Copa América 1999 var den 39. Copa América-turneringen som ble avholdt. Den ble spilt i Paraguay i tidsrommet 29. juni – 18. juli, og arrangert av CONMEBOL. Vinneren av Copa América 1999 ble Brasil. Det er ingen kvalifisering for sluttspillet i denne turneringen. Alle ti landene fra Sør-Amerika deltar, i tillegg til to inviterte lag, Mexico og Japan.
Lagene ble delt inn i tre grupper med 4 lag i hver. CONMEBOL sto for oppsettet av gruppene, etter en offentlig loddtrekning. Hvert lag spilte én kamp mot alle de 3 andre lagene i gruppen. 3 poeng for seier, 1 for uavgjort og 0 for tap.
De lagene som endte på første- og andreplass avanserte direkte til kvartfinalen. I tillegg avanserte de to beste lagene som endte på tredjeplass i sin gruppe.
Regler for hvis flere lag ender på samme poengsum i gruppespillet: