Lysin-spezifische Demethylase 5D

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Lysin-spezifische Demethylase 5D
Lysin-spezifische Demethylase 5D

Vorhandene Strukturdaten: 2E6R, 2YQE

Eigenschaften des menschlichen Proteins
Bezeichner
Externe IDs
Orthologe
Mensch Hausmaus
Entrez 8284 20592
Ensembl ENSG00000012817 ENSMUSG00000056673
UniProt Q9BY66 Q62240
Refseq (mRNA) NM_001146705 NM_011419
Refseq (Protein) NP_001140177 NP_035549
Genlocus Chr Y: 19.7 – 19.74 Mb Chr Y: 0.9 – 0.96 Mb
PubMed-Suche 8284 20592

Die Lysin-spezifische Demethylase 5D ist ein Enzym, das beim Menschen durch das KDM5D-Gen kodiert wird.[1][2] Das Enzym gehört zur Superfamilie der α-Ketoglutarat-abhängigen Hydroxylasen.

Es handelt sich bei der Lysin-spezifischen Demethylase 5D um ein Zinkfingerprotein.

Biologische Bedeutung

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Die Lysin-spezifische Demethylase 5 ist ein Enzym aus der Gruppe der Histon-Lysin-Demethylasen. Es demethyliert spezifisch di- und trimethyliertes Lysin 4 (K4) im Histon H3 (Histonmodifikationen H3K4me2/3) und hat damit Einfluss auf die Epigenetik („Histon-Code“). Nicht demethyliert werden H3K9me, H3K27me, H3K36me oder H3K79me.[3]

Das KDM5D-Gen, das für die Lysin-spezifische Demethylase (KDM5D-Protein) kodiert, ist beim Menschen auf dem Y-Chromosom lokalisiert. In einer Studie identifizierten Forscher KDM5D als ein transkriptionell hochreguliertes Gen in kolorektalen Tumoren. Dies könne zu den geschlechtsbedingten Unterschieden beim Auftreten bestimmter Formen von Darmkrebs (KRAS-positives kolorektales Karzinom) beitragen.[4]

Einzelnachweise

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  1. P. Froggatt: The foundation of the "Inst" medical department and its association with the Belfast Fever Hospital. In: The Ulster Medical Journal. Band 45, Nr. 2, 1976, S. 107–145, PMID 795123, PMC 2385577 (freier Volltext).
  2. M. G. Kent-First, M. Maffitt, A. Muallem, P. Brisco, J. Shultz, S. Ekenberg, A. I. Agulnik, I. Agulnik, D. Shramm, B. Bavister, A. Abdul-Mawgood, J. VandeBerg: Gene sequence and evolutionary conservation of human SMCY. In: Nature Genetics. Band 14, Nr. 2, Oktober 1996, S. 128–129, doi:10.1038/ng1096-128.
  3. UniProt. In: uniprot.org. Abgerufen am 29. Juli 2024.
  4. Jiexi Li, Zhengdao Lan, Wenting Liao, James W. Horner, Xueping Xu, Jielin Liu, Yohei Yoshihama, Shan Jiang, Hong Seok Shim, Max Slotnik, Kyle A. LaBella, Chang‐Jiun Wu, Kenneth Dunner, Wen-Hao Hsu, Rumi Lee, Isha Khanduri, Christopher Terranova, Kadir C. Akdemir, Deepavali Chakravarti, Xiaoying Shang, Denise J. Spring, Li Wang, Ronald A. DePinho: Histone demethylase KDM5D upregulation drives sex differences in colon cancer. In: Nature. Band 619, Nr. 7970, 21. Juni 2023, S. 632–639, doi:10.1038/s41586-023-06254-7.