienia mechanizmu większości procesów zachodzących w komórce takich jak [[oddychanie komórkowe]] czy obróbka [[informacja genetyczna|informacji genetycznej]], ponieważ zaangażowane są w nie cząsteczki białek, których funkcja jest ściśle powiązana z ich budową.
-[[image:DNase1.jpg|thumb|[[Kryształ]] białka otrzymany na potrzeby rozwiązania jego struktury przestrzennej]]
+[[Plik:DNase1.jpg|thumb|[[Kryształ]] białka ([[enzym]]u [[Deoksyrybonukleazy|DNazy]]) otrzymany na potrzeby rozwiązania jego struktury przestrzennej]]
-Z powodu mikroskopijnego rozmiaru nawet największe układy biocząsteczek (takie jak [[proteasom|proteasomy]] oraz [[rybosom|rybosomy]] są niedostrzegalne przy pomocy [[mikroskop świetlny|mikroskopu świetlnego]].
+Z powodu mikroskopijnego rozmiaru nawet największe układy biocząsteczek (takie jak [[proteasom]]y oraz [[rybosom]]y) są niedostrzegalne w [[mikroskop optyczny|mikroskopie optycznego]].
-Zazwyczaj do rozwiązywania struktury białek i kwasów nukleinowych wykorzystuje się metody biofizyczne takie jak [[krystalografia rentgenowska]] oraz [[spektroskopia NMR]] pozwalające ma uzyskanie dokładnych współrzędnych przestrzennych atomów budujących daną cząsteczkę. Wykorzystanie metod takich jak superszybka [[spektroskopia laserowa]], [[mikroskopia elektronowa]], [[mikroskop sił atomowych|mikroskopia sił atomowych]], [[spektroskopia IR|spektroskopia w podczerwieni]] z wykorzystaniem [[transformata Fouriera|transformaty Fouriera]], [[dichroizm kołowy]] oraz [[spektrometria mas]] pozwala na zdobycie uzupełniających informacji na temat budowy dużych cząsteczek. Często stosowane są one do badania związków, które nie tworzą kryształów lub są zbyt zbyt złożone by badać je za pomocą NMR. Ponadto za ich pomocą możliwe jest nie tylko badania statycznych [[konformacja|konformacji]] natywnych ale także dynamikę biomolekuł a zwłaszcza proces [[zwijanie białka|zwijania białek]].
+Zazwyczaj do rozwiązywania struktury białek i kwasów nukleinowych wykorzystuje się metody biofizyczne, takie jak [[krystalografia rentgenowska]] oraz [[spektroskopia NMR]], pozwalające na uzyskanie dokładnych współrzędnych przestrzennych atomów budujących daną cząsteczkę. Wykorzystanie metod, takich jak superszybka [[spektroskopia laserowa]], [[mikroskopia elektronowa]], [[mikroskop sił atomowych|mikroskopia sił atomowych]], [[spektroskopia IR|spektroskopia w podczerwieni]] z wykorzystaniem [[transformacja Fouriera|transformacji Fouriera]], [[dichroizm kołowy]] oraz [[spektrometria mas]] pozwala na zdobycie uzupełniających informacji na temat budowy dużych cząsteczek. Często stosowane są one do badania związków, które nie tworzą kryształów lub są zbyt złożone by badać je za pomocą NMR. Ponadto za ich pomocą możliwe jest nie tylko badanie statycznych [[konformacja|konformacji]] natywnych, ale także dynamiki biomolekuł, a zwłaszcza procesu [[zwijanie białka|zwijania białek]].
-Obecnie poza metodami eksperymentalnymi duże znaczenie ma teoretyczna biologia strukturalna. Wykorzystuje ona różnorodne metody bioinformatyczne oraz [[modelowanie molekularne]] do przewidywania struktury oraz badania mechanizmów zwijania się biocząsteczek. Stosowane są zarówno techniki [[modelowanie homologiczne|modelowania homologicznego]] polegające na tworzeniu modelu cząsteczki w oparciu o znane struktury spokrewnionych białek jak i metody fizyczne takie jak [[dynamika molekularna]] i [[metoda Monte Carlo]].
+Obecnie poza metodami eksperymentalnymi duże znaczenie ma teoretyczna biologia strukturalna. Wykorzystuje ona różnorodne metody [[bioinformatyka|bioinformatyczne]] oraz [[modelowanie molekularne]] do przewidywania struktury oraz badania mechanizmów zwijania się biocząsteczek. Stosowane są zarówno techniki [[modelowanie homologiczne|modelowania homologicznego]] polegające na tworzeniu modelu cząsteczki w oparciu o znane struktury spokrewnionych białek, jak i metody fizyczne takie jak [[dynamika molekularna]] i [[metoda Monte Carlo]].
-== Patrz także ==
-*[[białka]]
-*[[kwasy nukleinowe]]
-*[[bioinformatyka]]
-*[[modelowanie molekularne]]
-*[[struktura trzeciorzędowa białka]]
 == Linki zewnętrzne ==
-*[http://www.nature.com/nsmb/ ''Nature: Structural & Molecular Biology'' strona magazynu]
+* [http://www.nature.com/nsmb/ ''Nature: Structural & Molecular Biology'' strona magazynu]
-*[http://www.biochemweb.org/structural.shtml Structural Biology - Wirtualna Biblioteka Biochemii i Biologii Komórki]
+* [http://www.biochemweb.org/structural.shtml Structural Biology - Wirtualna Biblioteka Biochemii i Biologii Komórki]
-*[http://www.structuralbiology.uzh.ch NCCR Structural Biology - Szwajcarska inicjatywa badawcza skupiona na badaniach białek transbłonowych i układów supramolekularnych]
+* [http://www.structuralbiology.uzh.ch NCCR Structural Biology - Szwajcarska inicjatywa badawcza skupiona na badaniach białek transbłonowych i układów supramolekularnych]
-*[http://www3.imperial.ac.uk/structuralbiology Centrum Biologii Strukturalnej w Imperial College]
+* [http://www3.imperial.ac.uk/structuralbiology Centrum Biologii Strukturalnej w Imperial College]
 [[Kategoria:Biologia molekularna]]